More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_1923 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010320  Teth514_1923  transketolase domain-containing protein  100 
 
 
315 aa  639    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0969  transketolase, central region  43.93 
 
 
306 aa  256  2e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86113  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0280  Transketolase central region  42.62 
 
 
310 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.741894  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0265  Transketolase central region  41.95 
 
 
310 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00214892 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2019  Transketolase central region  39.1 
 
 
320 aa  229  4e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.6126  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1860  Transketolase central region  39.81 
 
 
321 aa  229  5e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0293  putative transketolase, C-terminal subunit  42.14 
 
 
314 aa  228  8e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0288  transketolase  42.14 
 
 
314 aa  228  8e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000211069  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0183  Transketolase central region  39.81 
 
 
320 aa  228  9e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1381  Transketolase central region  41.75 
 
 
306 aa  227  2e-58  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1895  transketolase, C-terminal subunit  38.26 
 
 
318 aa  227  2e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00759771 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0873  Transketolase central region  38.66 
 
 
319 aa  226  3e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.199119  hitchhiker  0.00317558 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2059  Transketolase central region  42.18 
 
 
313 aa  226  3e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1505  transketolase central region  40.07 
 
 
314 aa  225  1e-57  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0385912  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0244  Transketolase central region  41 
 
 
305 aa  224  1e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.304733  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0492  transketolase, central region  40.13 
 
 
312 aa  223  4e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2513  transketolase subunit B  39.53 
 
 
322 aa  221  9.999999999999999e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0333  Transketolase central region  38.02 
 
 
322 aa  219  5e-56  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2935  Transketolase central region  38.33 
 
 
317 aa  216  2.9999999999999998e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2213  transketolase subunit B  38.06 
 
 
317 aa  217  2.9999999999999998e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000528401  hitchhiker  0.000741425 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0975  Transketolase central region  38.67 
 
 
317 aa  215  9e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.127122  normal  0.063318 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1527  Transketolase central region  37.42 
 
 
319 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0552  transketolase subunit B  41.98 
 
 
314 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0471  transketolase subunit B  37.97 
 
 
312 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0285277  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0237  transketolase subunit B  41.1 
 
 
311 aa  212  5.999999999999999e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4744  Transketolase central region  39.66 
 
 
311 aa  212  7e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0438  transketolase central region  39.09 
 
 
312 aa  212  9e-54  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0397028  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0244  transketolase-like protein  35.05 
 
 
311 aa  211  1e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0365  transketolase central region  37.66 
 
 
312 aa  210  2e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.556876  normal  0.0129681 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1554  transketolase central region  37.66 
 
 
312 aa  211  2e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0600642  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1178  Transketolase central region  37.58 
 
 
327 aa  210  2e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0058066  normal  0.0131189 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2254  Transketolase domain protein  38.31 
 
 
318 aa  209  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.655402  normal  0.0447096 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1878  transketolase subunit B  37.46 
 
 
312 aa  209  7e-53  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0711  Transketolase central region  37.5 
 
 
315 aa  208  1e-52  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00000202012  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2444  transketolase subunit B  36.33 
 
 
313 aa  207  2e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2705  transketolase subunit B  39.87 
 
 
311 aa  207  2e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000194197  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3967  Transketolase central region  39.55 
 
 
313 aa  206  4e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000645501  unclonable  0.000000000133165 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3949  Transketolase domain protein  36.96 
 
 
338 aa  206  4e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05490  transketolase subunit B  37.85 
 
 
325 aa  206  5e-52  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.948034 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4663  transketolase central region  37.88 
 
 
328 aa  206  6e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0173  Transketolase central region  38.29 
 
 
313 aa  205  7e-52  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0470  Transketolase central region  43.14 
 
 
318 aa  203  2e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2719  transketolase, C-terminal subunit  37.62 
 
 
311 aa  204  2e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0894  transketolase subunit B  38.51 
 
 
314 aa  202  5e-51  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1775  transketolase, central region  37.22 
 
 
314 aa  202  6e-51  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1130  transketolase central region  37.5 
 
 
336 aa  202  9e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0049  transketolase, central region  36.13 
 
 
317 aa  201  9.999999999999999e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6295  Transketolase central region  35.53 
 
 
332 aa  200  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09040  transketolase subunit B  37.46 
 
 
315 aa  200  1.9999999999999998e-50  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.28283  normal  0.0525296 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3129  transketolase domain-containing protein  38.7 
 
