More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0049 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014248  Aazo_0419  transketolase central region  62.58 
 
 		 630 aa  779    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.218492  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0415  Transketolase central region  70.18 
 
 		 624 aa  909    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1655  transketolase  63.92 
 
 		 629 aa  791    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.168649 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36720  transketolase  60.1 
 
 		 614 aa  708    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.148891  normal  0.641961 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4832  transketolase  57.78 
 
 		 639 aa  639    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2123  transketolase  60.97 
 
 		 627 aa  726    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1278  transketolase  60.42 
 
 		 624 aa  719    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17580  transketolase  60.83 
 
 		 622 aa  676    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.569597  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3317  transketolase  60.41 
 
 		 612 aa  660    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0049  transketolase  100 
 
 		 626 aa  1272    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2381  transketolase  46.42 
 
 		 621 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.652214  normal  0.294409 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0268  transketolase  48.38 
 
 		 606 aa  540  9.999999999999999e-153  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2307  transketolase  38.17 
 
 		 662 aa  359  8e-98  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0505074 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0183  transketolase  31.47 
 
 		 640 aa  295  1e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2237  transketolase  34.67 
 
 		 689 aa  293  5e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1753  transketolase  31.45 
 
 		 618 aa  280  8e-74  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.599828  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1946  transketolase  30.63 
 
 		 631 aa  279  1e-73  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.120337  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1050  transketolase  31.45 
 
 		 635 aa  265  2e-69  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1062  transketolase  31.45 
 
 		 635 aa  265  2e-69  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0809  transketolase central region  31.16 
 
 		 592 aa  264  4e-69  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.32467  normal  0.55266 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1680  transketolase  30.25 
 
 		 623 aa  263  6.999999999999999e-69  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1302  transketolase  31.99 
 
 		 653 aa  255  2.0000000000000002e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0226315  normal  0.530799 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0968  transketolase domain-containing protein  48.01 
 
 		 273 aa  236  9e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4745  Transketolase domain protein  47.58 
 
 		 277 aa  229  1e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1130  Transketolase central region  31.46 
 
 		 648 aa  228  3e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2060  Transketolase domain protein  46.44 
 
 		 282 aa  227  4e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3125  transketolase  30.36 
 
 		 664 aa  224  3e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2213  transketolase subunit B  40.63 
 
 		 317 aa  223  9e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000528401  hitchhiker  0.000741425 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1382  Transketolase domain protein  44.85 
 
 		 269 aa  220  6e-56  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0287  transketolase  44.28 
 
 		 274 aa  219  1e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.132447  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1861  Transketolase domain protein  47.17 
 
 		 279 aa  219  1e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0236  transketolase subunit A  45.76 
 
 		 271 aa  218  2e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0292  putative transketolase, N-terminal subunit  44.28 
 
 		 274 aa  218  2e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3075  transketolase domain-containing protein  45.35 
 
 		 271 aa  218  2.9999999999999998e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0025975  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3968  Transketolase domain protein  45.69 
 
 		 272 aa  214  4.9999999999999996e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000279469  unclonable  0.000000000126614 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0469  Transketolase domain protein  48.86 
 
 		 273 aa  211  2e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.833145  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2704  transketolase subunit A  45.02 
 
 		 281 aa  210  7e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000372386  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0444  Transketolase central region  28.53 
 
 		 636 aa  209  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0712  Transketolase domain protein  44.4 
 
 		 281 aa  209  2e-52  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0142999  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1817  transketolase  27.42 
 
 		 632 aa  207  7e-52  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0069  transketolase  28.7 
 
 		 636 aa  206  7e-52  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.874951  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0334  Transketolase domain protein  42.05 
 
 		 286 aa  206  1e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0487  transketolase  28.48 
 
 		 667 aa  205  2e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.33279  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0969  transketolase, central region  36.89 
 
 		 306 aa  205  2e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86113  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1636  transketolase  27.63 
 
 		 632 aa  205  2e-51  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0069  transketolase  30.04 
 
 		 633 aa  204  3e-51  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.317261  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3423  transketolase  31.55 
 
 		 668 aa  204  4e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1503  transketolase domain-containing protein  40.66 
 
 		 272 aa  204  4e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0294001  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2005  transketolase  27.73 
 
 		 632 aa  204  5e-51  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0551  transketolase subunit A  43.66 
 
 		 286 aa  203  7e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0172  Transketolase domain protein  42.65 
 
