More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1878 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1878  transketolase subunit B  100 
 
 		 312 aa  636    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1277  Transketolase central region  69.65 
 
 		 313 aa  481  1e-135  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0809  transketolase central region  55.05 
 
 		 592 aa  371  1e-102  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.32467  normal  0.55266 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0894  transketolase subunit B  52.81 
 
 		 314 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0789  transketolase central region  49.83 
 
 		 314 aa  323  2e-87  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1775  transketolase, central region  50.17 
 
 		 314 aa  322  6e-87  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2110  transketolase, central region  50.17 
 
 		 314 aa  316  3e-85  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.44874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0969  transketolase, central region  46.69 
 
 		 306 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86113  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2059  Transketolase central region  45.28 
 
 		 313 aa  275  9e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0293  putative transketolase, C-terminal subunit  46.36 
 
 		 314 aa  271  7e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0288  transketolase  46.36 
 
 		 314 aa  271  7e-72  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000211069  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0492  transketolase, central region  43.79 
 
 		 312 aa  269  5e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0300  transketolase central region  43.17 
 
 		 324 aa  263  4e-69  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0477096 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1860  Transketolase central region  43 
 
 		 321 aa  260  2e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2705  transketolase subunit B  46.58 
 
 		 311 aa  260  2e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000194197  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2213  transketolase subunit B  43.61 
 
 		 317 aa  259  3e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000528401  hitchhiker  0.000741425 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4744  Transketolase central region  46.78 
 
 		 311 aa  258  1e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0173  Transketolase central region  42.02 
 
 		 313 aa  256  3e-67  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0244  Transketolase central region  44.63 
 
 		 305 aa  256  5e-67  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.304733  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0552  transketolase subunit B  44.7 
 
 		 314 aa  251  1e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0280  Transketolase central region  42.16 
 
 		 310 aa  251  1e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.741894  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0265  Transketolase central region  41.83 
 
 		 310 aa  251  1e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00214892 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0711  Transketolase central region  42.49 
 
 		 315 aa  248  1e-64  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00000202012  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0244  transketolase-like protein  39.87 
 
 		 311 aa  247  2e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05490  transketolase subunit B  44.22 
 
 		 325 aa  246  3e-64  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.948034 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1381  Transketolase central region  41.56 
 
 		 306 aa  246  4e-64  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3967  Transketolase central region  43.32 
 
 		 313 aa  246  4.9999999999999997e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000645501  unclonable  0.000000000133165 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0333  Transketolase central region  45.66 
 
 		 322 aa  245  8e-64  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0881  Transketolase central region  40.8 
 
 		 327 aa  242  5e-63  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000876605  normal  0.0478781 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2918  transketolase, C-terminal subunit  44.44 
 
 		 314 aa  242  6e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2077  transketolase, central region  44.59 
 
 		 308 aa  241  9e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3074  transketolase, central region  45.03 
 
 		 313 aa  241  1e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0289222  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1178  Transketolase central region  40.46 
 
 		 327 aa  239  5e-62  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0058066  normal  0.0131189 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09040  transketolase subunit B  42.3 
 
 		 315 aa  237  2e-61  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.28283  normal  0.0525296 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0874  Transketolase central region  40.13 
 
 		 326 aa  235  6e-61  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1895  transketolase, C-terminal subunit  37.7 
 
 		 318 aa  235  6e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00759771 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0860  Transketolase domain protein  39.8 
 
 		 310 aa  234  1.0000000000000001e-60  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.476833  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00875  transketolase, C-terminal subunit  38.96 
 
 		 317 aa  233  5e-60  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1192  transketolase-like  38.8 
 
 		 327 aa  231  1e-59  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.101787  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1173  Transketolase central region  39.46 
 
 		 327 aa  230  2e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000000393635  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1286  transketolase-like  39.46 
 
 		 327 aa  228  9e-59  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.290354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0470  Transketolase central region  42.35 
 
 		 318 aa  228  9e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0237  transketolase subunit B  42.3 
 
 		 311 aa  227  2e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2019  Transketolase central region  38.83 
 
 		 320 aa  227  2e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.6126  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1170  transketolase subunit B  39 
 
 		 326 aa  227  2e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000103125  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2719  transketolase, C-terminal subunit  40.73 
 
 		 311 aa  226  4e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0873  Transketolase central region  37.38 
 
 		 319 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.199119  hitchhiker  0.00317558 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1997  Transketolase central region  41.72 
 
 		 321 aa  226  5.0000000000000005e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00329881 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1527  Transketolase central region  39.74 
 
