More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene JJD26997_2005 on replicon NC_009707
Organism: Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE1817  transketolase  98.1 
 
 
632 aa  1273    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1636  transketolase  97.78 
 
 
632 aa  1272    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0116  transketolase  78.54 
 
 
634 aa  1020    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.984177  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1933  transketolase  63.81 
 
 
656 aa  823    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2005  transketolase  100 
 
 
632 aa  1292    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0338  transketolase  58.75 
 
 
639 aa  748    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.025251  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1735  transketolase  68.46 
 
 
636 aa  869    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00492424  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0202  transketolase  62.72 
 
 
636 aa  830    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0069  transketolase  68.62 
 
 
636 aa  874    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.874951  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0069  transketolase  67.36 
 
 
633 aa  873    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.317261  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0384  transketolase  46.32 
 
 
663 aa  532  1e-150  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0651  transketolase  44.95 
 
 
723 aa  530  1e-149  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3415  transketolase  45.44 
 
 
662 aa  531  1e-149  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07130  transketolase  44.95 
 
 
665 aa  531  1e-149  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3352  transketolase  45.41 
 
 
664 aa  525  1e-148  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0552  transketolase  44.66 
 
 
664 aa  527  1e-148  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2102  transketolase  44.51 
 
 
668 aa  528  1e-148  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000131444  normal  0.204144 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3125  transketolase  43.36 
 
 
664 aa  526  1e-148  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0367  transketolase  44.51 
 
 
671 aa  526  1e-148  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0201094  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1241  transketolase  44.79 
 
 
668 aa  522  1e-147  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000546415  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1617  transketolase  44.43 
 
 
665 aa  525  1e-147  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.804069 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0850  transketolase  45.26 
 
 
664 aa  523  1e-147  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.889577  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0847  transketolase  45.26 
 
 
664 aa  523  1e-147  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1311  transketolase  46.2 
 
 
654 aa  523  1e-147  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0409  transketolase  45.65 
 
 
662 aa  518  1e-146  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.148616  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1883  transketolase  44.07 
 
 
672 aa  520  1e-146  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.768149  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0353  transketolase  44.66 
 
 
663 aa  521  1e-146  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1849  transketolase  44.27 
 
 
665 aa  518  1e-146  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.322822 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02765  transketolase 1, thiamin-binding  44.29 
 
 
663 aa  516  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0759  transketolase  44.29 
 
 
663 aa  516  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1904  transketolase  42.51 
 
 
668 aa  515  1.0000000000000001e-145  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0385  transketolase  44.51 
 
 
665 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3470  transketolase  43.35 
 
 
666 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000202879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3436  transketolase  43.35 
 
 
666 aa  517  1.0000000000000001e-145  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000116203  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3388  transketolase  43.35 
 
 
666 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000543798  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4792  transketolase  44.6 
 
 
665 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00646987 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0510  transketolase  44.95 
 
 
664 aa  517  1.0000000000000001e-145  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4237  transketolase  44.29 
 
 
663 aa  516  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3744  transketolase  43.35 
 
 
666 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000152991  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3369  transketolase  43.05 
 
 
666 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00015872  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3269  transketolase  44.29 
 
 
663 aa  516  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0776  transketolase  44.29 
 
 
663 aa  516  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0260346 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3742  transketolase  43.35 
 
 
666 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000620958  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3093  transketolase  44.29 
 
 
663 aa  516  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3077  transketolase  44.29 
 
 
663 aa  517  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00342437 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02728  hypothetical protein  44.29 
 
 
663 aa  516  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3699  transketolase  43.35 
 
 
680 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000172901 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2336  transketolase  42.9 
 
 
666 aa  512  1e-144  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000657537  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3480  transketolase  45.41 
 
 
664 aa  514  1e-144  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.661363  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3718  transketolase  43.05 
 
 
666 aa  512  1e-144  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000892016  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0520  transketolase  45.22 
 
 
663 aa  514  1e-144  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1524  transketolase  43.05 
 
