More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2444 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2444  transketolase subunit B  100 
 
 		 313 aa  637    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2126  Transketolase domain protein  45.7 
 
 		 320 aa  262  6e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.764032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2800  Transketolase central region  42.35 
 
 		 320 aa  255  7e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0173  Transketolase central region  44.3 
 
 		 313 aa  247  2e-64  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0969  transketolase, central region  42.9 
 
 		 306 aa  241  9e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86113  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0244  transketolase-like protein  41.48 
 
 		 311 aa  239  4e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1895  transketolase, C-terminal subunit  40.65 
 
 		 318 aa  236  4e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00759771 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1178  Transketolase central region  38.96 
 
 		 327 aa  235  7e-61  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0058066  normal  0.0131189 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0183  Transketolase central region  38.78 
 
 		 320 aa  233  3e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0881  Transketolase central region  38.83 
 
 		 327 aa  232  5e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000876605  normal  0.0478781 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2254  Transketolase domain protein  39.22 
 
 		 318 aa  231  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.655402  normal  0.0447096 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0407  transketolase central region  38.11 
 
 		 323 aa  230  2e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0194561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0492  transketolase, central region  39.09 
 
 		 312 aa  230  2e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0873  Transketolase central region  38.71 
 
 		 319 aa  230  3e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.199119  hitchhiker  0.00317558 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00875  transketolase, C-terminal subunit  39.02 
 
 		 317 aa  227  2e-58  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2059  Transketolase central region  42.17 
 
 		 313 aa  227  2e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05490  transketolase subunit B  40.19 
 
 		 325 aa  226  3e-58  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.948034 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0333  Transketolase central region  40.19 
 
 		 322 aa  226  4e-58  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1170  transketolase subunit B  38.31 
 
 		 326 aa  225  6e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000103125  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1192  transketolase-like  38.31 
 
 		 327 aa  225  9e-58  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.101787  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1130  transketolase central region  40.66 
 
 		 336 aa  224  1e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2213  transketolase subunit B  39.54 
 
 		 317 aa  224  1e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000528401  hitchhiker  0.000741425 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2019  Transketolase central region  39.16 
 
 		 320 aa  224  1e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.6126  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3129  transketolase domain-containing protein  40.34 
 
 		 322 aa  224  1e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1381  Transketolase central region  40.98 
 
 		 306 aa  224  2e-57  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1286  transketolase-like  37.01 
 
 		 327 aa  223  3e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.290354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3967  Transketolase central region  41.03 
 
 		 313 aa  223  4e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000645501  unclonable  0.000000000133165 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0280  Transketolase central region  37.66 
 
 		 310 aa  222  4.9999999999999996e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.741894  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0265  Transketolase central region  37.66 
 
 		 310 aa  222  8e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00214892 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2935  Transketolase central region  38.51 
 
 		 317 aa  222  8e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1173  Transketolase central region  37.66 
 
 		 327 aa  222  8e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000000393635  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0874  Transketolase central region  36.69 
 
 		 326 aa  220  1.9999999999999999e-56  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1860  Transketolase central region  38.44 
 
 		 321 aa  219  6e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2032  Transketolase domain protein  39.22 
 
 		 318 aa  217  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.262756  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3949  Transketolase domain protein  38.49 
 
 		 338 aa  216  5e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0975  Transketolase central region  37.82 
 
 		 317 aa  215  8e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.127122  normal  0.063318 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09040  transketolase subunit B  38.06 
 
 		 315 aa  214  9.999999999999999e-55  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.28283  normal  0.0525296 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4663  transketolase central region  39.1 
 
 		 328 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0552  transketolase subunit B  41.24 
 
 		 314 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0237  transketolase subunit B  43.41 
 
 		 311 aa  213  3.9999999999999995e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4744  Transketolase central region  39.32 
 
 		 311 aa  211  1e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2705  transketolase subunit B  41.03 
 
 		 311 aa  211  1e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000194197  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0470  Transketolase central region  42.81 
 
 		 318 aa  210  3e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0293  putative transketolase, C-terminal subunit  36.94 
 
 		 314 aa  209  6e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0288  transketolase  36.94 
 
 		 314 aa  209  6e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000211069  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2077  transketolase, central region  41.88 
 
 		 308 aa  207  2e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2719  transketolase, C-terminal subunit  37.79 
 
 		 311 aa  206  3e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3074  transketolase, central region  39.94 
 
 		 313 aa  206  4e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0289222  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0711  Transketolase central region  38.05 
 
