More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1753 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1062  transketolase  58.97 
 
 		 635 aa  751    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1753  transketolase  100 
 
 		 618 aa  1263    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.599828  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1946  transketolase  54.17 
 
 		 631 aa  685    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.120337  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0183  transketolase  53.14 
 
 		 640 aa  666    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1680  transketolase  73.9 
 
 		 623 aa  943    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1050  transketolase  58.97 
 
 		 635 aa  751    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1130  Transketolase central region  46.08 
 
 		 648 aa  532  1e-150  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1302  transketolase  44.18 
 
 		 653 aa  523  1e-147  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0226315  normal  0.530799 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0415  Transketolase central region  32.97 
 
 		 624 aa  293  5e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1655  transketolase  33.18 
 
 		 629 aa  286  7e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.168649 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0419  transketolase central region  32.5 
 
 		 630 aa  286  7e-76  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.218492  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0049  transketolase  31.23 
 
 		 626 aa  280  7e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2381  transketolase  31.07 
 
 		 621 aa  270  7e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.652214  normal  0.294409 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2237  transketolase  31.01 
 
 		 689 aa  264  4e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36720  transketolase  30.14 
 
 		 614 aa  258  2e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.148891  normal  0.641961 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0809  transketolase central region  30.57 
 
 		 592 aa  257  4e-67  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.32467  normal  0.55266 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1278  transketolase  30.7 
 
 		 624 aa  256  9e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2123  transketolase  30.08 
 
 		 627 aa  254  5.000000000000001e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0268  transketolase  29.37 
 
 		 606 aa  250  7e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4745  Transketolase domain protein  45.69 
 
 		 277 aa  243  6e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4832  transketolase  30.06 
 
 		 639 aa  243  9e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0968  transketolase domain-containing protein  48.48 
 
 		 273 aa  241  2.9999999999999997e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0334  Transketolase domain protein  47.12 
 
 		 286 aa  238  2e-61  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3317  transketolase  29.9 
 
 		 612 aa  238  3e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2060  Transketolase domain protein  47.35 
 
 		 282 aa  236  8e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1382  Transketolase domain protein  46.84 
 
 		 269 aa  230  6e-59  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1503  transketolase domain-containing protein  44.57 
 
 		 272 aa  229  8e-59  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0294001  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0712  Transketolase domain protein  46.82 
 
 		 281 aa  229  1e-58  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0142999  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17580  transketolase  30.22 
 
 		 622 aa  227  4e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.569597  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2704  transketolase subunit A  45.69 
 
 		 281 aa  227  6e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000372386  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0236  transketolase subunit A  44.94 
 
 		 271 aa  226  1e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0292  putative transketolase, N-terminal subunit  43.66 
 
 		 274 aa  225  2e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0287  transketolase  43.66 
 
 		 274 aa  225  2e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.132447  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1861  Transketolase domain protein  43.98 
 
 		 279 aa  224  4.9999999999999996e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3075  transketolase domain-containing protein  45.32 
 
 		 271 aa  222  1.9999999999999999e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0025975  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0440  transketolase  43.98 
 
 		 275 aa  220  5e-56  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.707668  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0367  transketolase domain-containing protein  44.32 
 
 		 275 aa  217  5e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0144552 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0469  transketolase subunit A  43.96 
 
 		 275 aa  217  5.9999999999999996e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.125923  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1552  transketolase domain-containing protein  44.32 
 
 		 275 aa  216  9.999999999999999e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.12208  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3968  Transketolase domain protein  41.42 
 
 		 272 aa  214  2.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000279469  unclonable  0.000000000126614 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0172  Transketolase domain protein  43.98 
 
 		 273 aa  214  3.9999999999999995e-54  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.906394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1528  Transketolase domain protein  43.8 
 
 		 297 aa  209  9e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0491  transketolase domain-containing protein  41.76 
 
 		 276 aa  208  2e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2078  transketolase domain-containing protein  42.54 
 
 		 271 aa  207  3e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0469  Transketolase domain protein  42.91 
 
 		 273 aa  206  8e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.833145  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2214  transketolase subunit A  45.6 
 
 		 284 aa  206  1e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000519395  hitchhiker  0.000381558 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2919  transketolase, N-terminal subunit  42.75 
 
 		 277 aa  205  2e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0551  transketolase subunit A  42.54 
 
 		 286 aa  204  4e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0116  transketolase  28.48 
 
 		 634 aa  204  4e-51  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.984177  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1933  transketolase  28.68 
 
 		 656 aa  203  8e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0243  transketolase-like protein  42.58 
 
