More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0333 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0333  Transketolase central region  100 
 
 		 322 aa  657    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0492  transketolase, central region  51.79 
 
 		 312 aa  338  5e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0711  Transketolase central region  56.76 
 
 		 315 aa  335  5e-91  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00000202012  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0280  Transketolase central region  50.81 
 
 		 310 aa  333  2e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.741894  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0265  Transketolase central region  50.81 
 
 		 310 aa  332  4e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00214892 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0969  transketolase, central region  54.15 
 
 		 306 aa  331  9e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86113  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2213  transketolase subunit B  54.48 
 
 		 317 aa  330  2e-89  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000528401  hitchhiker  0.000741425 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2719  transketolase, C-terminal subunit  51.46 
 
 		 311 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0244  transketolase-like protein  50.48 
 
 		 311 aa  327  2.0000000000000001e-88  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4744  Transketolase central region  55.07 
 
 		 311 aa  321  9.999999999999999e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0244  Transketolase central region  51.62 
 
 		 305 aa  320  1.9999999999999998e-86  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.304733  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0173  Transketolase central region  52.44 
 
 		 313 aa  318  6e-86  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3967  Transketolase central region  52.43 
 
 		 313 aa  318  9e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000645501  unclonable  0.000000000133165 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0293  putative transketolase, C-terminal subunit  50.48 
 
 		 314 aa  309  4e-83  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0288  transketolase  50.48 
 
 		 314 aa  309  4e-83  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000211069  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1860  Transketolase central region  52.9 
 
 		 321 aa  308  9e-83  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2705  transketolase subunit B  52.1 
 
 		 311 aa  307  1.0000000000000001e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000194197  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0552  transketolase subunit B  51.89 
 
 		 314 aa  304  1.0000000000000001e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09040  transketolase subunit B  49.51 
 
 		 315 aa  304  1.0000000000000001e-81  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.28283  normal  0.0525296 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1178  Transketolase central region  48.44 
 
 		 327 aa  303  3.0000000000000004e-81  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0058066  normal  0.0131189 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1505  transketolase central region  50.49 
 
 		 314 aa  302  6.000000000000001e-81  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0385912  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1381  Transketolase central region  48.97 
 
 		 306 aa  298  1e-79  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2918  transketolase, C-terminal subunit  50.81 
 
 		 314 aa  296  4e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05490  transketolase subunit B  48.23 
 
 		 325 aa  293  2e-78  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.948034 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2059  Transketolase central region  48.72 
 
 		 313 aa  292  6e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0470  Transketolase central region  51.25 
 
 		 318 aa  290  2e-77  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2077  transketolase, central region  51.69 
 
 		 308 aa  290  3e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0365  transketolase central region  47.77 
 
 		 312 aa  289  4e-77  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.556876  normal  0.0129681 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0300  transketolase central region  44.94 
 
 		 324 aa  288  1e-76  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0477096 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3074  transketolase, central region  51.46 
 
 		 313 aa  286  2.9999999999999996e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0289222  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1286  transketolase-like  48.54 
 
 		 327 aa  285  5e-76  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.290354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0874  Transketolase central region  47.57 
 
 		 326 aa  285  8e-76  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0881  Transketolase central region  48.22 
 
 		 327 aa  285  8e-76  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000876605  normal  0.0478781 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0237  transketolase subunit B  49.84 
 
 		 311 aa  284  1.0000000000000001e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0471  transketolase subunit B  47.27 
 
 		 312 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0285277  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1527  Transketolase central region  48.81 
 
 		 319 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1554  transketolase central region  46.82 
 
 		 312 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0600642  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0438  transketolase central region  48.52 
 
 		 312 aa  282  5.000000000000001e-75  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0397028  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1173  Transketolase central region  48.22 
 
 		 327 aa  281  9e-75  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000000393635  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1170  transketolase subunit B  47.57 
 
 		 326 aa  280  2e-74  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000103125  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1192  transketolase-like  46.6 
 
 		 327 aa  278  1e-73  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.101787  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1997  Transketolase central region  45.63 
 
 		 321 aa  278  1e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00329881 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0860  Transketolase domain protein  48.21 
 
 		 310 aa  277  2e-73  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.476833  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1895  transketolase, C-terminal subunit  44.34 
 
 		 318 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00759771 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0183  Transketolase central region  41.27 
 
 		 320 aa  269  4e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00875  transketolase, C-terminal subunit  44.01 
 
 		 317 aa  266  4e-70  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2019  Transketolase central region  45.48 
 
 		 320 aa  265  8.999999999999999e-70  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.6126  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0975  Transketolase central region  42.39 
 
