More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2381 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2381  transketolase  100 
 
 		 621 aa  1285    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.652214  normal  0.294409 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0415  Transketolase central region  48.7 
 
 		 624 aa  597  1e-169  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1655  transketolase  47.42 
 
 		 629 aa  567  1e-160  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.168649 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0419  transketolase central region  47.44 
 
 		 630 aa  561  1.0000000000000001e-159  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.218492  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0049  transketolase  46.17 
 
 		 626 aa  553  1e-156  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3317  transketolase  48.35 
 
 		 612 aa  530  1e-149  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0268  transketolase  48.04 
 
 		 606 aa  531  1e-149  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2123  transketolase  44.02 
 
 		 627 aa  514  1e-144  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36720  transketolase  46 
 
 		 614 aa  514  1e-144  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.148891  normal  0.641961 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1278  transketolase  44.41 
 
 		 624 aa  505  9.999999999999999e-143  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17580  transketolase  45.2 
 
 		 622 aa  481  1e-134  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.569597  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4832  transketolase  43.81 
 
 		 639 aa  461  9.999999999999999e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2307  transketolase  37.14 
 
 		 662 aa  367  1e-100  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0505074 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2237  transketolase  36.09 
 
 		 689 aa  324  3e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0183  transketolase  32.81 
 
 		 640 aa  300  6e-80  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0809  transketolase central region  34.69 
 
 		 592 aa  287  2.9999999999999996e-76  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.32467  normal  0.55266 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1946  transketolase  32.13 
 
 		 631 aa  286  8e-76  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.120337  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1753  transketolase  31.07 
 
 		 618 aa  263  8.999999999999999e-69  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.599828  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1680  transketolase  31.97 
 
 		 623 aa  256  1.0000000000000001e-66  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1062  transketolase  30.02 
 
 		 635 aa  251  3e-65  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1050  transketolase  30.02 
 
 		 635 aa  251  3e-65  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1302  transketolase  29.47 
 
 		 653 aa  244  3.9999999999999997e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0226315  normal  0.530799 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1861  Transketolase domain protein  47.39 
 
 		 279 aa  239  8e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1636  transketolase  29.93 
 
 		 632 aa  227  6e-58  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1998  Transketolase domain protein  47.01 
 
 		 279 aa  226  8e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.337759  hitchhiker  0.00336505 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0116  transketolase  31.16 
 
 		 634 aa  226  8e-58  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.984177  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0968  transketolase domain-containing protein  46.27 
 
 		 273 aa  226  1e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0236  transketolase subunit A  45.39 
 
 		 271 aa  225  2e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0444  Transketolase central region  29.87 
 
 		 636 aa  224  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2005  transketolase  29.72 
 
 		 632 aa  224  3e-57  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0712  Transketolase domain protein  46.21 
 
 		 281 aa  224  4.9999999999999996e-57  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0142999  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1817  transketolase  29.75 
 
 		 632 aa  223  9.999999999999999e-57  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3075  transketolase domain-containing protein  43.54 
 
 		 271 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0025975  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1130  Transketolase central region  28.66 
 
 		 648 aa  222  1.9999999999999999e-56  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0551  transketolase subunit A  45.02 
 
 		 286 aa  221  3e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0292  putative transketolase, N-terminal subunit  42.65 
 
 		 274 aa  221  3.9999999999999997e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0287  transketolase  42.65 
 
 		 274 aa  221  3.9999999999999997e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.132447  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2919  transketolase, N-terminal subunit  44.28 
 
 		 277 aa  218  2.9999999999999998e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4745  Transketolase domain protein  43.98 
 
 		 277 aa  218  4e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2060  Transketolase domain protein  44.32 
 
 		 282 aa  216  8e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0334  Transketolase domain protein  43.62 
 
 		 286 aa  214  3.9999999999999995e-54  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3968  Transketolase domain protein  44.61 
 
 		 272 aa  214  4.9999999999999996e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000279469  unclonable  0.000000000126614 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2078  transketolase domain-containing protein  45.28 
 
 		 271 aa  213  7.999999999999999e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0440  transketolase  42.32 
 
 		 275 aa  213  9e-54  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.707668  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0172  Transketolase domain protein  44.44 
 
 		 273 aa  213  1e-53  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.906394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0243  transketolase-like protein  45.8 
 
 		 275 aa  213  1e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0469  Transketolase domain protein  46.84 
 
 		 273 aa  213  1e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.833145  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05480  transketolase subunit A  44.19 
 
 		 275 aa  211  2e-53  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0069  transketolase  30.88 
 
 		 636 aa  210  5e-53  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.874951  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0491  transketolase domain-containing protein  43.59 
 
 		 276 aa  209  8e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0338  Transketolase central region  44.52 
 
