More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_2842 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_2842  transketolase subunit B  100 
 
 
317 aa  655    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.837175  normal  0.299247 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2481  transketolase domain protein  92.11 
 
 
317 aa  607  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.120495  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2689  transketolase domain-containing protein  92.11 
 
 
317 aa  607  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.423567 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2581  transketolase domain-containing protein  92.11 
 
 
317 aa  607  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.230809  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2569  transketolase domain protein  91.8 
 
 
317 aa  604  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.126502  normal  0.742091 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2526  transketolase domain protein  91.8 
 
 
317 aa  606  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.508569 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3364  Transketolase domain protein  65.3 
 
 
317 aa  439  9.999999999999999e-123  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1146  Transketolase domain protein  52.43 
 
 
319 aa  340  2.9999999999999998e-92  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0200  transketolase, C-terminal subunit  44.08 
 
 
309 aa  265  5.999999999999999e-70  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2213  transketolase subunit B  38.76 
 
 
317 aa  249  5e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000528401  hitchhiker  0.000741425 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0280  Transketolase central region  43.51 
 
 
310 aa  245  8e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.741894  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0265  Transketolase central region  43.16 
 
 
310 aa  241  9e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00214892 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0969  transketolase, central region  40.66 
 
 
306 aa  241  2e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86113  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1860  Transketolase central region  43.51 
 
 
321 aa  239  2.9999999999999997e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0881  Transketolase central region  45.36 
 
 
327 aa  237  2e-61  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000876605  normal  0.0478781 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0492  transketolase, central region  38.69 
 
 
312 aa  237  2e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1178  Transketolase central region  43.42 
 
 
327 aa  235  7e-61  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0058066  normal  0.0131189 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0293  putative transketolase, C-terminal subunit  40.85 
 
 
314 aa  226  4e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0288  transketolase  40.85 
 
 
314 aa  226  4e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000211069  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3967  Transketolase central region  44.06 
 
 
313 aa  224  1e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000645501  unclonable  0.000000000133165 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1286  transketolase-like  42.72 
 
 
327 aa  224  2e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.290354  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0244  transketolase-like protein  39.51 
 
 
311 aa  223  4.9999999999999996e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2719  transketolase, C-terminal subunit  43.16 
 
 
311 aa  222  7e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0711  Transketolase central region  39.8 
 
 
315 aa  222  7e-57  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00000202012  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2705  transketolase subunit B  41.61 
 
 
311 aa  222  8e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000194197  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2059  Transketolase central region  39.22 
 
 
313 aa  219  3.9999999999999997e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2019  Transketolase central region  38.44 
 
 
320 aa  219  5e-56  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.6126  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4744  Transketolase central region  44.53 
 
 
311 aa  218  1e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0873  Transketolase central region  37.46 
 
 
319 aa  217  2e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.199119  hitchhiker  0.00317558 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1192  transketolase-like  41.98 
 
 
327 aa  216  2.9999999999999998e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.101787  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0552  transketolase subunit B  41.06 
 
 
314 aa  216  5e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1170  transketolase subunit B  42.81 
 
 
326 aa  215  9e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000103125  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0874  Transketolase central region  42.32 
 
 
326 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1173  Transketolase central region  41.98 
 
 
327 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000000393635  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0244  Transketolase central region  36.33 
 
 
305 aa  211  2e-53  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.304733  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2918  transketolase, C-terminal subunit  41.31 
 
 
314 aa  210  3e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1895  transketolase, C-terminal subunit  37.01 
 
 
318 aa  207  2e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00759771 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0470  Transketolase central region  40.39 
 
 
318 aa  206  4e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0860  Transketolase domain protein  38.66 
 
 
310 aa  206  6e-52  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.476833  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2935  Transketolase central region  39.22 
 
 
317 aa  205  7e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1381  Transketolase central region  37.33 
 
 
306 aa  205  9e-52  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09040  transketolase subunit B  37.75 
 
 
315 aa  205  9e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.28283  normal  0.0525296 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00875  transketolase, C-terminal subunit  37.05 
 
 
317 aa  205  9e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0173  Transketolase central region  39.37 
 
 
313 aa  204  1e-51  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0333  Transketolase central region  36.96 
 
 
322 aa  204  2e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0975  Transketolase central region  35.5 
 
 
317 aa  204  2e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.127122  normal  0.063318 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0183  Transketolase central region  36.42 
 
 
320 aa  204  2e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05490  transketolase subunit B  39.52 
 
