More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3129 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_3129  transketolase domain-containing protein  100 
 
 		 322 aa  644    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2254  Transketolase domain protein  80.5 
 
 		 318 aa  510  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.655402  normal  0.0447096 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2032  Transketolase domain protein  80.82 
 
 		 318 aa  480  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.262756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0407  transketolase central region  57.24 
 
 		 323 aa  334  1e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0194561  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0265  Transketolase central region  45.6 
 
 		 310 aa  276  3e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00214892 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0492  transketolase, central region  46.08 
 
 		 312 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0280  Transketolase central region  44.95 
 
 		 310 aa  273  3e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.741894  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0552  transketolase subunit B  47.39 
 
 		 314 aa  253  3e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0969  transketolase, central region  42.14 
 
 		 306 aa  251  1e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86113  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2719  transketolase, C-terminal subunit  46.23 
 
 		 311 aa  248  1e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2019  Transketolase central region  38.71 
 
 		 320 aa  243  3e-63  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.6126  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00875  transketolase, C-terminal subunit  39.74 
 
 		 317 aa  243  3.9999999999999997e-63  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0244  transketolase-like protein  40.97 
 
 		 311 aa  242  5e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2126  Transketolase domain protein  42.99 
 
 		 320 aa  242  7e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.764032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0975  Transketolase central region  39.74 
 
 		 317 aa  241  1e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.127122  normal  0.063318 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0873  Transketolase central region  38.17 
 
 		 319 aa  239  4e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.199119  hitchhiker  0.00317558 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2213  transketolase subunit B  38.76 
 
 		 317 aa  239  5e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000528401  hitchhiker  0.000741425 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2935  Transketolase central region  38.99 
 
 		 317 aa  238  8e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0293  putative transketolase, C-terminal subunit  41.5 
 
 		 314 aa  238  1e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0288  transketolase  41.5 
 
 		 314 aa  238  1e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000211069  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2800  Transketolase central region  40.79 
 
 		 320 aa  237  2e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3967  Transketolase central region  44.44 
 
 		 313 aa  236  5.0000000000000005e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000645501  unclonable  0.000000000133165 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2918  transketolase, C-terminal subunit  46.41 
 
 		 314 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0881  Transketolase central region  39.67 
 
 		 327 aa  233  2.0000000000000002e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000876605  normal  0.0478781 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4744  Transketolase central region  43.3 
 
 		 311 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0183  Transketolase central region  39.86 
 
 		 320 aa  233  3e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2705  transketolase subunit B  41.64 
 
 		 311 aa  233  3e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000194197  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1192  transketolase-like  39.34 
 
 		 327 aa  233  5e-60  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.101787  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0470  Transketolase central region  45.93 
 
 		 318 aa  231  9e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1173  Transketolase central region  39.34 
 
 		 327 aa  231  1e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000000393635  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0874  Transketolase central region  39.02 
 
 		 326 aa  231  1e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1170  transketolase subunit B  39.34 
 
 		 326 aa  231  1e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000103125  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1381  Transketolase central region  38.38 
 
 		 306 aa  230  2e-59  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2077  transketolase, central region  46.53 
 
 		 308 aa  230  2e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0711  Transketolase central region  38.41 
 
 		 315 aa  228  1e-58  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00000202012  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1895  transketolase, C-terminal subunit  36.16 
 
 		 318 aa  228  1e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00759771 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1286  transketolase-like  39.34 
 
 		 327 aa  227  2e-58  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.290354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1527  Transketolase central region  39.74 
 
 		 319 aa  227  2e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2444  transketolase subunit B  39.54 
 
 		 313 aa  227  2e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09040  transketolase subunit B  42.95 
 
 		 315 aa  226  3e-58  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.28283  normal  0.0525296 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1178  Transketolase central region  38.36 
 
 		 327 aa  226  5.0000000000000005e-58  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0058066  normal  0.0131189 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0244  Transketolase central region  38.05 
 
 		 305 aa  225  1e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.304733  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0860  Transketolase domain protein  40 
 
 		 310 aa  221  9.999999999999999e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.476833  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0049  transketolase, central region  38.11 
 
 		 317 aa  221  9.999999999999999e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1130  transketolase central region  41.3 
 
 		 336 aa  220  3e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1860  Transketolase central region  38.83 
 
 		 321 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05490  transketolase subunit B  41.37 
 
 		 325 aa  219  5e-56  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.948034 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0333  Transketolase central region  38.62 
 
 		 322 aa  219  5e-56  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3074  transketolase, central region  45.57 
 
