More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5637 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5637  transketolase subunit B  100 
 
 		 307 aa  635    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14551  transketolase C-terminal subunit  47.04 
 
 		 304 aa  283  3.0000000000000004e-75  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3397  Transketolase central region  40.27 
 
 		 298 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0293  putative transketolase, C-terminal subunit  39.41 
 
 		 314 aa  222  8e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0288  transketolase  39.41 
 
 		 314 aa  222  8e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000211069  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0244  Transketolase central region  39.27 
 
 		 305 aa  218  7e-56  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.304733  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0365  transketolase central region  38.11 
 
 		 312 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.556876  normal  0.0129681 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0471  transketolase subunit B  38.44 
 
 		 312 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0285277  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1505  transketolase central region  39.16 
 
 		 314 aa  215  9.999999999999999e-55  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0385912  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1058  transketolase subunit B  39.58 
 
 		 308 aa  214  1.9999999999999998e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.847424 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1130  transketolase central region  41.09 
 
 		 336 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0969  transketolase, central region  41.95 
 
 		 306 aa  212  4.9999999999999996e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86113  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1554  transketolase central region  37.13 
 
 		 312 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0600642  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0438  transketolase central region  36.57 
 
 		 312 aa  210  2e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0397028  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3967  Transketolase central region  42.47 
 
 		 313 aa  211  2e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000645501  unclonable  0.000000000133165 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2287  transketolase central region  36.16 
 
 		 305 aa  207  1e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0280  Transketolase central region  39.02 
 
 		 310 aa  206  3e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.741894  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1381  Transketolase central region  38.02 
 
 		 306 aa  206  4e-52  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0492  transketolase, central region  39.87 
 
 		 312 aa  204  1e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2254  Transketolase domain protein  37.83 
 
 		 318 aa  204  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.655402  normal  0.0447096 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0265  Transketolase central region  39.02 
 
 		 310 aa  204  1e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00214892 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1895  transketolase, C-terminal subunit  38.41 
 
 		 318 aa  201  9e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00759771 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2019  Transketolase central region  39.18 
 
 		 320 aa  200  3e-50  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.6126  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2513  transketolase subunit B  37.7 
 
 		 322 aa  200  3e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4221  transketolase subunit B  43.14 
 
 		 307 aa  199  3.9999999999999996e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1860  Transketolase central region  39.22 
 
 		 321 aa  199  5e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3949  Transketolase domain protein  39.13 
 
 		 338 aa  198  1.0000000000000001e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0049  transketolase, central region  40.48 
 
 		 317 aa  195  6e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2935  Transketolase central region  37.02 
 
 		 317 aa  195  9e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0173  Transketolase central region  38.98 
 
 		 313 aa  195  9e-49  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2126  Transketolase domain protein  36.04 
 
 		 320 aa  194  1e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.764032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1527  Transketolase central region  37.46 
 
 		 319 aa  195  1e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00875  transketolase, C-terminal subunit  37.01 
 
 		 317 aa  193  3e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0333  Transketolase central region  36.36 
 
 		 322 aa  192  4e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2705  transketolase subunit B  39.87 
 
 		 311 aa  192  4e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000194197  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0894  transketolase subunit B  42.15 
 
 		 314 aa  192  5e-48  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1078  deoxyxylulose-5-phosphate synthase  37.09 
 
 		 635 aa  192  5e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0303047  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2077  transketolase, central region  40.79 
 
 		 308 aa  192  7e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0975  Transketolase central region  35.76 
 
 		 317 aa  192  8e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.127122  normal  0.063318 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2110  transketolase, central region  37.87 
 
 		 314 aa  192  8e-48  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.44874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3129  transketolase domain-containing protein  35.93 
 
 		 322 aa  191  2e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4663  transketolase central region  39.05 
 
 		 328 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0873  Transketolase central region  38.06 
 
 		 319 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.199119  hitchhiker  0.00317558 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1775  transketolase, central region  37.87 
 
 		 314 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2213  transketolase subunit B  35.55 
 
 		 317 aa  190  2.9999999999999997e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000528401  hitchhiker  0.000741425 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2032  Transketolase domain protein  37.07 
 
 		 318 aa  189  7e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.262756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0552  transketolase subunit B  41.3 
 
 		 314 aa  188  9e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0244  transketolase-like protein  36.21 
 
 		 311 aa  187  2e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1792  transketolase subunit B  38.11 
 
 		 310 aa  187  2e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0510195  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2800  Transketolase central region  35.64 
 
