More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_2287 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_2287  transketolase central region  100 
 
 		 305 aa  622  1e-177  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5637  transketolase subunit B  36.16 
 
 		 307 aa  207  1e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3397  Transketolase central region  38.98 
 
 		 298 aa  193  2e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4221  transketolase subunit B  40.39 
 
 		 307 aa  186  3e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0293  putative transketolase, C-terminal subunit  34.1 
 
 		 314 aa  173  2.9999999999999996e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0288  transketolase  34.1 
 
 		 314 aa  173  2.9999999999999996e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000211069  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1792  transketolase subunit B  37.13 
 
 		 310 aa  171  1e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0510195  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14551  transketolase C-terminal subunit  30.29 
 
 		 304 aa  169  5e-41  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1058  transketolase subunit B  38.85 
 
 		 308 aa  168  8e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.847424 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2126  Transketolase domain protein  35.91 
 
 		 320 aa  162  7e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.764032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0333  Transketolase central region  33.23 
 
 		 322 aa  162  7e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0265  Transketolase central region  35.86 
 
 		 310 aa  161  1e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00214892 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0492  transketolase, central region  35.18 
 
 		 312 aa  160  3e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1589  transketolase family protein  31.46 
 
 		 288 aa  159  4e-38  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3129  transketolase domain-containing protein  33 
 
 		 322 aa  159  4e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0280  Transketolase central region  35.53 
 
 		 310 aa  159  7e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.741894  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2800  Transketolase central region  36.27 
 
 		 320 aa  158  9e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3967  Transketolase central region  35.62 
 
 		 313 aa  156  4e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000645501  unclonable  0.000000000133165 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1130  transketolase central region  34.05 
 
 		 336 aa  153  4e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6295  Transketolase central region  33.98 
 
 		 332 aa  152  7e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2444  transketolase subunit B  34.53 
 
 		 313 aa  152  7e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4663  transketolase central region  34.95 
 
 		 328 aa  152  8e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1381  Transketolase central region  33.44 
 
 		 306 aa  150  2e-35  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2254  Transketolase domain protein  32.78 
 
 		 318 aa  150  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.655402  normal  0.0447096 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1527  Transketolase central region  33.89 
 
 		 319 aa  149  4e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2041  transketolase central region  34.75 
 
 		 330 aa  149  7e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.522483 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0438  transketolase central region  30.03 
 
 		 312 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0397028  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0975  Transketolase central region  31.8 
 
 		 317 aa  148  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.127122  normal  0.063318 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1178  Transketolase central region  32.79 
 
 		 327 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0058066  normal  0.0131189 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0471  transketolase subunit B  30.07 
 
 		 312 aa  145  8.000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0285277  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1173  Transketolase central region  32.79 
 
 		 327 aa  145  9e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000000393635  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1505  transketolase central region  29.37 
 
 		 314 aa  144  1e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0385912  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1554  transketolase central region  29.41 
 
 		 312 aa  144  1e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0600642  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0969  transketolase, central region  31.68 
 
 		 306 aa  144  2e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86113  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1170  transketolase subunit B  32.14 
 
 		 326 aa  144  2e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000103125  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0365  transketolase central region  28.8 
 
 		 312 aa  144  2e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.556876  normal  0.0129681 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1286  transketolase-like  31.82 
 
 		 327 aa  143  4e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.290354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0244  transketolase-like protein  32.46 
 
 		 311 aa  143  4e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0244  Transketolase central region  30.72 
 
 		 305 aa  142  9e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.304733  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0300  transketolase central region  30.13 
 
 		 324 aa  141  9.999999999999999e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0477096 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2032  Transketolase domain protein  33.9 
 
 		 318 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.262756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3074  transketolase, central region  36.81 
 
 		 313 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0289222  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2719  transketolase, C-terminal subunit  34.1 
 
 		 311 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5659  Transketolase central region  32.79 
 
 		 333 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.252415  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0881  Transketolase central region  31.49 
 
 		 327 aa  139  3.9999999999999997e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000876605  normal  0.0478781 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1860  Transketolase central region  30.36 
 
 		 321 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0809  transketolase central region  32.79 
 
 		 592 aa  139  4.999999999999999e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.32467  normal  0.55266 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1192  transketolase-like  30.84 
 
 		 327 aa  138  1e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.101787  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5103  Transketolase central region  33.76 
 
 		 306 aa  137  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.47717 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2077  transketolase, central region  34.32 
 