 		 273 aa  202  9.999999999999999e-51  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.906394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0491  transketolase domain-containing protein  42.8 
 
 		 276 aa  202  1.9999999999999998e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0244  transketolase-like protein  37.26 
 
 		 311 aa  202  1.9999999999999998e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0440  transketolase  41.09 
 
 		 275 aa  201  3e-50  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.707668  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2720  transketolase, N-terminal subunit  43.07 
 
 		 273 aa  201  5e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1528  Transketolase domain protein  42.01 
 
 		 297 aa  200  6e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2919  transketolase, N-terminal subunit  42.91 
 
 		 277 aa  199  2.0000000000000003e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1552  transketolase domain-containing protein  39.78 
 
 		 275 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.12208  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0492  transketolase, central region  39.26 
 
 		 312 aa  198  3e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1860  Transketolase central region  38.51 
 
 		 321 aa  197  4.0000000000000005e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4744  Transketolase central region  40.27 
 
 		 311 aa  197  4.0000000000000005e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0367  transketolase domain-containing protein  39.43 
 
 		 275 aa  197  5.000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0144552 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0949  transketolase  30 
 
 		 671 aa  197  6e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1933  transketolase  26.92 
 
 		 656 aa  197  6e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0469  transketolase subunit A  39.43 
 
 		 275 aa  197  7e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.125923  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1904  transketolase  28.88 
 
 		 668 aa  196  1e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0338  Transketolase central region  44.15 
 
 		 319 aa  196  1e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1052  transketolase  28.97 
 
 		 671 aa  196  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.25792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0333  Transketolase central region  37.14 
 
 		 322 aa  196  1e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1320  transketolase  29.21 
 
 		 660 aa  196  1e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.29997 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2902  transketolase  29.09 
 
 		 666 aa  195  2e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2214  transketolase subunit A  41.15 
 
 		 284 aa  194  5e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000519395  hitchhiker  0.000381558 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2102  transketolase  29.5 
 
 		 668 aa  194  5e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000131444  normal  0.204144 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2108  transketolase  27.89 
 
 		 684 aa  194  5e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159274 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0468  transketolase  29.94 
 
 		 707 aa  193  6e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3228  transketolase  30.13 
 
 		 665 aa  194  6e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0116  transketolase  27.63 
 
 		 634 aa  193  9e-48  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.984177  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0387  transketolase  26.39 
 
 		 690 aa  192  1e-47  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0202  transketolase  27.57 
 
 		 636 aa  192  1e-47  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0465  transketolase  27.04 
 
 		 663 aa  192  2e-47  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0244  Transketolase central region  35.28 
 
 		 305 aa  192  2e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.304733  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00875  transketolase, C-terminal subunit  37.25 
 
 		 317 aa  192  2e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1178  Transketolase central region  37.83 
 
 		 327 aa  191  2.9999999999999997e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0058066  normal  0.0131189 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1998  Transketolase domain protein  45.9 
 
 		 279 aa  191  2.9999999999999997e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.337759  hitchhiker  0.00336505 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1895  transketolase, C-terminal subunit  34.47 
 
 		 318 aa  191  2.9999999999999997e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00759771 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0178  transketolase  30.67 
 
 		 668 aa  190  5e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02356  transketolase 2, thiamin-binding  29.5 
 
 		 667 aa  190  5.999999999999999e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1205  transketolase  29.5 
 
 		 667 aa  190  5.999999999999999e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1212  transketolase  29.5 
 
 		 667 aa  190  5.999999999999999e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2743  transketolase  29.5 
 
 		 667 aa  190  5.999999999999999e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02318  hypothetical protein  29.5 
 
 		 667 aa  190  5.999999999999999e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2611  transketolase  29.5 
 
 		 667 aa  190  5.999999999999999e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14410  transketolase  30.49 
 
 		 660 aa  190  7e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4387  transketolase  30.2 
 
 		 660 aa  190  7e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2935  Transketolase central region  34.49 
 
 		 317 aa  190  8e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2594  transketolase  29.5 
 
 		 667 aa  189  9e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0333  Transketolase domain protein  37.59 
 
 		 309 aa  189  1e-46  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03290  transketolase  30.49 
 
 		 661 aa  189  1e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3753  transketolase  29.43 
 
 		 675 aa  189  1e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2804  transketolase  29.03 
 
 		 665 aa  188  2e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>