 
680 aa  514  1e-144  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000346626  normal  0.0243149 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0309  transketolase  44.36 
 
 
684 aa  514  1e-144  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000137507 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0026  transketolase  44.33 
 
 
694 aa  513  1e-144  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0910343  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0472  transketolase  45.07 
 
 
667 aa  513  1e-144  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0841196  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3954  transketolase  45.26 
 
 
664 aa  513  1e-144  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0554  transketolase  45.22 
 
 
665 aa  514  1e-144  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3367  transketolase  44.14 
 
 
663 aa  514  1e-144  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05570  transketolase  43.88 
 
 
665 aa  513  1e-144  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0565  transketolase  44.55 
 
 
680 aa  513  1e-144  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2808  transketolase  43.61 
 
 
697 aa  514  1e-144  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.189513  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2841  transketolase  44.38 
 
 
665 aa  512  1e-144  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0644  transketolase  44.13 
 
 
666 aa  508  1e-143  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0678  transketolase  44.13 
 
 
666 aa  508  1e-143  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0227  transketolase  43.43 
 
 
657 aa  509  1e-143  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2122  transketolase  44 
 
 
668 aa  511  1e-143  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03567  transketolase  45.54 
 
 
675 aa  508  1e-143  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0616  transketolase  44.65 
 
 
666 aa  511  1e-143  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_584  transketolase  44.29 
 
 
666 aa  509  1e-143  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5284  transketolase  41.34 
 
 
691 aa  508  1e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2261  transketolase  44.29 
 
 
666 aa  509  1e-143  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5573  transketolase  41.34 
 
 
691 aa  508  1e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2853  transketolase  45.04 
 
 
665 aa  505  9.999999999999999e-143  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4965  transketolase  43.43 
 
 
665 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1538  transketolase  43.51 
 
 
666 aa  505  9.999999999999999e-143  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0168278  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3252  transketolase  45.04 
 
 
663 aa  505  9.999999999999999e-143  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3790  transketolase  43.2 
 
 
666 aa  507  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00258353  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3418  transketolase  44.04 
 
 
663 aa  506  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0637477 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4838  transketolase  43.43 
 
 
665 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3313  transketolase  44.04 
 
 
663 aa  506  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.333465  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3256  transketolase  44.04 
 
 
663 aa  506  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1379  transketolase  42.37 
 
 
711 aa  508  9.999999999999999e-143  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.356531  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3238  transketolase  44.04 
 
 
663 aa  506  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3322  transketolase  44.04 
 
 
663 aa  506  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0551  transketolase  45.21 
 
 
662 aa  508  9.999999999999999e-143  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0249  transketolase  42.79 
 
 
664 aa  507  9.999999999999999e-143  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3341  transketolase  43.27 
 
 
663 aa  506  9.999999999999999e-143  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0470091 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0605  transketolase  43.92 
 
 
690 aa  502  1e-141  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0697832  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0745  transketolase  43.88 
 
 
664 aa  504  1e-141  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.94211  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2989  transketolase  43.53 
 
 
671 aa  504  1e-141  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5267  transketolase  44.04 
 
 
681 aa  505  1e-141  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2903  transketolase  41.77 
 
 
711 aa  502  1e-141  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000161618 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0155  transketolase  43.92 
 
 
690 aa  502  1e-141  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3330  transketolase  44.65 
 
 
666 aa  502  1e-141  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0024244  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3250  transketolase  44.56 
 
 
664 aa  504  1e-141  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.456833  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0538  transketolase  43.92 
 
 
690 aa  505  1e-141  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.242033  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0638  transketolase  43.92 
 
 
690 aa  502  1e-141  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0364868  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3703  transketolase  44.34 
 
 
664 aa  503  1e-141  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.94599  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3353  transketolase  44.26 
 
 
664 aa  503  1e-141  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.741116  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2148  transketolase  44.22 
 
 
671 aa  504  1e-141  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>