More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0861 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_0861  Transketolase domain protein  100 
 
 
299 aa  612  9.999999999999999e-175  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1382  Transketolase domain protein  48.87 
 
 
269 aa  255  7e-67  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2060  Transketolase domain protein  47.45 
 
 
282 aa  254  1.0000000000000001e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0236  transketolase subunit A  48.71 
 
 
271 aa  250  2e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1503  transketolase domain-containing protein  45.19 
 
 
272 aa  245  6.999999999999999e-64  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0294001  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0968  transketolase domain-containing protein  50.19 
 
 
273 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1861  Transketolase domain protein  49.25 
 
 
279 aa  243  1.9999999999999999e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0712  Transketolase domain protein  47.21 
 
 
281 aa  240  2e-62  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0142999  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3968  Transketolase domain protein  47.81 
 
 
272 aa  240  2e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000279469  unclonable  0.000000000126614 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0551  transketolase subunit A  45.39 
 
 
286 aa  238  8e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0292  putative transketolase, N-terminal subunit  42.7 
 
 
274 aa  236  2e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0287  transketolase  42.7 
 
 
274 aa  237  2e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.132447  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2078  transketolase domain-containing protein  49.44 
 
 
271 aa  236  4e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0469  Transketolase domain protein  49.63 
 
 
273 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.833145  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2919  transketolase, N-terminal subunit  44.65 
 
 
277 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3075  transketolase domain-containing protein  46.13 
 
 
271 aa  230  2e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0025975  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0172  Transketolase domain protein  46.59 
 
 
273 aa  229  3e-59  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.906394  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0334  Transketolase domain protein  45.16 
 
 
286 aa  226  3e-58  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2704  transketolase subunit A  44.44 
 
 
281 aa  224  1e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000372386  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4745  Transketolase domain protein  45.9 
 
 
277 aa  224  2e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0491  transketolase domain-containing protein  43.75 
 
 
276 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0440  transketolase  42.64 
 
 
275 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.707668  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0243  transketolase-like protein  46.56 
 
 
275 aa  219  6e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0279  Transketolase domain protein  43.01 
 
 
274 aa  218  7e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000402099  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0469  transketolase subunit A  41.92 
 
 
275 aa  217  2e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.125923  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2720  transketolase, N-terminal subunit  43.82 
 
 
273 aa  217  2e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0264  Transketolase domain protein  42.28 
 
 
274 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00137267 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1552  transketolase domain-containing protein  42.31 
 
 
275 aa  216  4e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.12208  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0367  transketolase domain-containing protein  42.31 
 
 
275 aa  216  4e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0144552 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2214  transketolase subunit A  46.86 
 
 
284 aa  214  9.999999999999999e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000519395  hitchhiker  0.000381558 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2799  Transketolase domain protein  42.35 
 
 
274 aa  204  1e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05480  transketolase subunit A  43.77 
 
 
275 aa  201  9.999999999999999e-51  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0245  Transketolase domain protein  43.58 
 
 
265 aa  201  1.9999999999999998e-50  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.411817  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1373  Transketolase domain protein  40.07 
 
 
303 aa  199  5e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.160442  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1924  transketolase domain-containing protein  41.18 
 
 
281 aa  199  7e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2237  transketolase  40.73 
 
 
689 aa  195  8.000000000000001e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1059  transketolase subunit A  40.74 
 
 
277 aa  195  8.000000000000001e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.579948 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2127  Transketolase domain protein  41.38 
 
 
276 aa  194  1e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.359071  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1998  Transketolase domain protein  46.32 
 
 
279 aa  193  3e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.337759  hitchhiker  0.00336505 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0299  ribulose-phosphate 3-epimerase  39.78 
 
 
555 aa  193  3e-48  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0242597 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1680  transketolase  37.99 
 
 
623 aa  193  4e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0268  transketolase  38.81 
 
 
606 aa  192  7e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2042  transketolase domain-containing protein  37.5 
 
 
311 aa  191  1e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.71288 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1467  Transketolase domain protein  39.38 
 
 
273 aa  191  1e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3879  transketolase-like  43.82 
 
 
279 aa  190  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.521893  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1131  transketolase domain-containing protein  41.15 
 
 
280 aa  189  5.999999999999999e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0183  transketolase  38.87 
 
 
640 aa  189  5.999999999999999e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4664  transketolase domain-containing protein  38.75 
 
 
289 aa  185  8e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1107  Transketolase domain protein  36.61 
 
