More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0976 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0976  Transketolase domain protein  100 
 
 		 285 aa  592  1e-168  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.160297  normal  0.0621663 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2936  Transketolase domain protein  67.96 
 
 		 285 aa  383  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0874  Transketolase domain protein  60 
 
 		 281 aa  335  2.9999999999999997e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.677625  hitchhiker  0.00151524 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1894  transketolase  59.22 
 
 		 280 aa  333  2e-90  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00737367 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0048  transketolase domain-containing protein  64.47 
 
 		 282 aa  332  5e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1576  Transketolase domain protein  59.72 
 
 		 280 aa  328  8e-89  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.516999  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0391  Transketolase domain protein  57.89 
 
 		 280 aa  325  4.0000000000000003e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0504613 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00870  transketolase, N-terminal subunit  58.89 
 
 		 293 aa  318  7.999999999999999e-86  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1192  transketolase-like  52.17 
 
 		 301 aa  271  1e-71  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.437056 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1107  Transketolase domain protein  51.64 
 
 		 303 aa  267  1e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1190  Transketolase domain protein  50.18 
 
 		 303 aa  264  1e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00778844  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1437  transketolase-like  50.36 
 
 		 297 aa  263  2e-69  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05480  transketolase subunit A  47.67 
 
 		 275 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1373  Transketolase domain protein  48.38 
 
 		 303 aa  253  3e-66  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.160442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3075  transketolase domain-containing protein  48.91 
 
 		 271 aa  251  9.000000000000001e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0025975  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1184  Transketolase domain protein  50.9 
 
 		 305 aa  250  2e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2078  transketolase domain-containing protein  49.27 
 
 		 271 aa  250  2e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0968  transketolase domain-containing protein  47.46 
 
 		 273 aa  247  1e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0236  transketolase subunit A  45.82 
 
 		 271 aa  244  9.999999999999999e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1861  Transketolase domain protein  46.18 
 
 		 279 aa  242  3.9999999999999997e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0469  Transketolase domain protein  48.54 
 
 		 273 aa  241  1e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.833145  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1017  transketolase subunit A  50.18 
 
 		 303 aa  239  2.9999999999999997e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0292  putative transketolase, N-terminal subunit  44.49 
 
 		 274 aa  236  2e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3968  Transketolase domain protein  45.99 
 
 		 272 aa  236  2e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000279469  unclonable  0.000000000126614 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0287  transketolase  44.12 
 
 		 274 aa  234  9e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.132447  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1503  transketolase domain-containing protein  44.4 
 
 		 272 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0294001  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09030  transketolase subunit A  47.64 
 
 		 278 aa  232  5e-60  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.169995  normal  0.0273628 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1998  Transketolase domain protein  47.5 
 
 		 279 aa  232  6e-60  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.337759  hitchhiker  0.00336505 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2060  Transketolase domain protein  45.22 
 
 		 282 aa  231  9e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0334  Transketolase domain protein  45.26 
 
 		 286 aa  230  2e-59  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4745  Transketolase domain protein  43.48 
 
 		 277 aa  229  6e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1382  Transketolase domain protein  43.48 
 
 		 269 aa  225  8e-58  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2704  transketolase subunit A  42.34 
 
 		 281 aa  224  1e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000372386  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0172  Transketolase domain protein  45.42 
 
 		 273 aa  223  2e-57  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.906394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0551  transketolase subunit A  43.64 
 
 		 286 aa  223  4e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0440  transketolase  43.88 
 
 		 275 aa  222  7e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.707668  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1552  transketolase domain-containing protein  42.81 
 
 		 275 aa  220  3e-56  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.12208  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0367  transketolase domain-containing protein  42.81 
 
 		 275 aa  219  3e-56  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0144552 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0712  Transketolase domain protein  44 
 
 		 281 aa  219  3.9999999999999997e-56  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0142999  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2919  transketolase, N-terminal subunit  43.27 
 
 		 277 aa  218  8.999999999999998e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2214  transketolase subunit A  43.73 
 
 		 284 aa  217  2e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000519395  hitchhiker  0.000381558 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0469  transketolase subunit A  42.09 
 
 		 275 aa  217  2e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.125923  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2720  transketolase, N-terminal subunit  44.16 
 
 		 273 aa  211  9e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0243  transketolase-like protein  43.18 
 
 		 275 aa  211  9e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0491  transketolase domain-containing protein  41.97 
 
 		 276 aa  209  4e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0279  Transketolase domain protein  42.91 
 
 		 274 aa  209  5e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000402099  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0245  Transketolase domain protein  43.54 
 
 		 265 aa  208  8e-53  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.411817  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0264  Transketolase domain protein  42.55 
 
