More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0391 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0391  Transketolase domain protein  100 
 
 		 280 aa  578  1e-164  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0504613 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0874  Transketolase domain protein  70.14 
 
 		 281 aa  408  1e-113  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.677625  hitchhiker  0.00151524 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00870  transketolase, N-terminal subunit  65.83 
 
 		 293 aa  369  1e-101  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2936  Transketolase domain protein  63.16 
 
 		 285 aa  360  2e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0048  transketolase domain-containing protein  61.65 
 
 		 282 aa  356  2.9999999999999997e-97  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1576  Transketolase domain protein  62.37 
 
 		 280 aa  347  1e-94  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.516999  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1894  transketolase  58.99 
 
 		 280 aa  340  2e-92  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00737367 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0976  Transketolase domain protein  57.89 
 
 		 285 aa  325  4.0000000000000003e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.160297  normal  0.0621663 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1437  transketolase-like  55.68 
 
 		 297 aa  299  3e-80  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1192  transketolase-like  55.28 
 
 		 301 aa  295  4e-79  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.437056 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1107  Transketolase domain protein  52.48 
 
 		 303 aa  287  1e-76  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1373  Transketolase domain protein  53.9 
 
 		 303 aa  287  1e-76  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.160442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1190  Transketolase domain protein  52.67 
 
 		 303 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00778844  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1184  Transketolase domain protein  51.77 
 
 		 305 aa  263  2e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0292  putative transketolase, N-terminal subunit  48.33 
 
 		 274 aa  259  5.0000000000000005e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0287  transketolase  48.33 
 
 		 274 aa  258  6e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.132447  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0551  transketolase subunit A  48.38 
 
 		 286 aa  256  4e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0491  transketolase domain-containing protein  47.29 
 
 		 276 aa  253  3e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0334  Transketolase domain protein  46.1 
 
 		 286 aa  251  7e-66  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0245  Transketolase domain protein  47.76 
 
 		 265 aa  251  1e-65  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.411817  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1017  transketolase subunit A  50.71 
 
 		 303 aa  250  2e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1503  transketolase domain-containing protein  47.6 
 
 		 272 aa  246  2e-64  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0294001  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2078  transketolase domain-containing protein  49.44 
 
 		 271 aa  246  4e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2919  transketolase, N-terminal subunit  46.57 
 
 		 277 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0367  transketolase domain-containing protein  48.48 
 
 		 275 aa  244  9.999999999999999e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0144552 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4745  Transketolase domain protein  45.42 
 
 		 277 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05480  transketolase subunit A  47.65 
 
 		 275 aa  243  1.9999999999999999e-63  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3075  transketolase domain-containing protein  46.84 
 
 		 271 aa  243  3e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0025975  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0440  transketolase  47.58 
 
 		 275 aa  242  3.9999999999999997e-63  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.707668  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0236  transketolase subunit A  47.23 
 
 		 271 aa  242  5e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0469  transketolase subunit A  46.1 
 
 		 275 aa  242  6e-63  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.125923  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3968  Transketolase domain protein  47.97 
 
 		 272 aa  241  7e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000279469  unclonable  0.000000000126614 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1552  transketolase domain-containing protein  47.58 
 
 		 275 aa  241  1e-62  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.12208  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0172  Transketolase domain protein  46.47 
 
 		 273 aa  241  1e-62  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.906394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1382  Transketolase domain protein  46.47 
 
 		 269 aa  241  1e-62  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1998  Transketolase domain protein  48.19 
 
 		 279 aa  240  2e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.337759  hitchhiker  0.00336505 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0968  transketolase domain-containing protein  46.27 
 
 		 273 aa  239  2.9999999999999997e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0469  Transketolase domain protein  47.96 
 
 		 273 aa  239  4e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.833145  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0279  Transketolase domain protein  45.76 
 
 		 274 aa  238  9e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000402099  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0712  Transketolase domain protein  45.96 
 
 		 281 aa  237  2e-61  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0142999  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0264  Transketolase domain protein  45.02 
 
 		 274 aa  234  9e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00137267 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09030  transketolase subunit A  48.53 
 
 		 278 aa  234  1.0000000000000001e-60  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.169995  normal  0.0273628 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2720  transketolase, N-terminal subunit  46.3 
 
 		 273 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2060  Transketolase domain protein  44.16 
 
 		 282 aa  233  2.0000000000000002e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1861  Transketolase domain protein  45.56 
 
 		 279 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0243  transketolase-like protein  45.59 
 
 		 275 aa  230  2e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0333  Transketolase domain protein  45.94 
 
 		 309 aa  229  3e-59  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2214  transketolase subunit A  46.12 
 
 		 284 aa  228  1e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000519395  hitchhiker  0.000381558 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2704  transketolase subunit A  41.7 
 
