More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6295 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6295  Transketolase central region  100 
 
 		 332 aa  662    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0293  putative transketolase, C-terminal subunit  43.32 
 
 		 314 aa  241  1e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0288  transketolase  43.32 
 
 		 314 aa  241  1e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000211069  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0969  transketolase, central region  40.07 
 
 		 306 aa  241  1e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86113  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1860  Transketolase central region  47.68 
 
 		 321 aa  235  8e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2213  transketolase subunit B  43.29 
 
 		 317 aa  233  5e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000528401  hitchhiker  0.000741425 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3967  Transketolase central region  45.4 
 
 		 313 aa  228  8e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000645501  unclonable  0.000000000133165 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0244  transketolase-like protein  41.21 
 
 		 311 aa  223  4e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1381  Transketolase central region  40.13 
 
 		 306 aa  222  6e-57  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1130  transketolase central region  42.44 
 
 		 336 aa  222  7e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2719  transketolase, C-terminal subunit  44.73 
 
 		 311 aa  221  9.999999999999999e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2077  transketolase, central region  46.23 
 
 		 308 aa  221  1.9999999999999999e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0492  transketolase, central region  40.19 
 
 		 312 aa  219  6e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0173  Transketolase central region  43.04 
 
 		 313 aa  217  2e-55  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0265  Transketolase central region  38.76 
 
 		 310 aa  217  2e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00214892 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0280  Transketolase central region  38.76 
 
 		 310 aa  216  4e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.741894  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4744  Transketolase central region  43.24 
 
 		 311 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0470  Transketolase central region  46.3 
 
 		 318 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0333  Transketolase central region  40.5 
 
 		 322 aa  213  4.9999999999999996e-54  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0244  Transketolase central region  37.17 
 
 		 305 aa  213  4.9999999999999996e-54  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.304733  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05490  transketolase subunit B  39.87 
 
 		 325 aa  206  4e-52  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.948034 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1527  Transketolase central region  37.42 
 
 		 319 aa  206  6e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1178  Transketolase central region  39.87 
 
 		 327 aa  204  1e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0058066  normal  0.0131189 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0552  transketolase subunit B  41.56 
 
 		 314 aa  204  2e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1058  transketolase subunit B  42.61 
 
 		 308 aa  204  2e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.847424 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09040  transketolase subunit B  39.68 
 
 		 315 aa  204  2e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.28283  normal  0.0525296 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3074  transketolase, central region  44.12 
 
 		 313 aa  203  3e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0289222  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4663  transketolase central region  43.23 
 
 		 328 aa  203  4e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1505  transketolase central region  35.06 
 
 		 314 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0385912  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2444  transketolase subunit B  36.77 
 
 		 313 aa  199  6e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2254  Transketolase domain protein  41.39 
 
 		 318 aa  198  9e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.655402  normal  0.0447096 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2705  transketolase subunit B  40.89 
 
 		 311 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000194197  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1923  transketolase domain-containing protein  35.53 
 
 		 315 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0711  Transketolase central region  36.24 
 
 		 315 aa  196  4.0000000000000005e-49  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00000202012  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2059  Transketolase central region  36.48 
 
 		 313 aa  196  6e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3129  transketolase domain-containing protein  41.31 
 
 		 322 aa  194  2e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1997  Transketolase central region  39.68 
 
 		 321 aa  193  3e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00329881 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3949  Transketolase domain protein  40.73 
 
 		 338 aa  193  4e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0881  Transketolase central region  37.99 
 
 		 327 aa  192  7e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000876605  normal  0.0478781 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0237  transketolase subunit B  42.9 
 
 		 311 aa  192  8e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0975  Transketolase central region  36.04 
 
 		 317 aa  192  9e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.127122  normal  0.063318 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1170  transketolase subunit B  37.66 
 
 		 326 aa  191  1e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000103125  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5637  transketolase subunit B  36.93 
 
 		 307 aa  191  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2019  Transketolase central region  36.04 
 
 		 320 aa  191  2e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.6126  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0183  Transketolase central region  34.3 
 
 		 320 aa  190  2.9999999999999997e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0300  transketolase central region  35.6 
 
 		 324 aa  189  5e-47  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0477096 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0471  transketolase subunit B  35.37 
 
 		 312 aa  189  5.999999999999999e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0285277  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2032  Transketolase domain protein  42.96 
 
 		 318 aa  189  8e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.262756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1286  transketolase-like  37.34 
 
 		 327 aa  188  9e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.290354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1192  transketolase-like  36.04 
 
