More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2307 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_2307  transketolase  100 
 
 		 662 aa  1330    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0505074 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1655  transketolase  38.58 
 
 		 629 aa  392  1e-108  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.168649 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0268  transketolase  37.39 
 
 		 606 aa  392  1e-107  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0419  transketolase central region  38.04 
 
 		 630 aa  390  1e-107  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.218492  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2381  transketolase  37.14 
 
 		 621 aa  389  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.652214  normal  0.294409 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2123  transketolase  39.6 
 
 		 627 aa  370  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0049  transketolase  37.54 
 
 		 626 aa  366  1e-100  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0415  Transketolase central region  37.61 
 
 		 624 aa  367  1e-100  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3317  transketolase  39.71 
 
 		 612 aa  357  2.9999999999999997e-97  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1278  transketolase  38.05 
 
 		 624 aa  357  5e-97  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36720  transketolase  37.83 
 
 		 614 aa  353  4e-96  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.148891  normal  0.641961 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17580  transketolase  38.43 
 
 		 622 aa  348  2e-94  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.569597  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4832  transketolase  37.6 
 
 		 639 aa  322  1.9999999999999998e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2237  transketolase  30.52 
 
 		 689 aa  227  4e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0183  transketolase  27.11 
 
 		 640 aa  206  1e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1680  transketolase  29.94 
 
 		 623 aa  195  3e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1946  transketolase  26.93 
 
 		 631 aa  194  6e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.120337  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1302  transketolase  29.25 
 
 		 653 aa  192  2e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0226315  normal  0.530799 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1062  transketolase  29.41 
 
 		 635 aa  184  3e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1050  transketolase  29.41 
 
 		 635 aa  184  3e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0236  transketolase subunit A  40.43 
 
 		 271 aa  184  4.0000000000000006e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2078  transketolase domain-containing protein  42.91 
 
 		 271 aa  184  5.0000000000000004e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1130  Transketolase central region  30.43 
 
 		 648 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2060  Transketolase domain protein  38.43 
 
 		 282 aa  181  4e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0492  transketolase, central region  38.7 
 
 		 312 aa  181  4e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0969  transketolase, central region  35.58 
 
 		 306 aa  181  4.999999999999999e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86113  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0491  transketolase domain-containing protein  40.36 
 
 		 276 aa  180  7e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1753  transketolase  26.71 
 
 		 618 aa  179  2e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.599828  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0339  Transketolase domain protein  39.33 
 
 		 280 aa  177  4e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2213  transketolase subunit B  36.16 
 
 		 317 aa  177  6e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000528401  hitchhiker  0.000741425 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0280  Transketolase central region  37.35 
 
 		 310 aa  177  6e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.741894  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0469  Transketolase domain protein  41.79 
 
 		 273 aa  177  7e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.833145  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3075  transketolase domain-containing protein  38.63 
 
 		 271 aa  177  8e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0025975  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4744  Transketolase central region  40.46 
 
 		 311 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2704  transketolase subunit A  37.22 
 
 		 281 aa  174  5.999999999999999e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000372386  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3968  Transketolase domain protein  39.86 
 
 		 272 aa  173  1e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000279469  unclonable  0.000000000126614 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0551  transketolase subunit A  38.91 
 
 		 286 aa  172  2e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0287  transketolase  36.82 
 
 		 274 aa  172  2e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.132447  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0244  transketolase-like protein  35.49 
 
 		 311 aa  172  2e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1860  Transketolase central region  35.91 
 
 		 321 aa  171  3e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0244  Transketolase central region  35.33 
 
 		 305 aa  171  4e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.304733  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0292  putative transketolase, N-terminal subunit  36.82 
 
 		 274 aa  171  4e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0265  Transketolase central region  36.62 
 
 		 310 aa  170  6e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00214892 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0712  Transketolase domain protein  36.4 
 
 		 281 aa  169  1e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0142999  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1382  Transketolase domain protein  39.16 
 
 		 269 aa  169  1e-40  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0293  putative transketolase, C-terminal subunit  35.19 
 
 		 314 aa  169  1e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0288  transketolase  35.19 
 
 		 314 aa  169  1e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000211069  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1503  transketolase domain-containing protein  36.12 
 
 		 272 aa  169  2e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0294001  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2214  transketolase subunit A  40.34 
 
 		 284 aa  169  2e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000519395  hitchhiker  0.000381558 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2059  Transketolase central region  36.31 
 
