More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_09040 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_09040  transketolase subunit B  100 
 
 		 315 aa  635    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.28283  normal  0.0525296 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05490  transketolase subunit B  76.6 
 
 		 325 aa  479  1e-134  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.948034 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1997  Transketolase central region  74.36 
 
 		 321 aa  446  1.0000000000000001e-124  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00329881 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2213  transketolase subunit B  53.31 
 
 		 317 aa  348  7e-95  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000528401  hitchhiker  0.000741425 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0334  Transketolase central region  60.33 
 
 		 308 aa  327  2.0000000000000001e-88  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3967  Transketolase central region  53.05 
 
 		 313 aa  325  5e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000645501  unclonable  0.000000000133165 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0969  transketolase, central region  52.65 
 
 		 306 aa  323  2e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86113  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0492  transketolase, central region  51.14 
 
 		 312 aa  317  1e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0280  Transketolase central region  49.35 
 
 		 310 aa  317  2e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.741894  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0265  Transketolase central region  49.35 
 
 		 310 aa  315  6e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00214892 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1860  Transketolase central region  51.14 
 
 		 321 aa  315  7e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1895  transketolase, C-terminal subunit  48.71 
 
 		 318 aa  314  9.999999999999999e-85  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00759771 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00875  transketolase, C-terminal subunit  51.13 
 
 		 317 aa  310  1e-83  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0333  Transketolase central region  49.51 
 
 		 322 aa  309  4e-83  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0873  Transketolase central region  48.54 
 
 		 319 aa  306  3e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.199119  hitchhiker  0.00317558 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0244  transketolase-like protein  46.45 
 
 		 311 aa  304  1.0000000000000001e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1505  transketolase central region  49.03 
 
 		 314 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0385912  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2059  Transketolase central region  47.59 
 
 		 313 aa  303  2.0000000000000002e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0711  Transketolase central region  45.34 
 
 		 315 aa  302  5.000000000000001e-81  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00000202012  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1381  Transketolase central region  50.17 
 
 		 306 aa  301  7.000000000000001e-81  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4744  Transketolase central region  52.22 
 
 		 311 aa  301  7.000000000000001e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2019  Transketolase central region  48.87 
 
 		 320 aa  301  9e-81  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.6126  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2719  transketolase, C-terminal subunit  51.79 
 
 		 311 aa  300  3e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0881  Transketolase central region  47.13 
 
 		 327 aa  298  8e-80  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000876605  normal  0.0478781 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0438  transketolase central region  47.6 
 
 		 312 aa  298  8e-80  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0397028  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2705  transketolase subunit B  48.87 
 
 		 311 aa  296  2e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000194197  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0975  Transketolase central region  47.42 
 
 		 317 aa  296  4e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.127122  normal  0.063318 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0552  transketolase subunit B  50.16 
 
 		 314 aa  295  5e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0237  transketolase subunit B  52.58 
 
 		 311 aa  295  5e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0244  Transketolase central region  46.71 
 
 		 305 aa  295  6e-79  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.304733  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0183  Transketolase central region  46.15 
 
 		 320 aa  295  7e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0470  Transketolase central region  51.92 
 
 		 318 aa  294  1e-78  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2077  transketolase, central region  52.12 
 
 		 308 aa  294  2e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1178  Transketolase central region  47.23 
 
 		 327 aa  292  5e-78  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0058066  normal  0.0131189 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3074  transketolase, central region  53.7 
 
 		 313 aa  292  5e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0289222  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2935  Transketolase central region  47.74 
 
 		 317 aa  291  1e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0874  Transketolase central region  45.37 
 
 		 326 aa  291  1e-77  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0293  putative transketolase, C-terminal subunit  46.3 
 
 		 314 aa  291  1e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0288  transketolase  46.3 
 
 		 314 aa  291  1e-77  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000211069  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0471  transketolase subunit B  47.23 
 
 		 312 aa  291  1e-77  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0285277  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0049  transketolase, central region  50.65 
 
 		 317 aa  289  3e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1170  transketolase subunit B  45.37 
 
 		 326 aa  287  2e-76  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000103125  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0365  transketolase central region  46.25 
 
 		 312 aa  287  2e-76  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.556876  normal  0.0129681 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1286  transketolase-like  45.54 
 
 		 327 aa  286  2.9999999999999996e-76  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.290354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0300  transketolase central region  44.27 
 
 		 324 aa  286  4e-76  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0477096 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1554  transketolase central region  46.25 
 
 		 312 aa  286  4e-76  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0600642  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0173  Transketolase central region  49.03 
 
 		 313 aa  283  2.0000000000000002e-75  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1192  transketolase-like  44.9 
 
 		 327 aa  283  3.0000000000000004e-75  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.101787  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2918  transketolase, C-terminal subunit  49.35 
 
