More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_1146 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_1146  Transketolase domain protein  100 
 
 		 319 aa  659    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3364  Transketolase domain protein  59.54 
 
 		 317 aa  367  1e-100  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2842  transketolase subunit B  52.43 
 
 		 317 aa  340  2.9999999999999998e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.837175  normal  0.299247 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2689  transketolase domain-containing protein  51.94 
 
 		 317 aa  338  5.9999999999999996e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.423567 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2581  transketolase domain-containing protein  51.94 
 
 		 317 aa  338  5.9999999999999996e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.230809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2526  transketolase domain protein  51.94 
 
 		 317 aa  338  5.9999999999999996e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.508569 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2481  transketolase domain protein  51.94 
 
 		 317 aa  337  9.999999999999999e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.120495  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2569  transketolase domain protein  51.94 
 
 		 317 aa  337  1.9999999999999998e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.126502  normal  0.742091 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0969  transketolase, central region  45.02 
 
 		 306 aa  236  3e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86113  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0200  transketolase, C-terminal subunit  41.45 
 
 		 309 aa  224  2e-57  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1178  Transketolase central region  41.64 
 
 		 327 aa  223  3e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0058066  normal  0.0131189 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2213  transketolase subunit B  40.52 
 
 		 317 aa  221  9.999999999999999e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000528401  hitchhiker  0.000741425 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0280  Transketolase central region  37.92 
 
 		 310 aa  216  4e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.741894  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0265  Transketolase central region  38.26 
 
 		 310 aa  216  5e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00214892 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0492  transketolase, central region  36.13 
 
 		 312 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0881  Transketolase central region  41.5 
 
 		 327 aa  214  1.9999999999999998e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000876605  normal  0.0478781 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1860  Transketolase central region  38.28 
 
 		 321 aa  208  1e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1286  transketolase-like  40.42 
 
 		 327 aa  205  8e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.290354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1381  Transketolase central region  38.06 
 
 		 306 aa  205  9e-52  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0711  Transketolase central region  37.63 
 
 		 315 aa  204  1e-51  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00000202012  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0333  Transketolase central region  38.68 
 
 		 322 aa  202  7e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1895  transketolase, C-terminal subunit  40 
 
 		 318 aa  202  9e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00759771 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1170  transketolase subunit B  39.86 
 
 		 326 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000103125  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0293  putative transketolase, C-terminal subunit  37.3 
 
 		 314 aa  199  3.9999999999999996e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0288  transketolase  37.3 
 
 		 314 aa  199  3.9999999999999996e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000211069  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2059  Transketolase central region  38.69 
 
 		 313 aa  199  3.9999999999999996e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1173  Transketolase central region  40.55 
 
 		 327 aa  199  5e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000000393635  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1192  transketolase-like  39.86 
 
 		 327 aa  199  7e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.101787  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0874  Transketolase central region  38.62 
 
 		 326 aa  196  4.0000000000000005e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2705  transketolase subunit B  39.03 
 
 		 311 aa  196  5.000000000000001e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000194197  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0552  transketolase subunit B  36.81 
 
 		 314 aa  196  6e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2719  transketolase, C-terminal subunit  38.11 
 
 		 311 aa  195  1e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4744  Transketolase central region  40.51 
 
 		 311 aa  194  2e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1527  Transketolase central region  35.71 
 
 		 319 aa  194  2e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0975  Transketolase central region  37.8 
 
 		 317 aa  192  9e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.127122  normal  0.063318 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3967  Transketolase central region  37.94 
 
 		 313 aa  191  1e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000645501  unclonable  0.000000000133165 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00875  transketolase, C-terminal subunit  39.16 
 
 		 317 aa  191  1e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0244  transketolase-like protein  35.84 
 
 		 311 aa  190  2e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0873  Transketolase central region  39.51 
 
 		 319 aa  189  5e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.199119  hitchhiker  0.00317558 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0244  Transketolase central region  34.43 
 
 		 305 aa  189  5e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.304733  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0470  Transketolase central region  39.74 
 
 		 318 aa  189  5e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2935  Transketolase central region  39.25 
 
 		 317 aa  189  5.999999999999999e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0860  Transketolase domain protein  35.05 
 
 		 310 aa  187  1e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.476833  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2019  Transketolase central region  37.41 
 
 		 320 aa  186  5e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.6126  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2918  transketolase, C-terminal subunit  36.45 
 
 		 314 aa  185  7e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4663  transketolase central region  36.79 
 
 		 328 aa  185  8e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09040  transketolase subunit B  36.77 
 
 		 315 aa  185  8e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.28283  normal  0.0525296 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0365  transketolase central region  36.3 
 
