More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1589 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1589  transketolase family protein  100 
 
 		 288 aa  587  1e-167  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14551  transketolase C-terminal subunit  34.44 
 
 		 304 aa  174  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0697  transketoloase, C half  70.19 
 
 		 104 aa  165  6.9999999999999995e-40  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.837924  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5637  transketolase subunit B  30.69 
 
 		 307 aa  163  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3397  Transketolase central region  33.33 
 
 		 298 aa  161  1e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2287  transketolase central region  31.46 
 
 		 305 aa  159  4e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3642  Transketolase central region  29.01 
 
 		 307 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3528  Transketolase central region  29.01 
 
 		 306 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.605284  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1058  transketolase subunit B  27.87 
 
 		 308 aa  128  1.0000000000000001e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.847424 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4221  transketolase subunit B  31.25 
 
 		 307 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0796  Transketolase central region  26.17 
 
 		 316 aa  124  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2402  transketolase, C-terminal subunit  30.22 
 
 		 310 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.730568  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0438  transketolase central region  30.56 
 
 		 312 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0397028  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1505  transketolase central region  30.46 
 
 		 314 aa  119  6e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0385912  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2646  Transketolase domain protein  28.52 
 
 		 314 aa  119  6e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0477221  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2213  transketolase subunit B  32.46 
 
 		 317 aa  118  9e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000528401  hitchhiker  0.000741425 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3382  transketolase domain-containing protein  29.23 
 
 		 314 aa  117  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3248  putative transketolase, C-terminal subunit  28.46 
 
 		 314 aa  117  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2444  transketolase subunit B  29.7 
 
 		 313 aa  117  3e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0244  Transketolase central region  30.13 
 
 		 305 aa  116  5e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.304733  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1054  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  31.44 
 
 		 608 aa  116  5e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5103  Transketolase central region  27.91 
 
 		 306 aa  115  7.999999999999999e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.47717 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0910  putative transketolase, C-terminal subunit  28.12 
 
 		 310 aa  114  1.0000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0969  transketolase, central region  30.67 
 
 		 306 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86113  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1923  transketolase domain-containing protein  30.41 
 
 		 315 aa  113  3e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1058  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  31.44 
 
 		 608 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00967368  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6362  Transketolase central region  25.76 
 
 		 307 aa  112  5e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.465513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0244  transketolase-like protein  34.39 
 
 		 311 aa  112  7.000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2126  Transketolase domain protein  28.23 
 
 		 320 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.764032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2655  transketolase, C-terminal subunit  26.57 
 
 		 303 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0365  transketolase central region  29.04 
 
 		 312 aa  110  3e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.556876  normal  0.0129681 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0809  transketolase central region  26.48 
 
 		 592 aa  110  4.0000000000000004e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.32467  normal  0.55266 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0265  Transketolase central region  31.45 
 
 		 310 aa  109  5e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00214892 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1554  transketolase central region  28.95 
 
 		 312 aa  109  6e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0600642  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1628  transketolase, C-terminal subunit  26.39 
 
 		 303 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.750747  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1404  transketolase, C-terminal subunit  26.39 
 
 		 303 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.108594  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2130  transketolase, C-terminal subunit  26.39 
 
 		 303 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.963697  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3184  transketolase, C-terminal subunit  26.39 
 
 		 303 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2515  transketolase domain-containing protein  26.39 
 
 		 303 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2568  transketolase domain-containing protein  26.39 
 
 		 303 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.974177  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1130  transketolase central region  28.52 
 
 		 336 aa  107  2e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0280  Transketolase central region  32.04 
 
 		 310 aa  107  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.741894  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2800  Transketolase central region  32.06 
 
 		 320 aa  107  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0471  transketolase subunit B  30.14 
 
 		 312 aa  106  3e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0285277  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1963  transketolase, C-terminal subunit  24.32 
 
 		 302 aa  105  6e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.686485  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4002  Transketolase central region  25.17 
 
 		 299 aa  103  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.226763  normal  0.146008 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1381  Transketolase central region  27.72 
 
 		 306 aa  103  4e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2254  Transketolase domain protein  26.78 
 
 		 318 aa  102  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.655402  normal  0.0447096 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05490  transketolase subunit B  27.66 
 
 		 325 aa  102  8e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.948034 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4834  transketolase central region  24.66 
 
 		 333 aa  100  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0293  putative transketolase, C-terminal subunit  25.57 
 
 		 314 aa  100  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0288  transketolase  25.57 
 
