More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0338 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0338  Transketolase central region  100 
 
 		 319 aa  640    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0969  transketolase, central region  48.36 
 
 		 306 aa  305  6e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86113  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0470  Transketolase central region  57.84 
 
 		 318 aa  305  7e-82  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0492  transketolase, central region  48.69 
 
 		 312 aa  296  2e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3967  Transketolase central region  51.63 
 
 		 313 aa  295  8e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000645501  unclonable  0.000000000133165 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1178  Transketolase central region  48.82 
 
 		 327 aa  292  6e-78  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0058066  normal  0.0131189 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1860  Transketolase central region  49.35 
 
 		 321 aa  290  3e-77  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0293  putative transketolase, C-terminal subunit  47.71 
 
 		 314 aa  289  4e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0288  transketolase  47.71 
 
 		 314 aa  289  4e-77  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000211069  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2059  Transketolase central region  48.36 
 
 		 313 aa  289  4e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0265  Transketolase central region  47.39 
 
 		 310 aa  289  5.0000000000000004e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00214892 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0881  Transketolase central region  46.62 
 
 		 327 aa  288  9e-77  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000876605  normal  0.0478781 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0280  Transketolase central region  47.39 
 
 		 310 aa  288  1e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.741894  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0244  transketolase-like protein  44.95 
 
 		 311 aa  287  2e-76  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2213  transketolase subunit B  47.68 
 
 		 317 aa  285  5.999999999999999e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000528401  hitchhiker  0.000741425 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1192  transketolase-like  48.66 
 
 		 327 aa  284  1.0000000000000001e-75  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.101787  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1286  transketolase-like  48.66 
 
 		 327 aa  284  2.0000000000000002e-75  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.290354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0873  Transketolase central region  46.25 
 
 		 319 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.199119  hitchhiker  0.00317558 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1170  transketolase subunit B  48.32 
 
 		 326 aa  281  1e-74  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000103125  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0552  transketolase subunit B  49.67 
 
 		 314 aa  280  3e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2719  transketolase, C-terminal subunit  48.04 
 
 		 311 aa  279  4e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2019  Transketolase central region  46.91 
 
 		 320 aa  279  4e-74  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.6126  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0183  Transketolase central region  44.3 
 
 		 320 aa  277  2e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1895  transketolase, C-terminal subunit  46.25 
 
 		 318 aa  275  6e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00759771 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0874  Transketolase central region  46.64 
 
 		 326 aa  275  7e-73  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1381  Transketolase central region  46.64 
 
 		 306 aa  275  8e-73  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2077  transketolase, central region  52.81 
 
 		 308 aa  274  1.0000000000000001e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1173  Transketolase central region  47.32 
 
 		 327 aa  272  5.000000000000001e-72  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000000393635  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4744  Transketolase central region  49.15 
 
 		 311 aa  271  7e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00875  transketolase, C-terminal subunit  45.93 
 
 		 317 aa  271  2e-71  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3074  transketolase, central region  50.33 
 
 		 313 aa  270  2e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0289222  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2935  Transketolase central region  44.95 
 
 		 317 aa  268  5.9999999999999995e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0244  Transketolase central region  46.33 
 
 		 305 aa  268  8e-71  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.304733  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0975  Transketolase central region  43 
 
 		 317 aa  265  8.999999999999999e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.127122  normal  0.063318 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0237  transketolase subunit B  48.84 
 
 		 311 aa  265  1e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0049  transketolase, central region  47.88 
 
 		 317 aa  263  2e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2918  transketolase, C-terminal subunit  48.69 
 
 		 314 aa  263  4e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0711  Transketolase central region  42.18 
 
 		 315 aa  259  5.0000000000000005e-68  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00000202012  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2705  transketolase subunit B  45.54 
 
 		 311 aa  259  5.0000000000000005e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000194197  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05490  transketolase subunit B  47.59 
 
 		 325 aa  256  3e-67  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.948034 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1997  Transketolase central region  46.62 
 
 		 321 aa  255  9e-67  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00329881 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0173  Transketolase central region  41.25 
 
 		 313 aa  247  2e-64  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09040  transketolase subunit B  45.28 
 
 		 315 aa  244  9.999999999999999e-64  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.28283  normal  0.0525296 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0300  transketolase central region  42.99 
 
 		 324 aa  243  3e-63  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0477096 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1527  Transketolase central region  42.95 
 
 		 319 aa  241  1e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0438  transketolase central region  42.67 
 
 		 312 aa  241  1e-62  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0397028  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1505  transketolase central region  41.67 
 
