More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1277 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1277  Transketolase central region  100 
 
 		 313 aa  635    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1878  transketolase subunit B  69.65 
 
 		 312 aa  481  1e-135  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0809  transketolase central region  56.54 
 
 		 592 aa  369  1e-101  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.32467  normal  0.55266 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0789  transketolase central region  45.72 
 
 		 314 aa  288  6e-77  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0894  transketolase subunit B  47.37 
 
 		 314 aa  285  7e-76  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2110  transketolase, central region  46.71 
 
 		 314 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.44874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1775  transketolase, central region  45.07 
 
 		 314 aa  281  1e-74  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0969  transketolase, central region  45.21 
 
 		 306 aa  259  4e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86113  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2059  Transketolase central region  43.18 
 
 		 313 aa  250  3e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2213  transketolase subunit B  41.35 
 
 		 317 aa  248  1e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000528401  hitchhiker  0.000741425 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0333  Transketolase central region  48.12 
 
 		 322 aa  246  4e-64  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0293  putative transketolase, C-terminal subunit  42.57 
 
 		 314 aa  243  1.9999999999999999e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0288  transketolase  42.57 
 
 		 314 aa  243  1.9999999999999999e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000211069  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0300  transketolase central region  42.72 
 
 		 324 aa  241  1e-62  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0477096 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0244  transketolase-like protein  41.56 
 
 		 311 aa  241  2e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05490  transketolase subunit B  43.65 
 
 		 325 aa  240  2e-62  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.948034 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0874  Transketolase central region  43.38 
 
 		 326 aa  239  5.999999999999999e-62  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0492  transketolase, central region  40.65 
 
 		 312 aa  238  1e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0711  Transketolase central region  42.04 
 
 		 315 aa  238  1e-61  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00000202012  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0244  Transketolase central region  44.15 
 
 		 305 aa  238  1e-61  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.304733  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1997  Transketolase central region  44.19 
 
 		 321 aa  237  2e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00329881 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0881  Transketolase central region  41.39 
 
 		 327 aa  235  6e-61  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000876605  normal  0.0478781 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0280  Transketolase central region  41.1 
 
 		 310 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.741894  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1178  Transketolase central region  41.06 
 
 		 327 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0058066  normal  0.0131189 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0265  Transketolase central region  40.45 
 
 		 310 aa  232  5e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00214892 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4744  Transketolase central region  44.75 
 
 		 311 aa  232  6e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1860  Transketolase central region  39.94 
 
 		 321 aa  231  1e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1192  transketolase-like  41.72 
 
 		 327 aa  231  1e-59  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.101787  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1381  Transketolase central region  42.86 
 
 		 306 aa  231  1e-59  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2705  transketolase subunit B  43.31 
 
 		 311 aa  231  1e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000194197  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3967  Transketolase central region  43.83 
 
 		 313 aa  230  2e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000645501  unclonable  0.000000000133165 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0173  Transketolase central region  38.31 
 
 		 313 aa  231  2e-59  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1170  transketolase subunit B  42.33 
 
 		 326 aa  229  4e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000103125  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1286  transketolase-like  40.73 
 
 		 327 aa  226  3e-58  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.290354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0552  transketolase subunit B  43.1 
 
 		 314 aa  226  4e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1173  Transketolase central region  40.4 
 
 		 327 aa  224  2e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000000393635  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09040  transketolase subunit B  41.58 
 
 		 315 aa  224  2e-57  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.28283  normal  0.0525296 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2019  Transketolase central region  40.2 
 
 		 320 aa  222  7e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.6126  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1895  transketolase, C-terminal subunit  37.91 
 
 		 318 aa  221  9.999999999999999e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00759771 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0183  Transketolase central region  37.25 
 
 		 320 aa  217  2.9999999999999998e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3074  transketolase, central region  44.22 
 
 		 313 aa  216  5.9999999999999996e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0289222  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00875  transketolase, C-terminal subunit  38.69 
 
 		 317 aa  215  9e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0860  Transketolase domain protein  40.2 
 
 		 310 aa  214  9.999999999999999e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.476833  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2918  transketolase, C-terminal subunit  43.77 
 
 		 314 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2077  transketolase, central region  43.33 
 
 		 308 aa  213  2.9999999999999995e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0975  Transketolase central region  37.33 
 
 		 317 aa  213  2.9999999999999995e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.127122  normal  0.063318 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0365  transketolase central region  39.56 
 
 		 312 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.556876  normal  0.0129681 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0873  Transketolase central region  36.93 
 