 		 314 aa  100  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000211069  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0614  transketolase, central region  34.55 
 
 		 310 aa  100  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.593318 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0711  Transketolase central region  28.2 
 
 		 315 aa  100  3e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00000202012  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3967  Transketolase central region  29.84 
 
 		 313 aa  98.2  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000645501  unclonable  0.000000000133165 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0860  Transketolase domain protein  27.08 
 
 		 310 aa  98.2  1e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.476833  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0492  transketolase, central region  27.96 
 
 		 312 aa  97.1  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3074  transketolase, central region  33.33 
 
 		 313 aa  95.9  6e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0289222  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0407  transketolase central region  26.32 
 
 		 323 aa  95.9  6e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0194561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1178  Transketolase central region  27.71 
 
 		 327 aa  95.9  6e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0058066  normal  0.0131189 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06530  deoxyxylulose-5-phosphate synthase  30.37 
 
 		 636 aa  95.9  7e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000553997  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3878  transketolase, central region  28.85 
 
 		 342 aa  95.9  7e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.733485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3129  transketolase domain-containing protein  26.29 
 
 		 322 aa  95.9  7e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0333  Transketolase central region  29.06 
 
 		 322 aa  95.1  1e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1273  transketolase central region  30.13 
 
 		 303 aa  95.1  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.257757  hitchhiker  0.0057855 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1078  deoxyxylulose-5-phosphate synthase  28.83 
 
 		 635 aa  94.7  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0303047  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0486  Transketolase domain protein  25.76 
 
 		 313 aa  94.4  2e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2032  Transketolase domain protein  27.49 
 
 		 318 aa  94.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.262756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0342  Transketolase domain protein  28.21 
 
 		 321 aa  94.4  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.276697 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2041  transketolase central region  27.21 
 
 		 330 aa  94.4  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.522483 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1258  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  25.09 
 
 		 646 aa  94.7  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.260207  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0881  Transketolase central region  29.49 
 
 		 327 aa  94.7  2e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000876605  normal  0.0478781 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1852  deoxyxylulose-5-phosphate synthase  25.09 
 
 		 640 aa  93.6  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1775  transketolase, central region  27.3 
 
 		 314 aa  94  3e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2182  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  25.19 
 
 		 625 aa  93.6  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0455646  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0894  transketolase subunit B  29.08 
 
 		 314 aa  94  3e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0789  transketolase central region  27.15 
 
 		 314 aa  93.6  4e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2073  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  25.99 
 
 		 619 aa  93.2  5e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.763377  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2077  transketolase, central region  27.81 
 
 		 308 aa  92.8  6e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2615  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  27.01 
 
 		 637 aa  92.8  6e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0207867  normal  0.922526 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4663  transketolase central region  28.09 
 
 		 328 aa  92.8  6e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004258  1-deoxy-D-xylulose 5-phosphate synthase  26.79 
 
 		 621 aa  92.8  6e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0180  transketolase, central region  32.26 
 
 		 162 aa  92.4  8e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2584  deoxyxylulose-5-phosphate synthase  29.17 
 
 		 633 aa  92  9e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.931562  normal  0.224926 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1044  deoxyxylulose-5-phosphate synthase  29 
 
 		 618 aa  92.4  9e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.213907  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09040  transketolase subunit B  27.55 
 
 		 315 aa  91.7  1e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.28283  normal  0.0525296 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2513  transketolase subunit B  26.97 
 
 		 322 aa  91.7  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1146  Transketolase domain protein  26.06 
 
 		 319 aa  91.7  1e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2059  Transketolase central region  26.98 
 
 		 313 aa  91.3  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0882  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  26.37 
 
 		 638 aa  91.3  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0173  Transketolase central region  27.18 
 
 		 313 aa  90.9  2e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0237  transketolase subunit B  26 
 
 		 311 aa  91.3  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2827  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  25.27 
 
 		 635 aa  91.3  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1787  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  25.9 
 
 		 619 aa  91.3  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5715  Transketolase central region  24.91 
 
 		 296 aa  90.9  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1277  Transketolase central region  31.37 
 
 		 313 aa  90.1  3e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2200  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  25.8 
 
 		 661 aa  90.5  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2110  transketolase, central region  27.3 
 
 		 314 aa  90.5  3e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.44874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0252  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  27.93 
 
 		 613 aa  90.1  4e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4744  Transketolase central region  27.36 
 
 		 311 aa  89.7  4e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>