More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0131 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  TC0131  transketolase  100 
 
 		 666 aa  1377    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03290  transketolase  49.7 
 
 		 661 aa  635    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14410  transketolase  49.47 
 
 		 660 aa  638    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1241  transketolase  47.24 
 
 		 668 aa  595  1e-169  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000546415  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0278  transketolase  47.35 
 
 		 661 aa  594  1e-168  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2336  transketolase  45.93 
 
 		 666 aa  587  1e-166  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000657537  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3388  transketolase  48.1 
 
 		 664 aa  585  1e-166  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.170816  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1844  transketolase  48.33 
 
 		 664 aa  587  1e-166  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.862582 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1734  transketolase  46.82 
 
 		 658 aa  585  1e-166  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.901909  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1308  transketolase  46.59 
 
 		 675 aa  583  1.0000000000000001e-165  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0912  transketolase  47.18 
 
 		 662 aa  583  1.0000000000000001e-165  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.240506  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3411  transketolase  47.87 
 
 		 664 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.856564  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4614  transketolase  47.97 
 
 		 674 aa  585  1.0000000000000001e-165  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.566503 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2122  transketolase  47 
 
 		 668 aa  582  1.0000000000000001e-165  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3165  transketolase  47.72 
 
 		 664 aa  580  1e-164  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3082  transketolase  47.72 
 
 		 664 aa  579  1e-164  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3401  transketolase  47.87 
 
 		 664 aa  581  1e-164  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3413  transketolase  47.87 
 
 		 664 aa  581  1e-164  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2102  transketolase  44.11 
 
 		 668 aa  579  1e-164  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000131444  normal  0.204144 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0154  transketolase  45.11 
 
 		 668 aa  577  1.0000000000000001e-163  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0139  transketolase  44.66 
 
 		 668 aa  576  1.0000000000000001e-163  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1904  transketolase  45.04 
 
 		 668 aa  577  1.0000000000000001e-163  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3415  transketolase  44.75 
 
 		 662 aa  578  1.0000000000000001e-163  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0416  transketolase  48.04 
 
 		 678 aa  577  1.0000000000000001e-163  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.985586  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1883  transketolase  47.01 
 
 		 672 aa  572  1.0000000000000001e-162  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.768149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0551  transketolase  45.52 
 
 		 662 aa  573  1.0000000000000001e-162  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3040  transketolase  45.23 
 
 		 670 aa  569  1e-161  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0242601  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3046  transketolase  45.23 
 
 		 670 aa  568  1e-161  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.590988  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3718  transketolase  44.7 
 
 		 666 aa  569  1e-161  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000892016  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3181  transketolase  46.86 
 
 		 674 aa  570  1e-161  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3470  transketolase  44.85 
 
 		 666 aa  570  1e-161  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000202879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3436  transketolase  44.7 
 
 		 666 aa  571  1e-161  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000116203  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3388  transketolase  44.7 
 
 		 666 aa  569  1e-161  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000543798  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0946  transketolase  46.08 
 
 		 665 aa  570  1e-161  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3432  transketolase  46.86 
 
 		 674 aa  570  1e-161  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3744  transketolase  44.85 
 
 		 666 aa  570  1e-161  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000152991  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2390  transketolase  45.27 
 
 		 666 aa  571  1e-161  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0781466 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3742  transketolase  44.7 
 
 		 666 aa  569  1e-161  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000620958  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1524  transketolase  44.7 
 
 		 680 aa  570  1e-161  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000346626  normal  0.0243149 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3369  transketolase  44.39 
 
 		 666 aa  569  1e-161  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00015872  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3699  transketolase  44.7 
 
 		 680 aa  571  1e-161  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000172901 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1547  transketolase  45.78 
 
 		 659 aa  567  1e-160  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.45317  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3765  transketolase  45.78 
 
 		 659 aa  567  1e-160  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3790  transketolase  44.85 
 
 		 666 aa  567  1e-160  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00258353  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2594  transketolase  44.53 
 
 		 681 aa  562  1.0000000000000001e-159  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.123442 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1430  transketolase  45.12 
 
 		 662 aa  563  1.0000000000000001e-159  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3805  transketolase  45.52 
 
 		 662 aa  563  1.0000000000000001e-159  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.437191 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2893  transketolase  44.02 
 
 		 665 aa  563  1.0000000000000001e-159  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1403  transketolase  45.12 
 
