More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_3248 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_3248  putative transketolase, C-terminal subunit  100 
 
 		 314 aa  637    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3382  transketolase domain-containing protein  99.68 
 
 		 314 aa  637    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0910  putative transketolase, C-terminal subunit  97.77 
 
 		 310 aa  604  9.999999999999999e-173  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2646  Transketolase domain protein  80.51 
 
 		 314 aa  528  1e-149  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0477221  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2402  transketolase, C-terminal subunit  66.56 
 
 		 310 aa  431  1e-120  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.730568  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3642  Transketolase central region  45.48 
 
 		 307 aa  282  4.0000000000000003e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3528  Transketolase central region  45.45 
 
 		 306 aa  279  4e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.605284  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2254  Transketolase domain protein  43.08 
 
 		 318 aa  216  4e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.655402  normal  0.0447096 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1130  transketolase central region  40.99 
 
 		 336 aa  216  5e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2032  Transketolase domain protein  43.46 
 
 		 318 aa  211  9e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.262756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3129  transketolase domain-containing protein  42.58 
 
 		 322 aa  205  1e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0407  transketolase central region  39.22 
 
 		 323 aa  202  5e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0194561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2126  Transketolase domain protein  38.97 
 
 		 320 aa  202  5e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.764032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0969  transketolase, central region  38.68 
 
 		 306 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86113  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2800  Transketolase central region  36.72 
 
 		 320 aa  195  8.000000000000001e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1505  transketolase central region  35.07 
 
 		 314 aa  189  5e-47  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0385912  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0438  transketolase central region  34.49 
 
 		 312 aa  188  1e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0397028  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3397  Transketolase central region  36.05 
 
 		 298 aa  188  1e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09040  transketolase subunit B  37.54 
 
 		 315 aa  183  3e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.28283  normal  0.0525296 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2444  transketolase subunit B  35.34 
 
 		 313 aa  182  6e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4744  Transketolase central region  41.25 
 
 		 311 aa  181  1e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3967  Transketolase central region  37.63 
 
 		 313 aa  180  2.9999999999999997e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000645501  unclonable  0.000000000133165 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0471  transketolase subunit B  33.8 
 
 		 312 aa  179  4e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0285277  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2513  transketolase subunit B  37.28 
 
 		 322 aa  177  2e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1527  Transketolase central region  40.48 
 
 		 319 aa  177  2e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0244  transketolase-like protein  34.6 
 
 		 311 aa  176  3e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1923  transketolase domain-containing protein  35.86 
 
 		 315 aa  176  7e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0280  Transketolase central region  34.15 
 
 		 310 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.741894  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1554  transketolase central region  33.45 
 
 		 312 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0600642  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1878  transketolase subunit B  34.55 
 
 		 312 aa  174  1.9999999999999998e-42  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0365  transketolase central region  33.8 
 
 		 312 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.556876  normal  0.0129681 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0265  Transketolase central region  33.8 
 
 		 310 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00214892 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0492  transketolase, central region  35.64 
 
 		 312 aa  172  5e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0711  Transketolase central region  32.53 
 
 		 315 aa  171  2e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00000202012  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05490  transketolase subunit B  34.59 
 
 		 325 aa  169  4e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.948034 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1860  Transketolase central region  35.69 
 
 		 321 aa  169  4e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0333  Transketolase central region  36.58 
 
 		 322 aa  168  9e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1381  Transketolase central region  34.01 
 
 		 306 aa  168  1e-40  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0809  transketolase central region  35.74 
 
 		 592 aa  168  1e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.32467  normal  0.55266 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2213  transketolase subunit B  34.24 
 
 		 317 aa  167  2e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000528401  hitchhiker  0.000741425 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0334  Transketolase central region  34.9 
 
 		 308 aa  167  2.9999999999999998e-40  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3074  transketolase, central region  38.75 
 
 		 313 aa  166  4e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0289222  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0237  transketolase subunit B  37.19 
 
 		 311 aa  166  5.9999999999999996e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0183  Transketolase central region  31.31 
 
 		 320 aa  163  3e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4663  transketolase central region  35.31 
 
 		 328 aa  161  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0244  Transketolase central region  34.6 
 
 		 305 aa  160  3e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.304733  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5637  transketolase subunit B  33.46 
 
 		 307 aa  160  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0293  putative transketolase, C-terminal subunit  34.11 
 
 		 314 aa  159  5e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0288  transketolase  34.11 
 
 		 314 aa  159  5e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000211069  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2041  transketolase central region  33.33 
 
