More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2255 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_2255  Transketolase domain protein  100 
 
 		 269 aa  561  1.0000000000000001e-159  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.158936  normal  0.0249782 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2033  Transketolase domain protein  95.54 
 
 		 269 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.309611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3128  transketolase domain-containing protein  82.53 
 
 		 281 aa  475  1e-133  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.616231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0406  transketolase domain-containing protein  55.73 
 
 		 302 aa  281  7.000000000000001e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.186012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1861  Transketolase domain protein  50.76 
 
 		 279 aa  266  2e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3968  Transketolase domain protein  49.43 
 
 		 272 aa  258  5.0000000000000005e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000279469  unclonable  0.000000000126614 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0469  Transketolase domain protein  51.14 
 
 		 273 aa  258  9e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.833145  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2060  Transketolase domain protein  47.01 
 
 		 282 aa  256  2e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2799  Transketolase domain protein  46.1 
 
 		 274 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0236  transketolase subunit A  47.01 
 
 		 271 aa  253  2.0000000000000002e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1382  Transketolase domain protein  45.15 
 
 		 269 aa  251  7e-66  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0968  transketolase domain-containing protein  46.27 
 
 		 273 aa  251  7e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0172  Transketolase domain protein  47.55 
 
 		 273 aa  248  5e-65  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.906394  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2401  transketolase, N-terminal subunit  46.67 
 
 		 278 aa  248  9e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.488371  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2127  Transketolase domain protein  44.85 
 
 		 276 aa  247  1e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.359071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3075  transketolase domain-containing protein  46.42 
 
 		 271 aa  247  2e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0025975  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2647  Transketolase domain protein  45.76 
 
 		 276 aa  243  3e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.142698  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0287  transketolase  43.56 
 
 		 274 aa  242  3.9999999999999997e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.132447  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0292  putative transketolase, N-terminal subunit  43.56 
 
 		 274 aa  242  5e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2078  transketolase domain-containing protein  49.06 
 
 		 271 aa  241  7e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0334  Transketolase domain protein  44.68 
 
 		 286 aa  241  1e-62  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1528  Transketolase domain protein  45.85 
 
 		 297 aa  239  2.9999999999999997e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3383  transketolase domain-containing protein  47.13 
 
 		 276 aa  239  5e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3249  putative transketolase. N-terminal subunit  47.13 
 
 		 276 aa  238  5e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0911  putative transketolase. N-terminal subunit  47.13 
 
 		 276 aa  239  5e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4745  Transketolase domain protein  46.62 
 
 		 277 aa  238  1e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2704  transketolase subunit A  44.98 
 
 		 281 aa  237  2e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000372386  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1503  transketolase domain-containing protein  42.59 
 
 		 272 aa  234  8e-61  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0294001  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0551  transketolase subunit A  43.23 
 
 		 286 aa  231  8.000000000000001e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0243  transketolase-like protein  44.75 
 
 		 275 aa  231  8.000000000000001e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0245  Transketolase domain protein  41.06 
 
 		 265 aa  230  2e-59  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.411817  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1998  Transketolase domain protein  47.01 
 
 		 279 aa  229  4e-59  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.337759  hitchhiker  0.00336505 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1793  transketolase subunit A  43.66 
 
 		 297 aa  229  4e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0143837  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05480  transketolase subunit A  42.44 
 
 		 275 aa  226  2e-58  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2919  transketolase, N-terminal subunit  43.23 
 
 		 277 aa  226  3e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4222  transketolase subunit A  43.12 
 
 		 270 aa  225  6e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0712  Transketolase domain protein  46.44 
 
 		 281 aa  225  7e-58  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0142999  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2214  transketolase subunit A  43.65 
 
 		 284 aa  225  7e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000519395  hitchhiker  0.000381558 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1467  Transketolase domain protein  42.32 
 
 		 273 aa  225  7e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3398  Transketolase domain protein  41.9 
 
 		 263 aa  224  1e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0491  transketolase domain-containing protein  43.4 
 
 		 276 aa  223  3e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09030  transketolase subunit A  44.28 
 
 		 278 aa  222  4e-57  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.169995  normal  0.0273628 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2237  transketolase  43.61 
 
 		 689 aa  221  9.999999999999999e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3879  transketolase-like  42.54 
 
 		 279 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.521893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1552  transketolase domain-containing protein  41.89 
 
 		 275 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.12208  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0367  transketolase domain-containing protein  41.89 
 
 		 275 aa  217  1e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0144552 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2443  transketolase subunit A  44.79 
 
 		 278 aa  217  2e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1924  transketolase domain-containing protein  42.26 
 
 		 281 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2720  transketolase, N-terminal subunit  41.83 
 
 		 273 aa  215  5e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0469  transketolase subunit A  41.51 
 
