More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1713 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_1713  transketolase central region  100 
 
 		 332 aa  677    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.548893  normal  0.0621953 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0901  transketolase, central region  61.61 
 
 		 336 aa  404  1e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4411  transketolase, central region  46.96 
 
 		 332 aa  294  1e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0682016 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5275  transketolase, central region  47.12 
 
 		 335 aa  294  2e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.181452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4930  transketolase central region  46.96 
 
 		 332 aa  293  2e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6255  transketolase central region  47.28 
 
 		 332 aa  291  9e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.156319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6422  transketolase, central region  47.28 
 
 		 332 aa  290  2e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6657  transketolase, central region  47.28 
 
 		 332 aa  290  2e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4991  transketolase central region  46.96 
 
 		 332 aa  290  3e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.908463 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3618  transketolase subunit B  46.45 
 
 		 331 aa  286  2.9999999999999996e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.189872  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2718  transketolase subunit B  46.15 
 
 		 340 aa  286  4e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4778  transketolase subunit B  46.13 
 
 		 332 aa  283  2.0000000000000002e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3269  transketolase subunit B  46.47 
 
 		 337 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.444228 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3958  transketolase subunit B  46.2 
 
 		 340 aa  282  6.000000000000001e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.158278  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1717  Transketolase central region  46.75 
 
 		 347 aa  277  2e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3641  transketolase, central region  45.03 
 
 		 334 aa  276  3e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.150786 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0406  Transketolase central region  47.19 
 
 		 343 aa  274  1.0000000000000001e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2744  transketolase central region  45.54 
 
 		 342 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0728122  normal  0.0592981 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0261  Transketolase central region  45.69 
 
 		 339 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.885505 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4383  Transketolase central region  47.13 
 
 		 342 aa  273  3e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0967269  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3003  transketolase central region  45.54 
 
 		 340 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1539  transketolase central region  46.5 
 
 		 348 aa  272  5.000000000000001e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.844968  normal  0.490255 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2092  transketolase central region  43.77 
 
 		 339 aa  272  6e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.147262 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1462  transketolase subunit B  46.15 
 
 		 332 aa  272  6e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.304967 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2367  Transketolase central region  43.77 
 
 		 339 aa  272  6e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.438048  normal  0.0327946 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0727  transketolase central region  46.5 
 
 		 335 aa  272  8.000000000000001e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6139  Transketolase central region  44.52 
 
 		 332 aa  270  2e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.47666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2699  transketolase subunit B  47.92 
 
 		 288 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3312  Transketolase central region  43.59 
 
 		 332 aa  269  4e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5878  transketolase central region  45.48 
 
 		 333 aa  268  1e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0718  transketolase, central region  45.54 
 
 		 334 aa  265  5.999999999999999e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2613  transketolase central region  43.27 
 
 		 333 aa  265  1e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0875571  normal  0.474338 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4275  transketolase central region  42.99 
 
 		 338 aa  262  6.999999999999999e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3347  Transketolase central region  47.06 
 
 		 331 aa  261  1e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.027962  normal  0.023237 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2506  Transketolase central region  45.03 
 
 		 343 aa  253  5.000000000000001e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.165482 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4834  transketolase central region  38.19 
 
 		 333 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0969  transketolase, central region  41 
 
 		 306 aa  210  2e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86113  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0471  transketolase subunit B  39.1 
 
 		 312 aa  207  2e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0285277  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1554  transketolase central region  39.1 
 
 		 312 aa  206  3e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0600642  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0492  transketolase, central region  41.67 
 
 		 312 aa  207  3e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0365  transketolase central region  38.06 
 
 		 312 aa  205  1e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.556876  normal  0.0129681 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3967  Transketolase central region  42.91 
 
 		 313 aa  204  2e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000645501  unclonable  0.000000000133165 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1527  Transketolase central region  41.99 
 
 		 319 aa  203  3e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0280  Transketolase central region  41.45 
 
 		 310 aa  203  4e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.741894  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0265  Transketolase central region  40.46 
 
 		 310 aa  199  7.999999999999999e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00214892 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1860  Transketolase central region  41.28 
 
 		 321 aa  198  9e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0438  transketolase central region  36.46 
 
 		 312 aa  198  9e-50  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0397028  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2213  transketolase subunit B  38.68 
 
 		 317 aa  197  2.0000000000000003e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000528401  hitchhiker  0.000741425 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2719  transketolase, C-terminal subunit  42.51 
 
 		 311 aa  196  5.000000000000001e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1505  transketolase central region  37.28 
 
 		 314 aa  195  9e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0385912  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4744  Transketolase central region  41.01 
 