 		 319 aa  225  6e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0975  Transketolase central region  37.04 
 
 		 317 aa  224  2e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.127122  normal  0.063318 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1554  transketolase central region  39.37 
 
 		 312 aa  223  3e-57  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0600642  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0183  Transketolase central region  36.67 
 
 		 320 aa  223  3e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0438  transketolase central region  39.74 
 
 		 312 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0397028  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0471  transketolase subunit B  39.05 
 
 		 312 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0285277  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2935  Transketolase central region  38 
 
 		 317 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0365  transketolase central region  38.73 
 
 		 312 aa  219  5e-56  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.556876  normal  0.0129681 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2254  Transketolase domain protein  40.33 
 
 		 318 aa  218  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.655402  normal  0.0447096 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1505  transketolase central region  38.02 
 
 		 314 aa  218  1e-55  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0385912  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0338  Transketolase central region  42.72 
 
 		 319 aa  215  8e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0334  Transketolase central region  40.07 
 
 		 308 aa  213  3.9999999999999995e-54  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4778  transketolase subunit B  37.46 
 
 		 332 aa  211  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1130  transketolase central region  40.31 
 
 		 336 aa  209  5e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4991  transketolase central region  38.38 
 
 		 332 aa  208  9e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.908463 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3129  transketolase domain-containing protein  39.25 
 
 		 322 aa  207  2e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6255  transketolase central region  36.9 
 
 		 332 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.156319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2444  transketolase subunit B  37.91 
 
 		 313 aa  204  2e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3269  transketolase subunit B  38.28 
 
 		 337 aa  203  3e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.444228 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1923  transketolase domain-containing protein  37.46 
 
 		 315 aa  203  4e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6422  transketolase, central region  36.9 
 
 		 332 aa  203  4e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6657  transketolase, central region  36.9 
 
 		 332 aa  203  4e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4411  transketolase, central region  37.24 
 
 		 332 aa  202  5e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0682016 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5275  transketolase, central region  36.73 
 
 		 335 aa  202  8e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.181452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4930  transketolase central region  36.9 
 
 		 332 aa  202  9e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1462  transketolase subunit B  37.04 
 
 		 332 aa  199  5e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.304967 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1539  transketolase central region  36.61 
 
 		 348 aa  199  5e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.844968  normal  0.490255 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2613  transketolase central region  37.29 
 
 		 333 aa  199  6e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0875571  normal  0.474338 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0049  transketolase, central region  37.05 
 
 		 317 aa  197  1.0000000000000001e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2032  Transketolase domain protein  40 
 
 		 318 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.262756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3878  transketolase, central region  33.67 
 
 		 342 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.733485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1418  deoxyxylulose-5-phosphate synthase  37.54 
 
 		 646 aa  198  1.0000000000000001e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.793105  normal  0.333041 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3312  Transketolase central region  36.05 
 
 		 332 aa  196  4.0000000000000005e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2718  transketolase subunit B  35.59 
 
 		 340 aa  193  3e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6139  Transketolase central region  34.68 
 
 		 332 aa  193  3e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.47666  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1468  Transketolase central region  36.25 
 
 		 314 aa  192  5e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2513  transketolase subunit B  37.42 
 
 		 322 aa  192  6e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2699  transketolase subunit B  37.32 
 
 		 288 aa  192  8e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2126  Transketolase domain protein  35.64 
 
 		 320 aa  191  2e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.764032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1027  deoxyxylulose-5-phosphate synthase  39.08 
 
 		 634 aa  190  2.9999999999999997e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5878  transketolase central region  36.9 
 
 		 333 aa  189  4e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2800  Transketolase central region  34.54 
 
 		 320 aa  187  2e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2092  transketolase central region  34.9 
 
 		 339 aa  187  3e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.147262 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3618  transketolase subunit B  36.03 
 
 		 331 aa  186  3e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.189872  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2842  transketolase subunit B  36.77 
 
 		 317 aa  186  3e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.837175  normal  0.299247 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2367  Transketolase central region  34.9 
 
 		 339 aa  187  3e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.438048  normal  0.0327946 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0261  Transketolase central region  35.23 
 
 		 339 aa  186  4e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.885505 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2235  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  39.08 
 
 		 622 aa  186  6e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.77755  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1717  Transketolase central region  37.25 
 
 		 347 aa  185  7e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3003  transketolase central region  35.12 
 
 		 340 aa  185  8e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1078  deoxyxylulose-5-phosphate synthase  36.6 
 
 		 635 aa  185  8e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0303047  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3641  transketolase, central region  35.17 
 
 		 334 aa  185  9e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.150786 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>