More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3641 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3641  transketolase, central region  100 
 
 		 334 aa  681    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.150786 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3618  transketolase subunit B  83.75 
 
 		 331 aa  553  1e-156  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.189872  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2718  transketolase subunit B  68.57 
 
 		 340 aa  463  1e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5275  transketolase, central region  67.94 
 
 		 335 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.181452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6139  Transketolase central region  64.51 
 
 		 332 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.47666  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3312  Transketolase central region  62.35 
 
 		 332 aa  441  1e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1462  transketolase subunit B  62.65 
 
 		 332 aa  437  9.999999999999999e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.304967 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2367  Transketolase central region  64.6 
 
 		 339 aa  436  1e-121  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.438048  normal  0.0327946 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2092  transketolase central region  64.6 
 
 		 339 aa  436  1e-121  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.147262 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0261  Transketolase central region  65.84 
 
 		 339 aa  436  1e-121  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.885505 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6255  transketolase central region  62.65 
 
 		 332 aa  432  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.156319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6422  transketolase, central region  62.96 
 
 		 332 aa  432  1e-120  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2744  transketolase central region  63.8 
 
 		 342 aa  432  1e-120  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0728122  normal  0.0592981 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6657  transketolase, central region  62.96 
 
 		 332 aa  432  1e-120  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3003  transketolase central region  65.62 
 
 		 340 aa  434  1e-120  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4991  transketolase central region  61.08 
 
 		 332 aa  429  1e-119  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.908463 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4411  transketolase, central region  62.35 
 
 		 332 aa  429  1e-119  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0682016 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4778  transketolase subunit B  60.55 
 
 		 332 aa  427  1e-118  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4930  transketolase central region  62.04 
 
 		 332 aa  427  1e-118  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4383  Transketolase central region  66.25 
 
 		 342 aa  424  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0967269  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5878  transketolase central region  62.35 
 
 		 333 aa  422  1e-117  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3269  transketolase subunit B  60.8 
 
 		 337 aa  422  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.444228 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2613  transketolase central region  59.57 
 
 		 333 aa  422  1e-117  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0875571  normal  0.474338 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4275  transketolase central region  61.23 
 
 		 338 aa  416  9.999999999999999e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1539  transketolase central region  59.88 
 
 		 348 aa  411  1e-114  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.844968  normal  0.490255 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0718  transketolase, central region  62.54 
 
 		 334 aa  414  1e-114  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1717  Transketolase central region  60.63 
 
 		 347 aa  398  9.999999999999999e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2699  transketolase subunit B  64.11 
 
 		 288 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0727  transketolase central region  60.76 
 
 		 335 aa  389  1e-107  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3958  transketolase subunit B  57.01 
 
 		 340 aa  389  1e-107  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.158278  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0406  Transketolase central region  56.56 
 
 		 343 aa  375  1e-103  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3347  Transketolase central region  54.89 
 
 		 331 aa  358  6e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.027962  normal  0.023237 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2506  Transketolase central region  56.51 
 
 		 343 aa  351  8e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.165482 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0901  transketolase, central region  45.71 
 
 		 336 aa  282  5.000000000000001e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1713  transketolase central region  45.03 
 
 		 332 aa  276  3e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.548893  normal  0.0621953 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1527  Transketolase central region  44.83 
 
 		 319 aa  236  6e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4834  transketolase central region  40 
 
 		 333 aa  231  1e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0492  transketolase, central region  41.39 
 
 		 312 aa  225  8e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0280  Transketolase central region  41 
 
 		 310 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.741894  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0969  transketolase, central region  38.21 
 
 		 306 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86113  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0265  Transketolase central region  41 
 
 		 310 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00214892 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0874  Transketolase central region  38.22 
 
 		 326 aa  213  2.9999999999999995e-54  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1170  transketolase subunit B  38.22 
 
 		 326 aa  213  2.9999999999999995e-54  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000103125  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1130  transketolase central region  38.21 
 
 		 336 aa  212  5.999999999999999e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1895  transketolase, C-terminal subunit  37.67 
 
 		 318 aa  212  5.999999999999999e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00759771 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1192  transketolase-like  36.99 
 
 		 327 aa  210  3e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.101787  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1286  transketolase-like  37.9 
 
 		 327 aa  209  4e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.290354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0975  Transketolase central region  38.33 
 
 		 317 aa  207  2e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.127122  normal  0.063318 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00875  transketolase, C-terminal subunit  38.49 
 
 		 317 aa  207  3e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2935  Transketolase central region  38 
 
 		 317 aa  204  1e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0881  Transketolase central region  37.38 
 
