More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A2689 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011083  SeHA_C2581  transketolase domain-containing protein  100 
 
 		 317 aa  655    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.230809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2569  transketolase domain protein  99.05 
 
 		 317 aa  649    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.126502  normal  0.742091 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2526  transketolase domain protein  99.37 
 
 		 317 aa  652    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.508569 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2481  transketolase domain protein  99.68 
 
 		 317 aa  652    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.120495  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2689  transketolase domain-containing protein  100 
 
 		 317 aa  655    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.423567 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2842  transketolase subunit B  92.11 
 
 		 317 aa  607  1e-173  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.837175  normal  0.299247 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3364  Transketolase domain protein  64.67 
 
 		 317 aa  431  1e-120  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1146  Transketolase domain protein  51.94 
 
 		 319 aa  338  5.9999999999999996e-92  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0200  transketolase, C-terminal subunit  44.74 
 
 		 309 aa  267  1e-70  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0280  Transketolase central region  42.11 
 
 		 310 aa  239  2.9999999999999997e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.741894  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2213  transketolase subunit B  38.26 
 
 		 317 aa  239  5.999999999999999e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000528401  hitchhiker  0.000741425 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0265  Transketolase central region  41.75 
 
 		 310 aa  236  3e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00214892 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1860  Transketolase central region  43.16 
 
 		 321 aa  235  8e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0969  transketolase, central region  42.25 
 
 		 306 aa  231  9e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86113  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0492  transketolase, central region  39.65 
 
 		 312 aa  231  1e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0881  Transketolase central region  43.9 
 
 		 327 aa  228  7e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000876605  normal  0.0478781 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2019  Transketolase central region  39.81 
 
 		 320 aa  228  1e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.6126  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1178  Transketolase central region  43.73 
 
 		 327 aa  225  8e-58  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0058066  normal  0.0131189 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0244  transketolase-like protein  40 
 
 		 311 aa  223  4.9999999999999996e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1286  transketolase-like  44.22 
 
 		 327 aa  221  9.999999999999999e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.290354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2719  transketolase, C-terminal subunit  43.16 
 
 		 311 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3967  Transketolase central region  44.56 
 
 		 313 aa  220  3e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000645501  unclonable  0.000000000133165 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0293  putative transketolase, C-terminal subunit  39.68 
 
 		 314 aa  218  7e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0288  transketolase  39.68 
 
 		 314 aa  218  7e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000211069  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0244  Transketolase central region  39.02 
 
 		 305 aa  217  2e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.304733  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0711  Transketolase central region  39.3 
 
 		 315 aa  214  1.9999999999999998e-54  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00000202012  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2705  transketolase subunit B  41.1 
 
 		 311 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000194197  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0873  Transketolase central region  37.46 
 
 		 319 aa  212  7.999999999999999e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.199119  hitchhiker  0.00317558 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1170  transketolase subunit B  42.65 
 
 		 326 aa  210  2e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000103125  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2059  Transketolase central region  38.24 
 
 		 313 aa  209  3e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1192  transketolase-like  41.5 
 
 		 327 aa  209  5e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.101787  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1381  Transketolase central region  39.78 
 
 		 306 aa  209  5e-53  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0874  Transketolase central region  41.84 
 
 		 326 aa  209  5e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00875  transketolase, C-terminal subunit  37.7 
 
 		 317 aa  207  1e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1173  Transketolase central region  41.84 
 
 		 327 aa  207  1e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000000393635  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0975  Transketolase central region  37.01 
 
 		 317 aa  206  4e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.127122  normal  0.063318 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4744  Transketolase central region  43.22 
 
 		 311 aa  206  4e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0552  transketolase subunit B  39.67 
 
 		 314 aa  205  7e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1895  transketolase, C-terminal subunit  37.46 
 
 		 318 aa  205  8e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00759771 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0860  Transketolase domain protein  40.13 
 
 		 310 aa  205  1e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.476833  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09040  transketolase subunit B  37.75 
 
 		 315 aa  204  1e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.28283  normal  0.0525296 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2935  Transketolase central region  38.82 
 
 		 317 aa  204  1e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05490  transketolase subunit B  39.18 
 
 		 325 aa  203  4e-51  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.948034 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0173  Transketolase central region  38.81 
 
 		 313 aa  202  7e-51  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0470  Transketolase central region  40.45 
 
 		 318 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0333  Transketolase central region  38.25 
 
 		 322 aa  199  7e-50  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2918  transketolase, C-terminal subunit  40 
 
