More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_3317 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_3317  transketolase  100 
 
 
612 aa  1217    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1655  transketolase  61.1 
 
 
629 aa  723    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.168649 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2123  transketolase  58.42 
 
 
627 aa  640    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0419  transketolase central region  58.67 
 
 
630 aa  701    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.218492  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1278  transketolase  59.24 
 
 
624 aa  660    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0415  Transketolase central region  59.81 
 
 
624 aa  728    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0049  transketolase  59.93 
 
 
626 aa  674    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36720  transketolase  56.11 
 
 
614 aa  620  1e-176  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.148891  normal  0.641961 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17580  transketolase  56.91 
 
 
622 aa  587  1e-166  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.569597  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4832  transketolase  55.04 
 
 
639 aa  572  1.0000000000000001e-162  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2381  transketolase  47.65 
 
 
621 aa  551  1e-155  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.652214  normal  0.294409 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0268  transketolase  48.42 
 
 
606 aa  518  1.0000000000000001e-145  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2307  transketolase  39.53 
 
 
662 aa  351  2e-95  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0505074 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0183  transketolase  29.27 
 
 
640 aa  282  2e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2237  transketolase  32.21 
 
 
689 aa  280  6e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1946  transketolase  29.51 
 
 
631 aa  254  3e-66  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.120337  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1680  transketolase  29.32 
 
 
623 aa  253  7e-66  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1753  transketolase  29.71 
 
 
618 aa  248  3e-64  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.599828  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0809  transketolase central region  31.05 
 
 
592 aa  245  9.999999999999999e-64  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.32467  normal  0.55266 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1302  transketolase  32.43 
 
 
653 aa  245  1.9999999999999999e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0226315  normal  0.530799 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1050  transketolase  30.58 
 
 
635 aa  235  2.0000000000000002e-60  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1062  transketolase  30.58 
 
 
635 aa  235  2.0000000000000002e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2060  Transketolase domain protein  43.85 
 
 
282 aa  224  4.9999999999999996e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3968  Transketolase domain protein  47.49 
 
 
272 aa  221  3e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000279469  unclonable  0.000000000126614 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0968  transketolase domain-containing protein  45.17 
 
 
273 aa  216  7e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2704  transketolase subunit A  44.4 
 
 
281 aa  215  1.9999999999999998e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000372386  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1904  transketolase  29.47 
 
 
668 aa  215  1.9999999999999998e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0236  transketolase subunit A  48.26 
 
 
271 aa  213  9e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0287  transketolase  40.22 
 
 
274 aa  213  9e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.132447  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0292  putative transketolase, N-terminal subunit  40.22 
 
 
274 aa  213  1e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3075  transketolase domain-containing protein  46.18 
 
 
271 aa  212  2e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0025975  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03290  transketolase  31.49 
 
 
661 aa  211  3e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0444  Transketolase central region  29.7 
 
 
636 aa  210  5e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14410  transketolase  31.31 
 
 
660 aa  210  5e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3125  transketolase  31.15 
 
 
664 aa  210  6e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2078  transketolase domain-containing protein  51.35 
 
 
271 aa  210  6e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0469  Transketolase domain protein  49.81 
 
 
273 aa  208  2e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.833145  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1861  Transketolase domain protein  46.72 
 
 
279 aa  207  3e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0243  transketolase-like protein  48.83 
 
 
275 aa  208  3e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0551  transketolase subunit A  46.24 
 
 
286 aa  206  8e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0969  transketolase, central region  38.69 
 
 
306 aa  206  1e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86113  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4745  Transketolase domain protein  43.46 
 
 
277 aa  204  3e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1382  Transketolase domain protein  41.92 
 
 
269 aa  204  3e-51  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1015  transketolase  29.77 
 
 
661 aa  203  6e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0069  transketolase  28.73 
 
 
636 aa  203  7e-51  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.874951  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05480  transketolase subunit A  45.04 
 
 
275 aa  202  9.999999999999999e-51  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2919  transketolase, N-terminal subunit  44.74 
 
 
277 aa  202  1.9999999999999998e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2720  transketolase, N-terminal subunit  43.45 
 
 
273 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0334  Transketolase domain protein  42.28 
 
 
286 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0069  transketolase  29.42 
 
