More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0796 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_0796  Transketolase central region  100 
 
 		 316 aa  651    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0614  transketolase, central region  46.82 
 
 		 310 aa  275  8e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.593318 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3397  Transketolase central region  32.78 
 
 		 298 aa  175  7e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2402  transketolase, C-terminal subunit  37.36 
 
 		 310 aa  162  1e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.730568  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05490  transketolase subunit B  36.59 
 
 		 325 aa  161  1e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.948034 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1058  transketolase subunit B  36.55 
 
 		 308 aa  156  4e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.847424 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3382  transketolase domain-containing protein  35.32 
 
 		 314 aa  156  5.0000000000000005e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0910  putative transketolase, C-terminal subunit  35.85 
 
 		 310 aa  156  5.0000000000000005e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3248  putative transketolase, C-terminal subunit  35.32 
 
 		 314 aa  155  6e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3642  Transketolase central region  34.67 
 
 		 307 aa  154  2e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3528  Transketolase central region  34.31 
 
 		 306 aa  154  2e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.605284  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2444  transketolase subunit B  31.53 
 
 		 313 aa  150  3e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2254  Transketolase domain protein  34.43 
 
 		 318 aa  149  9e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.655402  normal  0.0447096 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0492  transketolase, central region  32.06 
 
 		 312 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1130  transketolase central region  33.12 
 
 		 336 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5637  transketolase subunit B  31.34 
 
 		 307 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2213  transketolase subunit B  35.23 
 
 		 317 aa  144  2e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000528401  hitchhiker  0.000741425 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1527  Transketolase central region  35.44 
 
 		 319 aa  143  4e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3129  transketolase domain-containing protein  34.16 
 
 		 322 aa  142  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2646  Transketolase domain protein  33.46 
 
 		 314 aa  139  6e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0477221  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2032  Transketolase domain protein  34.57 
 
 		 318 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.262756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09040  transketolase subunit B  33.77 
 
 		 315 aa  137  3.0000000000000003e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.28283  normal  0.0525296 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0552  transketolase subunit B  34.49 
 
 		 314 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0438  transketolase central region  31.34 
 
 		 312 aa  133  3e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0397028  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0334  Transketolase central region  33.58 
 
 		 308 aa  133  3.9999999999999996e-30  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2126  Transketolase domain protein  31.91 
 
 		 320 aa  132  6e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.764032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2019  Transketolase central region  29.35 
 
 		 320 aa  132  6.999999999999999e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.6126  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4834  transketolase central region  29.79 
 
 		 333 aa  132  9e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1286  transketolase-like  32.03 
 
 		 327 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.290354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2513  transketolase subunit B  33.56 
 
 		 322 aa  132  1.0000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0244  transketolase-like protein  32.27 
 
 		 311 aa  131  1.0000000000000001e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0873  Transketolase central region  29.04 
 
 		 319 aa  130  3e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.199119  hitchhiker  0.00317558 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0711  Transketolase central region  31.91 
 
 		 315 aa  130  3e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00000202012  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14551  transketolase C-terminal subunit  28.57 
 
 		 304 aa  130  3e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6295  Transketolase central region  33.22 
 
 		 332 aa  130  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0333  Transketolase central region  32.27 
 
 		 322 aa  129  6e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3967  Transketolase central region  35.92 
 
 		 313 aa  129  7.000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000645501  unclonable  0.000000000133165 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0244  Transketolase central region  29.37 
 
 		 305 aa  129  8.000000000000001e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.304733  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0173  Transketolase central region  32.65 
 
 		 313 aa  129  9.000000000000001e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1997  Transketolase central region  33.33 
 
 		 321 aa  127  2.0000000000000002e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00329881 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0975  Transketolase central region  30.77 
 
 		 317 aa  127  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.127122  normal  0.063318 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0280  Transketolase central region  30.28 
 
 		 310 aa  127  3e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.741894  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1505  transketolase central region  29.68 
 
 		 314 aa  127  3e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0385912  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1178  Transketolase central region  31.32 
 
 		 327 aa  126  5e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0058066  normal  0.0131189 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0881  Transketolase central region  32.28 
 
 		 327 aa  125  1e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000876605  normal  0.0478781 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00875  transketolase, C-terminal subunit  29.41 
 
 		 317 aa  125  1e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1554  transketolase central region  29.33 
 
 		 312 aa  124  2e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0600642  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1589  transketolase family protein  26.17 
 
 		 288 aa  124  2e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1170  transketolase subunit B  30.6 
 
 		 326 aa  124  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000103125  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2719  transketolase, C-terminal subunit  33.33 
 