 		 275 aa  215  8e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.125923  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5636  transketolase subunit A  42.32 
 
 		 282 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1059  transketolase subunit A  44.92 
 
 		 277 aa  214  1.9999999999999998e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.579948 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0264  Transketolase domain protein  41.98 
 
 		 274 aa  212  4.9999999999999996e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00137267 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3529  Transketolase domain protein  41.85 
 
 		 267 aa  212  4.9999999999999996e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.322981  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0279  Transketolase domain protein  41.6 
 
 		 274 aa  211  7e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000402099  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14541  N-terminal subunit of transketolase  41.42 
 
 		 288 aa  211  9e-54  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0440  transketolase  39.03 
 
 		 275 aa  207  2e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.707668  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3643  Transketolase domain protein  40.74 
 
 		 267 aa  203  2e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0339  Transketolase domain protein  43.21 
 
 		 280 aa  202  4e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1437  transketolase-like  41.26 
 
 		 297 aa  200  1.9999999999999998e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1131  transketolase domain-containing protein  41.94 
 
 		 280 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0391  Transketolase domain protein  39.71 
 
 		 280 aa  194  9e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0504613 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6294  Transketolase domain protein  45.42 
 
 		 283 aa  194  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.583889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1753  transketolase  42.59 
 
 		 618 aa  194  2e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.599828  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2288  transketolase domain-containing protein  38.38 
 
 		 268 aa  190  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0874  Transketolase domain protein  39.71 
 
 		 281 aa  189  5e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.677625  hitchhiker  0.00151524 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2042  transketolase domain-containing protein  36.55 
 
 		 311 aa  188  8e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.71288 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3950  Transketolase domain protein  35.56 
 
 		 291 aa  188  9e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.804929  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2570  transketolase domain protein  39.13 
 
 		 276 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.479984  normal  0.537174 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2690  transketolase domain-containing protein  37.94 
 
 		 276 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.277704 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00870  transketolase, N-terminal subunit  40.44 
 
 		 293 aa  187  2e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1587  transketolase, N-terminal subunit  38.78 
 
 		 252 aa  187  2e-46  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1373  Transketolase domain protein  36.33 
 
 		 303 aa  186  3e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.160442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2843  transketolase subunit A  38.34 
 
 		 276 aa  185  8e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.140333  normal  0.2899 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0048  transketolase domain-containing protein  38.55 
 
 		 282 aa  184  1.0000000000000001e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1680  transketolase  39.77 
 
 		 623 aa  184  1.0000000000000001e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5660  Transketolase domain protein  35.07 
 
 		 294 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537076  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2482  transketolase domain protein  38.74 
 
 		 276 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0790989  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0976  Transketolase domain protein  38.77 
 
 		 285 aa  183  2.0000000000000003e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.160297  normal  0.0621663 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2527  transketolase domain protein  38.34 
 
 		 276 aa  183  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.336828 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2582  transketolase domain-containing protein  38.34 
 
 		 276 aa  183  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.935326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4664  transketolase domain-containing protein  37.05 
 
 		 289 aa  183  3e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1576  Transketolase domain protein  37.91 
 
 		 280 aa  182  4.0000000000000006e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.516999  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1192  transketolase-like  37.73 
 
 		 301 aa  182  6e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.437056 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1190  Transketolase domain protein  36.13 
 
 		 303 aa  182  6e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00778844  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0333  Transketolase domain protein  37.94 
 
 		 309 aa  182  7e-45  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0415  Transketolase central region  38.29 
 
 		 624 aa  181  9.000000000000001e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0299  ribulose-phosphate 3-epimerase  35.99 
 
 		 555 aa  180  2e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0242597 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0199  transketolase, N-terminal subunit  34.8 
 
 		 285 aa  179  4e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2936  Transketolase domain protein  37.94 
 
 		 285 aa  177  2e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1655  transketolase  38.31 
 
 		 629 aa  177  2e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.168649 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3365  Transketolase domain protein  34.81 
 
 		 277 aa  177  2e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0419  transketolase central region  36.98 
 
 		 630 aa  177  2e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.218492  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0861  Transketolase domain protein  37.12 
 
 		 299 aa  176  4e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4382  Transketolase domain protein  36.3 
 
 		 285 aa  176  5e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.415555  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5105  Transketolase domain protein  37.17 
 
 		 275 aa  175  7e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.441335 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1540  transketolase domain-containing protein  36.8 
 
 		 282 aa  174  9.999999999999999e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.220485  normal  0.477158 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3642  transketolase domain-containing protein  34.57 
 
 		 281 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0863468 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5877  transketolase domain-containing protein  36.57 
 
 		 283 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0260  Transketolase domain protein  37.1 
 
 		 286 aa  171  1e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.509651 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>