 
325 aa  202  4e-51  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.948034 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0300  transketolase central region  33.97 
 
 
324 aa  202  7e-51  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0477096 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3074  transketolase, central region  43.01 
 
 
313 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0289222  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2077  transketolase, central region  40.33 
 
 
308 aa  199  7.999999999999999e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1527  Transketolase central region  35.97 
 
 
319 aa  194  2e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0334  Transketolase central region  38.41 
 
 
308 aa  194  2e-48  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2254  Transketolase domain protein  34.82 
 
 
318 aa  192  5e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.655402  normal  0.0447096 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0338  Transketolase central region  36.62 
 
 
319 aa  192  7e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1997  Transketolase central region  35.64 
 
 
321 aa  191  2e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00329881 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0471  transketolase subunit B  36.58 
 
 
312 aa  187  1e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0285277  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1878  transketolase subunit B  36.77 
 
 
312 aa  186  3e-46  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0365  transketolase central region  35.91 
 
 
312 aa  185  8e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.556876  normal  0.0129681 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1554  transketolase central region  35.23 
 
 
312 aa  183  3e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0600642  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0438  transketolase central region  34.88 
 
 
312 aa  183  3e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0397028  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0049  transketolase, central region  36.56 
 
 
317 aa  183  4.0000000000000006e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3949  Transketolase domain protein  36.09 
 
 
338 aa  180  2e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0237  transketolase subunit B  36.51 
 
 
311 aa  180  2.9999999999999997e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2032  Transketolase domain protein  35.4 
 
 
318 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.262756  normal 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4834  transketolase central region  33.55 
 
 
333 aa  177  2e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1505  transketolase central region  32.45 
 
 
314 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0385912  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3129  transketolase domain-containing protein  36.26 
 
 
322 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2513  transketolase subunit B  35.11 
 
 
322 aa  174  1.9999999999999998e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1130  transketolase central region  34.52 
 
 
336 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5659  Transketolase central region  35.64 
 
 
333 aa  170  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.252415  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2041  transketolase central region  35.37 
 
 
330 aa  169  4e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.522483 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4663  transketolase central region  35.29 
 
 
328 aa  169  5e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2800  Transketolase central region  33.9 
 
 
320 aa  167  2e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0809  transketolase central region  35.59 
 
 
592 aa  166  2.9999999999999998e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.32467  normal  0.55266 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2444  transketolase subunit B  31.46 
 
 
313 aa  166  5.9999999999999996e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1923  transketolase domain-containing protein  30.92 
 
 
315 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5275  transketolase, central region  33.79 
 
 
335 aa  163  3e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.181452  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3269  transketolase subunit B  31.03 
 
 
337 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.444228 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0407  transketolase central region  32.7 
 
 
323 aa  162  7e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0194561  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3618  transketolase subunit B  34.66 
 
 
331 aa  162  8.000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.189872  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36720  transketolase  34.07 
 
 
614 aa  162  8.000000000000001e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.148891  normal  0.641961 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6295  Transketolase central region  34.87 
 
 
332 aa  161  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1468  Transketolase central region  31.16 
 
 
314 aa  161  1e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1277  Transketolase central region  31.83 
 
 
313 aa  160  3e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5637  transketolase subunit B  31.44 
 
 
307 aa  159  4e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0789  transketolase central region  34.6 
 
 
314 aa  159  4e-38  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2110  transketolase, central region  33.68 
 
 
314 aa  159  5e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.44874  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2092  transketolase central region  31.62 
 
 
339 aa  159  7e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.147262 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2367  Transketolase central region  31.62 
 
 
339 aa  159  7e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.438048  normal  0.0327946 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1713  transketolase central region  32.03 
 
 
332 aa  158  1e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.548893  normal  0.0621953 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2126  Transketolase domain protein  32.01 
 
 
320 aa  158  1e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.764032  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2718  transketolase subunit B  32.18 
 
 
340 aa  157  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1775  transketolase, central region  33.56 
 
 
314 aa  157  2e-37  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2381  transketolase  32.57 
 
 
621 aa  157  2e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.652214  normal  0.294409 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0894  transketolase subunit B  33.33 
 
 
314 aa  157  2e-37  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4991  transketolase central region  31.38 
 
 
332 aa  157  3e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.908463 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1278  transketolase  34.63 
 
 
624 aa  156  4e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1539  transketolase central region  31.65 
 
 
348 aa  155  6e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.844968  normal  0.490255 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4930  transketolase central region  31.01 
 
 
332 aa  155  9e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>