 		 315 aa  206  5e-52  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00000202012  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2041  transketolase central region  39.66 
 
 		 330 aa  206  5e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.522483 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0244  Transketolase central region  38.33 
 
 		 305 aa  205  6e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.304733  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0809  transketolase central region  37.7 
 
 		 592 aa  204  2e-51  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.32467  normal  0.55266 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1878  transketolase subunit B  37.91 
 
 		 312 aa  204  2e-51  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1997  Transketolase central region  38.19 
 
 		 321 aa  203  3e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00329881 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1058  transketolase subunit B  39.87 
 
 		 308 aa  202  5e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.847424 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1505  transketolase central region  36.81 
 
 		 314 aa  202  7e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0385912  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3397  Transketolase central region  39.93 
 
 		 298 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5659  Transketolase central region  39.04 
 
 		 333 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.252415  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0860  Transketolase domain protein  37.1 
 
 		 310 aa  200  1.9999999999999998e-50  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.476833  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0300  transketolase central region  35.67 
 
 		 324 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0477096 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2918  transketolase, C-terminal subunit  38.64 
 
 		 314 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1527  Transketolase central region  38.31 
 
 		 319 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1277  Transketolase central region  37.66 
 
 		 313 aa  197  3e-49  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0049  transketolase, central region  38.96 
 
 		 317 aa  196  3e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1923  transketolase domain-containing protein  36.33 
 
 		 315 aa  195  1e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0438  transketolase central region  36.54 
 
 		 312 aa  193  3e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0397028  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0471  transketolase subunit B  36.88 
 
 		 312 aa  193  4e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0285277  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2513  transketolase subunit B  37.46 
 
 		 322 aa  192  5e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1468  Transketolase central region  35.95 
 
 		 314 aa  192  6e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6295  Transketolase central region  36.77 
 
 		 332 aa  191  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0334  Transketolase central region  39.61 
 
 		 308 aa  191  1e-47  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0365  transketolase central region  36.21 
 
 		 312 aa  189  5.999999999999999e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.556876  normal  0.0129681 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1554  transketolase central region  35.55 
 
 		 312 aa  186  5e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0600642  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5637  transketolase subunit B  35 
 
 		 307 aa  186  5e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2402  transketolase, C-terminal subunit  36.59 
 
 		 310 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.730568  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3248  putative transketolase, C-terminal subunit  35.34 
 
 		 314 aa  182  6e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3382  transketolase domain-containing protein  34.98 
 
 		 314 aa  182  8.000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0338  Transketolase central region  37.13 
 
 		 319 aa  175  9.999999999999999e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1146  Transketolase domain protein  34.75 
 
 		 319 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1078  deoxyxylulose-5-phosphate synthase  34.9 
 
 		 635 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0303047  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2110  transketolase, central region  33.01 
 
 		 314 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.44874  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3642  Transketolase central region  31.35 
 
 		 307 aa  172  5.999999999999999e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0789  transketolase central region  33.33 
 
 		 314 aa  171  1e-41  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2646  Transketolase domain protein  32.19 
 
 		 314 aa  171  2e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0477221  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1775  transketolase, central region  32.68 
 
 		 314 aa  171  2e-41  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0910  putative transketolase, C-terminal subunit  34.63 
 
 		 310 aa  170  3e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06530  deoxyxylulose-5-phosphate synthase  33.44 
 
 		 636 aa  169  7e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000553997  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08020  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  35.5 
 
 		 630 aa  169  7e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.637143  hitchhiker  0.00000100626 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3364  Transketolase domain protein  34.44 
 
 		 317 aa  168  9e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5275  transketolase, central region  35.95 
 
 		 335 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.181452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1048  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  36.84 
 
 		 622 aa  167  2e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0671  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  35.08 
 
 		 643 aa  167  2e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0894  transketolase subunit B  33.33 
 
 		 314 aa  167  2e-40  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2718  transketolase subunit B  35.92 
 
 		 340 aa  166  5e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0486  Transketolase domain protein  32.29 
 
 		 313 aa  166  5e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2842  transketolase subunit B  31.46 
 
 		 317 aa  166  5.9999999999999996e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.837175  normal  0.299247 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3528  Transketolase central region  30.36 
 
 		 306 aa  165  8e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.605284  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1694  1-Deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  34.55 
 
 		 631 aa  165  1.0000000000000001e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.134316  normal  0.0277937 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3618  transketolase subunit B  35.1 
 
 		 331 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.189872  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1539  transketolase central region  34.67 
 
 		 348 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.844968  normal  0.490255 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>