More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE1817 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009707  JJD26997_2005  transketolase  98.1 
 
 		 632 aa  1273    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1636  transketolase  98.73 
 
 		 632 aa  1281    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1817  transketolase  100 
 
 		 632 aa  1291    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1933  transketolase  64.33 
 
 		 656 aa  829    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0202  transketolase  62.88 
 
 		 636 aa  833    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0338  transketolase  58.59 
 
 		 639 aa  753    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.025251  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1735  transketolase  68.78 
 
 		 636 aa  875    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00492424  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0069  transketolase  68.94 
 
 		 636 aa  879    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.874951  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0116  transketolase  79.33 
 
 		 634 aa  1029    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.984177  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0069  transketolase  67.83 
 
 		 633 aa  878    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.317261  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0651  transketolase  45.72 
 
 		 723 aa  538  9.999999999999999e-153  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07130  transketolase  45.72 
 
 		 665 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3415  transketolase  46.32 
 
 		 662 aa  537  1e-151  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0384  transketolase  46.48 
 
 		 663 aa  538  1e-151  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1617  transketolase  44.89 
 
 		 665 aa  533  1e-150  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.804069 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3125  transketolase  43.82 
 
 		 664 aa  534  1e-150  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0552  transketolase  45.12 
 
 		 664 aa  534  1e-150  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0367  transketolase  45.26 
 
 		 671 aa  533  1e-150  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0201094  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3352  transketolase  45.72 
 
 		 664 aa  529  1e-149  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1311  transketolase  46.93 
 
 		 654 aa  530  1e-149  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0409  transketolase  46.11 
 
 		 662 aa  528  1e-149  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.148616  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2102  transketolase  44.51 
 
 		 668 aa  530  1e-149  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000131444  normal  0.204144 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0510  transketolase  45.26 
 
 		 664 aa  526  1e-148  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3369  transketolase  43.66 
 
 		 666 aa  526  1e-148  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00015872  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02765  transketolase 1, thiamin-binding  44.95 
 
 		 663 aa  526  1e-148  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0759  transketolase  44.95 
 
 		 663 aa  526  1e-148  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3269  transketolase  44.95 
 
 		 663 aa  526  1e-148  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02728  hypothetical protein  44.95 
 
 		 663 aa  526  1e-148  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0776  transketolase  44.95 
 
 		 663 aa  526  1e-148  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0260346 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3470  transketolase  43.96 
 
 		 666 aa  526  1e-148  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000202879  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3742  transketolase  43.96 
 
 		 666 aa  526  1e-148  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000620958  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3436  transketolase  43.96 
 
 		 666 aa  526  1e-148  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000116203  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3388  transketolase  43.96 
 
 		 666 aa  526  1e-148  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000543798  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4237  transketolase  44.95 
 
 		 663 aa  526  1e-148  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4792  transketolase  45.21 
 
 		 665 aa  525  1e-148  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00646987 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1904  transketolase  43.27 
 
 		 668 aa  525  1e-148  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1883  transketolase  44.68 
 
 		 672 aa  528  1e-148  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.768149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3744  transketolase  43.96 
 
 		 666 aa  526  1e-148  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000152991  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0850  transketolase  45.57 
 
 		 664 aa  528  1e-148  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.889577  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3699  transketolase  43.96 
 
 		 680 aa  525  1e-148  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000172901 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0847  transketolase  45.57 
 
 		 664 aa  528  1e-148  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1241  transketolase  45.48 
 
 		 668 aa  527  1e-148  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000546415  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3077  transketolase  44.95 
 
 		 663 aa  526  1e-148  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00342437 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0353  transketolase  45.5 
 
 		 663 aa  526  1e-148  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1849  transketolase  44.73 
 
 		 665 aa  527  1e-148  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.322822 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3093  transketolase  44.95 
 
 		 663 aa  526  1e-148  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0385  transketolase  45.12 
 
 		 665 aa  524  1e-147  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1524  transketolase  43.66 
 
 		 680 aa  523  1e-147  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000346626  normal  0.0243149 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0309  transketolase  44.58 
 
 		 684 aa  523  1e-147  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000137507 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0520  transketolase  45.4 
 