 		 317 aa  265  1e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.127122  normal  0.063318 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0334  Transketolase central region  44.08 
 
 		 308 aa  252  6e-66  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1130  transketolase central region  48.85 
 
 		 336 aa  251  1e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0873  Transketolase central region  43.69 
 
 		 319 aa  251  1e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.199119  hitchhiker  0.00317558 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0809  transketolase central region  45.42 
 
 		 592 aa  248  7e-65  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.32467  normal  0.55266 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2935  Transketolase central region  41.75 
 
 		 317 aa  246  4e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1277  Transketolase central region  48.12 
 
 		 313 aa  246  4.9999999999999997e-64  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1878  transketolase subunit B  45.66 
 
 		 312 aa  245  9e-64  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2110  transketolase, central region  41.35 
 
 		 314 aa  230  2e-59  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.44874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1468  Transketolase central region  41.1 
 
 		 314 aa  230  3e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4663  transketolase central region  40.46 
 
 		 328 aa  230  3e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0789  transketolase central region  40.53 
 
 		 314 aa  228  1e-58  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1775  transketolase, central region  40.86 
 
 		 314 aa  228  1e-58  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2254  Transketolase domain protein  38.36 
 
 		 318 aa  228  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.655402  normal  0.0447096 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3878  transketolase, central region  38.39 
 
 		 342 aa  227  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.733485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2444  transketolase subunit B  40.19 
 
 		 313 aa  226  4e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0049  transketolase, central region  41.56 
 
 		 317 aa  224  2e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0894  transketolase subunit B  40.26 
 
 		 314 aa  221  9.999999999999999e-57  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3129  transketolase domain-containing protein  38.62 
 
 		 322 aa  219  6e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0338  Transketolase central region  41.98 
 
 		 319 aa  217  2e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4991  transketolase central region  38.74 
 
 		 332 aa  216  4e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.908463 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2032  Transketolase domain protein  40.14 
 
 		 318 aa  215  8e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.262756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3364  Transketolase domain protein  39.6 
 
 		 317 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2744  transketolase central region  39.53 
 
 		 342 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0728122  normal  0.0592981 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5275  transketolase, central region  38.46 
 
 		 335 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.181452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2718  transketolase subunit B  38.74 
 
 		 340 aa  212  5.999999999999999e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6139  Transketolase central region  38.46 
 
 		 332 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.47666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3269  transketolase subunit B  38.8 
 
 		 337 aa  212  7e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.444228 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3312  Transketolase central region  37.46 
 
 		 332 aa  211  9e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3618  transketolase subunit B  38.41 
 
 		 331 aa  211  9e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.189872  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1717  Transketolase central region  38.21 
 
 		 347 aa  211  1e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6422  transketolase, central region  36.75 
 
 		 332 aa  210  3e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6657  transketolase, central region  36.75 
 
 		 332 aa  210  3e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2367  Transketolase central region  38.28 
 
 		 339 aa  208  1e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.438048  normal  0.0327946 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2092  transketolase central region  38.28 
 
 		 339 aa  208  1e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.147262 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0718  transketolase, central region  39.46 
 
 		 334 aa  207  1e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6255  transketolase central region  36.42 
 
 		 332 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.156319  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1923  transketolase domain-containing protein  38.02 
 
 		 315 aa  206  3e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1792  transketolase subunit B  35.95 
 
 		 310 aa  206  4e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0510195  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4411  transketolase, central region  36.67 
 
 		 332 aa  206  5e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0682016 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2041  transketolase central region  36.58 
 
 		 330 aa  206  6e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.522483 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3949  Transketolase domain protein  35.9 
 
 		 338 aa  205  8e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4778  transketolase subunit B  37.93 
 
 		 332 aa  204  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4383  Transketolase central region  39.8 
 
 		 342 aa  205  1e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0967269  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2842  transketolase subunit B  36.96 
 
 		 317 aa  204  2e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.837175  normal  0.299247 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0261  Transketolase central region  37.67 
 
 		 339 aa  204  2e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.885505 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3003  transketolase central region  38.54 
 
 		 340 aa  204  2e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4930  transketolase central region  36 
 
 		 332 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5659  Transketolase central region  36.84 
 
 		 333 aa  204  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.252415  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1539  transketolase central region  37 
 
 		 348 aa  204  2e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.844968  normal  0.490255 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2513  transketolase subunit B  36.83 
 
 		 322 aa  203  4e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6295  Transketolase central region  40.5 
 
 		 332 aa  202  5e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4275  transketolase central region  37.67 
 
 		 338 aa  202  6e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>