 		 330 aa  159  6e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.522483 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5659  Transketolase central region  32.42 
 
 		 333 aa  158  9e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.252415  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1277  Transketolase central region  33.22 
 
 		 313 aa  158  1e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1468  Transketolase central region  30.07 
 
 		 314 aa  158  1e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0860  Transketolase domain protein  32.28 
 
 		 310 aa  158  1e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.476833  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1895  transketolase, C-terminal subunit  31.14 
 
 		 318 aa  158  1e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00759771 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3949  Transketolase domain protein  32.56 
 
 		 338 aa  158  1e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0975  Transketolase central region  30.42 
 
 		 317 aa  157  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.127122  normal  0.063318 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2935  Transketolase central region  30.07 
 
 		 317 aa  157  3e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2059  Transketolase central region  31.93 
 
 		 313 aa  156  4e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2182  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  35.64 
 
 		 625 aa  156  5.0000000000000005e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0455646  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2448  deoxyxylulose-5-phosphate synthase  36.56 
 
 		 631 aa  156  5.0000000000000005e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0789  transketolase central region  35.52 
 
 		 314 aa  156  5.0000000000000005e-37  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0796  Transketolase central region  35.32 
 
 		 316 aa  155  6e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2705  transketolase subunit B  34.3 
 
 		 311 aa  155  6e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000194197  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0873  Transketolase central region  29.07 
 
 		 319 aa  155  1e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.199119  hitchhiker  0.00317558 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1418  deoxyxylulose-5-phosphate synthase  37.31 
 
 		 646 aa  154  2e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.793105  normal  0.333041 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0894  transketolase subunit B  37.19 
 
 		 314 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0173  Transketolase central region  33.1 
 
 		 313 aa  153  4e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4834  transketolase central region  33.7 
 
 		 333 aa  152  7e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2077  transketolase, central region  37.35 
 
 		 308 aa  152  7e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3362  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  37.14 
 
 		 635 aa  152  8e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0552  transketolase subunit B  35.92 
 
 		 314 aa  151  1e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1997  Transketolase central region  35.98 
 
 		 321 aa  152  1e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00329881 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1713  transketolase central region  34.88 
 
 		 332 aa  152  1e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.548893  normal  0.0621953 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1775  transketolase, central region  34.48 
 
 		 314 aa  151  1e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1286  transketolase-like  31.72 
 
 		 327 aa  150  2e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.290354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1192  transketolase-like  32.3 
 
 		 327 aa  150  2e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.101787  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2110  transketolase, central region  35.09 
 
 		 314 aa  151  2e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.44874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0901  transketolase, central region  34.07 
 
 		 336 aa  150  2e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00875  transketolase, C-terminal subunit  30.63 
 
 		 317 aa  150  3e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1078  deoxyxylulose-5-phosphate synthase  32.57 
 
 		 635 aa  150  3e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0303047  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2019  Transketolase central region  30.88 
 
 		 320 aa  149  5e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.6126  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1173  Transketolase central region  33.61 
 
 		 327 aa  149  5e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000000393635  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1934  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  37.55 
 
 		 625 aa  149  6e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1792  transketolase subunit B  34.07 
 
 		 310 aa  149  6e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0510195  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0883  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  33.98 
 
 		 635 aa  149  8e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000207097 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1398  deoxyxylulose-5-phosphate synthase  36.24 
 
 		 629 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0300  transketolase central region  34.6 
 
 		 324 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0477096 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0686  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  38.37 
 
 		 637 aa  146  3e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.351489  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3269  transketolase subunit B  33.08 
 
 		 337 aa  147  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.444228 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2403  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  37.91 
 
 		 626 aa  147  3e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1027  deoxyxylulose-5-phosphate synthase  37.45 
 
 		 634 aa  145  6e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1178  Transketolase central region  30.35 
 
 		 327 aa  145  1e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0058066  normal  0.0131189 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1717  Transketolase central region  34.35 
 
 		 347 aa  143  3e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4221  transketolase subunit B  34.93 
 
 		 307 aa  144  3e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2719  transketolase, C-terminal subunit  34.74 
 
 		 311 aa  143  4e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0881  Transketolase central region  31.09 
 
 		 327 aa  143  4e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000876605  normal  0.0478781 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2367  Transketolase central region  32.58 
 
 		 339 aa  142  7e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.438048  normal  0.0327946 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2092  transketolase central region  32.58 
 
 		 339 aa  142  7e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.147262 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0874  Transketolase central region  31.64 
 
 		 326 aa  142  8e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>