More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2237 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_2237  transketolase  100 
 
 		 689 aa  1428    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2381  transketolase  34.43 
 
 		 621 aa  336  1e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.652214  normal  0.294409 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3075  transketolase domain-containing protein  56.34 
 
 		 271 aa  313  7.999999999999999e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0025975  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0415  Transketolase central region  33.54 
 
 		 624 aa  309  9e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1655  transketolase  33.8 
 
 		 629 aa  309  1.0000000000000001e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.168649 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0419  transketolase central region  33.89 
 
 		 630 aa  308  3e-82  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.218492  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0809  transketolase central region  35.44 
 
 		 592 aa  307  5.0000000000000004e-82  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.32467  normal  0.55266 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0268  transketolase  34.3 
 
 		 606 aa  305  1.0000000000000001e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0049  transketolase  34.25 
 
 		 626 aa  300  5e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36720  transketolase  35.15 
 
 		 614 aa  299  1e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.148891  normal  0.641961 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0551  transketolase subunit A  52.14 
 
 		 286 aa  295  2e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0183  transketolase  33.28 
 
 		 640 aa  295  3e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2919  transketolase, N-terminal subunit  53.9 
 
 		 277 aa  294  5e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0236  transketolase subunit A  57.6 
 
 		 271 aa  293  7e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3968  Transketolase domain protein  53.73 
 
 		 272 aa  291  2e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000279469  unclonable  0.000000000126614 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1382  Transketolase domain protein  53.38 
 
 		 269 aa  290  8e-77  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2060  Transketolase domain protein  53.76 
 
 		 282 aa  289  1e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0243  transketolase-like protein  53.99 
 
 		 275 aa  286  7e-76  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0491  transketolase domain-containing protein  51.67 
 
 		 276 aa  285  3.0000000000000004e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0968  transketolase domain-containing protein  54.31 
 
 		 273 aa  284  5.000000000000001e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0469  Transketolase domain protein  55.51 
 
 		 273 aa  283  6.000000000000001e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.833145  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1861  Transketolase domain protein  54.31 
 
 		 279 aa  283  1e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0264  Transketolase domain protein  51.48 
 
 		 274 aa  281  2e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00137267 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2078  transketolase domain-containing protein  54.24 
 
 		 271 aa  281  3e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3317  transketolase  32.4 
 
 		 612 aa  281  4e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0279  Transketolase domain protein  51.48 
 
 		 274 aa  280  5e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000402099  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0287  transketolase  50.19 
 
 		 274 aa  278  2e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.132447  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1503  transketolase domain-containing protein  50.37 
 
 		 272 aa  278  3e-73  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0294001  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0292  putative transketolase, N-terminal subunit  49.81 
 
 		 274 aa  277  6e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4745  Transketolase domain protein  51.87 
 
 		 277 aa  274  5.000000000000001e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2704  transketolase subunit A  50 
 
 		 281 aa  273  7e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000372386  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0334  Transketolase domain protein  50.18 
 
 		 286 aa  273  1e-71  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1680  transketolase  33.03 
 
 		 623 aa  272  2e-71  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1302  transketolase  32.49 
 
 		 653 aa  271  2.9999999999999997e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0226315  normal  0.530799 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1552  transketolase domain-containing protein  49.64 
 
 		 275 aa  270  5e-71  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.12208  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0367  transketolase domain-containing protein  49.64 
 
 		 275 aa  268  2.9999999999999995e-70  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0144552 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0712  Transketolase domain protein  48.39 
 
 		 281 aa  267  5e-70  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0142999  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1753  transketolase  30.64 
 
 		 618 aa  266  7e-70  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.599828  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1998  Transketolase domain protein  53.93 
 
 		 279 aa  265  2e-69  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.337759  hitchhiker  0.00336505 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0469  transketolase subunit A  48.91 
 
 		 275 aa  265  2e-69  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.125923  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05480  transketolase subunit A  53.23 
 
 		 275 aa  265  2e-69  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2214  transketolase subunit A  51.76 
 
 		 284 aa  264  4e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000519395  hitchhiker  0.000381558 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2123  transketolase  31.05 
 
 		 627 aa  262  2e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2720  transketolase, N-terminal subunit  49.82 
 
 		 273 aa  261  4e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1278  transketolase  31.83 
 
 		 624 aa  259  1e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09030  transketolase subunit A  52.79 
 
 		 278 aa  258  2e-67  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.169995  normal  0.0273628 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1946  transketolase  30.5 
 
 		 631 aa  256  1.0000000000000001e-66  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.120337  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1437  transketolase-like  48.75 
 
 		 297 aa  254  4.0000000000000004e-66  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1190  Transketolase domain protein  47.46 
 
