More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0173 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0173  Transketolase central region  100 
 
 		 313 aa  636    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0293  putative transketolase, C-terminal subunit  56.17 
 
 		 314 aa  363  2e-99  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0288  transketolase  56.17 
 
 		 314 aa  363  2e-99  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000211069  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0969  transketolase, central region  54.75 
 
 		 306 aa  353  2e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86113  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3967  Transketolase central region  55.99 
 
 		 313 aa  345  8e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000645501  unclonable  0.000000000133165 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0244  transketolase-like protein  49.35 
 
 		 311 aa  341  1e-92  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1860  Transketolase central region  52.43 
 
 		 321 aa  336  2.9999999999999997e-91  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2213  transketolase subunit B  50.64 
 
 		 317 aa  332  4e-90  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000528401  hitchhiker  0.000741425 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2705  transketolase subunit B  56.45 
 
 		 311 aa  329  3e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000194197  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0333  Transketolase central region  52.44 
 
 		 322 aa  329  4e-89  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4744  Transketolase central region  54.08 
 
 		 311 aa  328  9e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2077  transketolase, central region  55.02 
 
 		 308 aa  322  4e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0470  Transketolase central region  53.9 
 
 		 318 aa  319  3e-86  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2059  Transketolase central region  50.32 
 
 		 313 aa  319  3e-86  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2719  transketolase, C-terminal subunit  53.27 
 
 		 311 aa  319  3.9999999999999996e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0492  transketolase, central region  52.12 
 
 		 312 aa  316  4e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0265  Transketolase central region  50.16 
 
 		 310 aa  315  5e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00214892 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0280  Transketolase central region  49.51 
 
 		 310 aa  311  6.999999999999999e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.741894  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1178  Transketolase central region  50.5 
 
 		 327 aa  309  2.9999999999999997e-83  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0058066  normal  0.0131189 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1381  Transketolase central region  50.17 
 
 		 306 aa  305  5.0000000000000004e-82  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0244  Transketolase central region  47.06 
 
 		 305 aa  303  2.0000000000000002e-81  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.304733  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0881  Transketolase central region  49.5 
 
 		 327 aa  303  2.0000000000000002e-81  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000876605  normal  0.0478781 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3074  transketolase, central region  53.9 
 
 		 313 aa  303  3.0000000000000004e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0289222  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1286  transketolase-like  49.67 
 
 		 327 aa  301  1e-80  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.290354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1192  transketolase-like  50.34 
 
 		 327 aa  301  1e-80  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.101787  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2935  Transketolase central region  49.67 
 
 		 317 aa  300  3e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0183  Transketolase central region  47.68 
 
 		 320 aa  299  5e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1505  transketolase central region  47.42 
 
 		 314 aa  299  5e-80  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0385912  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1170  transketolase subunit B  50.34 
 
 		 326 aa  299  5e-80  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000103125  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0874  Transketolase central region  48.69 
 
 		 326 aa  298  7e-80  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1895  transketolase, C-terminal subunit  47.57 
 
 		 318 aa  298  1e-79  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00759771 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0711  Transketolase central region  46.05 
 
 		 315 aa  297  1e-79  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00000202012  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0975  Transketolase central region  49.02 
 
 		 317 aa  297  2e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.127122  normal  0.063318 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1173  Transketolase central region  50 
 
 		 327 aa  296  3e-79  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000000393635  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0552  transketolase subunit B  51.54 
 
 		 314 aa  295  5e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0237  transketolase subunit B  50.33 
 
 		 311 aa  295  6e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0471  transketolase subunit B  48.04 
 
 		 312 aa  295  7e-79  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0285277  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0873  Transketolase central region  47.9 
 
 		 319 aa  295  9e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.199119  hitchhiker  0.00317558 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2019  Transketolase central region  48.55 
 
 		 320 aa  292  6e-78  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.6126  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0365  transketolase central region  46.89 
 
 		 312 aa  290  2e-77  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.556876  normal  0.0129681 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0860  Transketolase domain protein  47.08 
 
 		 310 aa  290  2e-77  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.476833  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0438  transketolase central region  47.54 
 
 		 312 aa  290  2e-77  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0397028  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1554  transketolase central region  46.89 
 
 		 312 aa  289  5.0000000000000004e-77  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0600642  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00875  transketolase, C-terminal subunit  48.03 
 
 		 317 aa  288  7e-77  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2918  transketolase, C-terminal subunit  51.88 
 
 		 314 aa  282  5.000000000000001e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09040  transketolase subunit B  49.03 
 
 		 315 aa  281  8.000000000000001e-75  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.28283  normal  0.0525296 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0300  transketolase central region  43.23 
 
 		 324 aa  276  4e-73  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0477096 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05490  transketolase subunit B  47.06 
 
