More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0444 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_0444  Transketolase central region  100 
 
 		 636 aa  1304    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0809  transketolase central region  31.71 
 
 		 592 aa  248  2e-64  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.32467  normal  0.55266 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36720  transketolase  30.44 
 
 		 614 aa  231  3e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.148891  normal  0.641961 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2381  transketolase  30.03 
 
 		 621 aa  227  6e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.652214  normal  0.294409 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1278  transketolase  31.45 
 
 		 624 aa  219  8.999999999999998e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0268  transketolase  29.73 
 
 		 606 aa  219  1e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0415  Transketolase central region  29.5 
 
 		 624 aa  216  9e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17580  transketolase  33.63 
 
 		 622 aa  209  8e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.569597  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1655  transketolase  30.99 
 
 		 629 aa  208  2e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.168649 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0049  transketolase  27.97 
 
 		 626 aa  208  2e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2123  transketolase  30.31 
 
 		 627 aa  201  3.9999999999999996e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2237  transketolase  28.36 
 
 		 689 aa  199  1.0000000000000001e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0419  transketolase central region  29.38 
 
 		 630 aa  198  2.0000000000000003e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.218492  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3317  transketolase  29.39 
 
 		 612 aa  197  4.0000000000000005e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4832  transketolase  29.17 
 
 		 639 aa  195  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1753  transketolase  27.81 
 
 		 618 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.599828  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2720  transketolase, N-terminal subunit  40.77 
 
 		 273 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0183  transketolase  26.51 
 
 		 640 aa  181  2.9999999999999997e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1302  transketolase  28.43 
 
 		 653 aa  175  2.9999999999999996e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0226315  normal  0.530799 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1503  transketolase domain-containing protein  39.93 
 
 		 272 aa  175  2.9999999999999996e-42  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0294001  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0469  transketolase subunit A  39.21 
 
 		 275 aa  174  5e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.125923  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0440  transketolase  38.69 
 
 		 275 aa  172  1e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.707668  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0367  transketolase domain-containing protein  38.46 
 
 		 275 aa  171  4e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0144552 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1552  transketolase domain-containing protein  38.49 
 
 		 275 aa  169  1e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.12208  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1680  transketolase  26.63 
 
 		 623 aa  168  2e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2214  transketolase subunit A  39.92 
 
 		 284 aa  168  2.9999999999999998e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000519395  hitchhiker  0.000381558 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1381  Transketolase central region  36.57 
 
 		 306 aa  166  8e-40  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0968  transketolase domain-containing protein  38.64 
 
 		 273 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1050  transketolase  27.04 
 
 		 635 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1062  transketolase  27.04 
 
 		 635 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1946  transketolase  26.11 
 
 		 631 aa  166  1.0000000000000001e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.120337  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05480  transketolase subunit A  39.34 
 
 		 275 aa  166  2.0000000000000002e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0712  Transketolase domain protein  36.33 
 
 		 281 aa  165  2.0000000000000002e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0142999  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2060  Transketolase domain protein  36.67 
 
 		 282 aa  166  2.0000000000000002e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1900  deoxyxylulose-5-phosphate synthase  25.19 
 
 		 623 aa  165  3e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00488607  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3968  Transketolase domain protein  41.77 
 
 		 272 aa  165  3e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000279469  unclonable  0.000000000126614 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2078  transketolase domain-containing protein  41.29 
 
 		 271 aa  164  5.0000000000000005e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0236  transketolase subunit A  38.64 
 
 		 271 aa  164  6e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1861  Transketolase domain protein  39.6 
 
 		 279 aa  163  8.000000000000001e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3075  transketolase domain-containing protein  39.02 
 
 		 271 aa  162  1e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0025975  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2537  deoxyxylulose-5-phosphate synthase  28.18 
 
 		 625 aa  163  1e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2704  transketolase subunit A  37.91 
 
 		 281 aa  162  1e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000372386  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1192  transketolase-like  40.91 
 
 		 301 aa  162  2e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.437056 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2919  transketolase, N-terminal subunit  41.1 
 
 		 277 aa  161  3e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1373  Transketolase domain protein  38.4 
 
 		 303 aa  159  1e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.160442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0491  transketolase domain-containing protein  41.1 
 
 		 276 aa  159  1e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1130  Transketolase central region  27.97 
 
 		 648 aa  159  1e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1382  Transketolase domain protein  37.31 
 
 		 269 aa  159  1e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0551  transketolase subunit A  40.25 
 
 		 286 aa  159  2e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0287  transketolase  38.04 
 
 		 274 aa  157  4e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.132447  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0969  transketolase, central region  34.21 
 