 		 314 aa  239  5e-62  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0385912  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2254  Transketolase domain protein  44.08 
 
 		 318 aa  237  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.655402  normal  0.0447096 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0333  Transketolase central region  41.98 
 
 		 322 aa  236  4e-61  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0809  transketolase central region  44.52 
 
 		 592 aa  232  8.000000000000001e-60  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.32467  normal  0.55266 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0268  transketolase  43.81 
 
 		 606 aa  231  1e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1878  transketolase subunit B  42.72 
 
 		 312 aa  231  2e-59  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1130  transketolase central region  42.19 
 
 		 336 aa  228  8e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2381  transketolase  44.52 
 
 		 621 aa  225  7e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.652214  normal  0.294409 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3129  transketolase domain-containing protein  41.72 
 
 		 322 aa  223  2e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1554  transketolase central region  41.2 
 
 		 312 aa  223  4e-57  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0600642  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0365  transketolase central region  40.53 
 
 		 312 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.556876  normal  0.0129681 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0471  transketolase subunit B  40.53 
 
 		 312 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0285277  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1277  Transketolase central region  41.58 
 
 		 313 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0860  Transketolase domain protein  39.87 
 
 		 310 aa  220  3e-56  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.476833  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0415  Transketolase central region  40.84 
 
 		 624 aa  217  2e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1655  transketolase  42.72 
 
 		 629 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.168649 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0334  Transketolase central region  42.52 
 
 		 308 aa  214  1.9999999999999998e-54  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2032  Transketolase domain protein  43.42 
 
 		 318 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.262756  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0419  transketolase central region  42.72 
 
 		 630 aa  212  7.999999999999999e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.218492  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36720  transketolase  40.13 
 
 		 614 aa  209  3e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.148891  normal  0.641961 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0789  transketolase central region  39.4 
 
 		 314 aa  209  6e-53  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2842  transketolase subunit B  36.62 
 
 		 317 aa  209  7e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.837175  normal  0.299247 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3364  Transketolase domain protein  36.45 
 
 		 317 aa  208  8e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1775  transketolase, central region  40.07 
 
 		 314 aa  208  8e-53  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2581  transketolase domain-containing protein  37.32 
 
 		 317 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.230809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2526  transketolase domain protein  37.32 
 
 		 317 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.508569 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0049  transketolase  44.15 
 
 		 626 aa  207  2e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2689  transketolase domain-containing protein  37.32 
 
 		 317 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.423567 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2110  transketolase, central region  39.4 
 
 		 314 aa  207  2e-52  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.44874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2481  transketolase domain protein  36.97 
 
 		 317 aa  204  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.120495  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2569  transketolase domain protein  36.97 
 
 		 317 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.126502  normal  0.742091 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0407  transketolase central region  39.87 
 
 		 323 aa  202  5e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0194561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1468  Transketolase central region  36.48 
 
 		 314 aa  202  9e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0894  transketolase subunit B  39.74 
 
 		 314 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1923  transketolase domain-containing protein  38.44 
 
 		 315 aa  200  3e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3878  transketolase, central region  37.74 
 
 		 342 aa  200  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.733485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2123  transketolase  40.76 
 
 		 627 aa  200  3e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1792  transketolase subunit B  38.24 
 
 		 310 aa  200  3e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0510195  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3949  Transketolase domain protein  36 
 
 		 338 aa  199  5e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4991  transketolase central region  38.64 
 
 		 332 aa  195  1e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.908463 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3317  transketolase  43.94 
 
 		 612 aa  194  2e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1278  transketolase  41.23 
 
 		 624 aa  193  3e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6255  transketolase central region  38.89 
 
 		 332 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.156319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2444  transketolase subunit B  37.13 
 
 		 313 aa  189  4e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6422  transketolase, central region  38.89 
 
 		 332 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6657  transketolase, central region  38.89 
 
 		 332 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4778  transketolase subunit B  38.03 
 
 		 332 aa  189  8e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3269  transketolase subunit B  38.26 
 
 		 337 aa  188  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.444228 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2367  Transketolase central region  37.04 
 
 		 339 aa  187  2e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.438048  normal  0.0327946 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1539  transketolase central region  38.46 
 
 		 348 aa  187  2e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.844968  normal  0.490255 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2092  transketolase central region  37.04 
 
 		 339 aa  187  2e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.147262 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2513  transketolase subunit B  38.38 
 
 		 322 aa  186  5e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0486  Transketolase domain protein  38.21 
 
 		 313 aa  186  5e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3312  Transketolase central region  36.95 
 
 		 332 aa  186  6e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>