More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_2077 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_2077  transketolase, central region  100 
 
 		 308 aa  618  1e-176  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0470  Transketolase central region  78.1 
 
 		 318 aa  439  9.999999999999999e-123  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3967  Transketolase central region  70.36 
 
 		 313 aa  426  1e-118  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000645501  unclonable  0.000000000133165 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3074  transketolase, central region  70.68 
 
 		 313 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0289222  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0969  transketolase, central region  62.83 
 
 		 306 aa  396  1e-109  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86113  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0293  putative transketolase, C-terminal subunit  61.11 
 
 		 314 aa  393  1e-108  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0288  transketolase  61.11 
 
 		 314 aa  393  1e-108  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000211069  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4744  Transketolase central region  66.89 
 
 		 311 aa  388  1e-107  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0492  transketolase, central region  60.98 
 
 		 312 aa  382  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1860  Transketolase central region  61.44 
 
 		 321 aa  378  1e-104  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0244  transketolase-like protein  58.12 
 
 		 311 aa  375  1e-103  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2213  transketolase subunit B  58.33 
 
 		 317 aa  374  1e-102  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000528401  hitchhiker  0.000741425 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2705  transketolase subunit B  60.91 
 
 		 311 aa  362  4e-99  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000194197  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0237  transketolase subunit B  64.17 
 
 		 311 aa  362  6e-99  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0265  Transketolase central region  59.21 
 
 		 310 aa  361  7.0000000000000005e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00214892 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2719  transketolase, C-terminal subunit  62.62 
 
 		 311 aa  359  3e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2059  Transketolase central region  56.31 
 
 		 313 aa  359  3e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0280  Transketolase central region  58.55 
 
 		 310 aa  358  7e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.741894  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0552  transketolase subunit B  62.91 
 
 		 314 aa  348  4e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1178  Transketolase central region  57.48 
 
 		 327 aa  347  1e-94  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0058066  normal  0.0131189 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1381  Transketolase central region  55.67 
 
 		 306 aa  345  8e-94  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0244  Transketolase central region  53.11 
 
 		 305 aa  342  5e-93  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.304733  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0173  Transketolase central region  55.02 
 
 		 313 aa  340  1e-92  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0711  Transketolase central region  55.78 
 
 		 315 aa  338  9.999999999999999e-92  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00000202012  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0881  Transketolase central region  56.33 
 
 		 327 aa  335  3.9999999999999995e-91  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000876605  normal  0.0478781 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1192  transketolase-like  56 
 
 		 327 aa  333  3e-90  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.101787  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0874  Transketolase central region  56.33 
 
 		 326 aa  332  6e-90  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2918  transketolase, C-terminal subunit  61.97 
 
 		 314 aa  331  1e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1170  transketolase subunit B  55.67 
 
 		 326 aa  328  5.0000000000000004e-89  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000103125  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0300  transketolase central region  51.29 
 
 		 324 aa  327  1.0000000000000001e-88  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0477096 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0975  Transketolase central region  52.46 
 
 		 317 aa  327  2.0000000000000001e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.127122  normal  0.063318 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1286  transketolase-like  55 
 
 		 327 aa  326  3e-88  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.290354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1173  Transketolase central region  56 
 
 		 327 aa  323  2e-87  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000000393635  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1895  transketolase, C-terminal subunit  51.96 
 
 		 318 aa  322  6e-87  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00759771 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0183  Transketolase central region  51.16 
 
 		 320 aa  321  9.999999999999999e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0438  transketolase central region  51.8 
 
 		 312 aa  319  3.9999999999999996e-86  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0397028  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0333  Transketolase central region  51.69 
 
 		 322 aa  318  7e-86  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0873  Transketolase central region  52.29 
 
 		 319 aa  317  2e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.199119  hitchhiker  0.00317558 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00875  transketolase, C-terminal subunit  52.7 
 
 		 317 aa  314  9.999999999999999e-85  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2935  Transketolase central region  51.48 
 
 		 317 aa  313  1.9999999999999998e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09040  transketolase subunit B  52.12 
 
 		 315 aa  311  7.999999999999999e-84  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.28283  normal  0.0525296 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05490  transketolase subunit B  51.79 
 
 		 325 aa  310  2e-83  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.948034 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2019  Transketolase central region  50 
 
 		 320 aa  308  6.999999999999999e-83  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.6126  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1505  transketolase central region  49.51 
 
 		 314 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0385912  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1527  Transketolase central region  52.3 
 
 		 319 aa  305  7e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1997  Transketolase central region  53.09 
 
 		 321 aa  298  6e-80  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00329881 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0365  transketolase central region  49.84 
 
 		 312 aa  298  7e-80  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.556876  normal  0.0129681 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0471  transketolase subunit B  49.67 
 
