More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG0200 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004116  SAG0200  transketolase, C-terminal subunit  100 
 
 		 309 aa  632  1e-180  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2581  transketolase domain-containing protein  44.74 
 
 		 317 aa  267  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.230809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2689  transketolase domain-containing protein  44.74 
 
 		 317 aa  267  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.423567 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2481  transketolase domain protein  44.74 
 
 		 317 aa  267  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.120495  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2842  transketolase subunit B  44.08 
 
 		 317 aa  265  5.999999999999999e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.837175  normal  0.299247 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2526  transketolase domain protein  44.41 
 
 		 317 aa  265  7e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.508569 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2569  transketolase domain protein  44.41 
 
 		 317 aa  265  8.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.126502  normal  0.742091 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3364  Transketolase domain protein  45.21 
 
 		 317 aa  265  1e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1146  Transketolase domain protein  41.45 
 
 		 319 aa  224  2e-57  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0244  transketolase-like protein  38.94 
 
 		 311 aa  207  1e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3967  Transketolase central region  39.93 
 
 		 313 aa  206  4e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000645501  unclonable  0.000000000133165 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2213  transketolase subunit B  36.27 
 
 		 317 aa  204  2e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000528401  hitchhiker  0.000741425 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0969  transketolase, central region  38.33 
 
 		 306 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86113  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1381  Transketolase central region  37.46 
 
 		 306 aa  197  3e-49  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0492  transketolase, central region  37.42 
 
 		 312 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1860  Transketolase central region  37.42 
 
 		 321 aa  195  7e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0293  putative transketolase, C-terminal subunit  37.87 
 
 		 314 aa  195  8.000000000000001e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0288  transketolase  37.87 
 
 		 314 aa  195  8.000000000000001e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000211069  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0280  Transketolase central region  35.76 
 
 		 310 aa  194  2e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.741894  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0265  Transketolase central region  35.76 
 
 		 310 aa  192  7e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00214892 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0873  Transketolase central region  34.97 
 
 		 319 aa  189  5.999999999999999e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.199119  hitchhiker  0.00317558 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0244  Transketolase central region  34.43 
 
 		 305 aa  181  1e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.304733  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2719  transketolase, C-terminal subunit  37.21 
 
 		 311 aa  181  2e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0438  transketolase central region  34.42 
 
 		 312 aa  176  4e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0397028  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0183  Transketolase central region  35.45 
 
 		 320 aa  176  6e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0470  Transketolase central region  38.39 
 
 		 318 aa  175  8e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0173  Transketolase central region  33.99 
 
 		 313 aa  175  9e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1505  transketolase central region  33 
 
 		 314 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0385912  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1554  transketolase central region  33.86 
 
 		 312 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0600642  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0300  transketolase central region  33.01 
 
 		 324 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0477096 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0552  transketolase subunit B  36.09 
 
 		 314 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0333  Transketolase central region  33.11 
 
 		 322 aa  172  7.999999999999999e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09040  transketolase subunit B  33.87 
 
 		 315 aa  171  1e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.28283  normal  0.0525296 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1895  transketolase, C-terminal subunit  32.35 
 
 		 318 aa  171  1e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00759771 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2077  transketolase, central region  37.38 
 
 		 308 aa  171  2e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2059  Transketolase central region  34.43 
 
 		 313 aa  171  2e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2935  Transketolase central region  34.84 
 
 		 317 aa  170  3e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1178  Transketolase central region  33.45 
 
 		 327 aa  169  4e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0058066  normal  0.0131189 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0471  transketolase subunit B  33.23 
 
 		 312 aa  170  4e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0285277  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0365  transketolase central region  33.23 
 
 		 312 aa  169  7e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.556876  normal  0.0129681 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4744  Transketolase central region  35.03 
 
 		 311 aa  168  8e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1527  Transketolase central region  32.21 
 
 		 319 aa  168  1e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1286  transketolase-like  32.33 
 
 		 327 aa  166  4e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.290354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3074  transketolase, central region  36.88 
 
 		 313 aa  166  5.9999999999999996e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0289222  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1192  transketolase-like  33.11 
 
 		 327 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.101787  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0237  transketolase subunit B  34.67 
 
 		 311 aa  164  2.0000000000000002e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0881  Transketolase central region  32 
 
 		 327 aa  163  3e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000876605  normal  0.0478781 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05490  transketolase subunit B  32.03 
 
 		 325 aa  163  3e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.948034 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1170  transketolase subunit B  33.44 
 
 		 326 aa  163  4.0000000000000004e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000103125  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00875  transketolase, C-terminal subunit  31.58 
 