 		 320 aa  187  3e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2444  transketolase subunit B  35 
 
 		 313 aa  186  5e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4744  Transketolase central region  39.12 
 
 		 311 aa  185  9e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2719  transketolase, C-terminal subunit  40.98 
 
 		 311 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3074  transketolase, central region  43.96 
 
 		 313 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0289222  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0789  transketolase central region  37.87 
 
 		 314 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0407  transketolase central region  35.41 
 
 		 323 aa  183  3e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0194561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1178  Transketolase central region  37.26 
 
 		 327 aa  183  3e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0058066  normal  0.0131189 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1878  transketolase subunit B  32.25 
 
 		 312 aa  182  5.0000000000000004e-45  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1923  transketolase domain-containing protein  38.28 
 
 		 315 aa  181  1e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6295  Transketolase central region  36.27 
 
 		 332 aa  181  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2059  Transketolase central region  35.88 
 
 		 313 aa  181  2e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0881  Transketolase central region  35.92 
 
 		 327 aa  180  2e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000876605  normal  0.0478781 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0809  transketolase central region  34.44 
 
 		 592 aa  181  2e-44  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.32467  normal  0.55266 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0874  Transketolase central region  35.95 
 
 		 326 aa  180  2.9999999999999997e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1173  Transketolase central region  36.6 
 
 		 327 aa  179  4.999999999999999e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000000393635  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3362  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  34.88 
 
 		 635 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1018  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  36.7 
 
 		 637 aa  179  5.999999999999999e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09040  transketolase subunit B  40.07 
 
 		 315 aa  179  5.999999999999999e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.28283  normal  0.0525296 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1192  transketolase-like  35.95 
 
 		 327 aa  177  2e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.101787  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0470  Transketolase central region  39.41 
 
 		 318 aa  176  3e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1852  deoxyxylulose-5-phosphate synthase  35.62 
 
 		 640 aa  177  3e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1764  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  36.88 
 
 		 626 aa  176  4e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0479282  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0300  transketolase central region  34.59 
 
 		 324 aa  175  9e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0477096 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0883  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  33.55 
 
 		 635 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000207097 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05490  transketolase subunit B  34.87 
 
 		 325 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.948034 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2822  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  36.09 
 
 		 635 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.553695  normal  0.10664 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1418  deoxyxylulose-5-phosphate synthase  34.31 
 
 		 646 aa  174  1.9999999999999998e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.793105  normal  0.333041 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0860  Transketolase domain protein  34.67 
 
 		 310 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.476833  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1286  transketolase-like  33.87 
 
 		 327 aa  173  3.9999999999999995e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.290354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0237  transketolase subunit B  38.28 
 
 		 311 aa  173  3.9999999999999995e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1061  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  37.41 
 
 		 627 aa  172  5e-42  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00520521  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2041  transketolase central region  33.44 
 
 		 330 aa  172  5e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.522483 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1277  Transketolase central region  34.62 
 
 		 313 aa  171  1e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1468  Transketolase central region  32.44 
 
 		 314 aa  171  1e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1170  transketolase subunit B  33.86 
 
 		 326 aa  171  1e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000103125  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5659  Transketolase central region  36.5 
 
 		 333 aa  171  1e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.252415  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0183  Transketolase central region  35.02 
 
 		 320 aa  171  1e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2402  transketolase, C-terminal subunit  33.82 
 
 		 310 aa  170  2e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.730568  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2182  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  36.03 
 
 		 625 aa  171  2e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0455646  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1191  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  34.8 
 
 		 624 aa  171  2e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2918  transketolase, C-terminal subunit  38.33 
 
 		 314 aa  170  3e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1044  deoxyxylulose-5-phosphate synthase  35.62 
 
 		 618 aa  170  3e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.213907  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06530  deoxyxylulose-5-phosphate synthase  34.66 
 
 		 636 aa  169  5e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000553997  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2235  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  36.67 
 
 		 622 aa  168  1e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.77755  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1997  Transketolase central region  36.39 
 
 		 321 aa  167  2e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00329881 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1694  1-Deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  32.89 
 
 		 631 aa  167  2.9999999999999998e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.134316  normal  0.0277937 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0686  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  35.4 
 
 		 637 aa  166  4e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.351489  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09541  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  34.32 
 
 		 629 aa  166  4e-40  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.277651  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0652  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  34 
 
 		 631 aa  165  9e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1430  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  33.22 
 
 		 643 aa  164  2.0000000000000002e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0817623 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>