More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3528 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_3528  Transketolase central region  100 
 
 		 306 aa  632  1e-180  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.605284  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3642  Transketolase central region  94.44 
 
 		 307 aa  600  1e-170  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3248  putative transketolase, C-terminal subunit  45.45 
 
 		 314 aa  279  4e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3382  transketolase domain-containing protein  45.12 
 
 		 314 aa  278  6e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2402  transketolase, C-terminal subunit  46.08 
 
 		 310 aa  276  4e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.730568  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0910  putative transketolase, C-terminal subunit  46.08 
 
 		 310 aa  275  6e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2646  Transketolase domain protein  44.44 
 
 		 314 aa  266  2e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0477221  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2126  Transketolase domain protein  37.32 
 
 		 320 aa  202  6e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.764032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1505  transketolase central region  33.78 
 
 		 314 aa  189  5.999999999999999e-47  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0385912  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2254  Transketolase domain protein  39.16 
 
 		 318 aa  185  6e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.655402  normal  0.0447096 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3129  transketolase domain-containing protein  37.16 
 
 		 322 aa  182  9.000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2800  Transketolase central region  33.91 
 
 		 320 aa  180  2e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1130  transketolase central region  33.22 
 
 		 336 aa  179  4.999999999999999e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0365  transketolase central region  31.48 
 
 		 312 aa  179  5.999999999999999e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.556876  normal  0.0129681 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1554  transketolase central region  30.82 
 
 		 312 aa  177  2e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0600642  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2032  Transketolase domain protein  38.78 
 
 		 318 aa  176  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.262756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0438  transketolase central region  32.12 
 
 		 312 aa  176  3e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0397028  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0471  transketolase subunit B  30.82 
 
 		 312 aa  176  5e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0285277  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09040  transketolase subunit B  35.43 
 
 		 315 aa  171  2e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.28283  normal  0.0525296 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0244  transketolase-like protein  34.22 
 
 		 311 aa  167  2e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3397  Transketolase central region  33.84 
 
 		 298 aa  166  5e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2444  transketolase subunit B  30.36 
 
 		 313 aa  165  8e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3967  Transketolase central region  34.62 
 
 		 313 aa  165  9e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000645501  unclonable  0.000000000133165 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05490  transketolase subunit B  33.66 
 
 		 325 aa  165  9e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.948034 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0293  putative transketolase, C-terminal subunit  33.97 
 
 		 314 aa  164  1.0000000000000001e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0288  transketolase  33.97 
 
 		 314 aa  164  1.0000000000000001e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000211069  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0969  transketolase, central region  32.17 
 
 		 306 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86113  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1381  Transketolase central region  32.08 
 
 		 306 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0407  transketolase central region  32.56 
 
 		 323 aa  161  1e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0194561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2213  transketolase subunit B  31.52 
 
 		 317 aa  161  1e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000528401  hitchhiker  0.000741425 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0334  Transketolase central region  35.39 
 
 		 308 aa  161  1e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4744  Transketolase central region  36.4 
 
 		 311 aa  160  4e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5637  transketolase subunit B  32.3 
 
 		 307 aa  159  7e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0244  Transketolase central region  31.23 
 
 		 305 aa  157  2e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.304733  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0975  Transketolase central region  32.2 
 
 		 317 aa  157  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.127122  normal  0.063318 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0492  transketolase, central region  34.09 
 
 		 312 aa  157  3e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0333  Transketolase central region  30.99 
 
 		 322 aa  157  3e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0873  Transketolase central region  33.08 
 
 		 319 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.199119  hitchhiker  0.00317558 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1895  transketolase, C-terminal subunit  34.02 
 
 		 318 aa  156  5.0000000000000005e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00759771 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1923  transketolase domain-containing protein  33.45 
 
 		 315 aa  155  1e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2935  Transketolase central region  31.1 
 
 		 317 aa  155  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0796  Transketolase central region  34.31 
 
 		 316 aa  154  2e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1468  Transketolase central region  31.63 
 
 		 314 aa  154  2e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2513  transketolase subunit B  32.85 
 
 		 322 aa  154  2e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0300  transketolase central region  31.37 
 
 		 324 aa  151  2e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0477096 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3074  transketolase, central region  34.62 
 
 		 313 aa  149  5e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0289222  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1792  transketolase subunit B  33.09 
 
 		 310 aa  149  6e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0510195  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0711  Transketolase central region  29.5 
 
