More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_1468 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_1468  Transketolase central region  100 
 
 		 314 aa  637    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0492  transketolase, central region  42.9 
 
 		 312 aa  262  4e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1860  Transketolase central region  43.09 
 
 		 321 aa  258  6e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0280  Transketolase central region  43.23 
 
 		 310 aa  257  2e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.741894  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0265  Transketolase central region  42.9 
 
 		 310 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00214892 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3967  Transketolase central region  42.63 
 
 		 313 aa  251  1e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000645501  unclonable  0.000000000133165 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0293  putative transketolase, C-terminal subunit  41.94 
 
 		 314 aa  244  1.9999999999999999e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0288  transketolase  41.94 
 
 		 314 aa  244  1.9999999999999999e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000211069  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0244  Transketolase central region  41.55 
 
 		 305 aa  244  1.9999999999999999e-63  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.304733  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2213  transketolase subunit B  39.29 
 
 		 317 aa  241  1e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000528401  hitchhiker  0.000741425 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0552  transketolase subunit B  43.09 
 
 		 314 aa  241  2e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0969  transketolase, central region  42.11 
 
 		 306 aa  239  5.999999999999999e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86113  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3074  transketolase, central region  43.91 
 
 		 313 aa  236  5.0000000000000005e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0289222  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2719  transketolase, C-terminal subunit  40.97 
 
 		 311 aa  235  9e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2019  Transketolase central region  41.5 
 
 		 320 aa  234  2.0000000000000002e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.6126  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0183  Transketolase central region  41.04 
 
 		 320 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4744  Transketolase central region  43.84 
 
 		 311 aa  232  6e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0333  Transketolase central region  41.1 
 
 		 322 aa  230  2e-59  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1527  Transketolase central region  40 
 
 		 319 aa  230  3e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0237  transketolase subunit B  41.42 
 
 		 311 aa  230  3e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0711  Transketolase central region  39.26 
 
 		 315 aa  228  1e-58  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00000202012  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1381  Transketolase central region  41.14 
 
 		 306 aa  228  1e-58  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1170  transketolase subunit B  40.33 
 
 		 326 aa  228  1e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000103125  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0470  Transketolase central region  41.1 
 
 		 318 aa  227  2e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2059  Transketolase central region  39.48 
 
 		 313 aa  226  3e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0874  Transketolase central region  39.93 
 
 		 326 aa  226  3e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1505  transketolase central region  40.6 
 
 		 314 aa  226  4e-58  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0385912  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1178  Transketolase central region  39.87 
 
 		 327 aa  226  4e-58  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0058066  normal  0.0131189 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2077  transketolase, central region  43 
 
 		 308 aa  226  4e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05490  transketolase subunit B  38.64 
 
 		 325 aa  226  4e-58  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.948034 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1286  transketolase-like  39.26 
 
 		 327 aa  225  7e-58  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.290354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0438  transketolase central region  41.75 
 
 		 312 aa  224  1e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0397028  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2918  transketolase, C-terminal subunit  41.8 
 
 		 314 aa  224  2e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0244  transketolase-like protein  38.76 
 
 		 311 aa  223  2e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0881  Transketolase central region  39.93 
 
 		 327 aa  222  6e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000876605  normal  0.0478781 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1554  transketolase central region  42.28 
 
 		 312 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0600642  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0873  Transketolase central region  39.22 
 
 		 319 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.199119  hitchhiker  0.00317558 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0365  transketolase central region  42.28 
 
 		 312 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.556876  normal  0.0129681 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0471  transketolase subunit B  41.31 
 
 		 312 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0285277  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1192  transketolase-like  40.14 
 
 		 327 aa  220  3e-56  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.101787  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0975  Transketolase central region  38.38 
 
 		 317 aa  219  6e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.127122  normal  0.063318 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1895  transketolase, C-terminal subunit  38.24 
 
 		 318 aa  218  1e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00759771 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2705  transketolase subunit B  41.23 
 
 		 311 aa  218  1e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000194197  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1173  Transketolase central region  37.95 
 
 		 327 aa  215  7e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000000393635  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09040  transketolase subunit B  39.56 
 
 		 315 aa  214  1.9999999999999998e-54  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.28283  normal  0.0525296 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1130  transketolase central region  38.28 
 
 		 336 aa  211  1e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2935  Transketolase central region  37.46 
 
 		 317 aa  209  6e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0173  Transketolase central region  37.03 
 