 		 308 aa  137  3.0000000000000003e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0130  Transketolase central region  32.65 
 
 		 351 aa  137  3.0000000000000003e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0874  Transketolase central region  31.82 
 
 		 326 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2513  transketolase subunit B  31.29 
 
 		 322 aa  136  5e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1878  transketolase subunit B  32.13 
 
 		 312 aa  134  1.9999999999999998e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0789  transketolase central region  32.47 
 
 		 314 aa  134  3e-30  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4834  transketolase central region  29.24 
 
 		 333 aa  133  3e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0711  Transketolase central region  27.63 
 
 		 315 aa  133  3.9999999999999996e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00000202012  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0860  Transketolase domain protein  29.84 
 
 		 310 aa  132  6e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.476833  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1462  transketolase subunit B  33.01 
 
 		 332 aa  132  7.999999999999999e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.304967 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1717  Transketolase central region  30.87 
 
 		 347 aa  132  9e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09040  transketolase subunit B  33.44 
 
 		 315 aa  131  1.0000000000000001e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.28283  normal  0.0525296 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0407  transketolase central region  33 
 
 		 323 aa  132  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0194561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0470  Transketolase central region  34.43 
 
 		 318 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2019  Transketolase central region  30.42 
 
 		 320 aa  132  1.0000000000000001e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.6126  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2059  Transketolase central region  29.18 
 
 		 313 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2935  Transketolase central region  30.49 
 
 		 317 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4744  Transketolase central region  33.9 
 
 		 311 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00875  transketolase, C-terminal subunit  30.49 
 
 		 317 aa  130  2.0000000000000002e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0552  transketolase subunit B  34.69 
 
 		 314 aa  130  3e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1895  transketolase, C-terminal subunit  29.84 
 
 		 318 aa  130  3e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00759771 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1775  transketolase, central region  31.82 
 
 		 314 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0910  putative transketolase, C-terminal subunit  35.66 
 
 		 310 aa  129  6e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1923  transketolase domain-containing protein  32.57 
 
 		 315 aa  129  6e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3248  putative transketolase, C-terminal subunit  35.11 
 
 		 314 aa  129  7.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2092  transketolase central region  31.27 
 
 		 339 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.147262 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2367  Transketolase central region  31.27 
 
 		 339 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.438048  normal  0.0327946 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2918  transketolase, C-terminal subunit  34.64 
 
 		 314 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0300  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  32.47 
 
 		 628 aa  128  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.533137  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3382  transketolase domain-containing protein  34.73 
 
 		 314 aa  128  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2110  transketolase, central region  31.17 
 
 		 314 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.44874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3269  transketolase subunit B  32.04 
 
 		 337 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.444228 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0049  transketolase, central region  29.84 
 
 		 317 aa  127  2.0000000000000002e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09721  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  32.47 
 
 		 628 aa  127  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.274515 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4991  transketolase central region  31.72 
 
 		 332 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.908463 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0183  Transketolase central region  28.52 
 
 		 320 aa  126  6e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2402  transketolase, C-terminal subunit  30.4 
 
 		 310 aa  126  6e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.730568  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2718  transketolase subunit B  33.55 
 
 		 340 aa  125  7e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0873  Transketolase central region  30.16 
 
 		 319 aa  125  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.199119  hitchhiker  0.00317558 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2213  transketolase subunit B  27.1 
 
 		 317 aa  125  1e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000528401  hitchhiker  0.000741425 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1997  Transketolase central region  34.21 
 
 		 321 aa  125  1e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00329881 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1146  Transketolase domain protein  28.91 
 
 		 319 aa  124  2e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2613  transketolase central region  31.19 
 
 		 333 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0875571  normal  0.474338 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0261  Transketolase central region  31.17 
 
 		 339 aa  124  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.885505 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6255  transketolase central region  30.52 
 
 		 332 aa  123  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.156319  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3878  transketolase, central region  29.97 
 
 		 342 aa  123  4e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.733485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6422  transketolase, central region  30.52 
 
 		 332 aa  122  5e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6657  transketolase, central region  30.52 
 
 		 332 aa  122  5e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05490  transketolase subunit B  34.08 
 
 		 325 aa  122  6e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.948034 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1468  Transketolase central region  28.9 
 
 		 314 aa  122  8e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3312  Transketolase central region  32.47 
 
 		 332 aa  122  9e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>