More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1933 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003912  CJE1817  transketolase  64.33 
 
 		 632 aa  829    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0116  transketolase  63.28 
 
 		 634 aa  833    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.984177  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1735  transketolase  66.24 
 
 		 636 aa  877    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00492424  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1636  transketolase  64.01 
 
 		 632 aa  825    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0338  transketolase  64.58 
 
 		 639 aa  865    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.025251  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0202  transketolase  61.08 
 
 		 636 aa  824    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2005  transketolase  63.81 
 
 		 632 aa  823    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0069  transketolase  67.76 
 
 		 636 aa  901    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.874951  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1933  transketolase  100 
 
 		 656 aa  1364    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0069  transketolase  65.77 
 
 		 633 aa  873    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.317261  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2804  transketolase  48.65 
 
 		 665 aa  586  1e-166  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0616  transketolase  46.41 
 
 		 666 aa  585  1e-166  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0309  transketolase  46.64 
 
 		 684 aa  582  1.0000000000000001e-165  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000137507 
 
 
-
 
NC_002936  DET0644  transketolase  46.07 
 
 		 666 aa  580  1e-164  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0678  transketolase  46.07 
 
 		 666 aa  580  1e-164  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3718  transketolase  47.34 
 
 		 666 aa  580  1e-164  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000892016  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2102  transketolase  46.63 
 
 		 668 aa  579  1e-164  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000131444  normal  0.204144 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1904  transketolase  45.14 
 
 		 668 aa  580  1e-164  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_584  transketolase  45.62 
 
 		 666 aa  579  1e-164  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0367  transketolase  45.69 
 
 		 671 aa  577  1.0000000000000001e-163  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0201094  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2336  transketolase  46.42 
 
 		 666 aa  575  1.0000000000000001e-163  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000657537  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3470  transketolase  47.34 
 
 		 666 aa  578  1.0000000000000001e-163  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000202879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3436  transketolase  47.18 
 
 		 666 aa  578  1.0000000000000001e-163  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000116203  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3388  transketolase  47.18 
 
 		 666 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000543798  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3125  transketolase  46.5 
 
 		 664 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3744  transketolase  47.34 
 
 		 666 aa  578  1.0000000000000001e-163  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000152991  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3699  transketolase  47.03 
 
 		 680 aa  576  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000172901 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3742  transketolase  47.18 
 
 		 666 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000620958  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0946  transketolase  47.06 
 
 		 665 aa  575  1.0000000000000001e-163  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2148  transketolase  46.27 
 
 		 671 aa  577  1.0000000000000001e-163  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1524  transketolase  46.73 
 
 		 680 aa  572  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000346626  normal  0.0243149 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3369  transketolase  46.88 
 
 		 666 aa  575  1.0000000000000001e-162  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00015872  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0487  transketolase  46.21 
 
 		 667 aa  564  1.0000000000000001e-159  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.33279  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0554  transketolase  46.47 
 
 		 665 aa  561  1.0000000000000001e-159  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1241  transketolase  46.11 
 
 		 668 aa  565  1.0000000000000001e-159  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000546415  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3790  transketolase  46.88 
 
 		 666 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00258353  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0472  transketolase  46.79 
 
 		 682 aa  561  1e-158  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3415  transketolase  46.54 
 
 		 662 aa  558  1e-157  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1311  transketolase  47.06 
 
 		 654 aa  555  1e-157  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1883  transketolase  46.46 
 
 		 672 aa  556  1e-157  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.768149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0841  transketolase  46.02 
 
 		 679 aa  558  1e-157  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3879  transketolase  45.76 
 
 		 675 aa  556  1e-157  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.657918 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0520  transketolase  46 
 
 		 663 aa  553  1e-156  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0565  transketolase  45.6 
 
 		 680 aa  552  1e-156  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0026  transketolase  46.2 
 
 		 694 aa  552  1e-156  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0910343  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2808  transketolase  46.45 
 
 		 697 aa  554  1e-156  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.189513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2122  transketolase  45.52 
 
 		 668 aa  550  1e-155  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1828  transketolase  44.05 
 
 		 653 aa  549  1e-155  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.208586  normal  0.379943 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03290  transketolase  45.37 
 
 		 661 aa  548  1e-155  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14410  transketolase  46.12 
 