 		 325 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.948034 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1130  transketolase central region  43.45 
 
 		 336 aa  270  2e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0049  transketolase, central region  47.54 
 
 		 317 aa  269  4e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1997  Transketolase central region  46.43 
 
 		 321 aa  269  5e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00329881 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1878  transketolase subunit B  42.02 
 
 		 312 aa  265  5e-70  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0809  transketolase central region  47.59 
 
 		 592 aa  263  2e-69  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.32467  normal  0.55266 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0334  Transketolase central region  48.39 
 
 		 308 aa  263  4e-69  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1527  Transketolase central region  45 
 
 		 319 aa  259  3e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2444  transketolase subunit B  44.3 
 
 		 313 aa  252  5.000000000000001e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3878  transketolase, central region  41.64 
 
 		 342 aa  236  3e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.733485  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1277  Transketolase central region  38.31 
 
 		 313 aa  236  5.0000000000000005e-61  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0338  Transketolase central region  41.25 
 
 		 319 aa  235  8e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3949  Transketolase domain protein  41.78 
 
 		 338 aa  229  5e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0789  transketolase central region  39.68 
 
 		 314 aa  226  4e-58  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1775  transketolase, central region  39.37 
 
 		 314 aa  224  1e-57  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0894  transketolase subunit B  39.87 
 
 		 314 aa  222  6e-57  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2110  transketolase, central region  39.24 
 
 		 314 aa  220  3e-56  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.44874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1792  transketolase subunit B  40.48 
 
 		 310 aa  220  3e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0510195  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4991  transketolase central region  40.72 
 
 		 332 aa  217  2e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.908463 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1468  Transketolase central region  37.03 
 
 		 314 aa  217  2e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3269  transketolase subunit B  41.23 
 
 		 337 aa  218  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.444228 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2254  Transketolase domain protein  39.47 
 
 		 318 aa  217  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.655402  normal  0.0447096 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6295  Transketolase central region  43.04 
 
 		 332 aa  215  5.9999999999999996e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3129  transketolase domain-containing protein  39.52 
 
 		 322 aa  214  9.999999999999999e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3312  Transketolase central region  39.4 
 
 		 332 aa  214  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2613  transketolase central region  38.24 
 
 		 333 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0875571  normal  0.474338 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1462  transketolase subunit B  41.04 
 
 		 332 aa  213  4.9999999999999996e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.304967 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2842  transketolase subunit B  39.37 
 
 		 317 aa  212  7.999999999999999e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.837175  normal  0.299247 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1923  transketolase domain-containing protein  38.29 
 
 		 315 aa  210  3e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2126  Transketolase domain protein  38.26 
 
 		 320 aa  210  3e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.764032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5275  transketolase, central region  39.61 
 
 		 335 aa  209  5e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.181452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2800  Transketolase central region  38.11 
 
 		 320 aa  209  5e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4411  transketolase, central region  38.96 
 
 		 332 aa  208  8e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0682016 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5637  transketolase subunit B  38.98 
 
 		 307 aa  208  1e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4930  transketolase central region  38.64 
 
 		 332 aa  207  1e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6422  transketolase, central region  38.64 
 
 		 332 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6657  transketolase, central region  38.64 
 
 		 332 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6139  Transketolase central region  38.31 
 
 		 332 aa  207  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.47666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6255  transketolase central region  38.31 
 
 		 332 aa  207  3e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.156319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2032  Transketolase domain protein  40.21 
 
 		 318 aa  206  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.262756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2481  transketolase domain protein  38.81 
 
 		 317 aa  206  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.120495  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2718  transketolase subunit B  39.29 
 
 		 340 aa  207  3e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2526  transketolase domain protein  38.81 
 
 		 317 aa  206  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.508569 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2581  transketolase domain-containing protein  38.81 
 
 		 317 aa  206  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.230809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2569  transketolase domain protein  38.81 
 
 		 317 aa  206  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.126502  normal  0.742091 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2689  transketolase domain-containing protein  38.81 
 
 		 317 aa  206  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.423567 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4778  transketolase subunit B  38.64 
 
 		 332 aa  205  7e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4275  transketolase central region  39.6 
 
 		 338 aa  204  1e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4663  transketolase central region  41.38 
 
 		 328 aa  203  3e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2367  Transketolase central region  37.95 
 
 		 339 aa  203  4e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.438048  normal  0.0327946 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2092  transketolase central region  37.95 
 
 		 339 aa  203  4e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.147262 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0486  Transketolase domain protein  37.63 
 
 		 313 aa  202  4e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1539  transketolase central region  39.74 
 
 		 348 aa  200  1.9999999999999998e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.844968  normal  0.490255 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>