 
322 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00875  transketolase, C-terminal subunit  36 
 
 
317 aa  200  1.9999999999999998e-50  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1173  Transketolase central region  37.12 
 
 
327 aa  200  3e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000000393635  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1286  transketolase-like  37.17 
 
 
327 aa  199  6e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.290354  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0881  Transketolase central region  36.18 
 
 
327 aa  199  7e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000876605  normal  0.0478781 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1192  transketolase-like  37.12 
 
 
327 aa  199  7e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.101787  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0789  transketolase central region  36.57 
 
 
314 aa  198  7.999999999999999e-50  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2077  transketolase, central region  38.31 
 
 
308 aa  197  2.0000000000000003e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2110  transketolase, central region  36.48 
 
 
314 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.44874  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2402  transketolase, C-terminal subunit  39.58 
 
 
310 aa  197  3e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.730568  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0809  transketolase central region  39.22 
 
 
592 aa  196  3e-49  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.32467  normal  0.55266 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0860  Transketolase domain protein  37.26 
 
 
310 aa  195  7e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.476833  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0874  Transketolase central region  36.79 
 
 
326 aa  195  7e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1170  transketolase subunit B  37.17 
 
 
326 aa  195  8.000000000000001e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000103125  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0300  transketolase central region  37.81 
 
 
324 aa  194  1e-48  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0477096 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2032  Transketolase domain protein  39.04 
 
 
318 aa  194  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.262756  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1277  Transketolase central region  39.47 
 
 
313 aa  194  2e-48  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5637  transketolase subunit B  38.28 
 
 
307 aa  193  3e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2646  Transketolase domain protein  37.5 
 
 
314 aa  192  5e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0477221  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2041  transketolase central region  36.49 
 
 
330 aa  192  6e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.522483 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0338  Transketolase central region  38.44 
 
 
319 aa  191  1e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0718  transketolase, central region  37.06 
 
 
334 aa  191  1e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1462  transketolase subunit B  36.59 
 
 
332 aa  190  2e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.304967 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3312  Transketolase central region  35.67 
 
 
332 aa  190  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5275  transketolase, central region  37.58 
 
 
335 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.181452  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2126  Transketolase domain protein  38.98 
 
 
320 aa  188  9e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.764032  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2918  transketolase, C-terminal subunit  39.93 
 
 
314 aa  188  1e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2613  transketolase central region  35.13 
 
 
333 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0875571  normal  0.474338 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3074  transketolase, central region  41.72 
 
 
313 aa  187  2e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0289222  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5659  Transketolase central region  36.39 
 
 
333 aa  186  3e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.252415  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0407  transketolase central region  37.71 
 
 
323 aa  186  5e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0194561  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0334  Transketolase central region  36.25 
 
 
308 aa  185  8e-46  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2718  transketolase subunit B  35.76 
 
 
340 aa  185  8e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1078  deoxyxylulose-5-phosphate synthase  36.77 
 
 
635 aa  183  4.0000000000000006e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0303047  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3397  Transketolase central region  35.74 
 
 
298 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3248  putative transketolase, C-terminal subunit  35.86 
 
 
314 aa  182  5.0000000000000004e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2800  Transketolase central region  37.41 
 
 
320 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3618  transketolase subunit B  34.29 
 
 
331 aa  182  6e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.189872  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2092  transketolase central region  34.71 
 
 
339 aa  182  7e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.147262 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2367  Transketolase central region  34.71 
 
 
339 aa  182  7e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.438048  normal  0.0327946 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3382  transketolase domain-containing protein  35.52 
 
 
314 aa  182  8.000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1997  Transketolase central region  35.67 
 
 
321 aa  182  9.000000000000001e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00329881 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3364  Transketolase domain protein  33.88 
 
 
317 aa  179  4.999999999999999e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3269  transketolase subunit B  33.33 
 
 
337 aa  178  9e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.444228 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1468  Transketolase central region  34.74 
 
 
314 aa  176  4e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14551  transketolase C-terminal subunit  36 
 
 
304 aa  176  4e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4275  transketolase central region  33.97 
 
 
338 aa  176  5e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6139  Transketolase central region  35.58 
 
 
332 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.47666  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0261  Transketolase central region  34.39 
 
 
339 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.885505 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3642  Transketolase central region  32.36 
 
 
307 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1539  transketolase central region  33.12 
 
 
348 aa  173  2.9999999999999996e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.844968  normal  0.490255 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>