More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1130 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1130  transketolase central region  100 
 
 		 336 aa  697    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0492  transketolase, central region  46.53 
 
 		 312 aa  281  1e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0293  putative transketolase, C-terminal subunit  45.05 
 
 		 314 aa  279  4e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0288  transketolase  45.05 
 
 		 314 aa  279  4e-74  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000211069  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0280  Transketolase central region  47.54 
 
 		 310 aa  275  9e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.741894  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3967  Transketolase central region  48.85 
 
 		 313 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000645501  unclonable  0.000000000133165 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4663  transketolase central region  45.3 
 
 		 328 aa  273  3e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1178  Transketolase central region  45.97 
 
 		 327 aa  272  5.000000000000001e-72  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0058066  normal  0.0131189 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5659  Transketolase central region  48.45 
 
 		 333 aa  272  5.000000000000001e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.252415  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0265  Transketolase central region  46.89 
 
 		 310 aa  272  6e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00214892 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0874  Transketolase central region  45.64 
 
 		 326 aa  271  9e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2041  transketolase central region  46.9 
 
 		 330 aa  269  5e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.522483 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0438  transketolase central region  45.07 
 
 		 312 aa  268  1e-70  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0397028  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0969  transketolase, central region  46.51 
 
 		 306 aa  267  2e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86113  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0244  transketolase-like protein  45.57 
 
 		 311 aa  267  2e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1170  transketolase subunit B  45.3 
 
 		 326 aa  266  2.9999999999999995e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000103125  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0881  Transketolase central region  44.97 
 
 		 327 aa  266  5e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000876605  normal  0.0478781 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1192  transketolase-like  45.3 
 
 		 327 aa  265  5.999999999999999e-70  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.101787  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0365  transketolase central region  46.49 
 
 		 312 aa  265  1e-69  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.556876  normal  0.0129681 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2719  transketolase, C-terminal subunit  48.2 
 
 		 311 aa  264  2e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1286  transketolase-like  45.64 
 
 		 327 aa  264  2e-69  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.290354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1505  transketolase central region  42.9 
 
 		 314 aa  263  3e-69  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0385912  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0471  transketolase subunit B  46.18 
 
 		 312 aa  263  4e-69  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0285277  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2059  Transketolase central region  44.44 
 
 		 313 aa  261  8.999999999999999e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1554  transketolase central region  45.82 
 
 		 312 aa  261  1e-68  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0600642  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0173  Transketolase central region  43.45 
 
 		 313 aa  260  3e-68  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0470  Transketolase central region  48.09 
 
 		 318 aa  258  7e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1173  Transketolase central region  44.63 
 
 		 327 aa  258  9e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000000393635  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0244  Transketolase central region  45.48 
 
 		 305 aa  258  1e-67  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.304733  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1860  Transketolase central region  44.92 
 
 		 321 aa  258  1e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3949  Transketolase domain protein  42.67 
 
 		 338 aa  258  1e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2213  transketolase subunit B  44.22 
 
 		 317 aa  257  2e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000528401  hitchhiker  0.000741425 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0552  transketolase subunit B  48.34 
 
 		 314 aa  256  3e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1381  Transketolase central region  44.7 
 
 		 306 aa  255  8e-67  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4744  Transketolase central region  48.1 
 
 		 311 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2077  transketolase, central region  48.36 
 
 		 308 aa  254  2.0000000000000002e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0333  Transketolase central region  48.85 
 
 		 322 aa  251  2e-65  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0237  transketolase subunit B  48.18 
 
 		 311 aa  249  3e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2705  transketolase subunit B  44.37 
 
 		 311 aa  250  3e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000194197  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0711  Transketolase central region  42.86 
 
 		 315 aa  244  9.999999999999999e-64  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00000202012  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0183  Transketolase central region  41.94 
 
 		 320 aa  244  9.999999999999999e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2918  transketolase, C-terminal subunit  48.18 
 
 		 314 aa  243  3e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1717  Transketolase central region  41.42 
 
 		 347 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3074  transketolase, central region  47.02 
 
 		 313 aa  242  7.999999999999999e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0289222  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1527  Transketolase central region  44.33 
 
 		 319 aa  236  3e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2019  Transketolase central region  41.69 
 
 		 320 aa  236  5.0000000000000005e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.6126  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1895  transketolase, C-terminal subunit  40.59 
 
 		 318 aa  235  1.0000000000000001e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00759771 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09040  transketolase subunit B  42.24 
 
 		 315 aa  233  3e-60  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.28283  normal  0.0525296 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0975  Transketolase central region  39.74 
 
