More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1655 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_1655  transketolase  100 
 
 
629 aa  1286    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.168649 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36720  transketolase  60.2 
 
 
614 aa  714    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.148891  normal  0.641961 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1278  transketolase  60.77 
 
 
624 aa  736    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0415  Transketolase central region  67.21 
 
 
624 aa  865    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17580  transketolase  58.55 
 
 
622 aa  663    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.569597  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3317  transketolase  61.1 
 
 
612 aa  701    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0049  transketolase  64.05 
 
 
626 aa  782    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2123  transketolase  61.5 
 
 
627 aa  747    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0419  transketolase central region  84.24 
 
 
630 aa  1086    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.218492  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4832  transketolase  55.32 
 
 
639 aa  613  9.999999999999999e-175  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2381  transketolase  47.42 
 
 
621 aa  567  1e-160  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.652214  normal  0.294409 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0268  transketolase  49.1 
 
 
606 aa  535  1e-151  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2307  transketolase  38.58 
 
 
662 aa  377  1e-103  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0505074 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0183  transketolase  31.06 
 
 
640 aa  306  7e-82  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2237  transketolase  33.9 
 
 
689 aa  298  1e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1946  transketolase  31 
 
 
631 aa  286  1.0000000000000001e-75  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.120337  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1753  transketolase  32.92 
 
 
618 aa  281  2e-74  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.599828  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0809  transketolase central region  35.12 
 
 
592 aa  271  2e-71  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.32467  normal  0.55266 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1680  transketolase  30.58 
 
 
623 aa  260  4e-68  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1302  transketolase  30.8 
 
 
653 aa  260  6e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0226315  normal  0.530799 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1062  transketolase  30.17 
 
 
635 aa  255  2.0000000000000002e-66  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1050  transketolase  30.17 
 
 
635 aa  255  2.0000000000000002e-66  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3968  Transketolase domain protein  46.1 
 
 
272 aa  236  8e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000279469  unclonable  0.000000000126614 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0236  transketolase subunit A  45.93 
 
 
271 aa  234  3e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2060  Transketolase domain protein  45.8 
 
 
282 aa  231  3e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0968  transketolase domain-containing protein  47.33 
 
 
273 aa  231  4e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4745  Transketolase domain protein  46.74 
 
 
277 aa  231  4e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0469  Transketolase domain protein  49.08 
 
 
273 aa  229  8e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.833145  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3075  transketolase domain-containing protein  44.24 
 
 
271 aa  229  1e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0025975  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3125  transketolase  31.62 
 
 
664 aa  228  2e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1861  Transketolase domain protein  48.67 
 
 
279 aa  226  7e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0287  transketolase  43.38 
 
 
274 aa  225  2e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.132447  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0292  putative transketolase, N-terminal subunit  42.86 
 
 
274 aa  223  6e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14410  transketolase  31.14 
 
 
660 aa  221  1.9999999999999999e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2919  transketolase, N-terminal subunit  42.91 
 
 
277 aa  221  3e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03290  transketolase  31.14 
 
 
661 aa  220  6e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2704  transketolase subunit A  43.33 
 
 
281 aa  218  2.9999999999999998e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000372386  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1130  Transketolase central region  29.64 
 
 
648 aa  217  5e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0487  transketolase  28.91 
 
 
667 aa  216  9e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.33279  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1382  Transketolase domain protein  42.48 
 
 
269 aa  215  1.9999999999999998e-54  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2102  transketolase  30 
 
 
668 aa  214  3.9999999999999995e-54  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000131444  normal  0.204144 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1552  transketolase domain-containing protein  44.19 
 
 
275 aa  214  4.9999999999999996e-54  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.12208  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0367  transketolase domain-containing protein  44.57 
 
 
275 aa  213  5.999999999999999e-54  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0144552 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0551  transketolase subunit A  41.82 
 
 
286 aa  213  5.999999999999999e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1635  transketolase  29.95 
 
 
670 aa  212  1e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0440  transketolase  43.77 
 
 
275 aa  212  2e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.707668  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0841  transketolase  30.21 
 
 
679 aa  211  3e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0469  transketolase subunit A  43.82 
 
 
275 aa  211  4e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.125923  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0491  transketolase domain-containing protein  43.17 
 
