More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_2367 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_2092  transketolase central region  100 
 
 		 339 aa  689    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.147262 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0261  Transketolase central region  94.4 
 
 		 339 aa  659    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.885505 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2367  Transketolase central region  100 
 
 		 339 aa  689    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.438048  normal  0.0327946 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3003  transketolase central region  87.94 
 
 		 340 aa  607  1e-173  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2744  transketolase central region  84.21 
 
 		 342 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0728122  normal  0.0592981 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4383  Transketolase central region  83.04 
 
 		 342 aa  567  1e-160  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0967269  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0718  transketolase, central region  79.13 
 
 		 334 aa  526  1e-148  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2718  transketolase subunit B  77.57 
 
 		 340 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3269  transketolase subunit B  74.4 
 
 		 337 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.444228 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5275  transketolase, central region  76.95 
 
 		 335 aa  513  1e-144  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.181452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1462  transketolase subunit B  75.08 
 
 		 332 aa  505  9.999999999999999e-143  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.304967 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3312  Transketolase central region  74.14 
 
 		 332 aa  497  1e-140  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6139  Transketolase central region  73.11 
 
 		 332 aa  496  1e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.47666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1539  transketolase central region  72.5 
 
 		 348 aa  491  9.999999999999999e-139  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.844968  normal  0.490255 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4778  transketolase subunit B  72.36 
 
 		 332 aa  487  1e-136  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4991  transketolase central region  72.98 
 
 		 332 aa  484  1e-136  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.908463 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6255  transketolase central region  72.36 
 
 		 332 aa  481  1e-135  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.156319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6422  transketolase, central region  72.36 
 
 		 332 aa  481  1e-135  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6657  transketolase, central region  72.36 
 
 		 332 aa  481  1e-135  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4930  transketolase central region  71.12 
 
 		 332 aa  475  1e-133  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4275  transketolase central region  71.03 
 
 		 338 aa  477  1e-133  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4411  transketolase, central region  71.12 
 
 		 332 aa  474  1e-132  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0682016 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5878  transketolase central region  70.5 
 
 		 333 aa  464  9.999999999999999e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0727  transketolase central region  70.09 
 
 		 335 aa  456  1e-127  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2613  transketolase central region  67.91 
 
 		 333 aa  450  1e-125  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0875571  normal  0.474338 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3618  transketolase subunit B  66.46 
 
 		 331 aa  443  1e-123  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.189872  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3641  transketolase, central region  64.6 
 
 		 334 aa  436  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.150786 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3958  transketolase subunit B  65.64 
 
 		 340 aa  434  1e-120  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.158278  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2699  transketolase subunit B  72.22 
 
 		 288 aa  430  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1717  Transketolase central region  65.33 
 
 		 347 aa  418  1e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0406  Transketolase central region  65.12 
 
 		 343 aa  419  1e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3347  Transketolase central region  62.54 
 
 		 331 aa  398  9.999999999999999e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.027962  normal  0.023237 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2506  Transketolase central region  61.37 
 
 		 343 aa  387  1e-106  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.165482 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1713  transketolase central region  43.77 
 
 		 332 aa  272  6e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.548893  normal  0.0621953 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0901  transketolase, central region  41.72 
 
 		 336 aa  244  9.999999999999999e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0969  transketolase, central region  41.72 
 
 		 306 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86113  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0244  Transketolase central region  40.33 
 
 		 305 aa  229  5e-59  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.304733  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1527  Transketolase central region  43.34 
 
 		 319 aa  224  2e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4744  Transketolase central region  44.63 
 
 		 311 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3967  Transketolase central region  42.62 
 
 		 313 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000645501  unclonable  0.000000000133165 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1192  transketolase-like  39.61 
 
 		 327 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.101787  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0438  transketolase central region  38.41 
 
 		 312 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0397028  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1860  Transketolase central region  44.52 
 
 		 321 aa  219  5e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1170  transketolase subunit B  39.32 
 
 		 326 aa  219  5e-56  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000103125  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0293  putative transketolase, C-terminal subunit  39.6 
 
 		 314 aa  219  6e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0288  transketolase  39.6 
 
 		 314 aa  219  6e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000211069  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0881  Transketolase central region  39.63 
 
 		 327 aa  217  2e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000876605  normal  0.0478781 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4834  transketolase central region  38.61 
 
 		 333 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1130  transketolase central region  39.22 
 
 		 336 aa  215  9e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1505  transketolase central region  37.67 
 
 		 314 aa  215  9.999999999999999e-55  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0385912  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1286  transketolase-like  39.94 
 