 		 306 aa  157  6e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86113  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0292  putative transketolase, N-terminal subunit  38.04 
 
 		 274 aa  157  7e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0173  Transketolase central region  34.64 
 
 		 313 aa  155  1e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4745  Transketolase domain protein  36.67 
 
 		 277 aa  156  1e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0245  Transketolase domain protein  37.79 
 
 		 265 aa  156  1e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.411817  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4834  transketolase central region  32.79 
 
 		 333 aa  156  1e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0334  Transketolase domain protein  35.51 
 
 		 286 aa  155  2.9999999999999998e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1505  transketolase central region  33.23 
 
 		 314 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0385912  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0333  Transketolase domain protein  36.2 
 
 		 309 aa  154  4e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1924  transketolase domain-containing protein  37.76 
 
 		 281 aa  154  5e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3398  Transketolase domain protein  40 
 
 		 263 aa  154  5e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06530  deoxyxylulose-5-phosphate synthase  25.19 
 
 		 636 aa  154  7e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000553997  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0293  putative transketolase, C-terminal subunit  34.47 
 
 		 314 aa  150  5e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0288  transketolase  34.47 
 
 		 314 aa  150  5e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000211069  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1998  Transketolase domain protein  39.62 
 
 		 279 aa  150  5e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.337759  hitchhiker  0.00336505 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2401  transketolase, N-terminal subunit  34.91 
 
 		 278 aa  150  6e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.488371  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2073  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  25.93 
 
 		 619 aa  150  6e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.763377  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3950  Transketolase domain protein  37.26 
 
 		 291 aa  150  6e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.804929  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1130  transketolase central region  30.82 
 
 		 336 aa  150  9e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0172  Transketolase domain protein  35.98 
 
 		 273 aa  149  2.0000000000000003e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.906394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09030  transketolase subunit A  39.18 
 
 		 278 aa  149  2.0000000000000003e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.169995  normal  0.0273628 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2719  transketolase, C-terminal subunit  35.29 
 
 		 311 aa  148  3e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0860  Transketolase domain protein  32.46 
 
 		 310 aa  148  4.0000000000000006e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.476833  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0199  transketolase, N-terminal subunit  36.36 
 
 		 285 aa  147  4.0000000000000006e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3128  transketolase domain-containing protein  35.56 
 
 		 281 aa  147  6e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.616231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2042  transketolase domain-containing protein  36.67 
 
 		 311 aa  147  7.0000000000000006e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.71288 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1107  Transketolase domain protein  38.27 
 
 		 303 aa  146  1e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2307  transketolase  28.02 
 
 		 662 aa  146  1e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0505074 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3879  transketolase-like  36.33 
 
 		 279 aa  146  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.521893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2690  transketolase domain-containing protein  37.97 
 
 		 276 aa  146  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.277704 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2482  transketolase domain protein  37.97 
 
 		 276 aa  145  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0790989  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1437  transketolase-like  35.45 
 
 		 297 aa  145  2e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1527  Transketolase central region  35.34 
 
 		 319 aa  145  3e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0469  Transketolase domain protein  42.98 
 
 		 273 aa  145  3e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.833145  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0828  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  24.17 
 
 		 627 aa  145  3e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1787  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  26.24 
 
 		 619 aa  144  4e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0243  transketolase-like protein  35.85 
 
 		 275 aa  144  4e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09040  transketolase subunit B  35.85 
 
 		 315 aa  144  5e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.28283  normal  0.0525296 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2033  Transketolase domain protein  35.34 
 
 		 269 aa  144  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.309611  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0264  Transketolase domain protein  37.71 
 
 		 274 aa  144  5e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00137267 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2799  Transketolase domain protein  32.71 
 
 		 274 aa  144  5e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0492  transketolase, central region  36 
 
 		 312 aa  144  5e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2935  Transketolase central region  32.77 
 
 		 317 aa  144  6e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0438  transketolase central region  32.03 
 
 		 312 aa  144  6e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0397028  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0279  Transketolase domain protein  37.29 
 
 		 274 aa  144  6e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000402099  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0265  Transketolase central region  34.2 
 
 		 310 aa  144  6e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00214892 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2255  Transketolase domain protein  34.96 
 
 		 269 aa  144  7e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.158936  normal  0.0249782 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0976  Transketolase domain protein  35.07 
 
 		 285 aa  143  8e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.160297  normal  0.0621663 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0698  deoxyxylulose-5-phosphate synthase  25.51 
 
 		 631 aa  143  8e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0183  Transketolase central region  31.92 
 
 		 320 aa  143  8e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>