More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_0486 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013522  Taci_0486  Transketolase domain protein  100 
 
 
313 aa  628  1e-179  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2213  transketolase subunit B  42.07 
 
 
317 aa  254  1.0000000000000001e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000528401  hitchhiker  0.000741425 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05490  transketolase subunit B  46.24 
 
 
325 aa  232  8.000000000000001e-60  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.948034 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2059  Transketolase central region  40.2 
 
 
313 aa  231  9e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0244  transketolase-like protein  40.59 
 
 
311 aa  227  2e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0969  transketolase, central region  40.54 
 
 
306 aa  223  3e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86113  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1178  Transketolase central region  40.73 
 
 
327 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0058066  normal  0.0131189 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00875  transketolase, C-terminal subunit  39.42 
 
 
317 aa  211  1e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1860  Transketolase central region  40.26 
 
 
321 aa  209  3e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0300  transketolase central region  37.34 
 
 
324 aa  209  5e-53  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0477096 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2935  Transketolase central region  40.29 
 
 
317 aa  209  6e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0293  putative transketolase, C-terminal subunit  36.93 
 
 
314 aa  209  6e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0288  transketolase  36.93 
 
 
314 aa  209  6e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000211069  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1895  transketolase, C-terminal subunit  38.41 
 
 
318 aa  208  8e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00759771 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3967  Transketolase central region  40.26 
 
 
313 aa  208  9e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000645501  unclonable  0.000000000133165 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0873  Transketolase central region  38.91 
 
 
319 aa  206  3e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.199119  hitchhiker  0.00317558 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0492  transketolase, central region  37.62 
 
 
312 aa  206  4e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1192  transketolase-like  39.27 
 
 
327 aa  205  7e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.101787  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1170  transketolase subunit B  38.91 
 
 
326 aa  204  2e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000103125  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09040  transketolase subunit B  41.22 
 
 
315 aa  204  2e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.28283  normal  0.0525296 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0881  Transketolase central region  40 
 
 
327 aa  204  2e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000876605  normal  0.0478781 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2077  transketolase, central region  42.05 
 
 
308 aa  203  3e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0333  Transketolase central region  38.54 
 
 
322 aa  202  6e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1286  transketolase-like  38.18 
 
 
327 aa  202  7e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.290354  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1997  Transketolase central region  43.82 
 
 
321 aa  202  8e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00329881 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1381  Transketolase central region  38.64 
 
 
306 aa  202  8e-51  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0874  Transketolase central region  38.63 
 
 
326 aa  201  9.999999999999999e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0183  Transketolase central region  35.27 
 
 
320 aa  200  1.9999999999999998e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0975  Transketolase central region  37 
 
 
317 aa  201  1.9999999999999998e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.127122  normal  0.063318 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1505  transketolase central region  34.85 
 
 
314 aa  199  5e-50  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0385912  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0860  Transketolase domain protein  35.31 
 
 
310 aa  198  7.999999999999999e-50  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.476833  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2719  transketolase, C-terminal subunit  41.31 
 
 
311 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2705  transketolase subunit B  38.49 
 
 
311 aa  196  3e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000194197  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0237  transketolase subunit B  42.42 
 
 
311 aa  196  4.0000000000000005e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2019  Transketolase central region  37.96 
 
 
320 aa  196  5.000000000000001e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.6126  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0173  Transketolase central region  37.63 
 
 
313 aa  196  6e-49  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4744  Transketolase central region  40.14 
 
 
311 aa  194  1e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0265  Transketolase central region  37.17 
 
 
310 aa  194  1e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00214892 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0711  Transketolase central region  36.24 
 
 
315 aa  194  1e-48  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00000202012  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1173  Transketolase central region  38.18 
 
 
327 aa  194  2e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000000393635  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3074  transketolase, central region  39.81 
 
 
313 aa  192  5e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0289222  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0280  Transketolase central region  36.51 
 
 
310 aa  191  1e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.741894  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0244  Transketolase central region  35.79 
 
 
305 aa  189  5.999999999999999e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.304733  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0470  Transketolase central region  41.31 
 
 
318 aa  187  3e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0438  transketolase central region  34.22 
 
 
312 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0397028  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0552  transketolase subunit B  39.19 
 
 
314 aa  182  6e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0471  transketolase subunit B  32.81 
 
 
312 aa  182  9.000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0285277  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0049  transketolase, central region  39.42 
 