 		 281 aa  221  9.999999999999999e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000372386  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2237  transketolase  43.49 
 
 		 689 aa  219  3e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1467  Transketolase domain protein  38.38 
 
 		 273 aa  202  4e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0406  transketolase domain-containing protein  40 
 
 		 302 aa  201  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.186012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2647  Transketolase domain protein  40.89 
 
 		 276 aa  199  5e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.142698  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2255  Transketolase domain protein  39.71 
 
 		 269 aa  194  9e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.158936  normal  0.0249782 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2799  Transketolase domain protein  37.32 
 
 		 274 aa  193  2e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2401  transketolase, N-terminal subunit  38.52 
 
 		 278 aa  191  2e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.488371  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2127  Transketolase domain protein  37.27 
 
 		 276 aa  190  2.9999999999999997e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.359071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3879  transketolase-like  40.59 
 
 		 279 aa  188  7e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.521893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1528  Transketolase domain protein  39.64 
 
 		 297 aa  188  9e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3249  putative transketolase. N-terminal subunit  40.08 
 
 		 276 aa  187  1e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0911  putative transketolase. N-terminal subunit  40.08 
 
 		 276 aa  188  1e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3383  transketolase domain-containing protein  40.08 
 
 		 276 aa  188  1e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0268  transketolase  38.46 
 
 		 606 aa  187  2e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3128  transketolase domain-containing protein  38.89 
 
 		 281 aa  185  6e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.616231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0299  ribulose-phosphate 3-epimerase  37.41 
 
 		 555 aa  185  8e-46  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0242597 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1793  transketolase subunit A  39.86 
 
 		 297 aa  184  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0143837  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0415  Transketolase central region  40.81 
 
 		 624 aa  183  3e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1680  transketolase  38.97 
 
 		 623 aa  183  3e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2033  Transketolase domain protein  37.87 
 
 		 269 aa  182  6e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.309611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4274  transketolase domain-containing protein  38.1 
 
 		 287 aa  177  1e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0339  Transketolase domain protein  40.98 
 
 		 280 aa  178  1e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2690  transketolase domain-containing protein  37.13 
 
 		 276 aa  177  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.277704 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1147  Transketolase domain protein  36.67 
 
 		 271 aa  178  1e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1540  transketolase domain-containing protein  38.01 
 
 		 282 aa  177  2e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.220485  normal  0.477158 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2843  transketolase subunit A  38.24 
 
 		 276 aa  176  3e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.140333  normal  0.2899 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4664  transketolase domain-containing protein  35.56 
 
 		 289 aa  175  6e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2042  transketolase domain-containing protein  34.42 
 
 		 311 aa  175  8e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.71288 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3398  Transketolase domain protein  37.93 
 
 		 263 aa  175  8e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2582  transketolase domain-containing protein  37.13 
 
 		 276 aa  174  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.935326  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2527  transketolase domain protein  37.13 
 
 		 276 aa  174  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.336828 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6294  Transketolase domain protein  37.96 
 
 		 283 aa  174  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.583889  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0199  transketolase, N-terminal subunit  36.43 
 
 		 285 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14541  N-terminal subunit of transketolase  34.2 
 
 		 288 aa  174  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5276  transketolase domain-containing protein  37.36 
 
 		 282 aa  172  5e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5636  transketolase subunit A  37.31 
 
 		 282 aa  171  7.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2443  transketolase subunit A  38.52 
 
 		 278 aa  171  9e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1946  transketolase  37.13 
 
 		 631 aa  171  1e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.120337  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2482  transketolase domain protein  36.76 
 
 		 276 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0790989  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2570  transketolase domain protein  36.4 
 
 		 276 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.479984  normal  0.537174 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0183  transketolase  35.59 
 
 		 640 aa  169  3e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3311  Transketolase domain protein  38.22 
 
 		 279 aa  170  3e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4931  transketolase domain-containing protein  38.06 
 
 		 281 aa  169  4e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4222  transketolase subunit A  33.83 
 
 		 270 aa  169  4e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4382  Transketolase domain protein  36.9 
 
 		 285 aa  169  6e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.415555  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1587  transketolase, N-terminal subunit  35.69 
 
 		 252 aa  168  7e-41  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0728  transketolase domain-containing protein  37.14 
 
 		 286 aa  168  8e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3617  transketolase-like  35.82 
 
 		 281 aa  168  1e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.868014  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4412  transketolase domain-containing protein  37.69 
 
 		 281 aa  168  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0693677 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1924  transketolase domain-containing protein  36.78 
 
 		 281 aa  167  2e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0861  Transketolase domain protein  35.79 
 
 		 299 aa  166  2.9999999999999998e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>