 		 313 aa  168  2.9999999999999998e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0279  Transketolase domain protein  37.82 
 
 		 274 aa  167  6.9999999999999995e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000402099  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1015  transketolase  28.99 
 
 		 661 aa  166  9e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0447  transketolase  29 
 
 		 671 aa  166  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.127654 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0264  Transketolase domain protein  37.82 
 
 		 274 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00137267 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1193  transketolase  29.29 
 
 		 667 aa  165  3e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.043876 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1552  transketolase domain-containing protein  33.45 
 
 		 275 aa  164  5.0000000000000005e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.12208  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0367  transketolase domain-containing protein  33.69 
 
 		 275 aa  164  5.0000000000000005e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0144552 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2897  transketolase  29.4 
 
 		 673 aa  164  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.715416  normal  0.0202712 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0469  transketolase subunit A  33.1 
 
 		 275 aa  164  6e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.125923  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0968  transketolase domain-containing protein  37.5 
 
 		 273 aa  163  1e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05480  transketolase subunit A  36.36 
 
 		 275 aa  162  2e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2430  transketolase  28.31 
 
 		 660 aa  162  2e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2108  transketolase  27.12 
 
 		 684 aa  162  3e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159274 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1275  transketolase  28.86 
 
 		 672 aa  162  3e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.11718  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0338  Transketolase central region  39.12 
 
 		 319 aa  160  5e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1895  transketolase, C-terminal subunit  32.92 
 
 		 318 aa  160  5e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00759771 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3805  transketolase  28.03 
 
 		 665 aa  160  7e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.496968 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0440  transketolase  32.37 
 
 		 275 aa  160  7e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.707668  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2919  transketolase, N-terminal subunit  38.4 
 
 		 277 aa  159  1e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0444  Transketolase central region  27.82 
 
 		 636 aa  159  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0202  transketolase  27.84 
 
 		 636 aa  159  2e-37  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1861  Transketolase domain protein  37.18 
 
 		 279 aa  159  2e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0183  Transketolase central region  33.02 
 
 		 320 aa  158  3e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5124  transketolase  29.98 
 
 		 671 aa  158  3e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2601  transketolase  28.67 
 
 		 655 aa  157  4e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0860  Transketolase domain protein  33.54 
 
 		 310 aa  157  4e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.476833  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2935  Transketolase central region  32.7 
 
 		 317 aa  157  8e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00875  transketolase, C-terminal subunit  33.02 
 
 		 317 aa  156  1e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1052  transketolase  28.74 
 
 		 671 aa  156  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.25792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3967  Transketolase central region  35.91 
 
 		 313 aa  155  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000645501  unclonable  0.000000000133165 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0949  transketolase  28.69 
 
 		 671 aa  155  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2902  transketolase  28.71 
 
 		 666 aa  155  2.9999999999999998e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03290  transketolase  26.77 
 
 		 661 aa  155  2.9999999999999998e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0551  transketolase  25.35 
 
 		 662 aa  154  5e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0243  transketolase-like protein  37.64 
 
 		 275 aa  154  5e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1277  Transketolase central region  34.77 
 
 		 313 aa  154  5.9999999999999996e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1997  Transketolase central region  37.07 
 
 		 321 aa  154  7e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00329881 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0487  transketolase  27.87 
 
 		 667 aa  153  8e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.33279  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1107  Transketolase domain protein  36.14 
 
 		 303 aa  153  1e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1968  transketolase  28.85 
 
 		 655 aa  153  1e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00341468  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2705  transketolase subunit B  34.26 
 
 		 311 aa  152  1e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000194197  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00940  conserved hypothetical protein  26.64 
 
 		 687 aa  152  2e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.292242  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2734  transketolase  27.85 
 
 		 661 aa  152  2e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.784208 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1178  Transketolase central region  33.65 
 
 		 327 aa  152  2e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0058066  normal  0.0131189 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1697  transketolase  28.81 
 
 		 668 aa  152  2e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.473272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14410  transketolase  26.94 
 
 		 660 aa  152  2e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1220  transketolase  28.67 
 
 		 677 aa  152  3e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0069  transketolase  28.55 
 
 		 633 aa  151  3e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.317261  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0172  Transketolase domain protein  35.38 
 
 		 273 aa  150  5e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.906394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0334  Transketolase domain protein  36.19 
 
 		 286 aa  150  5e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>