 		 317 aa  162  6e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2019  Transketolase central region  33.01 
 
 		 320 aa  162  6e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.6126  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3878  transketolase, central region  30.29 
 
 		 342 aa  162  7e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.733485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1173  Transketolase central region  32.67 
 
 		 327 aa  162  7e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000000393635  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0711  Transketolase central region  31.41 
 
 		 315 aa  162  8.000000000000001e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00000202012  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2513  transketolase subunit B  35.17 
 
 		 322 aa  161  2e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0049  transketolase, central region  32.9 
 
 		 317 aa  160  2e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2705  transketolase subunit B  34.83 
 
 		 311 aa  160  2e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000194197  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0874  Transketolase central region  32.33 
 
 		 326 aa  160  3e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0860  Transketolase domain protein  32.77 
 
 		 310 aa  159  4e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.476833  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0975  Transketolase central region  30.79 
 
 		 317 aa  159  7e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.127122  normal  0.063318 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1997  Transketolase central region  33.33 
 
 		 321 aa  159  7e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00329881 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1468  Transketolase central region  33.11 
 
 		 314 aa  158  1e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2918  transketolase, C-terminal subunit  35.1 
 
 		 314 aa  156  4e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5637  transketolase subunit B  33.33 
 
 		 307 aa  154  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1792  transketolase subunit B  31.48 
 
 		 310 aa  153  2.9999999999999998e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0510195  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6295  Transketolase central region  31.35 
 
 		 332 aa  153  4e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4834  transketolase central region  31.79 
 
 		 333 aa  152  5.9999999999999996e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2254  Transketolase domain protein  30.07 
 
 		 318 aa  149  7e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.655402  normal  0.0447096 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4663  transketolase central region  32.98 
 
 		 328 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1130  transketolase central region  32.12 
 
 		 336 aa  145  1e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3949  Transketolase domain protein  30.26 
 
 		 338 aa  143  3e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2444  transketolase subunit B  31.89 
 
 		 313 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0334  Transketolase central region  32.46 
 
 		 308 aa  139  3.9999999999999997e-32  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2032  Transketolase domain protein  30.14 
 
 		 318 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.262756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1713  transketolase central region  30.1 
 
 		 332 aa  138  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.548893  normal  0.0621953 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3958  transketolase subunit B  31.72 
 
 		 340 aa  138  1e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.158278  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1923  transketolase domain-containing protein  30.07 
 
 		 315 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1717  Transketolase central region  28.87 
 
 		 347 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1058  transketolase subunit B  30.65 
 
 		 308 aa  136  5e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.847424 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5659  Transketolase central region  31.38 
 
 		 333 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.252415  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0809  transketolase central region  31.48 
 
 		 592 aa  134  9.999999999999999e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.32467  normal  0.55266 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2381  transketolase  30.39 
 
 		 621 aa  135  9.999999999999999e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.652214  normal  0.294409 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3488  deoxyxylulose-5-phosphate synthase  32.44 
 
 		 631 aa  134  3e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0451312  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0407  transketolase central region  28.85 
 
 		 323 aa  133  3e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0194561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1775  transketolase, central region  28.42 
 
 		 314 aa  132  5e-30  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0789  transketolase central region  28.42 
 
 		 314 aa  133  5e-30  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2110  transketolase, central region  28.52 
 
 		 314 aa  132  6.999999999999999e-30  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.44874  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3397  Transketolase central region  28.08 
 
 		 298 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3129  transketolase domain-containing protein  28.14 
 
 		 322 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0406  Transketolase central region  31.38 
 
 		 343 aa  130  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1878  transketolase subunit B  28.88 
 
 		 312 aa  131  2.0000000000000002e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2744  transketolase central region  30.85 
 
 		 342 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0728122  normal  0.0592981 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3269  transketolase subunit B  28.33 
 
 		 337 aa  130  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.444228 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0486  Transketolase domain protein  31.72 
 
 		 313 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1078  deoxyxylulose-5-phosphate synthase  31.23 
 
 		 635 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0303047  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2041  transketolase central region  30.82 
 
 		 330 aa  129  5.0000000000000004e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.522483 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0419  transketolase central region  31.27 
 
 		 630 aa  129  6e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.218492  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36720  transketolase  32.95 
 
 		 614 aa  129  7.000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.148891  normal  0.641961 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0894  transketolase subunit B  28.67 
 
 		 314 aa  129  7.000000000000001e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0901  transketolase, central region  28.62 
 
 		 336 aa  129  9.000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>