 		 319 aa  210  8e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0069  transketolase  29.16 
 
 		 633 aa  210  8e-53  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.317261  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2213  transketolase subunit B  38.98 
 
 		 317 aa  209  9e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000528401  hitchhiker  0.000741425 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0969  transketolase, central region  38.28 
 
 		 306 aa  208  2e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86113  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09030  transketolase subunit A  46.47 
 
 		 278 aa  208  3e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.169995  normal  0.0273628 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1503  transketolase domain-containing protein  42.64 
 
 		 272 aa  207  4e-52  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0294001  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2704  transketolase subunit A  41.29 
 
 		 281 aa  206  7e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000372386  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0300  transketolase central region  40.38 
 
 		 324 aa  206  1e-51  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0477096 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1528  Transketolase domain protein  44.29 
 
 		 297 aa  204  3e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0264  Transketolase domain protein  41.45 
 
 		 274 aa  204  4e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00137267 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0492  transketolase, central region  38.91 
 
 		 312 aa  204  4e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2214  transketolase subunit A  44.66 
 
 		 284 aa  203  8e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000519395  hitchhiker  0.000381558 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1735  transketolase  28.81 
 
 		 636 aa  203  9e-51  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00492424  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1552  transketolase domain-containing protein  42.86 
 
 		 275 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.12208  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0279  Transketolase domain protein  40.73 
 
 		 274 aa  202  1.9999999999999998e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000402099  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0469  transketolase subunit A  42.48 
 
 		 275 aa  201  3.9999999999999996e-50  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.125923  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0367  transketolase domain-containing protein  42.86 
 
 		 275 aa  201  3.9999999999999996e-50  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0144552 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1933  transketolase  28.45 
 
 		 656 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0244  transketolase-like protein  37.54 
 
 		 311 aa  199  1.0000000000000001e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0202  transketolase  29.25 
 
 		 636 aa  199  2.0000000000000003e-49  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0333  Transketolase domain protein  40.07 
 
 		 309 aa  197  3e-49  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1382  Transketolase domain protein  44.65 
 
 		 269 aa  198  3e-49  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2059  Transketolase central region  40.33 
 
 		 313 aa  196  7e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0280  Transketolase central region  37.74 
 
 		 310 aa  196  1e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.741894  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0299  ribulose-phosphate 3-epimerase  39.93 
 
 		 555 aa  195  2e-48  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0242597 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2720  transketolase, N-terminal subunit  43.07 
 
 		 273 aa  194  4e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0265  Transketolase central region  37.42 
 
 		 310 aa  194  6e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00214892 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1381  Transketolase central region  38.44 
 
 		 306 aa  193  9e-48  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0465  transketolase  26.95 
 
 		 663 aa  193  9e-48  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0339  Transketolase domain protein  41.7 
 
 		 280 aa  191  2.9999999999999997e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1173  Transketolase central region  37.62 
 
 		 327 aa  190  5.999999999999999e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000000393635  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0561  transketolase  27.29 
 
 		 661 aa  189  1e-46  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1286  transketolase-like  35.2 
 
 		 327 aa  189  1e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.290354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0293  putative transketolase, C-terminal subunit  37.06 
 
 		 314 aa  189  1e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0288  transketolase  37.06 
 
 		 314 aa  189  1e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000211069  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0245  Transketolase domain protein  40.61 
 
 		 265 aa  189  1e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.411817  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0552  transketolase subunit B  38.06 
 
 		 314 aa  189  2e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1793  transketolase subunit A  39.01 
 
 		 297 aa  188  3e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0143837  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1895  transketolase, C-terminal subunit  37.34 
 
 		 318 aa  187  4e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00759771 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1059  transketolase subunit A  39.62 
 
 		 277 aa  187  4e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.579948 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0438  transketolase central region  35.99 
 
 		 312 aa  187  5e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0397028  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1192  transketolase-like  36.33 
 
 		 327 aa  184  3e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.101787  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3967  Transketolase central region  40.53 
 
 		 313 aa  184  3e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000645501  unclonable  0.000000000133165 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09040  transketolase subunit B  35.81 
 
 		 315 aa  184  4.0000000000000006e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.28283  normal  0.0525296 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0874  Transketolase central region  36.33 
 
 		 326 aa  184  6e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2799  Transketolase domain protein  38.82 
 
 		 274 aa  183  7e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0881  Transketolase central region  35.38 
 
 		 327 aa  183  7e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000876605  normal  0.0478781 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1860  Transketolase central region  36.89 
 
 		 321 aa  183  7e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2808  transketolase  27.35 
 
 		 665 aa  182  1e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000368556  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14541  N-terminal subunit of transketolase  38.29 
 
 		 288 aa  182  2e-44  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>