 		 314 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0183  Transketolase central region  36.09 
 
 		 320 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0049  transketolase, central region  38.36 
 
 		 317 aa  195  1e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2254  Transketolase domain protein  37.89 
 
 		 318 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.655402  normal  0.0447096 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0334  Transketolase central region  39.12 
 
 		 308 aa  194  2e-48  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3074  transketolase, central region  43.51 
 
 		 313 aa  194  2e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0289222  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1997  Transketolase central region  35.97 
 
 		 321 aa  191  1e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00329881 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1527  Transketolase central region  36.3 
 
 		 319 aa  191  2e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2077  transketolase, central region  41.18 
 
 		 308 aa  190  2e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0338  Transketolase central region  37.32 
 
 		 319 aa  189  4e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0300  transketolase central region  33.01 
 
 		 324 aa  189  5e-47  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0477096 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0471  transketolase subunit B  35.67 
 
 		 312 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0285277  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0365  transketolase central region  35 
 
 		 312 aa  182  6e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.556876  normal  0.0129681 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0438  transketolase central region  34.97 
 
 		 312 aa  181  1e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0397028  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5659  Transketolase central region  36.33 
 
 		 333 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.252415  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1554  transketolase central region  34.33 
 
 		 312 aa  179  4e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0600642  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2032  Transketolase domain protein  37.89 
 
 		 318 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.262756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1505  transketolase central region  33.33 
 
 		 314 aa  175  8e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0385912  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2513  transketolase subunit B  37.28 
 
 		 322 aa  175  9e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1130  transketolase central region  36.81 
 
 		 336 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4663  transketolase central region  35.29 
 
 		 328 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3129  transketolase domain-containing protein  36.65 
 
 		 322 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2041  transketolase central region  35.64 
 
 		 330 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.522483 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0237  transketolase subunit B  39.18 
 
 		 311 aa  172  7.999999999999999e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4834  transketolase central region  32.12 
 
 		 333 aa  172  9e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1878  transketolase subunit B  34.71 
 
 		 312 aa  171  1e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3949  Transketolase domain protein  35.1 
 
 		 338 aa  169  5e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1468  Transketolase central region  32.42 
 
 		 314 aa  166  4e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2800  Transketolase central region  33.8 
 
 		 320 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0809  transketolase central region  36.84 
 
 		 592 aa  164  2.0000000000000002e-39  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.32467  normal  0.55266 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1923  transketolase domain-containing protein  32.51 
 
 		 315 aa  163  5.0000000000000005e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3618  transketolase subunit B  35.36 
 
 		 331 aa  162  5.0000000000000005e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.189872  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6295  Transketolase central region  36.98 
 
 		 332 aa  162  8.000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2444  transketolase subunit B  32.98 
 
 		 313 aa  159  6e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36720  transketolase  34.81 
 
 		 614 aa  159  8e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.148891  normal  0.641961 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2381  transketolase  32.57 
 
 		 621 aa  157  3e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.652214  normal  0.294409 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5275  transketolase, central region  32.21 
 
 		 335 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.181452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2126  Transketolase domain protein  32.34 
 
 		 320 aa  156  4e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.764032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5637  transketolase subunit B  30.9 
 
 		 307 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2718  transketolase subunit B  32.64 
 
 		 340 aa  155  8e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1539  transketolase central region  31.12 
 
 		 348 aa  155  1e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.844968  normal  0.490255 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1713  transketolase central region  31.77 
 
 		 332 aa  154  2e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.548893  normal  0.0621953 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6255  transketolase central region  31.94 
 
 		 332 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.156319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6422  transketolase, central region  32.29 
 
 		 332 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6657  transketolase, central region  32.29 
 
 		 332 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3641  transketolase, central region  31.94 
 
 		 334 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.150786 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0407  transketolase central region  31.45 
 
 		 323 aa  153  4e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0194561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2367  Transketolase central region  30.8 
 
 		 339 aa  153  4e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.438048  normal  0.0327946 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2092  transketolase central region  30.8 
 
 		 339 aa  153  4e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.147262 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1278  transketolase  33.96 
 
 		 624 aa  153  5e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0718  transketolase, central region  32.29 
 
 		 334 aa  152  5.9999999999999996e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3269  transketolase subunit B  29.86 
 
 		 337 aa  152  8e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.444228 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3878  transketolase, central region  31.55 
 
 		 342 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.733485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2123  transketolase  33.64 
 
 		 627 aa  151  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>