 		 315 aa  149  8e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00000202012  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0552  transketolase subunit B  36.26 
 
 		 314 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2059  Transketolase central region  32.52 
 
 		 313 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0280  Transketolase central region  31.92 
 
 		 310 aa  145  6e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.741894  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1860  Transketolase central region  32.22 
 
 		 321 aa  145  7.0000000000000006e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0265  Transketolase central region  31.54 
 
 		 310 aa  144  1e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00214892 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0809  transketolase central region  31.3 
 
 		 592 aa  143  3e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.32467  normal  0.55266 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2077  transketolase, central region  32.65 
 
 		 308 aa  143  3e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2110  transketolase, central region  33.85 
 
 		 314 aa  142  7e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.44874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1997  Transketolase central region  33.71 
 
 		 321 aa  142  8e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00329881 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2019  Transketolase central region  28.71 
 
 		 320 aa  142  9.999999999999999e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.6126  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0860  Transketolase domain protein  32.55 
 
 		 310 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.476833  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2041  transketolase central region  28.48 
 
 		 330 aa  140  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.522483 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0183  Transketolase central region  30.2 
 
 		 320 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2705  transketolase subunit B  33.33 
 
 		 311 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000194197  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00875  transketolase, C-terminal subunit  30 
 
 		 317 aa  140  3e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4834  transketolase central region  29.45 
 
 		 333 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1878  transketolase subunit B  28.77 
 
 		 312 aa  139  4.999999999999999e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0173  Transketolase central region  34.29 
 
 		 313 aa  139  7e-32  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3949  Transketolase domain protein  29.45 
 
 		 338 aa  139  7.999999999999999e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0237  transketolase subunit B  32.13 
 
 		 311 aa  138  1e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0470  Transketolase central region  32.3 
 
 		 318 aa  137  2e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1078  deoxyxylulose-5-phosphate synthase  32.62 
 
 		 635 aa  136  4e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0303047  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1527  Transketolase central region  31.68 
 
 		 319 aa  136  5e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0049  transketolase, central region  28.39 
 
 		 317 aa  136  5e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0789  transketolase central region  33.61 
 
 		 314 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1192  transketolase-like  28.98 
 
 		 327 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.101787  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4663  transketolase central region  30.92 
 
 		 328 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0874  Transketolase central region  29.63 
 
 		 326 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1775  transketolase, central region  33.2 
 
 		 314 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0894  transketolase subunit B  33.88 
 
 		 314 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1286  transketolase-like  29.27 
 
 		 327 aa  133  3e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.290354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1589  transketolase family protein  29.01 
 
 		 288 aa  134  3e-30  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5659  Transketolase central region  28.66 
 
 		 333 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.252415  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3878  transketolase, central region  31.6 
 
 		 342 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.733485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0881  Transketolase central region  27.73 
 
 		 327 aa  131  1.0000000000000001e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000876605  normal  0.0478781 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1058  transketolase subunit B  29.92 
 
 		 308 aa  130  3e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.847424 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1170  transketolase subunit B  28 
 
 		 326 aa  130  3e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000103125  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2719  transketolase, C-terminal subunit  31.33 
 
 		 311 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1173  Transketolase central region  28.57 
 
 		 327 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000000393635  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2918  transketolase, C-terminal subunit  34.73 
 
 		 314 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1178  Transketolase central region  27.85 
 
 		 327 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0058066  normal  0.0131189 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06530  deoxyxylulose-5-phosphate synthase  31.49 
 
 		 636 aa  124  2e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000553997  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2448  deoxyxylulose-5-phosphate synthase  31.79 
 
 		 631 aa  123  3e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1852  deoxyxylulose-5-phosphate synthase  31.75 
 
 		 640 aa  124  3e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2604  deoxyxylulose-5-phosphate synthase  31.34 
 
 		 618 aa  123  4e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1277  Transketolase central region  28.24 
 
 		 313 aa  122  9.999999999999999e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0338  Transketolase central region  32.28 
 
 		 319 aa  121  9.999999999999999e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2182  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  29.9 
 
 		 625 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0455646  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14551  transketolase C-terminal subunit  29.12 
 
 		 304 aa  121  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2287  transketolase central region  34.62 
 
 		 305 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1713  transketolase central region  27.27 
 
 		 332 aa  120  3e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.548893  normal  0.0621953 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08020  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  31.6 
 
 		 630 aa  120  3e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.637143  hitchhiker  0.00000100626 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>