 		 327 aa  214  9.999999999999999e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.290354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2213  transketolase subunit B  38.61 
 
 		 317 aa  214  9.999999999999999e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000528401  hitchhiker  0.000741425 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2719  transketolase, C-terminal subunit  43.14 
 
 		 311 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0874  Transketolase central region  38.54 
 
 		 326 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1895  transketolase, C-terminal subunit  37.67 
 
 		 318 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00759771 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0237  transketolase subunit B  44 
 
 		 311 aa  213  2.9999999999999995e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0975  Transketolase central region  38.21 
 
 		 317 aa  211  1e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.127122  normal  0.063318 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1173  Transketolase central region  40.26 
 
 		 327 aa  211  1e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000000393635  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0280  Transketolase central region  38.67 
 
 		 310 aa  209  5e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.741894  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1178  Transketolase central region  40 
 
 		 327 aa  209  5e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0058066  normal  0.0131189 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1381  Transketolase central region  40.68 
 
 		 306 aa  209  5e-53  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2705  transketolase subunit B  41.91 
 
 		 311 aa  209  5e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000194197  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0492  transketolase, central region  39.27 
 
 		 312 aa  209  6e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0265  Transketolase central region  38.33 
 
 		 310 aa  208  9e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00214892 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0333  Transketolase central region  38.28 
 
 		 322 aa  208  1e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0860  Transketolase domain protein  38.61 
 
 		 310 aa  206  4e-52  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.476833  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2059  Transketolase central region  37.62 
 
 		 313 aa  206  5e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2935  Transketolase central region  37.33 
 
 		 317 aa  205  8e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0244  transketolase-like protein  38.39 
 
 		 311 aa  203  4e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0471  transketolase subunit B  36.33 
 
 		 312 aa  203  4e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0285277  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0365  transketolase central region  36 
 
 		 312 aa  202  5e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.556876  normal  0.0129681 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0873  Transketolase central region  37.67 
 
 		 319 aa  202  6e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.199119  hitchhiker  0.00317558 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1554  transketolase central region  34.67 
 
 		 312 aa  199  7.999999999999999e-50  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0600642  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0711  Transketolase central region  36.63 
 
 		 315 aa  198  9e-50  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00000202012  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00875  transketolase, C-terminal subunit  36.3 
 
 		 317 aa  198  1.0000000000000001e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2077  transketolase, central region  42.9 
 
 		 308 aa  196  7e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1078  deoxyxylulose-5-phosphate synthase  34.78 
 
 		 635 aa  196  7e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0303047  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2019  Transketolase central region  35.69 
 
 		 320 aa  195  1e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.6126  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0470  Transketolase central region  42.9 
 
 		 318 aa  194  2e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0173  Transketolase central region  37.95 
 
 		 313 aa  193  3e-48  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0183  Transketolase central region  33.66 
 
 		 320 aa  192  6e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09040  transketolase subunit B  38.39 
 
 		 315 aa  192  1e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.28283  normal  0.0525296 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1792  transketolase subunit B  37.12 
 
 		 310 aa  191  1e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0510195  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1997  Transketolase central region  37.3 
 
 		 321 aa  189  8e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00329881 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2513  transketolase subunit B  38.33 
 
 		 322 aa  188  1e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1878  transketolase subunit B  34.9 
 
 		 312 aa  187  3e-46  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0552  transketolase subunit B  38.62 
 
 		 314 aa  185  8e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3074  transketolase, central region  41.91 
 
 		 313 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0289222  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0300  transketolase central region  35.28 
 
 		 324 aa  183  3e-45  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0477096 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0049  transketolase, central region  34.81 
 
 		 317 aa  183  4.0000000000000006e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2235  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  35.41 
 
 		 622 aa  179  4e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.77755  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1468  Transketolase central region  35.57 
 
 		 314 aa  179  5.999999999999999e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2182  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  36.1 
 
 		 625 aa  178  1e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0455646  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1775  transketolase, central region  38.72 
 
 		 314 aa  177  2e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2110  transketolase, central region  37.7 
 
 		 314 aa  176  4e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.44874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1058  transketolase subunit B  38.91 
 
 		 308 aa  176  6e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.847424 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1027  deoxyxylulose-5-phosphate synthase  33.55 
 
 		 634 aa  175  9.999999999999999e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1418  deoxyxylulose-5-phosphate synthase  31.79 
 
 		 646 aa  175  9.999999999999999e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.793105  normal  0.333041 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0671  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  35.2 
 
 		 643 aa  174  9.999999999999999e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1686  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  34.19 
 
 		 659 aa  174  1.9999999999999998e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>