 		 663 aa  524  1e-147  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3367  transketolase  44.8 
 
 		 663 aa  525  1e-147  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0472  transketolase  45.52 
 
 		 667 aa  524  1e-147  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0841196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2808  transketolase  44.36 
 
 		 697 aa  522  1e-147  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.189513  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0644  transketolase  44.6 
 
 		 666 aa  518  1e-146  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0678  transketolase  44.6 
 
 		 666 aa  518  1e-146  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3718  transketolase  43.66 
 
 		 666 aa  521  1e-146  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000892016  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0554  transketolase  45.09 
 
 		 665 aa  520  1e-146  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2122  transketolase  44.62 
 
 		 668 aa  521  1e-146  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0026  transketolase  44.78 
 
 		 694 aa  521  1e-146  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0910343  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0565  transketolase  45.04 
 
 		 680 aa  519  1e-146  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2336  transketolase  43.5 
 
 		 666 aa  521  1e-146  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000657537  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4965  transketolase  44.19 
 
 		 665 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3480  transketolase  45.72 
 
 		 664 aa  518  1.0000000000000001e-145  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.661363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3954  transketolase  45.57 
 
 		 664 aa  517  1.0000000000000001e-145  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3341  transketolase  44.04 
 
 		 663 aa  517  1.0000000000000001e-145  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0470091 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3790  transketolase  43.81 
 
 		 666 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00258353  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_584  transketolase  44.84 
 
 		 666 aa  517  1.0000000000000001e-145  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0616  transketolase  44.65 
 
 		 666 aa  516  1.0000000000000001e-145  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05570  transketolase  44.65 
 
 		 665 aa  517  1.0000000000000001e-145  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2841  transketolase  44.68 
 
 		 665 aa  517  1.0000000000000001e-145  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0227  transketolase  43.74 
 
 		 657 aa  518  1.0000000000000001e-145  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0458  transketolase  45.34 
 
 		 666 aa  514  1e-144  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03567  transketolase  46.42 
 
 		 675 aa  514  1e-144  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3418  transketolase  44.19 
 
 		 663 aa  513  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0637477 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3256  transketolase  44.19 
 
 		 663 aa  514  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5267  transketolase  44.5 
 
 		 681 aa  512  1e-144  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2148  transketolase  44.66 
 
 		 671 aa  513  1e-144  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2853  transketolase  45.18 
 
 		 665 aa  512  1e-144  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4838  transketolase  44.19 
 
 		 665 aa  514  1e-144  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1379  transketolase  42.51 
 
 		 711 aa  514  1e-144  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.356531  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3238  transketolase  44.19 
 
 		 663 aa  514  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3322  transketolase  44.19 
 
 		 663 aa  513  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1538  transketolase  44.27 
 
 		 666 aa  515  1e-144  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0168278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5284  transketolase  41.62 
 
 		 691 aa  512  1e-144  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3313  transketolase  44.19 
 
 		 663 aa  514  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.333465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0551  transketolase  44.9 
 
 		 662 aa  512  1e-144  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2261  transketolase  44.6 
 
 		 666 aa  514  1e-144  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5573  transketolase  41.62 
 
 		 691 aa  512  1e-144  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2748  transketolase  44.02 
 
 		 690 aa  510  1e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.495668 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2579  transketolase  43.82 
 
 		 671 aa  511  1e-143  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0249  transketolase  43.33 
 
 		 664 aa  511  1e-143  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0752  transketolase  44.43 
 
 		 664 aa  510  1e-143  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.394111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3722  transketolase  44.6 
 
 		 690 aa  509  1e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.323338 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0562  transketolase  44.53 
 
 		 690 aa  510  1e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.32365 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0155  transketolase  44.53 
 
 		 690 aa  510  1e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3250  transketolase  44.72 
 
 		 664 aa  510  1e-143  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.456833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0605  transketolase  44.53 
 
 		 690 aa  510  1e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0697832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0538  transketolase  44.53 
 
 		 690 aa  512  1e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.242033  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0638  transketolase  44.53 
 
 		 690 aa  510  1e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0364868  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3353  transketolase  44.56 
 
 		 664 aa  509  1e-143  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.741116  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>