 		 311 aa  124  3e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1895  transketolase, C-terminal subunit  30 
 
 		 318 aa  123  3e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00759771 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0365  transketolase central region  28.98 
 
 		 312 aa  123  5e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.556876  normal  0.0129681 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0293  putative transketolase, C-terminal subunit  30.1 
 
 		 314 aa  122  5e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0288  transketolase  30.1 
 
 		 314 aa  122  5e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000211069  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3878  transketolase, central region  33.21 
 
 		 342 aa  122  6e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.733485  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0265  Transketolase central region  29.34 
 
 		 310 aa  122  6e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00214892 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0471  transketolase subunit B  29.33 
 
 		 312 aa  122  7e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0285277  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2800  Transketolase central region  30.49 
 
 		 320 aa  122  8e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0809  transketolase central region  33.1 
 
 		 592 aa  122  9.999999999999999e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.32467  normal  0.55266 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0342  Transketolase domain protein  31.36 
 
 		 321 aa  121  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.276697 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0200  transketolase, C-terminal subunit  32.03 
 
 		 309 aa  121  9.999999999999999e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0237  transketolase subunit B  31.49 
 
 		 311 aa  121  9.999999999999999e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0183  Transketolase central region  30.03 
 
 		 320 aa  121  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0300  transketolase central region  31.44 
 
 		 324 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0477096 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0407  transketolase central region  33.2 
 
 		 323 aa  120  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0194561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1860  Transketolase central region  32.39 
 
 		 321 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0969  transketolase, central region  29.23 
 
 		 306 aa  120  3e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86113  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0860  Transketolase domain protein  31.25 
 
 		 310 aa  120  3.9999999999999996e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.476833  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0874  Transketolase central region  30.53 
 
 		 326 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2918  transketolase, C-terminal subunit  31.71 
 
 		 314 aa  119  6e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1792  transketolase subunit B  33.57 
 
 		 310 aa  119  7.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0510195  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2935  Transketolase central region  30.71 
 
 		 317 aa  119  7.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2481  transketolase domain protein  30.72 
 
 		 317 aa  119  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.120495  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1277  Transketolase central region  32.65 
 
 		 313 aa  118  9.999999999999999e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2569  transketolase domain protein  30.72 
 
 		 317 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.126502  normal  0.742091 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2287  transketolase central region  28.16 
 
 		 305 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2581  transketolase domain-containing protein  30.39 
 
 		 317 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.230809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2689  transketolase domain-containing protein  30.39 
 
 		 317 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.423567 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2526  transketolase domain protein  30.39 
 
 		 317 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.508569 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3364  Transketolase domain protein  28.91 
 
 		 317 aa  116  3.9999999999999997e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2110  transketolase, central region  33.7 
 
 		 314 aa  116  5e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.44874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1173  Transketolase central region  31.58 
 
 		 327 aa  116  5e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000000393635  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1775  transketolase, central region  33.83 
 
 		 314 aa  116  5e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0130  Transketolase central region  31.29 
 
 		 351 aa  116  6e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2705  transketolase subunit B  32.38 
 
 		 311 aa  115  6.9999999999999995e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000194197  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1192  transketolase-like  29.18 
 
 		 327 aa  115  7.999999999999999e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.101787  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2059  Transketolase central region  31.83 
 
 		 313 aa  115  7.999999999999999e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1539  transketolase central region  33.45 
 
 		 348 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.844968  normal  0.490255 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1381  Transketolase central region  28.47 
 
 		 306 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2613  transketolase central region  30.51 
 
 		 333 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0875571  normal  0.474338 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2842  transketolase subunit B  30.54 
 
 		 317 aa  114  2.0000000000000002e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.837175  normal  0.299247 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1713  transketolase central region  31.63 
 
 		 332 aa  114  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.548893  normal  0.0621953 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1468  Transketolase central region  29.01 
 
 		 314 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4991  transketolase central region  30.82 
 
 		 332 aa  113  5e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.908463 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2041  transketolase central region  29.41 
 
 		 330 aa  112  6e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.522483 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0486  Transketolase domain protein  31.09 
 
 		 313 aa  112  7.000000000000001e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1146  Transketolase domain protein  27.78 
 
 		 319 aa  112  8.000000000000001e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1878  transketolase subunit B  29.14 
 
 		 312 aa  110  2.0000000000000002e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2077  transketolase, central region  31.12 
 
 		 308 aa  111  2.0000000000000002e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3269  transketolase subunit B  31.72 
 
 		 337 aa  110  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.444228 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>