 
276 aa  209  1e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2720  transketolase, N-terminal subunit  42.7 
 
 
273 aa  209  2e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0468  transketolase  29.13 
 
 
707 aa  208  2e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1503  transketolase domain-containing protein  42.15 
 
 
272 aa  208  2e-52  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0294001  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2078  transketolase domain-containing protein  46.18 
 
 
271 aa  207  4e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0712  Transketolase domain protein  42.26 
 
 
281 aa  207  7e-52  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0142999  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0299  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.8 
 
 
555 aa  207  7e-52  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0242597 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1904  transketolase  28.38 
 
 
668 aa  206  8e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0338  Transketolase central region  42.72 
 
 
319 aa  206  1e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1998  Transketolase domain protein  46.18 
 
 
279 aa  206  1e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.337759  hitchhiker  0.00336505 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0172  Transketolase domain protein  42.48 
 
 
273 aa  205  2e-51  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.906394  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2214  transketolase subunit A  41.77 
 
 
284 aa  205  2e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000519395  hitchhiker  0.000381558 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2902  transketolase  30.09 
 
 
666 aa  205  2e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0334  Transketolase domain protein  43.43 
 
 
286 aa  204  3e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0116  transketolase  28.47 
 
 
634 aa  205  3e-51  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.984177  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0243  transketolase-like protein  44.07 
 
 
275 aa  204  3e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0472  transketolase  29.97 
 
 
682 aa  204  4e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0444  Transketolase central region  30.83 
 
 
636 aa  204  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3753  transketolase  30.24 
 
 
675 aa  204  5e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1241  transketolase  28.89 
 
 
668 aa  204  5e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000546415  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1933  transketolase  28.32 
 
 
656 aa  203  7e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0244  Transketolase central region  37.82 
 
 
305 aa  203  8e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.304733  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2336  transketolase  29.9 
 
 
666 aa  203  8e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000657537  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1828  transketolase  30.52 
 
 
653 aa  203  8e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.208586  normal  0.379943 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0069  transketolase  28.93 
 
 
633 aa  203  8e-51  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.317261  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05480  transketolase subunit A  42.97 
 
 
275 aa  202  1.9999999999999998e-50  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0946  transketolase  29.12 
 
 
665 aa  202  1.9999999999999998e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0384  transketolase  29.08 
 
 
663 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2213  transketolase subunit B  37.19 
 
 
317 aa  202  1.9999999999999998e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000528401  hitchhiker  0.000741425 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2148  transketolase  28.25 
 
 
671 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2249  transketolase  28.98 
 
 
663 aa  201  3e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0965691  hitchhiker  0.0000320127 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2707  transketolase  29.61 
 
 
666 aa  201  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0969  transketolase, central region  38.22 
 
 
306 aa  199  9e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86113  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2594  transketolase  29.59 
 
 
667 aa  199  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1513  transketolase  29.73 
 
 
684 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00869632  decreased coverage  0.000119249 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02356  transketolase 2, thiamin-binding  29.59 
 
 
667 aa  199  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1205  transketolase  29.59 
 
 
667 aa  199  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2743  transketolase  29.59 
 
 
667 aa  198  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02318  hypothetical protein  29.59 
 
 
667 aa  199  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4614  transketolase  31.59 
 
 
674 aa  199  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.566503 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2733  transketolase  29.27 
 
 
666 aa  198  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3686  transketolase  29.59 
 
 
667 aa  198  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.709027  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0339  Transketolase domain protein  44.4 
 
 
280 aa  199  2.0000000000000003e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2960  transketolase  29.78 
 
 
662 aa  198  2.0000000000000003e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.986583 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2840  transketolase  29.27 
 
 
666 aa  198  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1212  transketolase  29.59 
 
 
667 aa  199  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2611  transketolase  29.59 
 
 
667 aa  199  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2618  transketolase  29.27 
 
 
666 aa  198  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1727  transketolase  29.03 
 
 
663 aa  198  3e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.827271  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1669  transketolase  28.79 
 
 
738 aa  198  3e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0309  transketolase  28.79 
 
 
684 aa  198  3e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000137507 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2108  transketolase  28.64 
 
 
684 aa  197  3e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.159274 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>