More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_6422 on replicon NC_008062
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4930  transketolase central region  95.48 
 
 		 332 aa  650    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6422  transketolase, central region  100 
 
 		 332 aa  673    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6255  transketolase central region  99.4 
 
 		 332 aa  669    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.156319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4411  transketolase, central region  95.48 
 
 		 332 aa  652    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0682016 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6657  transketolase, central region  100 
 
 		 332 aa  673    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4991  transketolase central region  88.25 
 
 		 332 aa  594  1e-169  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.908463 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4778  transketolase subunit B  86.4 
 
 		 332 aa  591  1e-168  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5878  transketolase central region  87.58 
 
 		 333 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6139  Transketolase central region  83.08 
 
 		 332 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.47666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3269  transketolase subunit B  78.83 
 
 		 337 aa  531  1e-150  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.444228 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2699  transketolase subunit B  86.11 
 
 		 288 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1462  transketolase subunit B  74.55 
 
 		 332 aa  513  1e-144  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.304967 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2718  transketolase subunit B  71.76 
 
 		 340 aa  498  1e-140  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5275  transketolase, central region  72.12 
 
 		 335 aa  498  1e-140  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.181452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1539  transketolase central region  74.39 
 
 		 348 aa  498  1e-140  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.844968  normal  0.490255 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3312  Transketolase central region  70.61 
 
 		 332 aa  494  9.999999999999999e-139  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3003  transketolase central region  74.84 
 
 		 340 aa  488  1e-137  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2367  Transketolase central region  72.36 
 
 		 339 aa  481  1e-135  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.438048  normal  0.0327946 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2092  transketolase central region  72.36 
 
 		 339 aa  481  1e-135  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.147262 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4275  transketolase central region  69.58 
 
 		 338 aa  481  1e-135  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2744  transketolase central region  71.78 
 
 		 342 aa  477  1e-133  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0728122  normal  0.0592981 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2613  transketolase central region  70.15 
 
 		 333 aa  474  1e-133  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0875571  normal  0.474338 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0718  transketolase, central region  69.76 
 
 		 334 aa  473  1e-132  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0261  Transketolase central region  70.19 
 
 		 339 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.885505 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0727  transketolase central region  70.57 
 
 		 335 aa  461  1e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4383  Transketolase central region  70.55 
 
 		 342 aa  457  1e-127  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0967269  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3618  transketolase subunit B  66.35 
 
 		 331 aa  439  9.999999999999999e-123  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.189872  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3641  transketolase, central region  62.96 
 
 		 334 aa  432  1e-120  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.150786 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3958  transketolase subunit B  63.69 
 
 		 340 aa  427  1e-119  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.158278  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1717  Transketolase central region  63.25 
 
 		 347 aa  423  1e-117  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0406  Transketolase central region  63.19 
 
 		 343 aa  412  1e-114  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3347  Transketolase central region  60.73 
 
 		 331 aa  394  1e-108  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.027962  normal  0.023237 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2506  Transketolase central region  59.75 
 
 		 343 aa  385  1e-106  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.165482 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1713  transketolase central region  47.28 
 
 		 332 aa  290  2e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.548893  normal  0.0621953 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0901  transketolase, central region  42.86 
 
 		 336 aa  253  3e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0492  transketolase, central region  42.91 
 
 		 312 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0969  transketolase, central region  42.09 
 
 		 306 aa  229  4e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86113  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1527  Transketolase central region  43.33 
 
 		 319 aa  228  9e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4744  Transketolase central region  44.78 
 
 		 311 aa  228  9e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0293  putative transketolase, C-terminal subunit  42.09 
 
 		 314 aa  227  2e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0288  transketolase  42.09 
 
 		 314 aa  227  2e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000211069  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0244  Transketolase central region  40.26 
 
 		 305 aa  226  5.0000000000000005e-58  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.304733  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3967  Transketolase central region  45.45 
 
 		 313 aa  225  1e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000645501  unclonable  0.000000000133165 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1170  transketolase subunit B  42.95 
 
 		 326 aa  223  3e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000103125  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0874  Transketolase central region  40.58 
 
 		 326 aa  222  7e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1860  Transketolase central region  44.97 
 
 		 321 aa  222  7e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2213  transketolase subunit B  41.22 
 
 		 317 aa  221  9.999999999999999e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000528401  hitchhiker  0.000741425 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0237  transketolase subunit B  45.95 
 
 		 311 aa  221  1.9999999999999999e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1192  transketolase-like  41.08 
 
 		 327 aa  218  1e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.101787  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0280  Transketolase central region  41.08 
 
 		 310 aa  218  1e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.741894  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2719  transketolase, C-terminal subunit  45.45 
 
