More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_05490 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_05490  transketolase subunit B  100 
 
 		 325 aa  651    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.948034 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09040  transketolase subunit B  76.6 
 
 		 315 aa  462  1e-129  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.28283  normal  0.0525296 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1997  Transketolase central region  72.67 
 
 		 321 aa  448  1e-125  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00329881 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2213  transketolase subunit B  52.41 
 
 		 317 aa  330  2e-89  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000528401  hitchhiker  0.000741425 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0334  Transketolase central region  60.84 
 
 		 308 aa  325  5e-88  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2019  Transketolase central region  50.32 
 
 		 320 aa  317  1e-85  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.6126  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0244  transketolase-like protein  49.84 
 
 		 311 aa  315  8e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3967  Transketolase central region  51.45 
 
 		 313 aa  311  7.999999999999999e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000645501  unclonable  0.000000000133165 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1895  transketolase, C-terminal subunit  49.2 
 
 		 318 aa  311  9e-84  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00759771 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0969  transketolase, central region  50 
 
 		 306 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86113  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00875  transketolase, C-terminal subunit  49.2 
 
 		 317 aa  308  1.0000000000000001e-82  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1178  Transketolase central region  49.19 
 
 		 327 aa  308  1.0000000000000001e-82  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0058066  normal  0.0131189 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0492  transketolase, central region  48.56 
 
 		 312 aa  307  1.0000000000000001e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0873  Transketolase central region  48.71 
 
 		 319 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.199119  hitchhiker  0.00317558 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0975  Transketolase central region  46.62 
 
 		 317 aa  301  9e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.127122  normal  0.063318 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0280  Transketolase central region  48.54 
 
 		 310 aa  299  5e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.741894  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0265  Transketolase central region  48.54 
 
 		 310 aa  298  6e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00214892 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0711  Transketolase central region  47.16 
 
 		 315 aa  298  9e-80  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00000202012  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1860  Transketolase central region  50.49 
 
 		 321 aa  297  2e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0881  Transketolase central region  46.79 
 
 		 327 aa  295  7e-79  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000876605  normal  0.0478781 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4744  Transketolase central region  52.2 
 
 		 311 aa  295  8e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1286  transketolase-like  46.95 
 
 		 327 aa  294  1e-78  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.290354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0552  transketolase subunit B  51.46 
 
 		 314 aa  294  2e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0333  Transketolase central region  48.23 
 
 		 322 aa  293  2e-78  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2059  Transketolase central region  46.52 
 
 		 313 aa  293  3e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0874  Transketolase central region  46.3 
 
 		 326 aa  292  6e-78  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1170  transketolase subunit B  46.62 
 
 		 326 aa  292  6e-78  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000103125  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2935  Transketolase central region  47.27 
 
 		 317 aa  291  9e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0438  transketolase central region  47.27 
 
 		 312 aa  291  1e-77  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0397028  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0183  Transketolase central region  45.34 
 
 		 320 aa  291  1e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0244  Transketolase central region  46.56 
 
 		 305 aa  290  3e-77  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.304733  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2705  transketolase subunit B  50.16 
 
 		 311 aa  290  3e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000194197  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3074  transketolase, central region  52.09 
 
 		 313 aa  289  3e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0289222  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1381  Transketolase central region  48.51 
 
 		 306 aa  289  4e-77  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0237  transketolase subunit B  52.09 
 
 		 311 aa  288  9e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2077  transketolase, central region  51.79 
 
 		 308 aa  287  2e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0293  putative transketolase, C-terminal subunit  45.54 
 
 		 314 aa  286  2.9999999999999996e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0288  transketolase  45.54 
 
 		 314 aa  286  2.9999999999999996e-76  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000211069  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1505  transketolase central region  46.58 
 
 		 314 aa  286  4e-76  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0385912  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2719  transketolase, C-terminal subunit  51.46 
 
 		 311 aa  285  7e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1192  transketolase-like  44.87 
 
 		 327 aa  284  2.0000000000000002e-75  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.101787  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0049  transketolase, central region  50 
 
 		 317 aa  283  2.0000000000000002e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1173  Transketolase central region  45.83 
 
 		 327 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000000393635  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0471  transketolase subunit B  47.23 
 
 		 312 aa  282  6.000000000000001e-75  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0285277  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0470  Transketolase central region  51.1 
 
 		 318 aa  281  9e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1554  transketolase central region  46.91 
 
 		 312 aa  278  7e-74  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0600642  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0365  transketolase central region  45.93 
 
 		 312 aa  276  4e-73  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.556876  normal  0.0129681 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0300  transketolase central region  43.04 
 