 
303 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14541  N-terminal subunit of transketolase  37.08 
 
 
288 aa  184  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5636  transketolase subunit A  40.74 
 
 
282 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0415  Transketolase central region  37.94 
 
 
624 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1190  Transketolase domain protein  37.45 
 
 
303 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00778844  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1946  transketolase  36.46 
 
 
631 aa  182  7e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.120337  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0333  Transketolase domain protein  39.13 
 
 
309 aa  182  8.000000000000001e-45  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1753  transketolase  36.9 
 
 
618 aa  181  1e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.599828  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1576  Transketolase domain protein  38.35 
 
 
280 aa  180  2.9999999999999997e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.516999  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1437  transketolase-like  38.32 
 
 
297 aa  180  2.9999999999999997e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09030  transketolase subunit A  43.77 
 
 
278 aa  180  2.9999999999999997e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.169995  normal  0.0273628 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1793  transketolase subunit A  39.57 
 
 
297 aa  179  5.999999999999999e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0143837  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4222  transketolase subunit A  39.54 
 
 
270 aa  177  2e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3398  Transketolase domain protein  40.23 
 
 
263 aa  177  2e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1528  Transketolase domain protein  39.86 
 
 
297 aa  176  4e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2255  Transketolase domain protein  37.12 
 
 
269 aa  176  5e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.158936  normal  0.0249782 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3950  Transketolase domain protein  39.08 
 
 
291 aa  175  7e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.804929  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0874  Transketolase domain protein  36.73 
 
 
281 aa  174  9.999999999999999e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.677625  hitchhiker  0.00151524 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3317  transketolase  38.49 
 
 
612 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1894  transketolase  36.8 
 
 
280 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00737367 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2033  Transketolase domain protein  38.31 
 
 
269 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.309611  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2401  transketolase, N-terminal subunit  38.2 
 
 
278 aa  171  1e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.488371  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2936  Transketolase domain protein  36.46 
 
 
285 aa  171  1e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5660  Transketolase domain protein  37.17 
 
 
294 aa  171  1e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537076  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1192  transketolase-like  36.63 
 
 
301 aa  171  2e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.437056 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0406  transketolase domain-containing protein  40.15 
 
 
302 aa  170  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.186012  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00870  transketolase, N-terminal subunit  37.41 
 
 
293 aa  170  3e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3128  transketolase domain-containing protein  37.16 
 
 
281 aa  167  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.616231  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1017  transketolase subunit A  36.95 
 
 
303 aa  167  2e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0391  Transketolase domain protein  35.79 
 
 
280 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0504613 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0976  Transketolase domain protein  36.36 
 
 
285 aa  167  2.9999999999999998e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.160297  normal  0.0621663 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1655  transketolase  35.93 
 
 
629 aa  165  9e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.168649 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2288  transketolase domain-containing protein  37.16 
 
 
268 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2381  transketolase  36.82 
 
 
621 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.652214  normal  0.294409 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6294  Transketolase domain protein  41.2 
 
 
283 aa  163  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.583889  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0048  transketolase domain-containing protein  37.88 
 
 
282 aa  163  3e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0049  transketolase  36.88 
 
 
626 aa  162  8.000000000000001e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1302  transketolase  37.41 
 
 
653 aa  162  9e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0226315  normal  0.530799 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0419  transketolase central region  35.06 
 
 
630 aa  160  2e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.218492  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2443  transketolase subunit A  38.68 
 
 
278 aa  160  2e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1276  Transketolase domain protein  38.59 
 
 
274 aa  160  3e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1184  Transketolase domain protein  36.73 
 
 
305 aa  158  1e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0339  Transketolase domain protein  37.34 
 
 
280 aa  157  2e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36720  transketolase  35.77 
 
 
614 aa  157  2e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.148891  normal  0.641961 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3643  Transketolase domain protein  38.06 
 
 
267 aa  155  6e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3529  Transketolase domain protein  38.43 
 
 
267 aa  155  8e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.322981  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0199  transketolase, N-terminal subunit  34.51 
 
 
285 aa  152  5.9999999999999996e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1278  transketolase  35.82 
 
 
624 aa  152  5.9999999999999996e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2647  Transketolase domain protein  36.33 
 
 
276 aa  152  7e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.142698  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1050  transketolase  32.97 
 
 
635 aa  152  8.999999999999999e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1062  transketolase  32.97 
 
 
635 aa  152  8.999999999999999e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3365  Transketolase domain protein  36.76 
 
 
277 aa  150  2e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>