 		 313 aa  209  7e-53  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0809  transketolase central region  37.34 
 
 		 592 aa  205  7e-52  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.32467  normal  0.55266 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2110  transketolase, central region  36.25 
 
 		 314 aa  204  1e-51  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.44874  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00875  transketolase, C-terminal subunit  36.93 
 
 		 317 aa  204  2e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1997  Transketolase central region  38.91 
 
 		 321 aa  204  2e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00329881 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0049  transketolase, central region  37.58 
 
 		 317 aa  200  3e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1792  transketolase subunit B  36.03 
 
 		 310 aa  199  6e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0510195  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1775  transketolase, central region  34.63 
 
 		 314 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0300  transketolase central region  32.72 
 
 		 324 aa  197  3e-49  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0477096 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0789  transketolase central region  34.19 
 
 		 314 aa  196  3e-49  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2254  Transketolase domain protein  34.73 
 
 		 318 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.655402  normal  0.0447096 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0860  Transketolase domain protein  36.57 
 
 		 310 aa  195  7e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.476833  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0894  transketolase subunit B  35.24 
 
 		 314 aa  194  1e-48  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3878  transketolase, central region  34.87 
 
 		 342 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.733485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1878  transketolase subunit B  36.25 
 
 		 312 aa  192  5e-48  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2444  transketolase subunit B  35.95 
 
 		 313 aa  192  6e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3129  transketolase domain-containing protein  35.02 
 
 		 322 aa  190  2e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4834  transketolase central region  35.69 
 
 		 333 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3269  transketolase subunit B  34.35 
 
 		 337 aa  189  7e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.444228 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2513  transketolase subunit B  35.64 
 
 		 322 aa  188  9e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2800  Transketolase central region  36.67 
 
 		 320 aa  186  3e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0338  Transketolase central region  36.48 
 
 		 319 aa  186  6e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2126  Transketolase domain protein  36.27 
 
 		 320 aa  183  3e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.764032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1539  transketolase central region  33.33 
 
 		 348 aa  181  2e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.844968  normal  0.490255 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3488  deoxyxylulose-5-phosphate synthase  37.62 
 
 		 631 aa  180  2.9999999999999997e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0451312  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2032  Transketolase domain protein  34.73 
 
 		 318 aa  179  4e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.262756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2092  transketolase central region  35.57 
 
 		 339 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.147262 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2367  Transketolase central region  35.57 
 
 		 339 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.438048  normal  0.0327946 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3397  Transketolase central region  35.49 
 
 		 298 aa  179  8e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1462  transketolase subunit B  33.45 
 
 		 332 aa  178  1e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.304967 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6139  Transketolase central region  34.01 
 
 		 332 aa  177  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.47666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3618  transketolase subunit B  34.01 
 
 		 331 aa  177  2e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.189872  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3364  Transketolase domain protein  33.88 
 
 		 317 aa  176  5e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1277  Transketolase central region  36.1 
 
 		 313 aa  176  6e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0407  transketolase central region  31.68 
 
 		 323 aa  176  6e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0194561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3641  transketolase, central region  33.33 
 
 		 334 aa  176  7e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.150786 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0261  Transketolase central region  34.56 
 
 		 339 aa  175  9e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.885505 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0334  Transketolase central region  37.37 
 
 		 308 aa  175  9.999999999999999e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3958  transketolase subunit B  35.02 
 
 		 340 aa  174  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.158278  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4663  transketolase central region  32.81 
 
 		 328 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4778  transketolase subunit B  33.56 
 
 		 332 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0718  transketolase, central region  34.33 
 
 		 334 aa  173  2.9999999999999996e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2822  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  34.64 
 
 		 635 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.553695  normal  0.10664 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6255  transketolase central region  34.14 
 
 		 332 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.156319  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4930  transketolase central region  34.48 
 
 		 332 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6422  transketolase, central region  34.14 
 
 		 332 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6657  transketolase, central region  34.14 
 
 		 332 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2699  transketolase subunit B  35.44 
 
 		 288 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4411  transketolase, central region  34.14 
 
 		 332 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0682016 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2744  transketolase central region  34.67 
 
 		 342 aa  172  6.999999999999999e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0728122  normal  0.0592981 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2613  transketolase central region  32.53 
 
 		 333 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0875571  normal  0.474338 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4991  transketolase central region  32.88 
 
 		 332 aa  171  1e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.908463 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5637  transketolase subunit B  32.44 
 
 		 307 aa  171  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>