More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0338 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0202  transketolase  59.17 
 
 		 636 aa  782    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1817  transketolase  58.59 
 
 		 632 aa  753    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1735  transketolase  61.56 
 
 		 636 aa  796    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00492424  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0069  transketolase  62.62 
 
 		 636 aa  810    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.874951  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2005  transketolase  58.75 
 
 		 632 aa  748    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0338  transketolase  100 
 
 		 639 aa  1325    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.025251  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1636  transketolase  58.44 
 
 		 632 aa  751    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0116  transketolase  60.75 
 
 		 634 aa  773    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.984177  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1933  transketolase  64.58 
 
 		 656 aa  865    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0069  transketolase  61.51 
 
 		 633 aa  811    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.317261  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3125  transketolase  44.92 
 
 		 664 aa  569  1e-161  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0367  transketolase  44.79 
 
 		 671 aa  570  1e-161  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0201094  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3415  transketolase  45.4 
 
 		 662 aa  567  1e-160  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1241  transketolase  45.4 
 
 		 668 aa  562  1.0000000000000001e-159  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000546415  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0014  transketolase  45.33 
 
 		 660 aa  558  1e-158  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2122  transketolase  44.86 
 
 		 668 aa  560  1e-158  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0946  transketolase  45.4 
 
 		 665 aa  555  1e-157  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2808  transketolase  45.54 
 
 		 697 aa  558  1e-157  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.189513  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0644  transketolase  44.7 
 
 		 666 aa  553  1e-156  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0678  transketolase  44.7 
 
 		 666 aa  553  1e-156  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3369  transketolase  43.74 
 
 		 666 aa  549  1e-155  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00015872  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1883  transketolase  44.98 
 
 		 672 aa  550  1e-155  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.768149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3742  transketolase  43.59 
 
 		 666 aa  546  1e-154  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000620958  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0487  transketolase  43.16 
 
 		 667 aa  548  1e-154  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.33279  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1524  transketolase  43.59 
 
 		 680 aa  546  1e-154  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000346626  normal  0.0243149 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3470  transketolase  43.44 
 
 		 666 aa  546  1e-154  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000202879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3436  transketolase  43.67 
 
 		 666 aa  547  1e-154  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000116203  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3388  transketolase  43.59 
 
 		 666 aa  546  1e-154  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000543798  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1904  transketolase  43.27 
 
 		 668 aa  547  1e-154  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3699  transketolase  43.59 
 
 		 680 aa  548  1e-154  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000172901 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2336  transketolase  43.44 
 
 		 666 aa  548  1e-154  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000657537  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2102  transketolase  43.48 
 
 		 668 aa  545  1e-154  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000131444  normal  0.204144 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3744  transketolase  43.44 
 
 		 666 aa  546  1e-154  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000152991  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0616  transketolase  44.24 
 
 		 666 aa  546  1e-154  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0841  transketolase  45.1 
 
 		 679 aa  548  1e-154  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3790  transketolase  43.89 
 
 		 666 aa  542  1e-153  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00258353  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3718  transketolase  43.44 
 
 		 666 aa  545  1e-153  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000892016  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1403  transketolase  44.48 
 
 		 662 aa  544  1e-153  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.194488  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1430  transketolase  44.48 
 
 		 662 aa  544  1e-153  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_584  transketolase  44.31 
 
 		 666 aa  544  1e-153  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0137  transketolase  42.86 
 
 		 666 aa  540  9.999999999999999e-153  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2148  transketolase  45.12 
 
 		 671 aa  541  9.999999999999999e-153  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0912  transketolase  43.33 
 
 		 662 aa  538  1e-151  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.240506  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2283  transketolase  46.3 
 
 		 667 aa  536  1e-151  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0932399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1828  transketolase  42.9 
 
 		 653 aa  537  1e-151  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.208586  normal  0.379943 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1311  transketolase  44.48 
 
 		 654 aa  532  1e-150  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2804  transketolase  44.36 
 
 		 665 aa  533  1e-150  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0472  transketolase  44.31 
 
 		 682 aa  533  1e-150  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2601  transketolase  46.42 
 
 		 668 aa  533  1e-150  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000100411  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03290  transketolase  43.13 
 