 		 317 aa  230  3e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.127122  normal  0.063318 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00875  transketolase, C-terminal subunit  40.33 
 
 		 317 aa  230  3e-59  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0718  transketolase, central region  41.67 
 
 		 334 aa  229  4e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3312  Transketolase central region  39.86 
 
 		 332 aa  228  8e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0300  transketolase central region  40.97 
 
 		 324 aa  228  1e-58  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0477096 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3397  Transketolase central region  46.4 
 
 		 298 aa  228  2e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2718  transketolase subunit B  39.54 
 
 		 340 aa  226  4e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05490  transketolase subunit B  40.98 
 
 		 325 aa  226  4e-58  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.948034 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2935  Transketolase central region  40.07 
 
 		 317 aa  226  6e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1462  transketolase subunit B  40.33 
 
 		 332 aa  224  1e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.304967 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4991  transketolase central region  38.56 
 
 		 332 aa  224  2e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.908463 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3269  transketolase subunit B  38.69 
 
 		 337 aa  224  2e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.444228 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0873  Transketolase central region  40.59 
 
 		 319 aa  224  2e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.199119  hitchhiker  0.00317558 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2444  transketolase subunit B  40.79 
 
 		 313 aa  224  2e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0049  transketolase, central region  41.39 
 
 		 317 aa  223  4.9999999999999996e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6139  Transketolase central region  38.89 
 
 		 332 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.47666  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2254  Transketolase domain protein  41.67 
 
 		 318 aa  222  6e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.655402  normal  0.0447096 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0860  Transketolase domain protein  40.4 
 
 		 310 aa  221  9.999999999999999e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.476833  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2744  transketolase central region  41.37 
 
 		 342 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0728122  normal  0.0592981 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5275  transketolase, central region  38.69 
 
 		 335 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.181452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0407  transketolase central region  38.98 
 
 		 323 aa  220  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0194561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6295  Transketolase central region  41.82 
 
 		 332 aa  220  3e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1997  Transketolase central region  40.26 
 
 		 321 aa  220  3e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00329881 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0789  transketolase central region  40.25 
 
 		 314 aa  219  5e-56  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3129  transketolase domain-containing protein  41.81 
 
 		 322 aa  218  1e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2800  Transketolase central region  36.39 
 
 		 320 aa  217  2e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3382  transketolase domain-containing protein  41.34 
 
 		 314 aa  216  2.9999999999999998e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3248  putative transketolase, C-terminal subunit  40.99 
 
 		 314 aa  216  4e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1539  transketolase central region  39.54 
 
 		 348 aa  216  5e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.844968  normal  0.490255 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4930  transketolase central region  38.56 
 
 		 332 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6422  transketolase, central region  38.56 
 
 		 332 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6657  transketolase, central region  38.56 
 
 		 332 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2126  Transketolase domain protein  39.13 
 
 		 320 aa  215  9e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.764032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2513  transketolase subunit B  40.67 
 
 		 322 aa  214  9.999999999999999e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2367  Transketolase central region  39.22 
 
 		 339 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.438048  normal  0.0327946 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2092  transketolase central region  39.22 
 
 		 339 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.147262 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6255  transketolase central region  38.24 
 
 		 332 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.156319  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2402  transketolase, C-terminal subunit  40.64 
 
 		 310 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.730568  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3003  transketolase central region  40.07 
 
 		 340 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4411  transketolase, central region  38.24 
 
 		 332 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0682016 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5637  transketolase subunit B  41.09 
 
 		 307 aa  212  5.999999999999999e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1775  transketolase, central region  39.05 
 
 		 314 aa  212  5.999999999999999e-54  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3641  transketolase, central region  38.21 
 
 		 334 aa  212  5.999999999999999e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.150786 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4778  transketolase subunit B  39.25 
 
 		 332 aa  211  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1468  Transketolase central region  38.28 
 
 		 314 aa  210  2e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3347  Transketolase central region  39.6 
 
 		 331 aa  211  2e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.027962  normal  0.023237 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0809  transketolase central region  44.57 
 
 		 592 aa  210  2e-53  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.32467  normal  0.55266 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0261  Transketolase central region  38.69 
 
 		 339 aa  210  3e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.885505 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0338  Transketolase central region  42.19 
 
 		 319 aa  209  4e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3618  transketolase subunit B  38.54 
 
 		 331 aa  209  5e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.189872  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2032  Transketolase domain protein  43.64 
 
 		 318 aa  209  7e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.262756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4275  transketolase central region  37.67 
 
 		 338 aa  209  8e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>