 		 319 aa  212  7.999999999999999e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.199119  hitchhiker  0.00317558 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0471  transketolase subunit B  38.92 
 
 		 312 aa  211  2e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0285277  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0237  transketolase subunit B  41.23 
 
 		 311 aa  210  3e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1554  transketolase central region  38.61 
 
 		 312 aa  209  5e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0600642  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0438  transketolase central region  39.55 
 
 		 312 aa  209  7e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0397028  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1130  transketolase central region  41.83 
 
 		 336 aa  207  2e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1505  transketolase central region  38.54 
 
 		 314 aa  206  4e-52  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0385912  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2719  transketolase, C-terminal subunit  39.02 
 
 		 311 aa  204  1e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1527  Transketolase central region  38.64 
 
 		 319 aa  204  2e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0338  Transketolase central region  41.58 
 
 		 319 aa  202  6e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0470  Transketolase central region  39.87 
 
 		 318 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2935  Transketolase central region  35.55 
 
 		 317 aa  197  3e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2444  transketolase subunit B  37.66 
 
 		 313 aa  197  3e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0334  Transketolase central region  38.67 
 
 		 308 aa  194  2e-48  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2254  Transketolase domain protein  37.1 
 
 		 318 aa  189  4e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.655402  normal  0.0447096 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0049  transketolase, central region  37.95 
 
 		 317 aa  189  8e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3878  transketolase, central region  35.39 
 
 		 342 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.733485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1923  transketolase domain-containing protein  39.47 
 
 		 315 aa  186  3e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4778  transketolase subunit B  36.15 
 
 		 332 aa  186  4e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2800  Transketolase central region  35.71 
 
 		 320 aa  183  3e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6255  transketolase central region  38.19 
 
 		 332 aa  182  6e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.156319  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4930  transketolase central region  38.98 
 
 		 332 aa  182  7e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6422  transketolase, central region  38.19 
 
 		 332 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6657  transketolase, central region  38.19 
 
 		 332 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4411  transketolase, central region  38.98 
 
 		 332 aa  181  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0682016 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4991  transketolase central region  35.64 
 
 		 332 aa  181  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.908463 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5275  transketolase, central region  38.26 
 
 		 335 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.181452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3269  transketolase subunit B  34.87 
 
 		 337 aa  177  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.444228 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1539  transketolase central region  36.12 
 
 		 348 aa  177  2e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.844968  normal  0.490255 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2381  transketolase  35.44 
 
 		 621 aa  176  4e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.652214  normal  0.294409 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3129  transketolase domain-containing protein  34.12 
 
 		 322 aa  176  5e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1468  Transketolase central region  36.1 
 
 		 314 aa  176  6e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2032  Transketolase domain protein  37.5 
 
 		 318 aa  175  8e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.262756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2718  transketolase subunit B  38.64 
 
 		 340 aa  175  9e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3312  Transketolase central region  33.89 
 
 		 332 aa  174  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1418  deoxyxylulose-5-phosphate synthase  35.28 
 
 		 646 aa  173  2.9999999999999996e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.793105  normal  0.333041 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2699  transketolase subunit B  36.36 
 
 		 288 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2513  transketolase subunit B  34.07 
 
 		 322 aa  172  5.999999999999999e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5637  transketolase subunit B  34.62 
 
 		 307 aa  171  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2126  Transketolase domain protein  34.54 
 
 		 320 aa  171  1e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.764032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06530  deoxyxylulose-5-phosphate synthase  32.28 
 
 		 636 aa  171  2e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000553997  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6139  Transketolase central region  33.45 
 
 		 332 aa  170  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.47666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5878  transketolase central region  38.58 
 
 		 333 aa  171  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0686  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  37.68 
 
 		 637 aa  170  3e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.351489  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3949  Transketolase domain protein  34.96 
 
 		 338 aa  169  6e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2235  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  36.17 
 
 		 622 aa  168  9e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.77755  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0268  transketolase  35.37 
 
 		 606 aa  167  2e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3488  deoxyxylulose-5-phosphate synthase  35.8 
 
 		 631 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0451312  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1027  deoxyxylulose-5-phosphate synthase  36.15 
 
 		 634 aa  166  2.9999999999999998e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4663  transketolase central region  39.53 
 
 		 328 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09721  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  34.59 
 
 		 628 aa  166  4e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.274515 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2744  transketolase central region  34.33 
 
 		 342 aa  166  5e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0728122  normal  0.0592981 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0471  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  33.91 
 
 		 636 aa  165  9e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>