 
633 aa  202  1.9999999999999998e-50  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.317261  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1503  transketolase domain-containing protein  38.75 
 
 
272 aa  201  3e-50  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0294001  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0309  transketolase  29.96 
 
 
684 aa  200  7e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000137507 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0851  transketolase  30.12 
 
 
660 aa  200  7.999999999999999e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0149061  normal  0.206532 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3805  transketolase  30.8 
 
 
665 aa  200  7.999999999999999e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.496968 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2102  transketolase  29.23 
 
 
668 aa  200  7.999999999999999e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000131444  normal  0.204144 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2148  transketolase  28.94 
 
 
671 aa  200  7.999999999999999e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3879  transketolase-like  44.4 
 
 
279 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.521893  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0244  Transketolase central region  38.24 
 
 
305 aa  199  2.0000000000000003e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.304733  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2214  transketolase subunit A  42.17 
 
 
284 aa  198  3e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000519395  hitchhiker  0.000381558 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0949  transketolase  30.09 
 
 
671 aa  197  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2213  transketolase subunit B  36.54 
 
 
317 aa  197  5.000000000000001e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000528401  hitchhiker  0.000741425 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0712  Transketolase domain protein  42.97 
 
 
281 aa  196  7e-49  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0142999  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1052  transketolase  30.02 
 
 
671 aa  197  7e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.25792  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0103  transketolase  29.3 
 
 
662 aa  196  1e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1998  Transketolase domain protein  46.21 
 
 
279 aa  195  2e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.337759  hitchhiker  0.00336505 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3753  transketolase  31.31 
 
 
675 aa  195  2e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2902  transketolase  31.3 
 
 
666 aa  195  2e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1528  Transketolase domain protein  41.82 
 
 
297 aa  195  2e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2430  transketolase  30.34 
 
 
660 aa  195  2e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0339  Transketolase domain protein  45.38 
 
 
280 aa  194  3e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0338  Transketolase central region  42.3 
 
 
319 aa  195  3e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0472  transketolase  31.72 
 
 
682 aa  195  3e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0244  transketolase-like protein  38.06 
 
 
311 aa  194  4e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2059  Transketolase central region  38.26 
 
 
313 aa  194  5e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0491  transketolase domain-containing protein  44.36 
 
 
276 aa  193  6e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1130  Transketolase central region  30.15 
 
 
648 aa  193  7e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2148  transketolase  30.85 
 
 
669 aa  193  9e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1381  Transketolase central region  36.96 
 
 
306 aa  192  1e-47  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2841  transketolase  29.42 
 
 
677 aa  192  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09030  transketolase subunit A  46.36 
 
 
278 aa  192  1e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.169995  normal  0.0273628 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2108  transketolase  29.66 
 
 
684 aa  193  1e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.159274 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1275  transketolase  29.34 
 
 
672 aa  192  1e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.11718  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0159  transketolase  28.62 
 
 
661 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.311309 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1669  transketolase  27.78 
 
 
738 aa  191  2.9999999999999997e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1933  transketolase  28.8 
 
 
656 aa  191  2.9999999999999997e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4312  transketolase  30.26 
 
 
662 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0116  transketolase  28.01 
 
 
634 aa  191  2.9999999999999997e-47  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.984177  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1727  transketolase  27.78 
 
 
663 aa  191  4e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.827271  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0249  transketolase  28.6 
 
 
664 aa  191  5e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4466  transketolase  29.94 
 
 
662 aa  190  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.913477 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4915  transketolase  30.38 
 
 
653 aa  190  5.999999999999999e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5124  transketolase  29.5 
 
 
671 aa  190  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0227  transketolase  28.16 
 
 
657 aa  190  5.999999999999999e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4744  Transketolase central region  40.4 
 
 
311 aa  188  2e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0492  transketolase, central region  37.54 
 
 
312 aa  188  3e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0237  transketolase subunit B  42.21 
 
 
311 aa  187  4e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0465  transketolase  25.65 
 
 
663 aa  187  4e-46  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2989  transketolase  29.59 
 
 
671 aa  187  4e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1220  transketolase  29.3 
 
 
677 aa  187  4e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1190  transketolase  28.67 
 
 
663 aa  187  4e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>