 		 314 aa  282  5.000000000000001e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1173  Transketolase central region  45.54 
 
 		 327 aa  282  6.000000000000001e-75  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000000393635  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1527  Transketolase central region  43.87 
 
 		 319 aa  258  9e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0860  Transketolase domain protein  43.55 
 
 		 310 aa  250  2e-65  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.476833  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1878  transketolase subunit B  42.3 
 
 		 312 aa  242  6e-63  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2254  Transketolase domain protein  43.93 
 
 		 318 aa  241  7.999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.655402  normal  0.0447096 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1130  transketolase central region  42.24 
 
 		 336 aa  238  1e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0338  Transketolase central region  45.28 
 
 		 319 aa  233  3e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3878  transketolase, central region  40.98 
 
 		 342 aa  231  1e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.733485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0809  transketolase central region  43.61 
 
 		 592 aa  230  2e-59  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.32467  normal  0.55266 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1792  transketolase subunit B  42.33 
 
 		 310 aa  229  6e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0510195  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1277  Transketolase central region  41.42 
 
 		 313 aa  227  2e-58  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4663  transketolase central region  42.95 
 
 		 328 aa  227  3e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1468  Transketolase central region  39.56 
 
 		 314 aa  220  1.9999999999999999e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5659  Transketolase central region  41.95 
 
 		 333 aa  219  3e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.252415  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3129  transketolase domain-containing protein  42.95 
 
 		 322 aa  219  5e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2444  transketolase subunit B  38.06 
 
 		 313 aa  218  8.999999999999998e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2032  Transketolase domain protein  43.28 
 
 		 318 aa  218  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.262756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3364  Transketolase domain protein  37.25 
 
 		 317 aa  213  2.9999999999999995e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0789  transketolase central region  41.5 
 
 		 314 aa  212  4.9999999999999996e-54  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0486  Transketolase domain protein  41.22 
 
 		 313 aa  212  4.9999999999999996e-54  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2041  transketolase central region  41.53 
 
 		 330 aa  211  1e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.522483 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2513  transketolase subunit B  41.47 
 
 		 322 aa  211  1e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1775  transketolase, central region  41.83 
 
 		 314 aa  210  2e-53  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2569  transketolase domain protein  38.08 
 
 		 317 aa  208  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.126502  normal  0.742091 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0894  transketolase subunit B  44.3 
 
 		 314 aa  207  1e-52  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2842  transketolase subunit B  37.75 
 
 		 317 aa  207  1e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.837175  normal  0.299247 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2481  transketolase domain protein  38.08 
 
 		 317 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.120495  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2110  transketolase, central region  41.5 
 
 		 314 aa  207  2e-52  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.44874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2581  transketolase domain-containing protein  37.75 
 
 		 317 aa  206  5e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.230809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2689  transketolase domain-containing protein  37.75 
 
 		 317 aa  206  5e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.423567 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2526  transketolase domain protein  37.75 
 
 		 317 aa  206  6e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.508569 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0407  transketolase central region  39.4 
 
 		 323 aa  204  2e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0194561  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3949  Transketolase domain protein  37.87 
 
 		 338 aa  203  4e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6295  Transketolase central region  39.35 
 
 		 332 aa  200  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5275  transketolase, central region  38.59 
 
 		 335 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.181452  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0419  transketolase central region  38.68 
 
 		 630 aa  199  6e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.218492  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1539  transketolase central region  38.49 
 
 		 348 aa  198  1.0000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.844968  normal  0.490255 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3312  Transketolase central region  37.5 
 
 		 332 aa  196  5.000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1923  transketolase domain-containing protein  37.46 
 
 		 315 aa  195  8.000000000000001e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2718  transketolase subunit B  37.9 
 
 		 340 aa  193  4e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2367  Transketolase central region  38.39 
 
 		 339 aa  192  4e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.438048  normal  0.0327946 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2092  transketolase central region  38.39 
 
 		 339 aa  192  4e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.147262 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2646  Transketolase domain protein  37.54 
 
 		 314 aa  192  5e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0477221  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1146  Transketolase domain protein  36.64 
 
 		 319 aa  192  9e-48  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2126  Transketolase domain protein  36.07 
 
 		 320 aa  191  1e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.764032  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0883  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  36.77 
 
 		 635 aa  190  2e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000207097 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36720  transketolase  37.94 
 
 		 614 aa  190  2.9999999999999997e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.148891  normal  0.641961 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5637  transketolase subunit B  40.07 
 
 		 307 aa  189  4e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3248  putative transketolase, C-terminal subunit  37.54 
 
 		 314 aa  189  5e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0718  transketolase, central region  37.74 
 
 		 334 aa  189  5.999999999999999e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0049  transketolase  38.46 
 
 		 626 aa  189  5.999999999999999e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>