More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0874 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0874  Transketolase domain protein  100 
 
 		 281 aa  585  1e-166  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.677625  hitchhiker  0.00151524 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0048  transketolase domain-containing protein  70.57 
 
 		 282 aa  412  1e-114  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0391  Transketolase domain protein  70.14 
 
 		 280 aa  408  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0504613 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2936  Transketolase domain protein  70.32 
 
 		 285 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00870  transketolase, N-terminal subunit  69.78 
 
 		 293 aa  399  9.999999999999999e-111  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1576  Transketolase domain protein  68.35 
 
 		 280 aa  394  1e-109  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.516999  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1894  transketolase  64.49 
 
 		 280 aa  385  1e-106  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00737367 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0976  Transketolase domain protein  60 
 
 		 285 aa  335  2.9999999999999997e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.160297  normal  0.0621663 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1107  Transketolase domain protein  49.1 
 
 		 303 aa  275  4e-73  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1437  transketolase-like  50 
 
 		 297 aa  273  2.0000000000000002e-72  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1192  transketolase-like  50.72 
 
 		 301 aa  271  7e-72  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.437056 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1373  Transketolase domain protein  50 
 
 		 303 aa  270  2e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.160442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1190  Transketolase domain protein  47.48 
 
 		 303 aa  261  8e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00778844  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1184  Transketolase domain protein  49.82 
 
 		 305 aa  258  7e-68  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3075  transketolase domain-containing protein  48.36 
 
 		 271 aa  252  4.0000000000000004e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0025975  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0968  transketolase domain-containing protein  49.26 
 
 		 273 aa  248  1e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2078  transketolase domain-containing protein  48 
 
 		 271 aa  247  1e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0292  putative transketolase, N-terminal subunit  46.35 
 
 		 274 aa  246  4e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0287  transketolase  45.99 
 
 		 274 aa  244  8e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.132447  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0551  transketolase subunit A  47.97 
 
 		 286 aa  243  3e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1017  transketolase subunit A  48.75 
 
 		 303 aa  241  1e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0334  Transketolase domain protein  45.94 
 
 		 286 aa  240  2e-62  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0491  transketolase domain-containing protein  46.72 
 
 		 276 aa  239  4e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0236  transketolase subunit A  46.18 
 
 		 271 aa  238  5.999999999999999e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2060  Transketolase domain protein  46.89 
 
 		 282 aa  238  9e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3968  Transketolase domain protein  47.65 
 
 		 272 aa  238  1e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000279469  unclonable  0.000000000126614 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0469  Transketolase domain protein  47.81 
 
 		 273 aa  237  2e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.833145  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09030  transketolase subunit A  48.9 
 
 		 278 aa  236  3e-61  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.169995  normal  0.0273628 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2919  transketolase, N-terminal subunit  47.41 
 
 		 277 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1998  Transketolase domain protein  48.72 
 
 		 279 aa  232  5e-60  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.337759  hitchhiker  0.00336505 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1503  transketolase domain-containing protein  45.96 
 
 		 272 aa  231  9e-60  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0294001  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1861  Transketolase domain protein  46.32 
 
 		 279 aa  230  2e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0264  Transketolase domain protein  45.85 
 
 		 274 aa  229  4e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00137267 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2720  transketolase, N-terminal subunit  44.36 
 
 		 273 aa  229  4e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0279  Transketolase domain protein  45.85 
 
 		 274 aa  229  5e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000402099  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0172  Transketolase domain protein  45.39 
 
 		 273 aa  228  1e-58  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.906394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1382  Transketolase domain protein  44.53 
 
 		 269 aa  228  1e-58  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1552  transketolase domain-containing protein  45.32 
 
 		 275 aa  225  5.0000000000000005e-58  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.12208  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4745  Transketolase domain protein  44.78 
 
 		 277 aa  225  6e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05480  transketolase subunit A  45.15 
 
 		 275 aa  224  9e-58  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0367  transketolase domain-containing protein  44.8 
 
 		 275 aa  223  2e-57  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0144552 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2704  transketolase subunit A  43.73 
 
 		 281 aa  223  3e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000372386  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0469  transketolase subunit A  43.53 
 
 		 275 aa  223  3e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.125923  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2214  transketolase subunit A  44.75 
 
 		 284 aa  220  1.9999999999999999e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000519395  hitchhiker  0.000381558 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0712  Transketolase domain protein  42.91 
 
 		 281 aa  219  3.9999999999999997e-56  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0142999  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0243  transketolase-like protein  44.7 
 
 		 275 aa  219  3.9999999999999997e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0245  Transketolase domain protein  44.24 
 
 		 265 aa  217  2e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.411817  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0440  transketolase  44.03 
 