 		 303 aa  254  5.000000000000001e-66  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00778844  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0245  Transketolase domain protein  51.42 
 
 		 265 aa  253  6e-66  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.411817  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1373  Transketolase domain protein  46.59 
 
 		 303 aa  250  6e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.160442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1178  Transketolase central region  43.64 
 
 		 327 aa  249  8e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0058066  normal  0.0131189 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0440  transketolase  47.23 
 
 		 275 aa  249  1e-64  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.707668  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1062  transketolase  32.28 
 
 		 635 aa  249  1e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1050  transketolase  32.28 
 
 		 635 aa  249  1e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0881  Transketolase central region  43.07 
 
 		 327 aa  248  2e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000876605  normal  0.0478781 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1192  transketolase-like  41.69 
 
 		 327 aa  241  4e-62  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.101787  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1173  Transketolase central region  41.81 
 
 		 327 aa  239  1e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000000393635  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1286  transketolase-like  41.39 
 
 		 327 aa  238  2e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.290354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4832  transketolase  30.23 
 
 		 639 aa  238  3e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0172  Transketolase domain protein  46.82 
 
 		 273 aa  237  7e-61  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.906394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0874  Transketolase central region  39.88 
 
 		 326 aa  236  1.0000000000000001e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1107  Transketolase domain protein  45.49 
 
 		 303 aa  235  2.0000000000000002e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0969  transketolase, central region  41.62 
 
 		 306 aa  233  1e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86113  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17580  transketolase  31.29 
 
 		 622 aa  232  2e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.569597  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1170  transketolase subunit B  39.88 
 
 		 326 aa  231  5e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000103125  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3879  transketolase-like  45.28 
 
 		 279 aa  228  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.521893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0333  Transketolase domain protein  43.92 
 
 		 309 aa  228  3e-58  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1192  transketolase-like  46.18 
 
 		 301 aa  228  4e-58  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.437056 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2705  transketolase subunit B  42.55 
 
 		 311 aa  228  4e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000194197  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0244  Transketolase central region  40.43 
 
 		 305 aa  226  1e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.304733  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1528  Transketolase domain protein  43.93 
 
 		 297 aa  224  4.9999999999999996e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1467  Transketolase domain protein  43.28 
 
 		 273 aa  223  8e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0265  Transketolase central region  39.18 
 
 		 310 aa  223  8e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00214892 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0280  Transketolase central region  39.18 
 
 		 310 aa  223  9e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.741894  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1184  Transketolase domain protein  44.77 
 
 		 305 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0299  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.53 
 
 		 555 aa  221  3e-56  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0242597 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2255  Transketolase domain protein  43.61 
 
 		 269 aa  221  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.158936  normal  0.0249782 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2033  Transketolase domain protein  45.11 
 
 		 269 aa  220  6e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.309611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1895  transketolase, C-terminal subunit  38.12 
 
 		 318 aa  220  6e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00759771 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1924  transketolase domain-containing protein  43.59 
 
 		 281 aa  220  7.999999999999999e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0391  Transketolase domain protein  43.49 
 
 		 280 aa  219  1e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0504613 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1860  Transketolase central region  39.88 
 
 		 321 aa  219  1e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2307  transketolase  30.52 
 
 		 662 aa  218  2.9999999999999998e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0505074 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0975  Transketolase central region  38.53 
 
 		 317 aa  217  5.9999999999999996e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.127122  normal  0.063318 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0406  transketolase domain-containing protein  45.75 
 
 		 302 aa  216  9e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.186012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1130  Transketolase central region  30.09 
 
 		 648 aa  216  9.999999999999999e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3950  Transketolase domain protein  42.11 
 
 		 291 aa  214  4.9999999999999996e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.804929  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2127  Transketolase domain protein  43.07 
 
 		 276 aa  214  5.999999999999999e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.359071  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00875  transketolase, C-terminal subunit  37.35 
 
 		 317 aa  213  1e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2799  Transketolase domain protein  44.27 
 
 		 274 aa  213  1e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1017  transketolase subunit A  44.77 
 
 		 303 aa  213  1e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2935  Transketolase central region  38.53 
 
 		 317 aa  213  1e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1131  transketolase domain-containing protein  46.75 
 
 		 280 aa  212  2e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0711  Transketolase central region  37.72 
 
 		 315 aa  212  2e-53  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00000202012  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0183  Transketolase central region  36.84 
 
 		 320 aa  210  6e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1059  transketolase subunit A  45.82 
 
 		 277 aa  209  1e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.579948 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5636  transketolase subunit A  44.56 
 
 		 282 aa  209  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1894  transketolase  44.8 
 
 		 280 aa  208  2e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00737367 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0293  putative transketolase, C-terminal subunit  38.3 
 
 		 314 aa  209  2e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>