More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2401 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2401  transketolase, N-terminal subunit  100 
 
 		 278 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.488371  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2647  Transketolase domain protein  67.15 
 
 		 276 aa  387  1e-107  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.142698  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3383  transketolase domain-containing protein  65.45 
 
 		 276 aa  363  2e-99  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0911  putative transketolase. N-terminal subunit  65.45 
 
 		 276 aa  363  2e-99  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3249  putative transketolase. N-terminal subunit  65.45 
 
 		 276 aa  362  3e-99  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3529  Transketolase domain protein  51.85 
 
 		 267 aa  270  2e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.322981  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3643  Transketolase domain protein  51.11 
 
 		 267 aa  266  2.9999999999999995e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1861  Transketolase domain protein  48.88 
 
 		 279 aa  257  1e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2799  Transketolase domain protein  47.49 
 
 		 274 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0236  transketolase subunit A  47.39 
 
 		 271 aa  248  9e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2255  Transketolase domain protein  46.67 
 
 		 269 aa  248  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.158936  normal  0.0249782 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2033  Transketolase domain protein  47.78 
 
 		 269 aa  246  3e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.309611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0469  Transketolase domain protein  48.5 
 
 		 273 aa  246  4e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.833145  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0406  transketolase domain-containing protein  48.88 
 
 		 302 aa  244  9e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.186012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1924  transketolase domain-containing protein  46.32 
 
 		 281 aa  241  9e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3075  transketolase domain-containing protein  43.61 
 
 		 271 aa  239  5e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0025975  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2127  Transketolase domain protein  45.9 
 
 		 276 aa  236  3e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.359071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3968  Transketolase domain protein  44.74 
 
 		 272 aa  235  6e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000279469  unclonable  0.000000000126614 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2060  Transketolase domain protein  44.91 
 
 		 282 aa  235  6e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3128  transketolase domain-containing protein  46.1 
 
 		 281 aa  235  7e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.616231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2078  transketolase domain-containing protein  47.55 
 
 		 271 aa  232  6e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0551  transketolase subunit A  44.15 
 
 		 286 aa  231  1e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4745  Transketolase domain protein  44.15 
 
 		 277 aa  229  3e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0243  transketolase-like protein  45.42 
 
 		 275 aa  229  3e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0292  putative transketolase, N-terminal subunit  41.73 
 
 		 274 aa  229  5e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1382  Transketolase domain protein  42.91 
 
 		 269 aa  228  7e-59  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0287  transketolase  41.73 
 
 		 274 aa  228  7e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.132447  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2214  transketolase subunit A  46.03 
 
 		 284 aa  227  1e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000519395  hitchhiker  0.000381558 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2720  transketolase, N-terminal subunit  43.61 
 
 		 273 aa  225  5.0000000000000005e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2443  transketolase subunit A  49.15 
 
 		 278 aa  223  2e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0712  Transketolase domain protein  44.94 
 
 		 281 aa  223  2e-57  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0142999  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0968  transketolase domain-containing protein  42.54 
 
 		 273 aa  223  3e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0172  Transketolase domain protein  43.02 
 
 		 273 aa  221  8e-57  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.906394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1503  transketolase domain-containing protein  42.7 
 
 		 272 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0294001  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0245  Transketolase domain protein  42.97 
 
 		 265 aa  217  2e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.411817  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1059  transketolase subunit A  45.7 
 
 		 277 aa  216  4e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.579948 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3398  Transketolase domain protein  42.53 
 
 		 263 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0491  transketolase domain-containing protein  42.26 
 
 		 276 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1373  Transketolase domain protein  42.07 
 
 		 303 aa  213  2.9999999999999995e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.160442  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2919  transketolase, N-terminal subunit  41.57 
 
 		 277 aa  212  5.999999999999999e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1552  transketolase domain-containing protein  41.2 
 
 		 275 aa  212  5.999999999999999e-54  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.12208  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0334  Transketolase domain protein  42.4 
 
 		 286 aa  212  5.999999999999999e-54  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0440  transketolase  40.15 
 
 		 275 aa  210  2e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.707668  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5636  transketolase subunit A  42.49 
 
 		 282 aa  209  3e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14541  N-terminal subunit of transketolase  40.43 
 
 		 288 aa  209  4e-53  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0367  transketolase domain-containing protein  40.82 
 
 		 275 aa  209  5e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0144552 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0469  transketolase subunit A  40.07 
 
 		 275 aa  209  5e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.125923  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3879  transketolase-like  43.02 
 
 		 279 aa  209  6e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.521893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05480  transketolase subunit A  43.38 
 
 		 275 aa  208  8e-53  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1528  Transketolase domain protein  42.96 
 
 		 297 aa  208  9e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6294  Transketolase domain protein  47.06 
 