 		 327 aa  187  2e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.101787  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0873  Transketolase central region  34.39 
 
 		 319 aa  186  4e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.199119  hitchhiker  0.00317558 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0874  Transketolase central region  36.69 
 
 		 326 aa  186  5e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2918  transketolase, C-terminal subunit  40.68 
 
 		 314 aa  182  9.000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1895  transketolase, C-terminal subunit  35.39 
 
 		 318 aa  182  9.000000000000001e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00759771 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00875  transketolase, C-terminal subunit  35.39 
 
 		 317 aa  182  9.000000000000001e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0407  transketolase central region  43.13 
 
 		 323 aa  181  1e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0194561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1173  Transketolase central region  36.69 
 
 		 327 aa  181  2e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000000393635  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2513  transketolase subunit B  40.46 
 
 		 322 aa  181  2e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0438  transketolase central region  31.11 
 
 		 312 aa  181  2e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0397028  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0365  transketolase central region  33.87 
 
 		 312 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.556876  normal  0.0129681 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1554  transketolase central region  33.87 
 
 		 312 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0600642  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2800  Transketolase central region  34.74 
 
 		 320 aa  179  4.999999999999999e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2935  Transketolase central region  34.95 
 
 		 317 aa  179  7e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2126  Transketolase domain protein  34.65 
 
 		 320 aa  179  9e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.764032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3364  Transketolase domain protein  34.46 
 
 		 317 aa  177  2e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1146  Transketolase domain protein  33.88 
 
 		 319 aa  177  2e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1878  transketolase subunit B  35.43 
 
 		 312 aa  176  3e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5659  Transketolase central region  39.47 
 
 		 333 aa  177  3e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.252415  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0049  transketolase, central region  35.71 
 
 		 317 aa  176  4e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0334  Transketolase central region  39.61 
 
 		 308 aa  176  7e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3397  Transketolase central region  34.9 
 
 		 298 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0860  Transketolase domain protein  35.18 
 
 		 310 aa  173  3.9999999999999995e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.476833  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3878  transketolase, central region  34.37 
 
 		 342 aa  172  5e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.733485  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0338  Transketolase central region  37.38 
 
 		 319 aa  171  1e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0901  transketolase, central region  38.24 
 
 		 336 aa  171  2e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1717  Transketolase central region  36.84 
 
 		 347 aa  169  6e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2842  transketolase subunit B  35.2 
 
 		 317 aa  169  6e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.837175  normal  0.299247 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1277  Transketolase central region  34.28 
 
 		 313 aa  169  9e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2041  transketolase central region  37.22 
 
 		 330 aa  168  1e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.522483 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2581  transketolase domain-containing protein  37.36 
 
 		 317 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.230809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2689  transketolase domain-containing protein  37.36 
 
 		 317 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.423567 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2526  transketolase domain protein  36.98 
 
 		 317 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.508569 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1792  transketolase subunit B  36.69 
 
 		 310 aa  167  2.9999999999999998e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0510195  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0809  transketolase central region  34.33 
 
 		 592 aa  166  5.9999999999999996e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.32467  normal  0.55266 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14551  transketolase C-terminal subunit  33 
 
 		 304 aa  166  6.9999999999999995e-40  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2481  transketolase domain protein  36.98 
 
 		 317 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.120495  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1775  transketolase, central region  35.86 
 
 		 314 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2569  transketolase domain protein  36.6 
 
 		 317 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.126502  normal  0.742091 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1462  transketolase subunit B  38.83 
 
 		 332 aa  164  2.0000000000000002e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.304967 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0342  Transketolase domain protein  37.21 
 
 		 321 aa  163  4.0000000000000004e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.276697 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0789  transketolase central region  37.33 
 
 		 314 aa  162  7e-39  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0200  transketolase, C-terminal subunit  31.35 
 
 		 309 aa  159  4e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2110  transketolase, central region  34.88 
 
 		 314 aa  158  1e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.44874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3958  transketolase subunit B  36.79 
 
 		 340 aa  158  1e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.158278  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4991  transketolase central region  37.25 
 
 		 332 aa  157  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.908463 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4834  transketolase central region  37.19 
 
 		 333 aa  156  5.0000000000000005e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0718  transketolase, central region  36.51 
 
 		 334 aa  156  5.0000000000000005e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3269  transketolase subunit B  36.75 
 
 		 337 aa  155  7e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.444228 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5275  transketolase, central region  36.01 
 
 		 335 aa  155  7e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.181452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1539  transketolase central region  36.75 
 
 		 348 aa  155  8e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.844968  normal  0.490255 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>