 		 275 aa  216  4e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.707668  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0333  Transketolase domain protein  40.78 
 
 		 309 aa  209  6e-53  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2237  transketolase  42.86 
 
 		 689 aa  207  2e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1467  Transketolase domain protein  39.49 
 
 		 273 aa  204  1e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3879  transketolase-like  41.7 
 
 		 279 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.521893  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2255  Transketolase domain protein  39.71 
 
 		 269 aa  189  5e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.158936  normal  0.0249782 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0339  Transketolase domain protein  41.63 
 
 		 280 aa  187  1e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3128  transketolase domain-containing protein  39.19 
 
 		 281 aa  187  1e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.616231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0268  transketolase  38.01 
 
 		 606 aa  187  2e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0406  transketolase domain-containing protein  40.3 
 
 		 302 aa  186  3e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.186012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2033  Transketolase domain protein  39.34 
 
 		 269 aa  185  7e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.309611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2647  Transketolase domain protein  37.13 
 
 		 276 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.142698  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1528  Transketolase domain protein  39.93 
 
 		 297 aa  181  1e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1793  transketolase subunit A  38.62 
 
 		 297 aa  181  1e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0143837  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14541  N-terminal subunit of transketolase  36.86 
 
 		 288 aa  180  2e-44  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3617  transketolase-like  38.95 
 
 		 281 aa  178  9e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.868014  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4274  transketolase domain-containing protein  38.49 
 
 		 287 aa  177  1e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1540  transketolase domain-containing protein  38.01 
 
 		 282 aa  177  1e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.220485  normal  0.477158 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0415  Transketolase central region  37.82 
 
 		 624 aa  176  3e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6294  Transketolase domain protein  37.84 
 
 		 283 aa  176  3e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.583889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2799  Transketolase domain protein  37.12 
 
 		 274 aa  175  6e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2127  Transketolase domain protein  36.63 
 
 		 276 aa  174  9.999999999999999e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.359071  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2401  transketolase, N-terminal subunit  35.14 
 
 		 278 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.488371  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0861  Transketolase domain protein  36.73 
 
 		 299 aa  174  9.999999999999999e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3643  Transketolase domain protein  38.24 
 
 		 267 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5877  transketolase domain-containing protein  36.63 
 
 		 283 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6256  transketolase domain-containing protein  36.23 
 
 		 281 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.632041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4382  Transketolase domain protein  38.15 
 
 		 285 aa  172  6.999999999999999e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.415555  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2614  transketolase domain-containing protein  38.49 
 
 		 285 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.336925  normal  0.70131 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4931  transketolase domain-containing protein  36.23 
 
 		 281 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3642  transketolase domain-containing protein  38.66 
 
 		 281 aa  171  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0863468 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3529  Transketolase domain protein  37.13 
 
 		 267 aa  170  2e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.322981  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6423  transketolase-like  35.87 
 
 		 281 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6658  transketolase domain-containing protein  35.87 
 
 		 281 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1946  transketolase  38.13 
 
 		 631 aa  169  4e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.120337  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3383  transketolase domain-containing protein  36.44 
 
 		 276 aa  169  4e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0911  putative transketolase. N-terminal subunit  36.44 
 
 		 276 aa  169  4e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3249  putative transketolase. N-terminal subunit  36.44 
 
 		 276 aa  169  5e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3311  Transketolase domain protein  36 
 
 		 279 aa  168  8e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4412  transketolase domain-containing protein  35.51 
 
 		 281 aa  168  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0693677 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3398  Transketolase domain protein  36.54 
 
 		 263 aa  167  2e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5636  transketolase subunit A  35.9 
 
 		 282 aa  166  5e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4777  transketolase, N-terminal  34.75 
 
 		 281 aa  165  5.9999999999999996e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2091  transketolase domain-containing protein  37.55 
 
 		 286 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.189394 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2366  Transketolase domain protein  37.55 
 
 		 286 aa  165  8e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.95971  normal  0.0469073 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1680  transketolase  38.13 
 
 		 623 aa  164  1.0000000000000001e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2443  transketolase subunit A  38.28 
 
 		 278 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1753  transketolase  38.1 
 
 		 618 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.599828  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0728  transketolase domain-containing protein  34.77 
 
 		 286 aa  163  3e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4664  transketolase domain-containing protein  32.22 
 
 		 289 aa  163  3e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1147  Transketolase domain protein  35.04 
 
 		 271 aa  163  3e-39  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0260  Transketolase domain protein  36.8 
 
 		 286 aa  163  3e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.509651 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1131  transketolase domain-containing protein  36.82 
 
 		 280 aa  163  3e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>