 		 327 aa  204  2e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000876605  normal  0.0478781 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1173  Transketolase central region  37.58 
 
 		 327 aa  203  3e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000000393635  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2019  Transketolase central region  36.74 
 
 		 320 aa  202  6e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.6126  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0873  Transketolase central region  36.67 
 
 		 319 aa  202  7e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.199119  hitchhiker  0.00317558 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0293  putative transketolase, C-terminal subunit  38.97 
 
 		 314 aa  202  7e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0288  transketolase  38.97 
 
 		 314 aa  202  7e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000211069  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1381  Transketolase central region  37.71 
 
 		 306 aa  202  9e-51  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0244  Transketolase central region  35.41 
 
 		 305 aa  201  1.9999999999999998e-50  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.304733  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3967  Transketolase central region  41.72 
 
 		 313 aa  200  3e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000645501  unclonable  0.000000000133165 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4744  Transketolase central region  40 
 
 		 311 aa  200  3.9999999999999996e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1505  transketolase central region  34.78 
 
 		 314 aa  199  5e-50  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0385912  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1792  transketolase subunit B  37.75 
 
 		 310 aa  199  6e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0510195  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2213  transketolase subunit B  38.28 
 
 		 317 aa  199  6e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000528401  hitchhiker  0.000741425 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1178  Transketolase central region  36.31 
 
 		 327 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0058066  normal  0.0131189 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0438  transketolase central region  34.45 
 
 		 312 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0397028  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1860  Transketolase central region  39.86 
 
 		 321 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2719  transketolase, C-terminal subunit  39.4 
 
 		 311 aa  196  6e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0365  transketolase central region  34.45 
 
 		 312 aa  194  2e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.556876  normal  0.0129681 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0471  transketolase subunit B  34.78 
 
 		 312 aa  194  2e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0285277  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0552  transketolase subunit B  40.8 
 
 		 314 aa  193  3e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1554  transketolase central region  34.11 
 
 		 312 aa  192  5e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0600642  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2705  transketolase subunit B  37.75 
 
 		 311 aa  192  6e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000194197  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0860  Transketolase domain protein  35.76 
 
 		 310 aa  188  9e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.476833  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0470  Transketolase central region  40.13 
 
 		 318 aa  187  2e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2077  transketolase, central region  40.4 
 
 		 308 aa  187  2e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4663  transketolase central region  39.48 
 
 		 328 aa  187  3e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0333  Transketolase central region  34.11 
 
 		 322 aa  187  3e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0183  Transketolase central region  34.26 
 
 		 320 aa  186  4e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2059  Transketolase central region  34.65 
 
 		 313 aa  186  5e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0237  transketolase subunit B  41.18 
 
 		 311 aa  186  5e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1878  transketolase subunit B  35.17 
 
 		 312 aa  185  1.0000000000000001e-45  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1078  deoxyxylulose-5-phosphate synthase  35.55 
 
 		 635 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0303047  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0049  transketolase, central region  36.22 
 
 		 317 aa  184  3e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2513  transketolase subunit B  36.55 
 
 		 322 aa  182  5.0000000000000004e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5659  Transketolase central region  40.07 
 
 		 333 aa  181  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.252415  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0894  transketolase subunit B  40.08 
 
 		 314 aa  181  1e-44  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2110  transketolase, central region  35.76 
 
 		 314 aa  181  2e-44  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.44874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1775  transketolase, central region  37.11 
 
 		 314 aa  180  2e-44  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0244  transketolase-like protein  35.1 
 
 		 311 aa  180  2.9999999999999997e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2918  transketolase, C-terminal subunit  40.73 
 
 		 314 aa  179  5.999999999999999e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1058  transketolase subunit B  39.63 
 
 		 308 aa  179  8e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.847424 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1044  deoxyxylulose-5-phosphate synthase  33.66 
 
 		 618 aa  178  1e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.213907  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2041  transketolase central region  38.11 
 
 		 330 aa  178  1e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.522483 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0789  transketolase central region  36.77 
 
 		 314 aa  177  2e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1468  Transketolase central region  33.33 
 
 		 314 aa  176  7e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0300  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  33.66 
 
 		 628 aa  174  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.533137  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09721  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  33.33 
 
 		 628 aa  175  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.274515 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3074  transketolase, central region  37.75 
 
 		 313 aa  173  2.9999999999999996e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0289222  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0173  Transketolase central region  35.53 
 
 		 313 aa  173  3.9999999999999995e-42  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0883  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  36.51 
 
 		 635 aa  172  5e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000207097 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>