 
317 aa  181  1e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1554  transketolase central region  32.58 
 
 
312 aa  180  2e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0600642  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0365  transketolase central region  31.61 
 
 
312 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.556876  normal  0.0129681 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0338  Transketolase central region  38.21 
 
 
319 aa  172  5e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0809  transketolase central region  36.03 
 
 
592 aa  171  1e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.32467  normal  0.55266 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3129  transketolase domain-containing protein  36.11 
 
 
322 aa  169  6e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1527  Transketolase central region  36.21 
 
 
319 aa  168  8e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2918  transketolase, C-terminal subunit  39.42 
 
 
314 aa  168  1e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2444  transketolase subunit B  32.29 
 
 
313 aa  166  5e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1878  transketolase subunit B  33.8 
 
 
312 aa  164  1.0000000000000001e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2254  Transketolase domain protein  35.13 
 
 
318 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.655402  normal  0.0447096 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0268  transketolase  34.65 
 
 
606 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1130  transketolase central region  32.36 
 
 
336 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1277  Transketolase central region  34.03 
 
 
313 aa  162  7e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3364  Transketolase domain protein  31.11 
 
 
317 aa  155  7e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0334  Transketolase central region  38.26 
 
 
308 aa  154  1e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2032  Transketolase domain protein  34.15 
 
 
318 aa  155  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.262756  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2699  transketolase subunit B  35.77 
 
 
288 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6422  transketolase, central region  35.88 
 
 
332 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6255  transketolase central region  35.88 
 
 
332 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.156319  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6657  transketolase, central region  35.88 
 
 
332 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1027  deoxyxylulose-5-phosphate synthase  36.92 
 
 
634 aa  153  5e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4930  transketolase central region  35.5 
 
 
332 aa  152  7e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4991  transketolase central region  34.83 
 
 
332 aa  151  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.908463 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4411  transketolase, central region  35.5 
 
 
332 aa  152  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0682016 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1398  deoxyxylulose-5-phosphate synthase  38.03 
 
 
629 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2842  transketolase subunit B  33.94 
 
 
317 aa  148  1.0000000000000001e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.837175  normal  0.299247 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3618  transketolase subunit B  36.54 
 
 
331 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.189872  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2402  transketolase, C-terminal subunit  31.69 
 
 
310 aa  147  3e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.730568  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3312  Transketolase central region  34.87 
 
 
332 aa  147  3e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6139  Transketolase central region  35.38 
 
 
332 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.47666  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0419  transketolase central region  33.99 
 
 
630 aa  145  1e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.218492  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3958  transketolase subunit B  35.32 
 
 
340 aa  145  1e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.158278  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2613  transketolase central region  32.68 
 
 
333 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0875571  normal  0.474338 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0407  transketolase central region  34.06 
 
 
323 aa  145  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0194561  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0686  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  37.07 
 
 
637 aa  144  2e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.351489  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4778  transketolase subunit B  35.41 
 
 
332 aa  144  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1713  transketolase central region  34.94 
 
 
332 aa  144  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.548893  normal  0.0621953 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1078  deoxyxylulose-5-phosphate synthase  33.22 
 
 
635 aa  144  2e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0303047  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0049  transketolase  34.22 
 
 
626 aa  144  2e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2481  transketolase domain protein  33.58 
 
 
317 aa  144  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.120495  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4275  transketolase central region  33.46 
 
 
338 aa  143  3e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2569  transketolase domain protein  33.58 
 
 
317 aa  143  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.126502  normal  0.742091 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1468  Transketolase central region  28.57 
 
 
314 aa  143  4e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0789  transketolase central region  32.36 
 
 
314 aa  143  4e-33  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2581  transketolase domain-containing protein  33.58 
 
 
317 aa  142  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.230809  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2123  transketolase  37.05 
 
 
627 aa  142  5e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1923  transketolase domain-containing protein  30.36 
 
 
315 aa  142  5e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2689  transketolase domain-containing protein  33.58 
 
 
317 aa  142  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.423567 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2526  transketolase domain protein  33.58 
 
 
317 aa  142  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.508569 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1775  transketolase, central region  32.13 
 
 
314 aa  141  9.999999999999999e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3269  transketolase subunit B  33.55 
 
 
337 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.444228 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2718  transketolase subunit B  34.62 
 
 
340 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>