 		 313 aa  218  1e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0289222  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1505  transketolase central region  36.51 
 
 		 314 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0385912  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1878  transketolase subunit B  39.14 
 
 		 312 aa  214  1.9999999999999998e-54  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0438  transketolase central region  36.93 
 
 		 312 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0397028  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2059  Transketolase central region  34.97 
 
 		 313 aa  213  3.9999999999999995e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0300  transketolase central region  36.79 
 
 		 324 aa  213  3.9999999999999995e-54  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0477096 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0338  Transketolase central region  41.45 
 
 		 319 aa  212  7.999999999999999e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2402  transketolase, C-terminal subunit  39.15 
 
 		 310 aa  210  2e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.730568  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0809  transketolase central region  38.28 
 
 		 592 aa  211  2e-53  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.32467  normal  0.55266 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1792  transketolase subunit B  40.07 
 
 		 310 aa  211  2e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0510195  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0471  transketolase subunit B  38.76 
 
 		 312 aa  211  2e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0285277  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1997  Transketolase central region  41.64 
 
 		 321 aa  209  4e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00329881 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2513  transketolase subunit B  39.93 
 
 		 322 aa  207  2e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1554  transketolase central region  38.21 
 
 		 312 aa  207  3e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0600642  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3382  transketolase domain-containing protein  42.97 
 
 		 314 aa  206  5e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3248  putative transketolase, C-terminal subunit  42.58 
 
 		 314 aa  205  7e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2646  Transketolase domain protein  40.07 
 
 		 314 aa  205  8e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0477221  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0365  transketolase central region  37.5 
 
 		 312 aa  205  1e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.556876  normal  0.0129681 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1539  transketolase central region  40.4 
 
 		 348 aa  203  3e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.844968  normal  0.490255 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0173  Transketolase central region  38.85 
 
 		 313 aa  203  4e-51  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3397  Transketolase central region  39.93 
 
 		 298 aa  202  7e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0237  transketolase subunit B  40.2 
 
 		 311 aa  197  2.0000000000000003e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1923  transketolase domain-containing protein  38.59 
 
 		 315 aa  195  9e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5637  transketolase subunit B  35.53 
 
 		 307 aa  194  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3949  Transketolase domain protein  38.78 
 
 		 338 aa  194  2e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1468  Transketolase central region  34.19 
 
 		 314 aa  193  3e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5659  Transketolase central region  38.69 
 
 		 333 aa  191  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.252415  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2110  transketolase, central region  37.58 
 
 		 314 aa  190  2e-47  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.44874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2613  transketolase central region  36.55 
 
 		 333 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0875571  normal  0.474338 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0910  putative transketolase, C-terminal subunit  41.41 
 
 		 310 aa  189  4e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2041  transketolase central region  38.14 
 
 		 330 aa  189  5e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.522483 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3364  Transketolase domain protein  33.44 
 
 		 317 aa  188  8e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4663  transketolase central region  40.15 
 
 		 328 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4991  transketolase central region  37.07 
 
 		 332 aa  186  4e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.908463 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0894  transketolase subunit B  38.61 
 
 		 314 aa  186  5e-46  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2481  transketolase domain protein  37.54 
 
 		 317 aa  185  9e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.120495  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2569  transketolase domain protein  37.54 
 
 		 317 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.126502  normal  0.742091 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3642  Transketolase central region  36.33 
 
 		 307 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6295  Transketolase central region  40.07 
 
 		 332 aa  184  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2581  transketolase domain-containing protein  37.2 
 
 		 317 aa  183  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.230809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1717  Transketolase central region  36.59 
 
 		 347 aa  183  3e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2689  transketolase domain-containing protein  37.2 
 
 		 317 aa  183  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.423567 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4834  transketolase central region  34.44 
 
 		 333 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0718  transketolase, central region  38.18 
 
 		 334 aa  183  4.0000000000000006e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2526  transketolase domain protein  37.2 
 
 		 317 aa  183  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.508569 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0334  Transketolase central region  39.66 
 
 		 308 aa  183  4.0000000000000006e-45  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1058  transketolase subunit B  42.51 
 
 		 308 aa  182  5.0000000000000004e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.847424 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2744  transketolase central region  38.46 
 
 		 342 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0728122  normal  0.0592981 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3528  Transketolase central region  37.16 
 
 		 306 aa  182  8.000000000000001e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.605284  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2699  transketolase subunit B  37.59 
 
 		 288 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3269  transketolase subunit B  36 
 
 		 337 aa  181  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.444228 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1775  transketolase, central region  36.63 
 
 		 314 aa  181  2e-44  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>