More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2918 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2918  transketolase, C-terminal subunit  100 
 
 		 314 aa  632  1e-180  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0552  transketolase subunit B  90.06 
 
 		 314 aa  534  1e-151  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0492  transketolase, central region  79.17 
 
 		 312 aa  510  1e-143  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0265  Transketolase central region  77.74 
 
 		 310 aa  492  9.999999999999999e-139  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00214892 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0280  Transketolase central region  77.74 
 
 		 310 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.741894  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2719  transketolase, C-terminal subunit  69.58 
 
 		 311 aa  409  1e-113  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3967  Transketolase central region  66.03 
 
 		 313 aa  385  1e-106  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000645501  unclonable  0.000000000133165 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0244  transketolase-like protein  57.98 
 
 		 311 aa  369  1e-101  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0969  transketolase, central region  57.95 
 
 		 306 aa  368  1e-101  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86113  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0293  putative transketolase, C-terminal subunit  55.73 
 
 		 314 aa  367  1e-100  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0288  transketolase  55.73 
 
 		 314 aa  367  1e-100  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000211069  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0470  Transketolase central region  63.26 
 
 		 318 aa  363  3e-99  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4744  Transketolase central region  64.95 
 
 		 311 aa  362  4e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1860  Transketolase central region  57.37 
 
 		 321 aa  362  5.0000000000000005e-99  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2213  transketolase subunit B  54.37 
 
 		 317 aa  353  2e-96  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000528401  hitchhiker  0.000741425 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3074  transketolase, central region  62.94 
 
 		 313 aa  349  3e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0289222  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2059  Transketolase central region  52.9 
 
 		 313 aa  349  4e-95  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0711  Transketolase central region  56.4 
 
 		 315 aa  348  8e-95  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00000202012  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1381  Transketolase central region  54.33 
 
 		 306 aa  345  8e-94  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2705  transketolase subunit B  56.09 
 
 		 311 aa  345  8e-94  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000194197  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2077  transketolase, central region  61.97 
 
 		 308 aa  342  4e-93  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0438  transketolase central region  54.52 
 
 		 312 aa  340  2e-92  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0397028  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0365  transketolase central region  56.19 
 
 		 312 aa  334  1e-90  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.556876  normal  0.0129681 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0471  transketolase subunit B  56.19 
 
 		 312 aa  334  1e-90  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0285277  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1554  transketolase central region  56.19 
 
 		 312 aa  332  7.000000000000001e-90  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0600642  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0874  Transketolase central region  52.77 
 
 		 326 aa  331  1e-89  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1173  Transketolase central region  51.79 
 
 		 327 aa  328  7e-89  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000000393635  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1286  transketolase-like  52.12 
 
 		 327 aa  328  7e-89  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.290354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0333  Transketolase central region  50.81 
 
 		 322 aa  327  1.0000000000000001e-88  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0237  transketolase subunit B  57.1 
 
 		 311 aa  327  1.0000000000000001e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1192  transketolase-like  51.47 
 
 		 327 aa  327  2.0000000000000001e-88  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.101787  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1178  Transketolase central region  51.3 
 
 		 327 aa  326  2.0000000000000001e-88  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0058066  normal  0.0131189 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0244  Transketolase central region  51.84 
 
 		 305 aa  326  4.0000000000000003e-88  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.304733  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1505  transketolase central region  53.82 
 
 		 314 aa  325  6e-88  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0385912  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0881  Transketolase central region  51.14 
 
 		 327 aa  324  2e-87  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000876605  normal  0.0478781 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1170  transketolase subunit B  50.49 
 
 		 326 aa  323  3e-87  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000103125  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0300  transketolase central region  50.31 
 
 		 324 aa  318  5e-86  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0477096 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0173  Transketolase central region  51.88 
 
 		 313 aa  309  4e-83  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09040  transketolase subunit B  49.35 
 
 		 315 aa  304  1.0000000000000001e-81  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.28283  normal  0.0525296 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05490  transketolase subunit B  50.49 
 
 		 325 aa  303  3.0000000000000004e-81  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.948034 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1895  transketolase, C-terminal subunit  47.23 
 
 		 318 aa  302  4.0000000000000003e-81  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00759771 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0183  Transketolase central region  47.56 
 
 		 320 aa  301  8.000000000000001e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2019  Transketolase central region  49.67 
 
 		 320 aa  301  9e-81  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.6126  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00875  transketolase, C-terminal subunit  49.35 
 
 		 317 aa  301  9e-81  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0975  Transketolase central region  47.06 
 
 		 317 aa  300  2e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.127122  normal  0.063318 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2935  Transketolase central region  47.39 
 
 		 317 aa  297  2e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0873  Transketolase central region  46.58 
 