 		 311 aa  193  3e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1130  transketolase central region  40.07 
 
 		 336 aa  191  2e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1792  transketolase subunit B  39.37 
 
 		 310 aa  191  2e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0510195  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3878  transketolase, central region  37.87 
 
 		 342 aa  188  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.733485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0293  putative transketolase, C-terminal subunit  37.16 
 
 		 314 aa  188  1e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0288  transketolase  37.16 
 
 		 314 aa  188  1e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000211069  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0552  transketolase subunit B  41.58 
 
 		 314 aa  187  2e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0975  Transketolase central region  36.51 
 
 		 317 aa  187  3e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.127122  normal  0.063318 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2918  transketolase, C-terminal subunit  42.66 
 
 		 314 aa  186  4e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1381  Transketolase central region  36.64 
 
 		 306 aa  186  6e-46  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2705  transketolase subunit B  36.93 
 
 		 311 aa  185  8e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000194197  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1895  transketolase, C-terminal subunit  35.45 
 
 		 318 aa  181  1e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00759771 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0333  Transketolase central region  34.03 
 
 		 322 aa  182  1e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0244  Transketolase central region  34.97 
 
 		 305 aa  179  4e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.304733  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0470  Transketolase central region  43.15 
 
 		 318 aa  179  4.999999999999999e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2935  Transketolase central region  36.27 
 
 		 317 aa  179  5.999999999999999e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0244  transketolase-like protein  36.55 
 
 		 311 aa  179  5.999999999999999e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2059  Transketolase central region  34.93 
 
 		 313 aa  179  7e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0237  transketolase subunit B  41.88 
 
 		 311 aa  178  1e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0873  Transketolase central region  36.27 
 
 		 319 aa  177  2e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.199119  hitchhiker  0.00317558 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1192  transketolase-like  35.08 
 
 		 327 aa  176  4e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.101787  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2077  transketolase, central region  39.09 
 
 		 308 aa  176  4e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3074  transketolase, central region  41.45 
 
 		 313 aa  176  5e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0289222  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0874  Transketolase central region  35.08 
 
 		 326 aa  175  9.999999999999999e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0173  Transketolase central region  34.38 
 
 		 313 aa  175  9.999999999999999e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0860  Transketolase domain protein  34.58 
 
 		 310 aa  172  5.999999999999999e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.476833  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09040  transketolase subunit B  36.84 
 
 		 315 aa  172  1e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.28283  normal  0.0525296 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0183  Transketolase central region  36.09 
 
 		 320 aa  170  3e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1170  transketolase subunit B  34.1 
 
 		 326 aa  170  3e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000103125  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3129  transketolase domain-containing protein  39 
 
 		 322 aa  170  4e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0881  Transketolase central region  36.75 
 
 		 327 aa  169  5e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000876605  normal  0.0478781 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2254  Transketolase domain protein  37.26 
 
 		 318 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.655402  normal  0.0447096 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1286  transketolase-like  34.2 
 
 		 327 aa  167  2e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.290354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1178  Transketolase central region  35.21 
 
 		 327 aa  166  4e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0058066  normal  0.0131189 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1173  Transketolase central region  34.75 
 
 		 327 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000000393635  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00875  transketolase, C-terminal subunit  33.89 
 
 		 317 aa  163  3e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2513  transketolase subunit B  36.65 
 
 		 322 aa  162  7e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1468  Transketolase central region  32.87 
 
 		 314 aa  159  6e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1146  Transketolase domain protein  31.83 
 
 		 319 aa  159  7e-38  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2842  transketolase subunit B  32.03 
 
 		 317 aa  158  1e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.837175  normal  0.299247 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1878  transketolase subunit B  30.85 
 
 		 312 aa  157  2e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2481  transketolase domain protein  32.11 
 
 		 317 aa  155  8e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.120495  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2569  transketolase domain protein  32.11 
 
 		 317 aa  155  8e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.126502  normal  0.742091 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0049  transketolase, central region  34.28 
 
 		 317 aa  155  9e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1078  deoxyxylulose-5-phosphate synthase  31.69 
 
 		 635 aa  154  1e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0303047  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1027  deoxyxylulose-5-phosphate synthase  34.11 
 
 		 634 aa  154  2e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2689  transketolase domain-containing protein  31.77 
 
 		 317 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.423567 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2526  transketolase domain protein  32.11 
 
 		 317 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.508569 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2581  transketolase domain-containing protein  31.77 
 
 		 317 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.230809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2584  deoxyxylulose-5-phosphate synthase  31.73 
 
 		 633 aa  154  2e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.931562  normal  0.224926 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>