 		 662 aa  563  1.0000000000000001e-159  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.194488  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03160  transketolase 1 (TK 1)  44.02 
 
 		 663 aa  563  1.0000000000000001e-159  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3252  transketolase  45.41 
 
 		 663 aa  560  1e-158  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2853  transketolase  45.41 
 
 		 665 aa  560  1e-158  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0227  transketolase  45.36 
 
 		 657 aa  555  1e-157  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2025  transketolase  44.21 
 
 		 686 aa  556  1e-157  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.410571 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0367  transketolase  43.9 
 
 		 671 aa  555  1e-157  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0201094  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1480  transketolase  43.33 
 
 		 679 aa  555  1e-157  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.7705  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0554  transketolase  44.75 
 
 		 665 aa  553  1e-156  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0026  transketolase  43.67 
 
 		 694 aa  552  1e-156  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0910343  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0651  transketolase  44.87 
 
 		 723 aa  553  1e-156  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1311  transketolase  45.91 
 
 		 654 aa  553  1e-156  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0409  transketolase  44.34 
 
 		 662 aa  555  1e-156  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.148616  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0841  transketolase  45.01 
 
 		 679 aa  553  1e-156  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2808  transketolase  43.24 
 
 		 697 aa  552  1e-156  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.189513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3330  transketolase  43.47 
 
 		 666 aa  553  1e-156  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0024244  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07130  transketolase  45.02 
 
 		 665 aa  555  1e-156  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02765  transketolase 1, thiamin-binding  43.77 
 
 		 663 aa  549  1e-155  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0759  transketolase  43.77 
 
 		 663 aa  549  1e-155  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0510  transketolase  44.07 
 
 		 664 aa  550  1e-155  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4237  transketolase  43.92 
 
 		 663 aa  549  1e-155  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0552  transketolase  43.92 
 
 		 664 aa  550  1e-155  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0565  transketolase  43.92 
 
 		 680 aa  550  1e-155  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0847  transketolase  43.42 
 
 		 664 aa  549  1e-155  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0776  transketolase  43.77 
 
 		 663 aa  549  1e-155  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0260346 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2960  transketolase  43.98 
 
 		 662 aa  549  1e-155  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.986583 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02728  hypothetical protein  43.77 
 
 		 663 aa  549  1e-155  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5299  transketolase  43.99 
 
 		 694 aa  548  1e-155  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0339  transketolase  43.79 
 
 		 667 aa  550  1e-155  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0850  transketolase  43.42 
 
 		 664 aa  549  1e-155  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.889577  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1309  transketolase  43.69 
 
 		 694 aa  550  1e-155  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369014  normal  0.106663 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3879  transketolase  47.21 
 
 		 675 aa  550  1e-155  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.657918 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0384  transketolase  44.56 
 
 		 663 aa  550  1e-155  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3093  transketolase  43.77 
 
 		 663 aa  549  1e-155  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3077  transketolase  43.77 
 
 		 663 aa  549  1e-155  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00342437 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3269  transketolase  43.92 
 
 		 663 aa  549  1e-155  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3352  transketolase  43.57 
 
 		 664 aa  551  1e-155  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02356  transketolase 2, thiamin-binding  43.98 
 
 		 667 aa  545  1e-154  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1205  transketolase  43.98 
 
 		 667 aa  545  1e-154  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1212  transketolase  43.98 
 
 		 667 aa  545  1e-154  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3341  transketolase  43.62 
 
 		 663 aa  547  1e-154  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0470091 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4319  transketolase  43.99 
 
 		 666 aa  547  1e-154  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.658339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3418  transketolase  43.77 
 
 		 663 aa  545  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0637477 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2667  transketolase  44.39 
 
 		 666 aa  545  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.562864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3313  transketolase  43.92 
 
 		 663 aa  546  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.333465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2283  transketolase  45.63 
 
 		 667 aa  548  1e-154  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0932399  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2707  transketolase  44.08 
 
 		 666 aa  545  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2743  transketolase  43.98 
 
 		 667 aa  545  1e-154  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3256  transketolase  43.92 
 
 		 663 aa  546  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0349  transketolase  45.04 
 
 		 658 aa  547  1e-154  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.515184  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1616  transketolase  43.87 
 
 		 662 aa  547  1e-154  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0712144  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3238  transketolase  43.92 
 
 		 663 aa  546  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>