 		 319 aa  296  3e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.199119  hitchhiker  0.00317558 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1527  Transketolase central region  50.66 
 
 		 319 aa  293  2e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0860  Transketolase domain protein  47.1 
 
 		 310 aa  287  2e-76  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.476833  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0049  transketolase, central region  48.69 
 
 		 317 aa  282  4.0000000000000003e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1997  Transketolase central region  49.84 
 
 		 321 aa  280  3e-74  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00329881 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1130  transketolase central region  48.18 
 
 		 336 aa  278  6e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0338  Transketolase central region  48.69 
 
 		 319 aa  276  4e-73  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1878  transketolase subunit B  44.44 
 
 		 312 aa  275  1.0000000000000001e-72  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2254  Transketolase domain protein  46.73 
 
 		 318 aa  272  5.000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.655402  normal  0.0447096 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0809  transketolase central region  46.58 
 
 		 592 aa  266  2.9999999999999995e-70  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.32467  normal  0.55266 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3878  transketolase, central region  46.75 
 
 		 342 aa  264  1e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.733485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2110  transketolase, central region  44.3 
 
 		 314 aa  260  2e-68  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.44874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3129  transketolase domain-containing protein  46.58 
 
 		 322 aa  258  8e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0789  transketolase central region  44.95 
 
 		 314 aa  258  1e-67  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1775  transketolase, central region  44.81 
 
 		 314 aa  255  7e-67  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1468  Transketolase central region  41.8 
 
 		 314 aa  255  8e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0894  transketolase subunit B  45.07 
 
 		 314 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2032  Transketolase domain protein  46.41 
 
 		 318 aa  251  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.262756  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1277  Transketolase central region  43.77 
 
 		 313 aa  249  4e-65  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0334  Transketolase central region  48.69 
 
 		 308 aa  249  6e-65  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3364  Transketolase domain protein  40.07 
 
 		 317 aa  242  5e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2842  transketolase subunit B  41.31 
 
 		 317 aa  242  5e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.837175  normal  0.299247 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5659  Transketolase central region  44.74 
 
 		 333 aa  238  1e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.252415  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3269  transketolase subunit B  43.14 
 
 		 337 aa  238  1e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.444228 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2481  transketolase domain protein  40.33 
 
 		 317 aa  233  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.120495  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2526  transketolase domain protein  40 
 
 		 317 aa  232  7.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.508569 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2569  transketolase domain protein  40 
 
 		 317 aa  231  8.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.126502  normal  0.742091 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2689  transketolase domain-containing protein  40 
 
 		 317 aa  231  9e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.423567 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2581  transketolase domain-containing protein  40 
 
 		 317 aa  231  9e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.230809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1792  transketolase subunit B  43.19 
 
 		 310 aa  231  2e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0510195  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4411  transketolase, central region  41.69 
 
 		 332 aa  227  2e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0682016 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4663  transketolase central region  43.42 
 
 		 328 aa  226  4e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0407  transketolase central region  40.39 
 
 		 323 aa  226  5.0000000000000005e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0194561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1539  transketolase central region  42.38 
 
 		 348 aa  226  5.0000000000000005e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.844968  normal  0.490255 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4930  transketolase central region  41.36 
 
 		 332 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6422  transketolase, central region  41.69 
 
 		 332 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6657  transketolase, central region  41.69 
 
 		 332 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5275  transketolase, central region  42.71 
 
 		 335 aa  224  1e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.181452  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3949  Transketolase domain protein  39.2 
 
 		 338 aa  224  2e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4991  transketolase central region  42.21 
 
 		 332 aa  223  2e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.908463 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2513  transketolase subunit B  42.43 
 
 		 322 aa  224  2e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6255  transketolase central region  41.02 
 
 		 332 aa  222  8e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.156319  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4778  transketolase subunit B  41.36 
 
 		 332 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2041  transketolase central region  41.2 
 
 		 330 aa  221  1.9999999999999999e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.522483 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2444  transketolase subunit B  38.64 
 
 		 313 aa  220  1.9999999999999999e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6139  Transketolase central region  41.84 
 
 		 332 aa  219  6e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.47666  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2800  Transketolase central region  38.76 
 
 		 320 aa  218  7e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2718  transketolase subunit B  42.37 
 
 		 340 aa  218  7e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5878  transketolase central region  42.52 
 
 		 333 aa  219  7e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2126  Transketolase domain protein  39.8 
 
 		 320 aa  218  1e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.764032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1462  transketolase subunit B  41.87 
 
 		 332 aa  218  1e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.304967 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0718  transketolase, central region  42.56 
 
 		 334 aa  216  4e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2699  transketolase subunit B  41.84 
 
 		 288 aa  215  8e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3618  transketolase subunit B  41.39 
 
 		 331 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.189872  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>