 		 311 aa  217  2e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4834  transketolase central region  37.95 
 
 		 333 aa  217  2e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0265  Transketolase central region  40.74 
 
 		 310 aa  217  2e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00214892 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1895  transketolase, C-terminal subunit  39.13 
 
 		 318 aa  216  2.9999999999999998e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00759771 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1130  transketolase central region  38.56 
 
 		 336 aa  215  8e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1381  Transketolase central region  43.4 
 
 		 306 aa  214  1.9999999999999998e-54  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0881  Transketolase central region  39.87 
 
 		 327 aa  214  1.9999999999999998e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000876605  normal  0.0478781 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1286  transketolase-like  40.94 
 
 		 327 aa  213  2.9999999999999995e-54  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.290354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0438  transketolase central region  36.09 
 
 		 312 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0397028  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1173  Transketolase central region  40.52 
 
 		 327 aa  211  1e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000000393635  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0333  Transketolase central region  36.75 
 
 		 322 aa  210  3e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00875  transketolase, C-terminal subunit  38.82 
 
 		 317 aa  208  1e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0873  Transketolase central region  38.67 
 
 		 319 aa  207  2e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.199119  hitchhiker  0.00317558 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0244  transketolase-like protein  39.03 
 
 		 311 aa  207  2e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2935  Transketolase central region  38.33 
 
 		 317 aa  206  4e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0552  transketolase subunit B  41.69 
 
 		 314 aa  206  4e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1178  Transketolase central region  40.4 
 
 		 327 aa  206  6e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0058066  normal  0.0131189 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0975  Transketolase central region  37.54 
 
 		 317 aa  205  8e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.127122  normal  0.063318 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2705  transketolase subunit B  40.89 
 
 		 311 aa  205  1e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000194197  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0471  transketolase subunit B  35.84 
 
 		 312 aa  204  2e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0285277  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1878  transketolase subunit B  36.9 
 
 		 312 aa  203  4e-51  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0365  transketolase central region  34.46 
 
 		 312 aa  202  8e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.556876  normal  0.0129681 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0470  Transketolase central region  46.33 
 
 		 318 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0711  Transketolase central region  36.01 
 
 		 315 aa  200  3e-50  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00000202012  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1554  transketolase central region  34.81 
 
 		 312 aa  200  3e-50  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0600642  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0183  Transketolase central region  36.72 
 
 		 320 aa  199  3.9999999999999996e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2059  Transketolase central region  37.37 
 
 		 313 aa  199  5e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0173  Transketolase central region  38.64 
 
 		 313 aa  198  1.0000000000000001e-49  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2019  Transketolase central region  39.4 
 
 		 320 aa  197  3e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.6126  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0860  Transketolase domain protein  38.33 
 
 		 310 aa  196  5.000000000000001e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.476833  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1792  transketolase subunit B  37.46 
 
 		 310 aa  195  8.000000000000001e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0510195  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3074  transketolase, central region  44.44 
 
 		 313 aa  194  1e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0289222  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1505  transketolase central region  33.01 
 
 		 314 aa  193  3e-48  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0385912  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2918  transketolase, C-terminal subunit  41.69 
 
 		 314 aa  193  4e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2077  transketolase, central region  43.58 
 
 		 308 aa  191  1e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0049  transketolase, central region  39.8 
 
 		 317 aa  186  4e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1058  transketolase subunit B  45.78 
 
 		 308 aa  186  4e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.847424 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05490  transketolase subunit B  39.05 
 
 		 325 aa  185  9e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.948034 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0300  transketolase central region  34.74 
 
 		 324 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0477096 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2513  transketolase subunit B  35.74 
 
 		 322 aa  184  2.0000000000000003e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1277  Transketolase central region  38.19 
 
 		 313 aa  182  9.000000000000001e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2254  Transketolase domain protein  36.73 
 
 		 318 aa  182  9.000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.655402  normal  0.0447096 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2110  transketolase, central region  40 
 
 		 314 aa  181  2e-44  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.44874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3129  transketolase domain-containing protein  37.24 
 
 		 322 aa  177  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09040  transketolase subunit B  35.99 
 
 		 315 aa  177  2e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.28283  normal  0.0525296 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1775  transketolase, central region  40.23 
 
 		 314 aa  177  2e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1078  deoxyxylulose-5-phosphate synthase  31.6 
 
 		 635 aa  177  3e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0303047  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0789  transketolase central region  39.85 
 
 		 314 aa  175  9e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2032  Transketolase domain protein  37.37 
 
 		 318 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.262756  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0338  Transketolase central region  38.89 
 
 		 319 aa  174  9.999999999999999e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>