 		 312 aa  298  7e-80  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0285277  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0049  transketolase, central region  52.65 
 
 		 317 aa  296  3e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1554  transketolase central region  48.2 
 
 		 312 aa  291  1e-77  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0600642  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0860  Transketolase domain protein  47.73 
 
 		 310 aa  290  3e-77  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.476833  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1130  transketolase central region  48.36 
 
 		 336 aa  284  1.0000000000000001e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0338  Transketolase central region  52.81 
 
 		 319 aa  283  2.0000000000000002e-75  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0334  Transketolase central region  51.82 
 
 		 308 aa  266  4e-70  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0809  transketolase central region  47.71 
 
 		 592 aa  265  5e-70  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.32467  normal  0.55266 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1878  transketolase subunit B  44.59 
 
 		 312 aa  265  5.999999999999999e-70  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3129  transketolase domain-containing protein  47.26 
 
 		 322 aa  261  1e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2254  Transketolase domain protein  45.87 
 
 		 318 aa  261  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.655402  normal  0.0447096 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1468  Transketolase central region  43 
 
 		 314 aa  250  2e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3878  transketolase, central region  46.92 
 
 		 342 aa  250  3e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.733485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6295  Transketolase central region  46.23 
 
 		 332 aa  247  2e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2613  transketolase central region  45.1 
 
 		 333 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0875571  normal  0.474338 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1277  Transketolase central region  43.33 
 
 		 313 aa  239  2.9999999999999997e-62  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0789  transketolase central region  43.37 
 
 		 314 aa  237  1e-61  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2032  Transketolase domain protein  45.36 
 
 		 318 aa  237  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.262756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1792  transketolase subunit B  45.05 
 
 		 310 aa  235  6e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0510195  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1775  transketolase, central region  43.69 
 
 		 314 aa  235  7e-61  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4991  transketolase central region  44.95 
 
 		 332 aa  235  8e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.908463 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2444  transketolase subunit B  41.88 
 
 		 313 aa  233  4.0000000000000004e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2513  transketolase subunit B  41.91 
 
 		 322 aa  232  6e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0486  Transketolase domain protein  42.05 
 
 		 313 aa  230  2e-59  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1539  transketolase central region  45.25 
 
 		 348 aa  230  3e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.844968  normal  0.490255 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3364  Transketolase domain protein  41.06 
 
 		 317 aa  229  4e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2842  transketolase subunit B  40.33 
 
 		 317 aa  229  5e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.837175  normal  0.299247 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3269  transketolase subunit B  44.77 
 
 		 337 aa  229  5e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.444228 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0894  transketolase subunit B  43.59 
 
 		 314 aa  229  5e-59  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4663  transketolase central region  43.46 
 
 		 328 aa  225  6e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2110  transketolase, central region  42.35 
 
 		 314 aa  225  6e-58  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.44874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2718  transketolase subunit B  43.51 
 
 		 340 aa  225  7e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3949  Transketolase domain protein  40 
 
 		 338 aa  224  1e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5275  transketolase, central region  44.67 
 
 		 335 aa  224  1e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.181452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1462  transketolase subunit B  43.97 
 
 		 332 aa  223  4e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.304967 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1717  Transketolase central region  41.72 
 
 		 347 aa  222  4.9999999999999996e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6139  Transketolase central region  42.11 
 
 		 332 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.47666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2581  transketolase domain-containing protein  41.18 
 
 		 317 aa  221  8e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.230809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2689  transketolase domain-containing protein  41.18 
 
 		 317 aa  221  8e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.423567 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3312  Transketolase central region  43.45 
 
 		 332 aa  222  8e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2526  transketolase domain protein  40.85 
 
 		 317 aa  221  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.508569 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0718  transketolase, central region  43.38 
 
 		 334 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2481  transketolase domain protein  41.18 
 
 		 317 aa  220  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.120495  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6255  transketolase central region  43.92 
 
 		 332 aa  220  3e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.156319  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2744  transketolase central region  44.12 
 
 		 342 aa  219  3e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0728122  normal  0.0592981 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3618  transketolase subunit B  42.72 
 
 		 331 aa  219  3e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.189872  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4275  transketolase central region  42 
 
 		 338 aa  219  3.9999999999999997e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2569  transketolase domain protein  41.18 
 
 		 317 aa  219  3.9999999999999997e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.126502  normal  0.742091 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4778  transketolase subunit B  43.77 
 
 		 332 aa  219  5e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2367  Transketolase central region  42.9 
 
 		 339 aa  219  6e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.438048  normal  0.0327946 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2092  transketolase central region  42.9 
 
 		 339 aa  219  6e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.147262 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6422  transketolase, central region  43.58 
 
 		 332 aa  217  2e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6657  transketolase, central region  43.58 
 
 		 332 aa  217  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>