 		 283 aa  208  9e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.583889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0279  Transketolase domain protein  40.53 
 
 		 274 aa  207  2e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000402099  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4222  transketolase subunit A  41.64 
 
 		 270 aa  207  2e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0264  Transketolase domain protein  40.15 
 
 		 274 aa  206  5e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00137267 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2237  transketolase  41.54 
 
 		 689 aa  205  6e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1437  transketolase-like  41.39 
 
 		 297 aa  203  2e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2704  transketolase subunit A  38.38 
 
 		 281 aa  203  2e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000372386  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1131  transketolase domain-containing protein  40 
 
 		 280 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1998  Transketolase domain protein  42.7 
 
 		 279 aa  196  3e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.337759  hitchhiker  0.00336505 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1190  Transketolase domain protein  40.15 
 
 		 303 aa  194  1e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00778844  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3642  transketolase domain-containing protein  41.77 
 
 		 281 aa  194  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0863468 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3950  Transketolase domain protein  38.4 
 
 		 291 aa  194  2e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.804929  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2042  transketolase domain-containing protein  37.59 
 
 		 311 aa  194  2e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.71288 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0299  ribulose-phosphate 3-epimerase  40.21 
 
 		 555 aa  192  6e-48  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0242597 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0391  Transketolase domain protein  38.52 
 
 		 280 aa  191  2e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0504613 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1587  transketolase, N-terminal subunit  39.53 
 
 		 252 aa  190  2e-47  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09030  transketolase subunit A  39.78 
 
 		 278 aa  190  2e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.169995  normal  0.0273628 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1716  Transketolase domain protein  44.36 
 
 		 293 aa  190  2e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1192  transketolase-like  39.63 
 
 		 301 aa  189  2.9999999999999997e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.437056 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2288  transketolase domain-containing protein  40.68 
 
 		 268 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1467  Transketolase domain protein  36.76 
 
 		 273 aa  186  4e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5276  transketolase domain-containing protein  40.23 
 
 		 282 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1107  Transketolase domain protein  38.01 
 
 		 303 aa  182  5.0000000000000004e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0333  Transketolase domain protein  39.49 
 
 		 309 aa  181  2e-44  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1576  Transketolase domain protein  37.59 
 
 		 280 aa  181  2e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.516999  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1793  transketolase subunit A  37.89 
 
 		 297 aa  181  2e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0143837  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2843  transketolase subunit A  40.3 
 
 		 276 aa  180  2.9999999999999997e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.140333  normal  0.2899 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0260  Transketolase domain protein  40.67 
 
 		 286 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.509651 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5660  Transketolase domain protein  33.58 
 
 		 294 aa  178  9e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537076  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4664  transketolase domain-containing protein  36.19 
 
 		 289 aa  177  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1184  Transketolase domain protein  39.27 
 
 		 305 aa  177  2e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0341  Transketolase domain protein  38.35 
 
 		 288 aa  176  3e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.18215 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0976  Transketolase domain protein  35.77 
 
 		 285 aa  176  3e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.160297  normal  0.0621663 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0874  Transketolase domain protein  35.14 
 
 		 281 aa  174  9.999999999999999e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.677625  hitchhiker  0.00151524 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3617  transketolase-like  38.55 
 
 		 281 aa  174  9.999999999999999e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.868014  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2091  transketolase domain-containing protein  39.55 
 
 		 286 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.189394 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1017  transketolase subunit A  39.26 
 
 		 303 aa  173  1.9999999999999998e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4382  Transketolase domain protein  40.64 
 
 		 285 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.415555  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3311  Transketolase domain protein  38.18 
 
 		 279 aa  172  3.9999999999999995e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2366  Transketolase domain protein  39.55 
 
 		 286 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.95971  normal  0.0469073 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5105  Transketolase domain protein  38.43 
 
 		 275 aa  172  5.999999999999999e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.441335 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0199  transketolase, N-terminal subunit  38.85 
 
 		 285 aa  171  1e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0407  Transketolase domain protein  41.02 
 
 		 307 aa  171  1e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1712  transketolase domain-containing protein  35.85 
 
 		 278 aa  171  1e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.605917  normal  0.0338585 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1540  transketolase domain-containing protein  38.46 
 
 		 282 aa  171  1e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.220485  normal  0.477158 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0861  Transketolase domain protein  38.2 
 
 		 299 aa  171  1e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00870  transketolase, N-terminal subunit  35.45 
 
 		 293 aa  171  1e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4274  transketolase domain-containing protein  37.14 
 
 		 287 aa  170  2e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2719  transketolase subunit A  40.48 
 
 		 282 aa  170  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1894  transketolase  36.43 
 
 		 280 aa  171  2e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00737367 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>