More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0530 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_0530  transketolase  100 
 
 
677 aa  1395    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3805  transketolase  59.94 
 
 
662 aa  810    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.437191 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_50819  transketolase  51.6 
 
 
711 aa  672    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.21265  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1241  transketolase  46.97 
 
 
668 aa  591  1e-167  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000546415  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3369  transketolase  45.56 
 
 
666 aa  575  1.0000000000000001e-163  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00015872  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3699  transketolase  45.12 
 
 
680 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000172901 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3470  transketolase  45.27 
 
 
666 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000202879  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3388  transketolase  45.12 
 
 
666 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000543798  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3742  transketolase  45.12 
 
 
666 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000620958  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3744  transketolase  45.27 
 
 
666 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000152991  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1524  transketolase  45.41 
 
 
680 aa  574  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000346626  normal  0.0243149 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3436  transketolase  45.12 
 
 
666 aa  572  1e-161  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000116203  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2336  transketolase  45.41 
 
 
666 aa  572  1e-161  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000657537  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2122  transketolase  46.38 
 
 
668 aa  571  1e-161  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3718  transketolase  44.82 
 
 
666 aa  568  1e-160  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000892016  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3790  transketolase  45.12 
 
 
666 aa  565  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00258353  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14410  transketolase  45.16 
 
 
660 aa  563  1.0000000000000001e-159  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03290  transketolase  44.99 
 
 
661 aa  559  1e-158  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1547  transketolase  45.45 
 
 
659 aa  557  1e-157  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.45317  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3765  transketolase  45.31 
 
 
659 aa  554  1e-156  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0349  transketolase  45.45 
 
 
658 aa  553  1e-156  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.515184  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0912  transketolase  42.73 
 
 
662 aa  546  1e-154  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.240506  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1430  transketolase  42.81 
 
 
662 aa  546  1e-154  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1403  transketolase  42.81 
 
 
662 aa  546  1e-154  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.194488  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0131  transketolase  42.98 
 
 
666 aa  536  1e-151  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0487  transketolase  44.07 
 
 
667 aa  537  1e-151  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.33279  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0847  transketolase  44.23 
 
 
664 aa  532  1e-150  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0850  transketolase  44.23 
 
 
664 aa  532  1e-150  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.889577  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0278  transketolase  44.94 
 
 
661 aa  531  1e-149  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3352  transketolase  44.08 
 
 
664 aa  531  1e-149  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0946  transketolase  43.69 
 
 
665 aa  529  1e-149  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0472  transketolase  44.08 
 
 
682 aa  529  1e-149  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3082  transketolase  43.6 
 
 
664 aa  526  1e-148  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3413  transketolase  43.28 
 
 
664 aa  527  1e-148  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0552  transketolase  45.41 
 
 
664 aa  525  1e-148  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0510  transketolase  45.54 
 
 
664 aa  528  1e-148  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3388  transketolase  43.43 
 
 
664 aa  525  1e-147  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.170816  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3411  transketolase  42.99 
 
 
664 aa  523  1e-147  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.856564  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3165  transketolase  43.28 
 
 
664 aa  524  1e-147  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3401  transketolase  43.45 
 
 
664 aa  523  1e-147  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1883  transketolase  45.74 
 
 
672 aa  522  1e-147  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.768149  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17981  transketolase  43.43 
 
 
668 aa  525  1e-147  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0551  transketolase  44.35 
 
 
662 aa  524  1e-147  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1734  transketolase  45.07 
 
 
658 aa  524  1e-147  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.901909  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1844  transketolase  43.43 
 
 
664 aa  522  1e-146  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.862582 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0384  transketolase  43.7 
 
 
663 aa  520  1e-146  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3879  transketolase  45.21 
 
 
675 aa  522  1e-146  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.657918 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3415  transketolase  44.16 
 
 
662 aa  519  1e-146  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0981  transketolase  44.2 
 
 
664 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.959252  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3900  transketolase  44.08 
 
 
664 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3703  transketolase  44.49 
 
 
664 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.94599  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18201  transketolase  43.52 
 