 		 275 aa  201  3e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0279  Transketolase domain protein  43.54 
 
 		 274 aa  201  3.9999999999999996e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000402099  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0264  Transketolase domain protein  43.17 
 
 		 274 aa  200  7e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00137267 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1467  Transketolase domain protein  41.73 
 
 		 273 aa  197  3e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2804  transketolase  28.55 
 
 		 665 aa  195  2e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2255  Transketolase domain protein  42.59 
 
 		 269 aa  193  6e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.158936  normal  0.0249782 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0841  transketolase  27.98 
 
 		 679 aa  192  1e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2720  transketolase, N-terminal subunit  39.55 
 
 		 273 aa  192  1e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1192  transketolase-like  38.69 
 
 		 301 aa  193  1e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.437056 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05480  transketolase subunit A  40.15 
 
 		 275 aa  192  1e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0069  transketolase  29.14 
 
 		 636 aa  192  1e-47  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.874951  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1735  transketolase  27.99 
 
 		 636 aa  192  2e-47  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00492424  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0202  transketolase  28.18 
 
 		 636 aa  192  2e-47  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1793  transketolase subunit A  39.58 
 
 		 297 aa  191  2.9999999999999997e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0143837  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2033  Transketolase domain protein  41.83 
 
 		 269 aa  190  7e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.309611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1373  Transketolase domain protein  38.85 
 
 		 303 aa  190  8e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.160442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0299  ribulose-phosphate 3-epimerase  40.23 
 
 		 555 aa  189  2e-46  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0242597 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14541  N-terminal subunit of transketolase  41.04 
 
 		 288 aa  188  2e-46  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0444  Transketolase central region  27.81 
 
 		 636 aa  188  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2430  transketolase  29.9 
 
 		 660 aa  187  3e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0465  transketolase  28.35 
 
 		 663 aa  187  5e-46  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0338  transketolase  27.8 
 
 		 639 aa  187  7e-46  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.025251  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1998  Transketolase domain protein  41.7 
 
 		 279 aa  186  1.0000000000000001e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.337759  hitchhiker  0.00336505 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1817  transketolase  27.59 
 
 		 632 aa  186  1.0000000000000001e-45  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1904  transketolase  27.16 
 
 		 668 aa  186  1.0000000000000001e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09030  transketolase subunit A  41.11 
 
 		 278 aa  186  1.0000000000000001e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.169995  normal  0.0273628 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0069  transketolase  28.38 
 
 		 633 aa  186  1.0000000000000001e-45  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.317261  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1437  transketolase-like  37.82 
 
 		 297 aa  184  4.0000000000000006e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0851  transketolase  26.73 
 
 		 660 aa  184  4.0000000000000006e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0149061  normal  0.206532 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3423  transketolase  26.99 
 
 		 668 aa  184  5.0000000000000004e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1636  transketolase  27.29 
 
 		 632 aa  184  5.0000000000000004e-45  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0530  transketolase  29.72 
 
 		 677 aa  182  1e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2005  transketolase  27.42 
 
 		 632 aa  182  2e-44  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0487  transketolase  27.16 
 
 		 667 aa  182  2e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.33279  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0861  Transketolase domain protein  36.9 
 
 		 299 aa  181  2.9999999999999997e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0245  Transketolase domain protein  38.78 
 
 		 265 aa  180  7e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.411817  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2127  Transketolase domain protein  39.62 
 
 		 276 aa  180  7e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.359071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0976  Transketolase domain protein  39.86 
 
 		 285 aa  180  8e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.160297  normal  0.0621663 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3128  transketolase domain-containing protein  39.02 
 
 		 281 aa  180  9e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.616231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1190  Transketolase domain protein  36.59 
 
 		 303 aa  179  1e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00778844  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5124  transketolase  27.57 
 
 		 671 aa  178  3e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1924  transketolase domain-containing protein  37.74 
 
 		 281 aa  178  3e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1241  transketolase  27.66 
 
 		 668 aa  177  4e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000546415  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0166  transketolase  27.57 
 
 		 976 aa  176  9.999999999999999e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.717678  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0227  transketolase  26.35 
 
 		 657 aa  175  1.9999999999999998e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3398  Transketolase domain protein  38.43 
 
 		 263 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2799  Transketolase domain protein  38.72 
 
 		 274 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1107  Transketolase domain protein  35.64 
 
 		 303 aa  174  5e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4222  transketolase subunit A  36.64 
 
 		 270 aa  174  5e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0249  transketolase  27.01 
 
 		 664 aa  174  5e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>