 		 661 aa  528  1e-149  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0561  transketolase  42.28 
 
 		 661 aa  529  1e-149  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0315  transketolase  43.01 
 
 		 665 aa  530  1e-149  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1849  transketolase  43.92 
 
 		 665 aa  530  1e-149  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.322822 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3352  transketolase  44.71 
 
 		 664 aa  529  1e-149  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14410  transketolase  43.22 
 
 		 660 aa  531  1e-149  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3411  transketolase  43.84 
 
 		 664 aa  527  1e-148  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.856564  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3388  transketolase  44.44 
 
 		 664 aa  528  1e-148  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.170816  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3413  transketolase  44.14 
 
 		 664 aa  526  1e-148  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3165  transketolase  44.14 
 
 		 664 aa  528  1e-148  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2903  transketolase  41.8 
 
 		 711 aa  526  1e-148  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000161618 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0465  transketolase  42 
 
 		 663 aa  527  1e-148  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0850  transketolase  44.56 
 
 		 664 aa  528  1e-148  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.889577  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0847  transketolase  44.56 
 
 		 664 aa  528  1e-148  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3401  transketolase  43.99 
 
 		 664 aa  524  1e-147  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3082  transketolase  43.99 
 
 		 664 aa  524  1e-147  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1379  transketolase  41 
 
 		 711 aa  525  1e-147  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.356531  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0565  transketolase  45.03 
 
 		 680 aa  523  1e-147  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0552  transketolase  42.64 
 
 		 664 aa  524  1e-147  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0745  transketolase  43.2 
 
 		 664 aa  523  1e-147  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.94211  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0538  transketolase  46 
 
 		 668 aa  524  1e-147  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0220  transketolase  43.39 
 
 		 681 aa  525  1e-147  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00103383 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0460  transketolase  43.5 
 
 		 698 aa  522  1e-147  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.857831  normal  0.375749 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15980  transketolase  41.75 
 
 		 699 aa  524  1e-147  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0310968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1968  transketolase  42.35 
 
 		 655 aa  523  1e-147  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00341468  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0551  transketolase  43.91 
 
 		 662 aa  523  1e-147  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3250  transketolase  45.44 
 
 		 664 aa  522  1e-147  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.456833  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3703  transketolase  43.35 
 
 		 664 aa  524  1e-147  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.94599  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1844  transketolase  43.99 
 
 		 664 aa  522  1e-147  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.862582 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4065  transketolase  44.31 
 
 		 668 aa  520  1e-146  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3181  transketolase  43.48 
 
 		 674 aa  521  1e-146  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2989  transketolase  45.25 
 
 		 671 aa  520  1e-146  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1617  transketolase  43.53 
 
 		 665 aa  521  1e-146  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.804069 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0554  transketolase  44.21 
 
 		 665 aa  521  1e-146  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3432  transketolase  43.48 
 
 		 674 aa  521  1e-146  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0872  transketolase  45.14 
 
 		 664 aa  520  1e-146  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2249  transketolase  44.53 
 
 		 663 aa  520  1e-146  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0965691  hitchhiker  0.0000320127 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1547  transketolase  43.31 
 
 		 659 aa  519  1e-146  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.45317  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2874  transketolase  43.2 
 
 		 687 aa  518  1e-146  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.610912  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0026  transketolase  44.83 
 
 		 694 aa  520  1e-146  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0910343  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0773  transketolase  45.29 
 
 		 664 aa  520  1e-146  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0232346  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2579  transketolase  45.25 
 
 		 671 aa  520  1e-146  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2023  transketolase  42.59 
 
 		 655 aa  519  1e-146  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.98963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1538  transketolase  43.23 
 
 		 666 aa  520  1e-146  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0168278  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0510  transketolase  43.07 
 
 		 664 aa  521  1e-146  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3353  transketolase  45.14 
 
 		 664 aa  521  1e-146  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.741116  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0387  transketolase  41.24 
 
 		 690 aa  518  1.0000000000000001e-145  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2025  transketolase  41.8 
 
 		 686 aa  516  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.410571 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0752  transketolase  44.46 
 
 		 664 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.394111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4499  transketolase  40.77 
 
 		 688 aa  516  1.0000000000000001e-145  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0876  transketolase  44.78 
 
 		 663 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>