 
668 aa  515  1.0000000000000001e-145  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0745  transketolase  44.49 
 
 
664 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.94211  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3181  transketolase  42.96 
 
 
674 aa  514  1e-144  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3432  transketolase  42.96 
 
 
674 aa  514  1e-144  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1703  transketolase  43.52 
 
 
668 aa  514  1e-144  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02765  transketolase 1, thiamin-binding  44.03 
 
 
663 aa  509  1e-143  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0759  transketolase  44.03 
 
 
663 aa  509  1e-143  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3040  transketolase  42.77 
 
 
670 aa  511  1e-143  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0242601  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3046  transketolase  42.77 
 
 
670 aa  511  1e-143  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.590988  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0776  transketolase  44.03 
 
 
663 aa  509  1e-143  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0260346 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1538  transketolase  42.39 
 
 
666 aa  511  1e-143  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0168278  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0309  transketolase  43.41 
 
 
684 aa  509  1e-143  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000137507 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02728  hypothetical protein  44.03 
 
 
663 aa  509  1e-143  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2893  transketolase  42.88 
 
 
665 aa  511  1e-143  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3077  transketolase  44.03 
 
 
663 aa  509  1e-143  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00342437 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3269  transketolase  43.88 
 
 
663 aa  509  1e-143  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4237  transketolase  43.88 
 
 
663 aa  509  1e-143  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3093  transketolase  44.03 
 
 
663 aa  509  1e-143  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03160  transketolase 1 (TK 1)  43.22 
 
 
663 aa  508  9.999999999999999e-143  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3686  transketolase  43.22 
 
 
667 aa  506  9.999999999999999e-143  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.709027  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1308  transketolase  42.58 
 
 
675 aa  506  9.999999999999999e-143  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3256  transketolase  43.73 
 
 
663 aa  506  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18031  transketolase  42.65 
 
 
668 aa  508  9.999999999999999e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3367  transketolase  43.58 
 
 
663 aa  506  9.999999999999999e-143  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3480  transketolase  42.37 
 
 
664 aa  507  9.999999999999999e-143  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.661363  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0416  transketolase  44.06 
 
 
678 aa  508  9.999999999999999e-143  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.985586  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17351  transketolase  43.13 
 
 
669 aa  505  9.999999999999999e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.625161  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0014  transketolase  41.96 
 
 
660 aa  506  9.999999999999999e-143  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3954  transketolase  42.37 
 
 
664 aa  507  9.999999999999999e-143  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5284  transketolase  43.89 
 
 
691 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0554  transketolase  42.88 
 
 
665 aa  505  9.999999999999999e-143  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5573  transketolase  43.89 
 
 
691 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3238  transketolase  43.75 
 
 
663 aa  506  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3313  transketolase  43.73 
 
 
663 aa  506  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.333465  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02356  transketolase 2, thiamin-binding  43.07 
 
 
667 aa  504  1e-141  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1205  transketolase  43.07 
 
 
667 aa  504  1e-141  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2611  transketolase  43.07 
 
 
667 aa  504  1e-141  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1904  transketolase  41.87 
 
 
668 aa  504  1e-141  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0227  transketolase  43.33 
 
 
657 aa  502  1e-141  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0872  transketolase  43.11 
 
 
664 aa  504  1e-141  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2743  transketolase  43.07 
 
 
667 aa  503  1e-141  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1212  transketolase  43.07 
 
 
667 aa  504  1e-141  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4614  transketolase  43.26 
 
 
674 aa  503  1e-141  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.566503 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0311  transketolase  44.54 
 
 
665 aa  503  1e-141  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.554758  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02318  hypothetical protein  43.07 
 
 
667 aa  504  1e-141  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3322  transketolase  43.58 
 
 
663 aa  505  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1480  transketolase  40.77 
 
 
679 aa  505  1e-141  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.7705  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2594  transketolase  42.92 
 
 
667 aa  502  1e-141  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3341  transketolase  43.49 
 
 
663 aa  499  1e-140  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0470091 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>