 		 324 aa  273  3e-72  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0477096 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2918  transketolase, C-terminal subunit  50.49 
 
 		 314 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0173  Transketolase central region  47.06 
 
 		 313 aa  265  8e-70  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1878  transketolase subunit B  44.22 
 
 		 312 aa  246  3e-64  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1527  Transketolase central region  45.36 
 
 		 319 aa  246  4.9999999999999997e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0338  Transketolase central region  47.59 
 
 		 319 aa  242  5e-63  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1277  Transketolase central region  43.65 
 
 		 313 aa  240  2e-62  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0809  transketolase central region  44.85 
 
 		 592 aa  234  1.0000000000000001e-60  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.32467  normal  0.55266 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0486  Transketolase domain protein  46.24 
 
 		 313 aa  232  8.000000000000001e-60  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0860  Transketolase domain protein  40.97 
 
 		 310 aa  231  1e-59  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.476833  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1130  transketolase central region  40.98 
 
 		 336 aa  226  3e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2444  transketolase subunit B  40.19 
 
 		 313 aa  226  3e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1468  Transketolase central region  38.64 
 
 		 314 aa  226  5.0000000000000005e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2254  Transketolase domain protein  42.02 
 
 		 318 aa  223  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.655402  normal  0.0447096 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4663  transketolase central region  43.56 
 
 		 328 aa  219  6e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3878  transketolase, central region  40.06 
 
 		 342 aa  216  4e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.733485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3364  Transketolase domain protein  37.25 
 
 		 317 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0894  transketolase subunit B  44.26 
 
 		 314 aa  211  1e-53  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1775  transketolase, central region  42.62 
 
 		 314 aa  207  1e-52  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3129  transketolase domain-containing protein  41.37 
 
 		 322 aa  206  3e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0789  transketolase central region  41.97 
 
 		 314 aa  206  4e-52  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2569  transketolase domain protein  39.52 
 
 		 317 aa  205  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.126502  normal  0.742091 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2481  transketolase domain protein  39.52 
 
 		 317 aa  204  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.120495  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6295  Transketolase central region  39.87 
 
 		 332 aa  203  3e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2689  transketolase domain-containing protein  39.18 
 
 		 317 aa  203  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.423567 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2581  transketolase domain-containing protein  39.18 
 
 		 317 aa  203  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.230809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2526  transketolase domain protein  39.18 
 
 		 317 aa  202  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.508569 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2842  transketolase subunit B  39.52 
 
 		 317 aa  202  5e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.837175  normal  0.299247 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2032  Transketolase domain protein  42.67 
 
 		 318 aa  202  7e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.262756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2110  transketolase, central region  41.56 
 
 		 314 aa  201  9.999999999999999e-51  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.44874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2513  transketolase subunit B  39.2 
 
 		 322 aa  200  3e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0407  transketolase central region  40.46 
 
 		 323 aa  199  5e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0194561  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0419  transketolase central region  40.12 
 
 		 630 aa  197  3e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.218492  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1923  transketolase domain-containing protein  37.85 
 
 		 315 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3949  Transketolase domain protein  38.28 
 
 		 338 aa  195  1e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5659  Transketolase central region  39.04 
 
 		 333 aa  195  1e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.252415  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2237  transketolase  37.87 
 
 		 689 aa  194  2e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1539  transketolase central region  38.73 
 
 		 348 aa  191  1e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.844968  normal  0.490255 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1655  transketolase  39.7 
 
 		 629 aa  190  2e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.168649 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4991  transketolase central region  40.58 
 
 		 332 aa  190  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.908463 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3312  Transketolase central region  37.62 
 
 		 332 aa  191  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2041  transketolase central region  41.25 
 
 		 330 aa  190  2.9999999999999997e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.522483 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1462  transketolase subunit B  40.65 
 
 		 332 aa  189  5.999999999999999e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.304967 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0049  transketolase  40.58 
 
 		 626 aa  189  7e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5275  transketolase, central region  39.24 
 
 		 335 aa  189  8e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.181452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4778  transketolase subunit B  39.8 
 
 		 332 aa  188  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2822  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  39.29 
 
 		 635 aa  187  1e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.553695  normal  0.10664 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1792  transketolase subunit B  37.54 
 
 		 310 aa  188  1e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0510195  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2718  transketolase subunit B  39.1 
 
 		 340 aa  185  7e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6422  transketolase, central region  39.05 
 
 		 332 aa  185  9e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6657  transketolase, central region  39.05 
 
 		 332 aa  185  9e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2613  transketolase central region  36.54 
 
 		 333 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0875571  normal  0.474338 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6255  transketolase central region  39.05 
 
 		 332 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.156319  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>