 		 274 aa  208  9e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00137267 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3879  transketolase-like  41.64 
 
 		 279 aa  207  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.521893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0333  Transketolase domain protein  41.09 
 
 		 309 aa  204  1e-51  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0339  Transketolase domain protein  41.29 
 
 		 280 aa  202  3e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2237  transketolase  43.48 
 
 		 689 aa  202  4e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1528  Transketolase domain protein  41.13 
 
 		 297 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1467  Transketolase domain protein  41.31 
 
 		 273 aa  194  9e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0268  transketolase  36.13 
 
 		 606 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2033  Transketolase domain protein  39.13 
 
 		 269 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.309611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1793  transketolase subunit A  39.64 
 
 		 297 aa  184  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0143837  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2255  Transketolase domain protein  38.77 
 
 		 269 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.158936  normal  0.0249782 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2647  Transketolase domain protein  37.91 
 
 		 276 aa  182  6e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.142698  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6294  Transketolase domain protein  37.09 
 
 		 283 aa  182  6e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.583889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0299  ribulose-phosphate 3-epimerase  38.08 
 
 		 555 aa  181  9.000000000000001e-45  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0242597 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1753  transketolase  39.86 
 
 		 618 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.599828  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0183  transketolase  38.25 
 
 		 640 aa  180  2.9999999999999997e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3128  transketolase domain-containing protein  38.04 
 
 		 281 aa  179  5.999999999999999e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.616231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2127  Transketolase domain protein  37.32 
 
 		 276 aa  178  1e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.359071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0406  transketolase domain-containing protein  38.75 
 
 		 302 aa  176  3e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.186012  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2401  transketolase, N-terminal subunit  35.77 
 
 		 278 aa  176  4e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.488371  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1059  transketolase subunit A  40 
 
 		 277 aa  176  5e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.579948 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3398  Transketolase domain protein  37.5 
 
 		 263 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2799  Transketolase domain protein  35.69 
 
 		 274 aa  172  7.999999999999999e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3383  transketolase domain-containing protein  38.4 
 
 		 276 aa  171  9e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1680  transketolase  38.46 
 
 		 623 aa  171  9e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0911  putative transketolase. N-terminal subunit  38.4 
 
 		 276 aa  171  9e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3249  putative transketolase. N-terminal subunit  38.4 
 
 		 276 aa  171  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3642  transketolase domain-containing protein  37.87 
 
 		 281 aa  171  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0863468 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2843  transketolase subunit A  37.94 
 
 		 276 aa  170  2e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.140333  normal  0.2899 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1946  transketolase  36.27 
 
 		 631 aa  169  4e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.120337  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0415  Transketolase central region  39.71 
 
 		 624 aa  169  5e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4777  transketolase, N-terminal  37.96 
 
 		 281 aa  169  7e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4664  transketolase domain-containing protein  35.38 
 
 		 289 aa  168  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1540  transketolase domain-containing protein  39.13 
 
 		 282 aa  167  2e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.220485  normal  0.477158 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0861  Transketolase domain protein  36.36 
 
 		 299 aa  167  2e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5660  Transketolase domain protein  34.87 
 
 		 294 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537076  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2614  transketolase domain-containing protein  37.82 
 
 		 285 aa  166  5e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.336925  normal  0.70131 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5877  transketolase domain-containing protein  37.5 
 
 		 283 aa  165  9e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5636  transketolase subunit A  33.45 
 
 		 282 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6423  transketolase-like  37.63 
 
 		 281 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1130  Transketolase central region  37.37 
 
 		 648 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6658  transketolase domain-containing protein  37.63 
 
 		 281 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6256  transketolase domain-containing protein  37.63 
 
 		 281 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.632041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4382  Transketolase domain protein  37.55 
 
 		 285 aa  163  3e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.415555  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1050  transketolase  36.84 
 
 		 635 aa  163  3e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1062  transketolase  36.84 
 
 		 635 aa  163  3e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1302  transketolase  36.3 
 
 		 653 aa  162  5.0000000000000005e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0226315  normal  0.530799 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3365  Transketolase domain protein  37.35 
 
 		 277 aa  162  5.0000000000000005e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4222  transketolase subunit A  36.26 
 
 		 270 aa  162  5.0000000000000005e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4274  transketolase domain-containing protein  37.77 
 
 		 287 aa  162  5.0000000000000005e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4412  transketolase domain-containing protein  37.05 
 
 		 281 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0693677 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14541  N-terminal subunit of transketolase  32.97 
 
 		 288 aa  161  1e-38  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3617  transketolase-like  38.28 
 
 		 281 aa  160  2e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.868014  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>