 		 312 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.556876  normal  0.0129681 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2254  Transketolase domain protein  35.53 
 
 		 318 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.655402  normal  0.0447096 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2077  transketolase, central region  39.86 
 
 		 308 aa  184  2.0000000000000003e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5659  Transketolase central region  35.74 
 
 		 333 aa  182  9.000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.252415  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0183  Transketolase central region  35.31 
 
 		 320 aa  181  1e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0049  transketolase, central region  39.86 
 
 		 317 aa  181  1e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3074  transketolase, central region  41.11 
 
 		 313 aa  180  2e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0289222  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1505  transketolase central region  35.97 
 
 		 314 aa  181  2e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0385912  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0438  transketolase central region  35.48 
 
 		 312 aa  179  4.999999999999999e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0397028  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0471  transketolase subunit B  34.98 
 
 		 312 aa  179  4.999999999999999e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0285277  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1554  transketolase central region  34.98 
 
 		 312 aa  178  1e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0600642  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3949  Transketolase domain protein  33.22 
 
 		 338 aa  176  4e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1997  Transketolase central region  34.25 
 
 		 321 aa  176  5e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00329881 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0300  transketolase central region  34.32 
 
 		 324 aa  176  6e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0477096 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2444  transketolase subunit B  34.75 
 
 		 313 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6295  Transketolase central region  33.88 
 
 		 332 aa  173  3.9999999999999995e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2041  transketolase central region  34.22 
 
 		 330 aa  172  5e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.522483 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05490  transketolase subunit B  34.29 
 
 		 325 aa  172  5.999999999999999e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.948034 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1130  transketolase central region  36.08 
 
 		 336 aa  172  9e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0237  transketolase subunit B  37.46 
 
 		 311 aa  170  3e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0173  Transketolase central region  34.68 
 
 		 313 aa  167  2e-40  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2032  Transketolase domain protein  35.49 
 
 		 318 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.262756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0334  Transketolase central region  34.25 
 
 		 308 aa  165  1.0000000000000001e-39  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3618  transketolase subunit B  33 
 
 		 331 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.189872  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0338  Transketolase central region  35.83 
 
 		 319 aa  164  2.0000000000000002e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3129  transketolase domain-containing protein  32.19 
 
 		 322 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1923  transketolase domain-containing protein  32.58 
 
 		 315 aa  160  2e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0407  transketolase central region  31.71 
 
 		 323 aa  159  5e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0194561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1058  transketolase subunit B  34.23 
 
 		 308 aa  159  7e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.847424 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1713  transketolase central region  31.83 
 
 		 332 aa  159  7e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.548893  normal  0.0621953 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2513  transketolase subunit B  34.02 
 
 		 322 aa  157  2e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5637  transketolase subunit B  32.97 
 
 		 307 aa  155  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5275  transketolase, central region  33.67 
 
 		 335 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.181452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4834  transketolase central region  29.83 
 
 		 333 aa  154  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3312  Transketolase central region  31.63 
 
 		 332 aa  153  2.9999999999999998e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1717  Transketolase central region  29.19 
 
 		 347 aa  153  4e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2718  transketolase subunit B  33.79 
 
 		 340 aa  152  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2744  transketolase central region  32.31 
 
 		 342 aa  150  4e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0728122  normal  0.0592981 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2092  transketolase central region  30.87 
 
 		 339 aa  149  8e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.147262 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2367  Transketolase central region  30.87 
 
 		 339 aa  149  8e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.438048  normal  0.0327946 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3269  transketolase subunit B  31.44 
 
 		 337 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.444228 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2800  Transketolase central region  31.46 
 
 		 320 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06530  deoxyxylulose-5-phosphate synthase  31.71 
 
 		 636 aa  146  4.0000000000000006e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000553997  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0261  Transketolase central region  30.87 
 
 		 339 aa  145  6e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.885505 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4383  Transketolase central region  33.11 
 
 		 342 aa  145  9e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0967269  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2126  Transketolase domain protein  29.79 
 
 		 320 aa  144  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.764032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3641  transketolase, central region  30.11 
 
 		 334 aa  144  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.150786 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0718  transketolase, central region  31.31 
 
 		 334 aa  144  2e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0809  transketolase central region  31.88 
 
 		 592 aa  144  2e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.32467  normal  0.55266 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6139  Transketolase central region  31.88 
 
 		 332 aa  143  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.47666  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3397  Transketolase central region  28.72 
 
 		 298 aa  142  6e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1468  Transketolase central region  31.29 
 
 		 314 aa  142  6e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4778  transketolase subunit B  32.25 
 
 		 332 aa  142  8e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>