 		 660 aa  550  1e-155  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2601  transketolase  47.53 
 
 		 668 aa  550  1e-155  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000100411  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0311  transketolase  46.53 
 
 		 665 aa  546  1e-154  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.554758  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2903  transketolase  43.68 
 
 		 711 aa  547  1e-154  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000161618 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1843  transketolase  45.17 
 
 		 676 aa  547  1e-154  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0227  transketolase  44.7 
 
 		 657 aa  546  1e-154  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1849  transketolase  44.66 
 
 		 665 aa  546  1e-154  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.322822 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1379  transketolase  44.48 
 
 		 711 aa  547  1e-154  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.356531  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1522  transketolase  45.17 
 
 		 676 aa  547  1e-154  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.566213 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0014  transketolase  46.02 
 
 		 660 aa  543  1e-153  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15980  transketolase  44.98 
 
 		 699 aa  545  1e-153  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0310968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1617  transketolase  44.66 
 
 		 665 aa  542  1e-153  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.804069 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0300  transketolase  46.22 
 
 		 665 aa  543  1e-153  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0289  transketolase  45.92 
 
 		 665 aa  543  1e-153  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0730452  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4499  transketolase  45.65 
 
 		 688 aa  544  1e-153  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5284  transketolase  44.05 
 
 		 691 aa  545  1e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0552  transketolase  44.66 
 
 		 664 aa  543  1e-153  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5573  transketolase  44.05 
 
 		 691 aa  545  1e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3352  transketolase  43.9 
 
 		 664 aa  540  9.999999999999999e-153  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0249  transketolase  44.04 
 
 		 664 aa  539  9.999999999999999e-153  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0315  transketolase  44.44 
 
 		 665 aa  540  9.999999999999999e-153  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0847  transketolase  43.9 
 
 		 664 aa  540  9.999999999999999e-153  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0850  transketolase  43.9 
 
 		 664 aa  540  9.999999999999999e-153  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.889577  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03567  transketolase  45.63 
 
 		 675 aa  539  9.999999999999999e-153  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0137  transketolase  44.33 
 
 		 666 aa  536  1e-151  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0912  transketolase  45.47 
 
 		 662 aa  538  1e-151  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.240506  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4792  transketolase  45.05 
 
 		 665 aa  536  1e-151  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00646987 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0551  transketolase  44.66 
 
 		 662 aa  536  1e-151  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000495  transketolase  46.07 
 
 		 663 aa  536  1e-151  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.585942  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1403  transketolase  45.26 
 
 		 662 aa  535  1e-150  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.194488  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1538  transketolase  44.05 
 
 		 666 aa  533  1e-150  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0168278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4614  transketolase  44.53 
 
 		 674 aa  533  1e-150  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.566503 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1430  transketolase  45.26 
 
 		 662 aa  535  1e-150  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2405  transketolase  43.5 
 
 		 682 aa  534  1e-150  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1052  transketolase  44.41 
 
 		 671 aa  534  1e-150  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.25792  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05570  transketolase  44.95 
 
 		 665 aa  534  1e-150  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3479  transketolase  44.97 
 
 		 655 aa  533  1e-150  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0109031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0460  transketolase  45.74 
 
 		 698 aa  531  1e-149  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.857831  normal  0.375749 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2305  transketolase  46.54 
 
 		 691 aa  530  1e-149  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.275969 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2841  transketolase  43.55 
 
 		 677 aa  531  1e-149  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1698  transketolase  44.2 
 
 		 691 aa  529  1e-149  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0510  transketolase  43.64 
 
 		 664 aa  530  1e-149  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06257  transketolase  45.09 
 
 		 668 aa  531  1e-149  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2023  transketolase  43.48 
 
 		 655 aa  530  1e-149  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.98963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0339  transketolase  44.18 
 
 		 667 aa  528  1e-149  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5124  transketolase  42.49 
 
 		 671 aa  529  1e-149  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0651  transketolase  44.34 
 
 		 723 aa  525  1e-148  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3252  transketolase  45.07 
 
 		 663 aa  526  1e-148  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2748  transketolase  43.16 
 
 		 690 aa  528  1e-148  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.495668 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3353  transketolase  44.78 
 
 		 664 aa  528  1e-148  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.741116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1127  transketolase  43.24 
 
 		 692 aa  528  1e-148  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0296008 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>